MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 plasmid pCD1

Total Repeats: 1032

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005813	GCC	2	6	215	220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478503
2	NC_005813	CGC	2	6	229	234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478503
3	NC_005813	CTG	2	6	238	243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478503
4	NC_005813	TCGC	2	8	328	335	0 %	25 %	25 %	50 %	45478503
5	NC_005813	CATT	2	8	382	389	25 %	50 %	0 %	25 %	45478503
6	NC_005813	TC	4	8	393	400	0 %	50 %	0 %	50 %	45478503
7	NC_005813	CAGGAG	2	12	408	419	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	45478503
8	NC_005813	GTTCG	2	10	426	435	0 %	40 %	40 %	20 %	45478503
9	NC_005813	GAC	2	6	448	453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478503
10	NC_005813	CTT	2	6	605	610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478503
11	NC_005813	TGG	2	6	611	616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478503
12	NC_005813	CG	3	6	622	627	0 %	0 %	50 %	50 %	45478503
13	NC_005813	TC	3	6	736	741	0 %	50 %	0 %	50 %	45478503
14	NC_005813	AAGGT	2	10	775	784	40 %	20 %	40 %	0 %	45478503
15	NC_005813	GCTG	2	8	895	902	0 %	25 %	50 %	25 %	45478503
16	NC_005813	AGC	2	6	970	975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478503
17	NC_005813	A	6	6	1002	1007	100 %	0 %	0 %	0 %	45478503
18	NC_005813	TGA	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478503
19	NC_005813	CAT	2	6	1062	1067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478503
20	NC_005813	TGA	2	6	1107	1112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478503
21	NC_005813	AGCGC	2	10	1175	1184	20 %	0 %	40 %	40 %	45478504
22	NC_005813	GAA	2	6	1253	1258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478504
23	NC_005813	TCA	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478504
24	NC_005813	CGG	2	6	1314	1319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45478504
25	NC_005813	CTCA	2	8	1390	1397	25 %	25 %	0 %	50 %	45478504
26	NC_005813	CAG	3	9	1518	1526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478504
27	NC_005813	ACG	2	6	1574	1579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478504
28	NC_005813	C	6	6	1599	1604	0 %	0 %	0 %	100 %	45478504
29	NC_005813	TCA	2	6	1611	1616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478504
30	NC_005813	TGA	2	6	1618	1623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478504
31	NC_005813	TCAG	2	8	1641	1648	25 %	25 %	25 %	25 %	45478504
32	NC_005813	GAA	2	6	1649	1654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478504
33	NC_005813	TTC	2	6	1664	1669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478504
34	NC_005813	GCA	2	6	1760	1765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478504
35	NC_005813	TCAAA	2	10	1813	1822	60 %	20 %	0 %	20 %	45478504
36	NC_005813	CAGA	2	8	1840	1847	50 %	0 %	25 %	25 %	45478504
37	NC_005813	GCC	2	6	1963	1968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478505
38	NC_005813	AGC	2	6	2066	2071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478505
39	NC_005813	GCA	2	6	2074	2079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478505
40	NC_005813	CTG	2	6	2091	2096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478505
41	NC_005813	GTG	2	6	2118	2123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478505
42	NC_005813	GCTG	2	8	2125	2132	0 %	25 %	50 %	25 %	45478505
43	NC_005813	GT	3	6	2266	2271	0 %	50 %	50 %	0 %	45478505
44	NC_005813	AT	3	6	2279	2284	50 %	50 %	0 %	0 %	45478505
45	NC_005813	TGG	2	6	2303	2308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478505
46	NC_005813	TCC	2	6	2405	2410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45478506
47	NC_005813	CCT	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45478506
48	NC_005813	CAG	2	6	2466	2471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478506
49	NC_005813	AC	3	6	2517	2522	50 %	0 %	0 %	50 %	45478506
50	NC_005813	CAT	2	6	2628	2633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478506
51	NC_005813	TTA	2	6	2666	2671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478507
52	NC_005813	AC	3	6	2674	2679	50 %	0 %	0 %	50 %	45478507
53	NC_005813	TGG	2	6	2694	2699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478507
54	NC_005813	GGAT	2	8	2772	2779	25 %	25 %	50 %	0 %	45478507
55	NC_005813	AGC	2	6	2896	2901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478507
56	NC_005813	G	6	6	2937	2942	0 %	0 %	100 %	0 %	45478507
57	NC_005813	GGT	2	6	2950	2955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478507
58	NC_005813	ACTG	2	8	2999	3006	25 %	25 %	25 %	25 %	45478507
59	NC_005813	TCG	2	6	3011	3016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478507
60	NC_005813	AAC	2	6	3239	3244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478508
61	NC_005813	A	6	6	3262	3267	100 %	0 %	0 %	0 %	45478508
62	NC_005813	TTCA	2	8	3292	3299	25 %	50 %	0 %	25 %	45478508
63	NC_005813	CAGA	2	8	3352	3359	50 %	0 %	25 %	25 %	45478508
64	NC_005813	AG	3	6	3380	3385	50 %	0 %	50 %	0 %	45478508
65	NC_005813	ACC	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45478509
