MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis KIM 10 chromosome

Total Repeats: 73018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004088	CTG	2	6	56	61	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123923
2	NC_004088	TTG	2	6	138	143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22123923
3	NC_004088	AACC	2	8	194	201	50 %	0 %	0 %	50 %	22123923
4	NC_004088	TGT	2	6	235	240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22123923
5	NC_004088	TAA	2	6	252	257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22123923
6	NC_004088	CTT	2	6	377	382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22123923
7	NC_004088	TCA	2	6	618	623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22123924
8	NC_004088	TTG	2	6	636	641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22123924
9	NC_004088	CTG	2	6	650	655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123924
10	NC_004088	TAA	2	6	685	690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22123924
11	NC_004088	GTG	2	6	708	713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123924
12	NC_004088	CTT	2	6	730	735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22123924
13	NC_004088	T	6	6	749	754	0 %	100 %	0 %	0 %	22123924
14	NC_004088	AGC	2	6	802	807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22123924
15	NC_004088	CGT	2	6	811	816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123924
16	NC_004088	GTT	2	6	823	828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22123924
17	NC_004088	GTGC	2	8	945	952	0 %	25 %	50 %	25 %	22123924
18	NC_004088	TGC	2	6	976	981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123924
19	NC_004088	A	6	6	1188	1193	100 %	0 %	0 %	0 %	22123925
20	NC_004088	ACA	3	9	1208	1216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22123925
21	NC_004088	CAA	2	6	1257	1262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22123925
22	NC_004088	CATT	2	8	1395	1402	25 %	50 %	0 %	25 %	22123925
23	NC_004088	ATTC	2	8	1509	1516	25 %	50 %	0 %	25 %	22123925
24	NC_004088	GCG	2	6	1629	1634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22123925
25	NC_004088	TGG	2	6	1787	1792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123925
26	NC_004088	ATG	2	6	1816	1821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123925
27	NC_004088	ATG	2	6	1837	1842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123925
28	NC_004088	ATT	2	6	1890	1895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22123925
29	NC_004088	TCT	2	6	1932	1937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22123925
30	NC_004088	ATCA	2	8	2020	2027	50 %	25 %	0 %	25 %	22123925
31	NC_004088	TGC	2	6	2095	2100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123925
32	NC_004088	ACA	2	6	2105	2110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22123925
33	NC_004088	CTG	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123925
34	NC_004088	GCG	2	6	2288	2293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22123926
35	NC_004088	TGG	2	6	2400	2405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123926
36	NC_004088	CTG	3	9	2408	2416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123926
37	NC_004088	TTTA	2	8	2513	2520	25 %	75 %	0 %	0 %	22123926
38	NC_004088	GCC	2	6	2538	2543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22123926
39	NC_004088	ACC	2	6	2552	2557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22123926
40	NC_004088	GTTG	2	8	2566	2573	0 %	50 %	50 %	0 %	22123926
41	NC_004088	ATT	2	6	2625	2630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22123926
42	NC_004088	ATG	2	6	2646	2651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123926
43	NC_004088	GCG	2	6	2657	2662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22123926
44	NC_004088	TCA	2	6	2781	2786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22123926
45	NC_004088	T	6	6	2818	2823	0 %	100 %	0 %	0 %	22123926
46	NC_004088	GCG	2	6	2876	2881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22123926
47	NC_004088	ACTC	2	8	2899	2906	25 %	25 %	0 %	50 %	22123926
48	NC_004088	AAT	2	6	2934	2939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22123926
49	NC_004088	TGA	2	6	2958	2963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123926
50	NC_004088	CCT	2	6	2974	2979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22123926
51	NC_004088	CTGG	2	8	2992	2999	0 %	25 %	50 %	25 %	22123926
52	NC_004088	GCA	2	6	3127	3132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22123926
53	NC_004088	TGG	2	6	3202	3207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123926
54	NC_004088	CAC	2	6	3226	3231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22123926
55	NC_004088	AAC	2	6	3285	3290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22123926
56	NC_004088	TGA	3	9	3291	3299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123926
57	NC_004088	T	6	6	3378	3383	0 %	100 %	0 %	0 %	22123926
58	NC_004088	TCC	2	6	3492	3497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22123926
59	NC_004088	ATTC	2	8	3523	3530	25 %	50 %	0 %	25 %	22123926
60	NC_004088	GTT	2	6	3565	3570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22123926
61	NC_004088	A	8	8	3635	3642	100 %	0 %	0 %	0 %	22123926
62	NC_004088	TGC	2	6	3656	3661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123926
63	NC_004088	ACC	2	6	3672	3677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22123926
64	NC_004088	CAG	2	6	3710	3715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22123926
65	NC_004088	TGT	2	6	3765	3770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22123927
66	NC_004088	GTT	2	6	3781	3786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22123927
67	NC_004088	TTG	2	6	3797	3802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22123927
68	NC_004088	TTG	2	6	3812	3817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22123927
69	NC_004088	CCA	2	6	3832	3837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22123927
70	NC_004088	GCCA	2	8	3864	3871	25 %	0 %	25 %	50 %	22123927
71	NC_004088	GAT	2	6	3873	3878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123927
72	NC_004088	TAAA	2	8	3883	3890	75 %	25 %	0 %	0 %	22123927
