MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis KIM 10 chromosome

Total Repeats: 73018

< Previous12...2425262728293031323334...146147Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_004088	GGTCA	2	10	889364	889373	20 %	20 %	40 %	20 %	22124708
14002	NC_004088	GATG	2	8	889378	889385	25 %	25 %	50 %	0 %	22124708
14003	NC_004088	AGATC	2	10	889441	889450	40 %	20 %	20 %	20 %	22124708
14004	NC_004088	GTG	2	6	889572	889577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124708
14005	NC_004088	CTT	2	6	889680	889685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124708
14006	NC_004088	GCA	2	6	889705	889710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124708
14007	NC_004088	CT	4	8	889735	889742	0 %	50 %	0 %	50 %	22124708
14008	NC_004088	GGC	2	6	889768	889773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124708
14009	NC_004088	CAAC	2	8	889785	889792	50 %	0 %	0 %	50 %	22124708
14010	NC_004088	AAG	2	6	889830	889835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124708
14011	NC_004088	GCG	2	6	889893	889898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124708
14012	NC_004088	CGC	2	6	889913	889918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124708
14013	NC_004088	CGG	2	6	889992	889997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124708
14014	NC_004088	GAT	2	6	890111	890116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124708
14015	NC_004088	TTA	2	6	890549	890554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124709
14016	NC_004088	TCA	2	6	890650	890655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124709
14017	NC_004088	ACC	2	6	890656	890661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124709
14018	NC_004088	GCA	2	6	890746	890751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124709
14019	NC_004088	GC	3	6	890817	890822	0 %	0 %	50 %	50 %	22124709
14020	NC_004088	CAA	2	6	890849	890854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124709
14021	NC_004088	TGG	2	6	890904	890909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124709
14022	NC_004088	TGG	2	6	890920	890925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124709
14023	NC_004088	TTGG	2	8	890941	890948	0 %	50 %	50 %	0 %	22124709
14024	NC_004088	GAT	2	6	890950	890955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124709
14025	NC_004088	CTGC	2	8	890974	890981	0 %	25 %	25 %	50 %	22124709
14026	NC_004088	TCA	2	6	891016	891021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124709
14027	NC_004088	GGC	2	6	891103	891108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124709
14028	NC_004088	GAT	2	6	891148	891153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124709
14029	NC_004088	TTA	2	6	891265	891270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124709
14030	NC_004088	TC	3	6	891294	891299	0 %	50 %	0 %	50 %	22124710
14031	NC_004088	TTC	2	6	891300	891305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124710
14032	NC_004088	ATT	2	6	891317	891322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124710
14033	NC_004088	ATT	2	6	891425	891430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124710
14034	NC_004088	GCG	2	6	891496	891501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124710
14035	NC_004088	TGAT	2	8	891542	891549	25 %	50 %	25 %	0 %	22124710
14036	NC_004088	GTC	2	6	891577	891582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124710
14037	NC_004088	CGG	2	6	891689	891694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124710
14038	NC_004088	CAA	2	6	891742	891747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124710
14039	NC_004088	CTG	2	6	891766	891771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124710
14040	NC_004088	GCTG	2	8	891858	891865	0 %	25 %	50 %	25 %	22124710
14041	NC_004088	TTA	2	6	891997	892002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124710
14042	NC_004088	TC	3	6	892007	892012	0 %	50 %	0 %	50 %	22124710
14043	NC_004088	GGT	2	6	892128	892133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124710
14044	NC_004088	CGA	2	6	892151	892156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124710
14045	NC_004088	GT	3	6	892174	892179	0 %	50 %	50 %	0 %	22124710
14046	NC_004088	AAT	2	6	892192	892197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124710
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14048	NC_004088	TCGT	2	8	892319	892326	0 %	50 %	25 %	25 %	22124710
14049	NC_004088	GGC	2	6	892384	892389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161484863
14050	NC_004088	TGG	2	6	892414	892419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161484863
14051	NC_004088	CT	4	8	892469	892476	0 %	50 %	0 %	50 %	161484863
14052	NC_004088	GGGGCT	2	12	892577	892588	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	161484863
14053	NC_004088	CAA	2	6	892605	892610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161484863
14054	NC_004088	GGT	2	6	892704	892709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161484863
14055	NC_004088	GGC	2	6	892727	892732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161484863
14056	NC_004088	GGT	2	6	892740	892745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161484863
14057	NC_004088	GTT	2	6	892892	892897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161484863
