MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Yersinia pestis KIM plasmid pMT-1

Total Repeats: 1605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004838	ACC	2	6	95737	95742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795439
1502	NC_004838	GGC	2	6	95783	95788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795439
1503	NC_004838	GAA	2	6	95801	95806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795439
1504	NC_004838	TCG	2	6	95810	95815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795439
1505	NC_004838	GCCC	2	8	95835	95842	0 %	0 %	25 %	75 %	31795439
1506	NC_004838	GGAT	2	8	95855	95862	25 %	25 %	50 %	0 %	31795439
1507	NC_004838	GAC	2	6	95913	95918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795439
1508	NC_004838	GAA	2	6	95927	95932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795439
1509	NC_004838	AAG	2	6	95938	95943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795439
1510	NC_004838	ATG	2	6	95976	95981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795439
1511	NC_004838	GAC	2	6	96027	96032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795439
1512	NC_004838	TC	3	6	96049	96054	0 %	50 %	0 %	50 %	31795439
1513	NC_004838	CTG	2	6	96090	96095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795439
1514	NC_004838	TGGCGA	2	12	96098	96109	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	31795439
1515	NC_004838	CAAGCA	2	12	96164	96175	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	31795439
1516	NC_004838	CG	3	6	96222	96227	0 %	0 %	50 %	50 %	31795439
1517	NC_004838	ACA	2	6	96265	96270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795439
1518	NC_004838	TGG	2	6	96296	96301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795439
1519	NC_004838	GCT	2	6	96311	96316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795439
1520	NC_004838	ACG	2	6	96358	96363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795439
1521	NC_004838	TCA	2	6	96373	96378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795439
1522	NC_004838	CAA	2	6	96404	96409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795439
1523	NC_004838	ATG	2	6	96474	96479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795439
1524	NC_004838	TGA	2	6	96481	96486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795439
1525	NC_004838	CCCA	2	8	96506	96513	25 %	0 %	0 %	75 %	31795439
1526	NC_004838	CTG	2	6	96635	96640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795439
1527	NC_004838	CAT	2	6	96652	96657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795440
1528	NC_004838	TCT	2	6	96702	96707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795440
1529	NC_004838	TGG	2	6	96726	96731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795440
1530	NC_004838	GCT	2	6	96752	96757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795440
1531	NC_004838	ATC	2	6	96812	96817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795440
1532	NC_004838	ACG	2	6	96843	96848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795440
1533	NC_004838	GCACTG	2	12	96928	96939	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	31795441
1534	NC_004838	GCA	2	6	96959	96964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795441
1535	NC_004838	ACG	2	6	97040	97045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795441
1536	NC_004838	CCA	2	6	97084	97089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795441
1537	NC_004838	CGA	2	6	97218	97223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795441
1538	NC_004838	GAC	2	6	97225	97230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795441
1539	NC_004838	CGA	2	6	97308	97313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795441
1540	NC_004838	CT	3	6	97356	97361	0 %	50 %	0 %	50 %	31795441
1541	NC_004838	ACA	2	6	97451	97456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795441
1542	NC_004838	GC	4	8	97465	97472	0 %	0 %	50 %	50 %	31795441
1543	NC_004838	TCT	2	6	97532	97537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795441
1544	NC_004838	GCG	2	6	97595	97600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795441
1545	NC_004838	AGA	2	6	97667	97672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795441
1546	NC_004838	GAA	2	6	97804	97809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795441
1547	NC_004838	TCG	2	6	97877	97882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795441
1548	NC_004838	ATC	2	6	97912	97917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795441
1549	NC_004838	GCA	2	6	97918	97923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795441
1550	NC_004838	GCGA	2	8	97944	97951	25 %	0 %	50 %	25 %	31795441
1551	NC_004838	GTC	2	6	97956	97961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795441
1552	NC_004838	CAG	2	6	97964	97969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795441
