MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis KIM 10 chromosome

Total Repeats: 73018

< Previous12...3233343536373839404142...146147Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_004088	CTGAA	2	10	1151588	1151597	40 %	20 %	20 %	20 %	161484848
18002	NC_004088	CAA	2	6	1151662	1151667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161484848
18003	NC_004088	CA	3	6	1151675	1151680	50 %	0 %	0 %	50 %	161484848
18004	NC_004088	AAT	2	6	1151698	1151703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161484848
18005	NC_004088	TCG	2	6	1151759	1151764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484848
18006	NC_004088	GGC	3	9	1151824	1151832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161484848
18007	NC_004088	AATA	2	8	1151840	1151847	75 %	25 %	0 %	0 %	161484848
18008	NC_004088	GCCA	2	8	1151856	1151863	25 %	0 %	25 %	50 %	161484848
18009	NC_004088	AACC	2	8	1151876	1151883	50 %	0 %	0 %	50 %	161484848
18010	NC_004088	CAG	2	6	1151913	1151918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161484848
18011	NC_004088	AG	3	6	1151917	1151922	50 %	0 %	50 %	0 %	161484848
18012	NC_004088	TG	3	6	1151942	1151947	0 %	50 %	50 %	0 %	161484848
18013	NC_004088	GCT	2	6	1151993	1151998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484848
18014	NC_004088	AT	3	6	1152051	1152056	50 %	50 %	0 %	0 %	161484848
18015	NC_004088	GCC	2	6	1152160	1152165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161484848
18016	NC_004088	AG	3	6	1152168	1152173	50 %	0 %	50 %	0 %	161484848
18017	NC_004088	AAT	2	6	1152178	1152183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161484848
18018	NC_004088	AGC	2	6	1152311	1152316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161484848
18019	NC_004088	ATT	2	6	1152331	1152336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161484848
18020	NC_004088	A	7	7	1152343	1152349	100 %	0 %	0 %	0 %	161484848
18021	NC_004088	TGG	2	6	1152388	1152393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161484848
18022	NC_004088	GCCA	2	8	1152480	1152487	25 %	0 %	25 %	50 %	161484848
18023	NC_004088	GCC	2	6	1152563	1152568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161484848
18024	NC_004088	AGT	2	6	1152586	1152591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161484848
18025	NC_004088	GCCA	2	8	1152668	1152675	25 %	0 %	25 %	50 %	161484848
18026	NC_004088	AAT	2	6	1152721	1152726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161484848
18027	NC_004088	AACC	2	8	1152749	1152756	50 %	0 %	0 %	50 %	161484848
18028	NC_004088	AAGG	2	8	1152918	1152925	50 %	0 %	50 %	0 %	161484848
18029	NC_004088	AGA	2	6	1152947	1152952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161484848
18030	NC_004088	ATA	2	6	1152998	1153003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161484848
18031	NC_004088	TGA	2	6	1153134	1153139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124931
18032	NC_004088	ACT	2	6	1153141	1153146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124931
18033	NC_004088	T	6	6	1153212	1153217	0 %	100 %	0 %	0 %	22124931
18034	NC_004088	CG	3	6	1153255	1153260	0 %	0 %	50 %	50 %	22124931
18035	NC_004088	T	6	6	1153265	1153270	0 %	100 %	0 %	0 %	22124931
18036	NC_004088	TTG	2	6	1153277	1153282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124931
18037	NC_004088	TGT	2	6	1153329	1153334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124931
18038	NC_004088	CCT	2	6	1153449	1153454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22124931
18039	NC_004088	CAGCG	2	10	1153522	1153531	20 %	0 %	40 %	40 %	22124931
18040	NC_004088	GAA	2	6	1154068	1154073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124932
18041	NC_004088	ATC	2	6	1154099	1154104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124932
18042	NC_004088	TGCC	2	8	1154138	1154145	0 %	25 %	25 %	50 %	22124932
18043	NC_004088	GCTG	2	8	1154235	1154242	0 %	25 %	50 %	25 %	22124932
18044	NC_004088	GCAG	2	8	1154251	1154258	25 %	0 %	50 %	25 %	22124932
18045	NC_004088	GTG	2	6	1154342	1154347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124932
18046	NC_004088	GCC	2	6	1154815	1154820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124933
18047	NC_004088	TGC	2	6	1154837	1154842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124933
18048	NC_004088	ATC	2	6	1155015	1155020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124933
18049	NC_004088	A	6	6	1155025	1155030	100 %	0 %	0 %	0 %	22124933
18050	NC_004088	GC	3	6	1155043	1155048	0 %	0 %	50 %	50 %	22124933
18051	NC_004088	GTT	2	6	1155165	1155170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124933
18052	NC_004088	ACG	2	6	1155178	1155183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124933
18053	NC_004088	CAA	2	6	1155219	1155224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124933
18054	NC_004088	GAAA	2	8	1155233	1155240	75 %	0 %	25 %	0 %	22124933
18055	NC_004088	GCA	2	6	1155249	1155254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124933
18056	NC_004088	CG	3	6	1155267	1155272	0 %	0 %	50 %	50 %	22124933
18057	NC_004088	GAA	2	6	1155303	1155308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124933
18058	NC_004088	GAA	2	6	1155375	1155380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124933
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18060	NC_004088	AGA	2	6	1155434	1155439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124933
18061	NC_004088	GAA	2	6	1155491	1155496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124933
18062	NC_004088	ACTG	2	8	1155521	1155528	25 %	25 %	25 %	25 %	22124933
18063	NC_004088	CGT	2	6	1155723	1155728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124933
18064	NC_004088	TGG	2	6	1155746	1155751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124933
18065	NC_004088	GCT	2	6	1155765	1155770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124933
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18067	NC_004088	GTT	2	6	1155816	1155821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124933
18068	NC_004088	CTG	2	6	1155825	1155830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124933
18069	NC_004088	CAGC	2	8	1155845	1155852	25 %	0 %	25 %	50 %	22124933
18070	NC_004088	GAA	2	6	1155894	1155899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124933
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18072	NC_004088	TGA	2	6	1155961	1155966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124933
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18074	NC_004088	GCAG	2	8	1155995	1156002	25 %	0 %	50 %	25 %	22124933