14058	NC_004088	CAG	2	6	892923	892928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161484863
14059	NC_004088	GGC	2	6	892982	892987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161484863
14060	NC_004088	CTT	2	6	892988	892993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161484863
14061	NC_004088	GAT	2	6	893022	893027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161484863
14062	NC_004088	TCGC	2	8	893032	893039	0 %	25 %	25 %	50 %	161484863
14063	NC_004088	GGTG	2	8	893120	893127	0 %	25 %	75 %	0 %	161484863
14064	NC_004088	TTG	2	6	893157	893162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161484863
14065	NC_004088	TGC	2	6	893227	893232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484863
14066	NC_004088	CAT	2	6	893252	893257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161484863
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14068	NC_004088	GTT	2	6	893333	893338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161484863
14069	NC_004088	TGC	3	9	893434	893442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484863
14070	NC_004088	G	6	6	893447	893452	0 %	0 %	100 %	0 %	161484863
14071	NC_004088	TCG	2	6	893503	893508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484863
14072	NC_004088	TGA	2	6	893510	893515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161484863
14073	NC_004088	GGC	2	6	893555	893560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161484863
14074	NC_004088	ATG	2	6	893574	893579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161484863
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14080	NC_004088	GCC	2	6	893992	893997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161484863
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14085	NC_004088	ATT	2	6	894224	894229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161484863
14086	NC_004088	GAT	2	6	894230	894235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161484863
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14088	NC_004088	TGC	2	6	894331	894336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484863
14089	NC_004088	CGA	2	6	894746	894751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124712
14090	NC_004088	CTT	2	6	894840	894845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124712
14091	NC_004088	GAA	2	6	894859	894864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124712
14092	NC_004088	TCA	2	6	894891	894896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124712
14093	NC_004088	ACC	2	6	894965	894970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124712
14094	NC_004088	GA	3	6	895059	895064	50 %	0 %	50 %	0 %	22124712
14095	NC_004088	CAGG	2	8	895072	895079	25 %	0 %	50 %	25 %	22124712
14096	NC_004088	CATT	2	8	895155	895162	25 %	50 %	0 %	25 %	22124712
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14100	NC_004088	TAA	2	6	895247	895252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124712
14101	NC_004088	GC	3	6	895257	895262	0 %	0 %	50 %	50 %	22124712
14102	NC_004088	GAT	2	6	895300	895305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124712
14103	NC_004088	TCA	2	6	895322	895327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124712
14104	NC_004088	CA	3	6	895326	895331	50 %	0 %	0 %	50 %	22124712
14105	NC_004088	GC	3	6	895334	895339	0 %	0 %	50 %	50 %	22124712
14106	NC_004088	CAGG	2	8	895344	895351	25 %	0 %	50 %	25 %	22124712
14107	NC_004088	ATA	2	6	895403	895408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124712
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14109	NC_004088	GT	3	6	895481	895486	0 %	50 %	50 %	0 %	22124712
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14111	NC_004088	AGC	2	6	895584	895589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124712
14112	NC_004088	TTATC	2	10	895602	895611	20 %	60 %	0 %	20 %	22124712
14113	NC_004088	TGG	2	6	895650	895655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124712
14114	NC_004088	GCAC	2	8	895934	895941	25 %	0 %	25 %	50 %	22124712
14115	NC_004088	CCCG	2	8	895954	895961	0 %	0 %	25 %	75 %	22124712
14116	NC_004088	TGT	2	6	895970	895975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124712
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14243	NC_004088	GAA	2	6	903592	903597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124720
14244	NC_004088	CTG	2	6	903741	903746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124720
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14247	NC_004088	GTC	2	6	903905	903910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124720
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14255	NC_004088	CTG	2	6	904459	904464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124721
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14483	NC_004088	GTC	2	6	919762	919767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124732
14484	NC_004088	TCA	2	6	919823	919828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124732
14485	NC_004088	GATG	2	8	919928	919935	25 %	25 %	50 %	0 %	22124732
14486	NC_004088	GTCAC	2	10	919941	919950	20 %	20 %	20 %	40 %	22124732
14487	NC_004088	GCGT	2	8	919968	919975	0 %	25 %	50 %	25 %	22124732
14488	NC_004088	GCA	2	6	920057	920062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124732
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