1553	NC_004838	AGA	2	6	97974	97979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795441
1554	NC_004838	GGT	2	6	98109	98114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39980780
1555	NC_004838	CTT	2	6	98178	98183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39980780
1556	NC_004838	ACTC	2	8	98249	98256	25 %	25 %	0 %	50 %	39980780
1557	NC_004838	AAGT	2	8	98272	98279	50 %	25 %	25 %	0 %	39980780
1558	NC_004838	GAA	2	6	98283	98288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795442
1559	NC_004838	GCT	2	6	98311	98316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795442
1560	NC_004838	CAA	2	6	98571	98576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795442
1561	NC_004838	GAC	2	6	98614	98619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795442
1562	NC_004838	AGA	2	6	98642	98647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795442
1563	NC_004838	GGTA	2	8	98763	98770	25 %	25 %	50 %	0 %	31795442
1564	NC_004838	TTA	2	6	98777	98782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31795442
1565	NC_004838	TGGG	2	8	98791	98798	0 %	25 %	75 %	0 %	31795442
1566	NC_004838	CAG	2	6	98875	98880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795442
1567	NC_004838	AGC	2	6	98888	98893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795442
1568	NC_004838	TGC	2	6	98912	98917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795442
1569	NC_004838	CAA	2	6	99039	99044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795442
1570	NC_004838	CAA	2	6	99432	99437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795443
1571	NC_004838	CAT	2	6	99456	99461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795443
1572	NC_004838	CAT	2	6	99480	99485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795443
1573	NC_004838	CCAG	2	8	99487	99494	25 %	0 %	25 %	50 %	31795443
1574	NC_004838	TGG	2	6	99527	99532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795443
1575	NC_004838	AACCCT	2	12	99562	99573	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	31795443
1576	NC_004838	A	6	6	99613	99618	100 %	0 %	0 %	0 %	31795443
1577	NC_004838	A	6	6	99623	99628	100 %	0 %	0 %	0 %	31795443
1578	NC_004838	CGCTG	2	10	99646	99655	0 %	20 %	40 %	40 %	31795444
1579	NC_004838	AGA	2	6	99754	99759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795444
1580	NC_004838	TCA	2	6	99780	99785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795444
1581	NC_004838	TGC	2	6	99834	99839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795444
1582	NC_004838	AGG	2	6	99852	99857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31795444
1583	NC_004838	TGA	2	6	99877	99882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795444
1584	NC_004838	CGC	2	6	99901	99906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795444
1585	NC_004838	GTC	2	6	99959	99964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795444
1586	NC_004838	CCA	2	6	100019	100024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795444
1587	NC_004838	TCA	2	6	100119	100124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795445
1588	NC_004838	GTT	2	6	100148	100153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795445
1589	NC_004838	GAA	2	6	100182	100187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795445
1590	NC_004838	GAT	2	6	100254	100259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795445
1591	NC_004838	TTG	2	6	100268	100273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795445
1592	NC_004838	GTT	2	6	100285	100290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795445
1593	NC_004838	GAC	2	6	100299	100304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795445
1594	NC_004838	ACG	2	6	100305	100310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795445
1595	NC_004838	GCT	2	6	100329	100334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795445
1596	NC_004838	GAT	2	6	100521	100526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39980781
1597	NC_004838	GAA	2	6	100592	100597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39980781
1598	NC_004838	AC	3	6	100642	100647	50 %	0 %	0 %	50 %	31795446
1599	NC_004838	ACG	2	6	100687	100692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795446
1600	NC_004838	CGT	2	6	100703	100708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795446
1601	NC_004838	GAT	2	6	100727	100732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795446
1602	NC_004838	GCG	2	6	100741	100746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795446
1603	NC_004838	GAT	2	6	100767	100772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795446
1604	NC_004838	GAA	2	6	100880	100885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795446
1605	NC_004838	AGG	2	6	100912	100917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31795446

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