18075	NC_004088	GCT	2	6	1156010	1156015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124933
18076	NC_004088	TGA	2	6	1156060	1156065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124933
18077	NC_004088	TCT	2	6	1156644	1156649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124934
18078	NC_004088	CAGGT	2	10	1156683	1156692	20 %	20 %	40 %	20 %	22124934
18079	NC_004088	CACAG	2	10	1156717	1156726	40 %	0 %	20 %	40 %	22124934
18080	NC_004088	TGA	2	6	1156944	1156949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124934
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18082	NC_004088	TC	3	6	1157066	1157071	0 %	50 %	0 %	50 %	22124934
18083	NC_004088	GAA	2	6	1157072	1157077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124934
18084	NC_004088	AG	4	8	1157080	1157087	50 %	0 %	50 %	0 %	22124934
18085	NC_004088	CAG	2	6	1157112	1157117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124934
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18087	NC_004088	TGA	2	6	1157374	1157379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124935
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18089	NC_004088	ATT	2	6	1157514	1157519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124935
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18094	NC_004088	CTGA	2	8	1157817	1157824	25 %	25 %	25 %	25 %	22124935
18095	NC_004088	CAT	2	6	1157855	1157860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124935
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18111	NC_004088	TGG	2	6	1158897	1158902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124936
18112	NC_004088	TTG	2	6	1158930	1158935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124936
18113	NC_004088	AGAA	2	8	1159005	1159012	75 %	0 %	25 %	0 %	22124936
18114	NC_004088	CGAC	2	8	1159017	1159024	25 %	0 %	25 %	50 %	22124936
18115	NC_004088	GTTG	2	8	1159111	1159118	0 %	50 %	50 %	0 %	22124936
18116	NC_004088	CAC	2	6	1159141	1159146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124936
18117	NC_004088	TGC	2	6	1159171	1159176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124936
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18119	NC_004088	AAG	2	6	1159221	1159226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124936
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18238	NC_004088	TGC	2	6	1167122	1167127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124942
18239	NC_004088	CAGC	2	8	1167222	1167229	25 %	0 %	25 %	50 %	22124942
18240	NC_004088	AAT	2	6	1167243	1167248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124942
18241	NC_004088	GC	3	6	1167338	1167343	0 %	0 %	50 %	50 %	22124942
18242	NC_004088	AAT	2	6	1167362	1167367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124942
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18246	NC_004088	GTA	2	6	1167589	1167594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124942
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18249	NC_004088	TGA	2	6	1167701	1167706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124942
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18355	NC_004088	ATC	2	6	1174267	1174272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229013131
18356	NC_004088	GCT	2	6	1174277	1174282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229013131
18357	NC_004088	TTA	2	6	1174298	1174303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229013131
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18359	NC_004088	GTG	2	6	1174846	1174851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124948
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18362	NC_004088	ATCGCC	2	12	1175017	1175028	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	22124948
18363	NC_004088	GAT	2	6	1175029	1175034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124948
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18379	NC_004088	GTG	2	6	1175773	1175778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124949
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18382	NC_004088	CGT	2	6	1175979	1175984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124949
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18384	NC_004088	GCA	2	6	1176100	1176105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124949
18385	NC_004088	TGGT	2	8	1176143	1176150	0 %	50 %	50 %	0 %	22124949
18386	NC_004088	G	6	6	1176167	1176172	0 %	0 %	100 %	0 %	22124949
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18473	NC_004088	AAG	2	6	1184039	1184044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124956
18474	NC_004088	CA	3	6	1184094	1184099	50 %	0 %	0 %	50 %	22124956
18475	NC_004088	CCA	2	6	1184121	1184126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124956
18476	NC_004088	A	6	6	1184198	1184203	100 %	0 %	0 %	0 %	22124956
18477	NC_004088	CCAA	2	8	1184243	1184250	50 %	0 %	0 %	50 %	22124956
18478	NC_004088	T	6	6	1184275	1184280	0 %	100 %	0 %	0 %	22124956
18479	NC_004088	CTT	2	6	1184286	1184291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124956
18480	NC_004088	GGT	2	6	1184294	1184299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124956
18481	NC_004088	CTC	2	6	1184305	1184310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22124956
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18487	NC_004088	TGAT	2	8	1184871	1184878	25 %	50 %	25 %	0 %	22124956
18488	NC_004088	TGG	2	6	1184902	1184907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124956
18489	NC_004088	C	7	7	1184911	1184917	0 %	0 %	0 %	100 %	22124956
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18491	NC_004088	TCCA	2	8	1185008	1185015	25 %	25 %	0 %	50 %	22124956
18492	NC_004088	AAC	2	6	1185041	1185046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124956
18493	NC_004088	CTG	2	6	1185121	1185126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124956
18494	NC_004088	CTA	2	6	1185170	1185175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124956
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18496	NC_004088	CTT	2	6	1185210	1185215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124956
18497	NC_004088	GCA	2	6	1185219	1185224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124956
18498	NC_004088	ACCTGA	2	12	1185254	1185265	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	22124956
18499	NC_004088	GTCAAC	2	12	1185296	1185307	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	22124956
18500	NC_004088	GGA	2	6	1185319	1185324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22124956

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