66	NC_005813	CA	3	6	3746	3751	50 %	0 %	0 %	50 %	45478510
67	NC_005813	CGC	2	6	3790	3795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478510
68	NC_005813	A	7	7	3804	3810	100 %	0 %	0 %	0 %	45478510
69	NC_005813	CG	3	6	3890	3895	0 %	0 %	50 %	50 %	45478510
70	NC_005813	GCC	2	6	3920	3925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478510
71	NC_005813	TAC	2	6	3928	3933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478510
72	NC_005813	TGCGC	2	10	4088	4097	0 %	20 %	40 %	40 %	45478510
73	NC_005813	TACC	2	8	4121	4128	25 %	25 %	0 %	50 %	45478510
74	NC_005813	GCA	2	6	4227	4232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478510
75	NC_005813	AAC	2	6	4276	4281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478510
76	NC_005813	GATG	2	8	4298	4305	25 %	25 %	50 %	0 %	45478510
77	NC_005813	GC	3	6	4395	4400	0 %	0 %	50 %	50 %	45478510
78	NC_005813	AGCG	2	8	5617	5624	25 %	0 %	50 %	25 %	45478511
79	NC_005813	GCC	2	6	6098	6103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478512
80	NC_005813	CAA	2	6	6115	6120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478512
81	NC_005813	AACA	2	8	6153	6160	75 %	0 %	0 %	25 %	45478512
82	NC_005813	TG	3	6	6744	6749	0 %	50 %	50 %	0 %	45478513
83	NC_005813	ACC	2	6	6756	6761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45478513
84	NC_005813	TG	3	6	6832	6837	0 %	50 %	50 %	0 %	45478513
85	NC_005813	TTA	2	6	6862	6867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478513
86	NC_005813	TGA	2	6	6878	6883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478513
87	NC_005813	GC	3	6	6939	6944	0 %	0 %	50 %	50 %	45478513
88	NC_005813	T	7	7	6961	6967	0 %	100 %	0 %	0 %	45478513
89	NC_005813	GAA	2	6	7020	7025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478513
90	NC_005813	TC	3	6	7053	7058	0 %	50 %	0 %	50 %	45478513
91	NC_005813	CAG	2	6	7132	7137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478513
92	NC_005813	CAG	2	6	7143	7148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478513
93	NC_005813	GGA	2	6	7312	7317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45478514
94	NC_005813	TC	3	6	7375	7380	0 %	50 %	0 %	50 %	45478514
95	NC_005813	AC	3	6	7451	7456	50 %	0 %	0 %	50 %	45478514
96	NC_005813	AGCCA	2	10	7530	7539	40 %	0 %	20 %	40 %	45478514
97	NC_005813	AGC	2	6	7673	7678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478514
98	NC_005813	CATGG	2	10	7792	7801	20 %	20 %	40 %	20 %	45478514
99	NC_005813	AGG	2	6	7826	7831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45478514
100	NC_005813	GATG	2	8	7842	7849	25 %	25 %	50 %	0 %	45478514
101	NC_005813	GTT	2	6	7865	7870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478514
102	NC_005813	AC	3	6	7874	7879	50 %	0 %	0 %	50 %	45478514
103	NC_005813	GTA	2	6	7999	8004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478514
104	NC_005813	GTT	2	6	8059	8064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478514
105	NC_005813	AAC	2	6	8096	8101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478514
106	NC_005813	ATCCA	2	10	8303	8312	40 %	20 %	0 %	40 %	45478514
107	NC_005813	TCA	2	6	8354	8359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478514
108	NC_005813	CGA	2	6	8442	8447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478514
109	NC_005813	AAG	2	6	8530	8535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478514
110	NC_005813	GCA	2	6	8578	8583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478514
111	NC_005813	G	8	8	8601	8608	0 %	0 %	100 %	0 %	45478514
112	NC_005813	TGG	2	6	8633	8638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478514
113	NC_005813	G	6	6	8661	8666	0 %	0 %	100 %	0 %	45478514
114	NC_005813	ATC	2	6	8789	8794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478514
115	NC_005813	ATCG	2	8	8811	8818	25 %	25 %	25 %	25 %	45478514
116	NC_005813	AC	3	6	8860	8865	50 %	0 %	0 %	50 %	45478514
117	NC_005813	GC	3	6	8892	8897	0 %	0 %	50 %	50 %	45478514
118	NC_005813	GCA	2	6	9018	9023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478514
119	NC_005813	CAG	4	12	9037	9048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478514
120	NC_005813	GAT	2	6	9192	9197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478514
121	NC_005813	GGC	2	6	9198	9203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45478514
122	NC_005813	AGG	2	6	9224	9229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45478514
123	NC_005813	TGA	2	6	9243	9248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478514
124	NC_005813	ACT	2	6	9279	9284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478514
125	NC_005813	AG	3	6	9332	9337	50 %	0 %	50 %	0 %	45478514
126	NC_005813	GAC	2	6	9354	9359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478514
127	NC_005813	AAAT	2	8	9817	9824	75 %	25 %	0 %	0 %	45478515
128	NC_005813	AT	3	6	9910	9915	50 %	50 %	0 %	0 %	45478515
129	NC_005813	GGAT	2	8	9917	9924	25 %	25 %	50 %	0 %	45478515
130	NC_005813	ATT	2	6	9940	9945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478515
131	NC_005813	AATA	2	8	9993	10000	75 %	25 %	0 %	0 %	45478515