73	NC_004088	GTT	2	6	3919	3924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22123927
74	NC_004088	CAG	3	9	3956	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22123927
75	NC_004088	TGG	2	6	3968	3973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123927
76	NC_004088	TGGC	2	8	4013	4020	0 %	25 %	50 %	25 %	22123927
77	NC_004088	ATC	2	6	4052	4057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22123927
78	NC_004088	GAT	2	6	4162	4167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123927
79	NC_004088	CTGT	2	8	4221	4228	0 %	50 %	25 %	25 %	22123927
80	NC_004088	AGTG	2	8	4289	4296	25 %	25 %	50 %	0 %	22123927
81	NC_004088	TGG	2	6	4299	4304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123927
82	NC_004088	TGC	2	6	4311	4316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123927
83	NC_004088	TAA	2	6	4361	4366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22123927
84	NC_004088	CAA	2	6	4394	4399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22123927
85	NC_004088	TCA	2	6	4488	4493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22123927
86	NC_004088	GAA	2	6	4502	4507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22123927
87	NC_004088	GTA	2	6	4519	4524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123927
88	NC_004088	CTT	2	6	4535	4540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22123927
89	NC_004088	GCG	2	6	4544	4549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22123927
90	NC_004088	TCAA	2	8	4641	4648	50 %	25 %	0 %	25 %	22123927
91	NC_004088	TGG	2	6	4659	4664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123927
92	NC_004088	TTC	2	6	4667	4672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22123927
93	NC_004088	CTG	2	6	4722	4727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123927
94	NC_004088	CAG	2	6	4730	4735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22123927
95	NC_004088	GCT	2	6	4811	4816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123927
96	NC_004088	CTT	3	9	5017	5025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22123927
97	NC_004088	TCA	2	6	5080	5085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22123927
98	NC_004088	GCG	2	6	5126	5131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22123927
99	NC_004088	GGA	2	6	5157	5162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22123927
100	NC_004088	TGC	2	6	5192	5197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123927
101	NC_004088	TTCT	2	8	5269	5276	0 %	75 %	0 %	25 %	22123927
102	NC_004088	GAT	2	6	5286	5291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123927
103	NC_004088	GA	3	6	5668	5673	50 %	0 %	50 %	0 %	22123928
104	NC_004088	T	6	6	5725	5730	0 %	100 %	0 %	0 %	22123928
105	NC_004088	GTC	2	6	5759	5764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123928
106	NC_004088	AGG	2	6	5812	5817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22123928
107	NC_004088	TGG	2	6	5877	5882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123928
108	NC_004088	TGG	2	6	5896	5901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123928
109	NC_004088	CTT	2	6	5905	5910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22123928
110	NC_004088	CGC	2	6	5974	5979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22123928
111	NC_004088	TAT	2	6	6133	6138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22123928
112	NC_004088	T	6	6	6188	6193	0 %	100 %	0 %	0 %	22123928
113	NC_004088	T	6	6	6215	6220	0 %	100 %	0 %	0 %	22123928
114	NC_004088	CGT	2	6	6330	6335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123928
115	NC_004088	ATT	2	6	6345	6350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22123928
116	NC_004088	TTA	2	6	6365	6370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22123928
117	NC_004088	CTT	2	6	6400	6405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22123928
118	NC_004088	ACC	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22123928
119	NC_004088	ATT	2	6	6548	6553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22123928
120	NC_004088	AT	4	8	6581	6588	50 %	50 %	0 %	0 %	22123928
121	NC_004088	GGT	2	6	6619	6624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123928
122	NC_004088	GGC	3	9	6661	6669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22123928
123	NC_004088	TCG	2	6	6759	6764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123928
124	NC_004088	TTG	2	6	6782	6787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22123928
125	NC_004088	ATT	2	6	6826	6831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22123928
126	NC_004088	GTTG	2	8	6840	6847	0 %	50 %	50 %	0 %	22123928
127	NC_004088	TAT	3	9	6874	6882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22123928
128	NC_004088	ACC	2	6	6884	6889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22123928
129	NC_004088	GAT	2	6	6952	6957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123928
130	NC_004088	CGG	2	6	6999	7004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22123928
131	NC_004088	AATG	2	8	7021	7028	50 %	25 %	25 %	0 %	22123928
132	NC_004088	ATT	2	6	7042	7047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22123928
133	NC_004088	GTGTT	2	10	7083	7092	0 %	60 %	40 %	0 %	22123928
134	NC_004088	GGT	2	6	7177	7182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22123928
135	NC_004088	GAT	2	6	7261	7266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22123928
136	NC_004088	CGT	2	6	7272	7277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22123928
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138	NC_004088	CCCA	2	8	7396	7403	25 %	0 %	0 %	75 %	22123928
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264	NC_004088	TA	3	6	20332	20337	50 %	50 %	0 %	0 %	22123937
265	NC_004088	ACC	2	6	20351	20356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22123937
266	NC_004088	CAGT	2	8	20380	20387	25 %	25 %	25 %	25 %	22123937
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268	NC_004088	G	6	6	20466	20471	0 %	0 %	100 %	0 %	22123937
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272	NC_004088	GGA	2	6	20820	20825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22123937
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