132	NC_005813	AATCTT	2	12	10011	10022	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	45478515
133	NC_005813	A	6	6	10055	10060	100 %	0 %	0 %	0 %	45478515
134	NC_005813	TGG	2	6	10276	10281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478515
135	NC_005813	A	7	7	10337	10343	100 %	0 %	0 %	0 %	45478515
136	NC_005813	GA	4	8	10353	10360	50 %	0 %	50 %	0 %	45478515
137	NC_005813	ATA	2	6	10384	10389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45478515
138	NC_005813	A	6	6	10482	10487	100 %	0 %	0 %	0 %	45478515
139	NC_005813	TGT	2	6	10532	10537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478515
140	NC_005813	A	8	8	10542	10549	100 %	0 %	0 %	0 %	45478515
141	NC_005813	TGA	2	6	11269	11274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478516
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143	NC_005813	GCC	2	6	11342	11347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478516
144	NC_005813	TCTG	2	8	11542	11549	0 %	50 %	25 %	25 %	45478516
145	NC_005813	CAT	2	6	11606	11611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478516
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147	NC_005813	CGTG	2	8	11761	11768	0 %	25 %	50 %	25 %	45478516
148	NC_005813	GTT	2	6	11881	11886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478517
149	NC_005813	CTG	2	6	11933	11938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478517
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156	NC_005813	TGT	2	6	12541	12546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478518
157	NC_005813	AAG	2	6	12555	12560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478518
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159	NC_005813	AAG	2	6	12616	12621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45478518
160	NC_005813	ATC	2	6	12739	12744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478518
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163	NC_005813	GC	4	8	12923	12930	0 %	0 %	50 %	50 %	45478518
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174	NC_005813	ATT	2	6	13738	13743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478518
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182	NC_005813	CAG	2	6	14676	14681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478520
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220	NC_005813	AGTG	2	8	17267	17274	25 %	25 %	50 %	0 %	45478524
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255	NC_005813	TGC	2	6	19083	19088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45478527
256	NC_005813	CATTC	2	10	19258	19267	20 %	40 %	0 %	40 %	45478528
257	NC_005813	ATTT	2	8	19392	19399	25 %	75 %	0 %	0 %	45478528
258	NC_005813	TTG	2	6	19402	19407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478528
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261	NC_005813	GCAAT	2	10	19499	19508	40 %	20 %	20 %	20 %	45478528
262	NC_005813	CTT	2	6	19512	19517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45478528
263	NC_005813	TTA	2	6	19671	19676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478529
264	NC_005813	TGT	2	6	19683	19688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478529
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269	NC_005813	ATTT	2	8	19848	19855	25 %	75 %	0 %	0 %	45478529
270	NC_005813	AAT	2	6	19877	19882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45478530
271	NC_005813	TC	3	6	19911	19916	0 %	50 %	0 %	50 %	45478530
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273	NC_005813	CAT	2	6	19952	19957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478530
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380	NC_005813	G	7	7	25224	25230	0 %	0 %	100 %	0 %	45478536
381	NC_005813	AGAAA	2	10	25248	25257	80 %	0 %	20 %	0 %	45478536
382	NC_005813	TGA	2	6	25258	25263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478536
383	NC_005813	TAT	2	6	25856	25861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45478537
384	NC_005813	TGT	2	6	25874	25879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45478537
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387	NC_005813	GTG	2	6	26085	26090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45478537
388	NC_005813	ACC	2	6	26141	26146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45478537
389	NC_005813	TGA	2	6	26149	26154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45478537
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391	NC_005813	GAC	2	6	26205	26210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45478537
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393	NC_005813	AT	3	6	26291	26296	50 %	50 %	0 %	0 %	45478537
394	NC_005813	AAC	2	6	26479	26484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45478537
395	NC_005813	GATT	2	8	26553	26560	25 %	50 %	25 %	0 %	45478537
396	NC_005813	T	7	7	26559	26565	0 %	100 %	0 %	0 %	45478537
397	NC_005813	CAC	2	6	26586	26591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45478537
398	NC_005813	GCC	2	6	26639	26644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45478537
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