MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis KIM 10 chromosome

Total Repeats: 73018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_004088	CTTTT	2	10	795519	795528	0 %	80 %	0 %	20 %	22124623
12502	NC_004088	GCT	2	6	795542	795547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124623
12503	NC_004088	CCG	2	6	795669	795674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124623
12504	NC_004088	GGT	2	6	795684	795689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124623
12505	NC_004088	GCA	2	6	795722	795727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124623
12506	NC_004088	GTTG	2	8	796018	796025	0 %	50 %	50 %	0 %	22124624
12507	NC_004088	ATA	2	6	796081	796086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124624
12508	NC_004088	GCT	2	6	796161	796166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124624
12509	NC_004088	GTT	2	6	796168	796173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124624
12510	NC_004088	TCTGT	2	10	796384	796393	0 %	60 %	20 %	20 %	22124624
12511	NC_004088	CTG	2	6	796430	796435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124624
12512	NC_004088	CGG	3	9	796491	796499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124624
12513	NC_004088	TGC	2	6	796607	796612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124624
12514	NC_004088	AGG	2	6	796643	796648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22124624
12515	NC_004088	T	7	7	796653	796659	0 %	100 %	0 %	0 %	22124624
12516	NC_004088	GGT	2	6	796730	796735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124624
12517	NC_004088	CGC	2	6	796807	796812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124624
12518	NC_004088	CAA	2	6	796832	796837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124624
12519	NC_004088	TCGG	2	8	796899	796906	0 %	25 %	50 %	25 %	22124624
12520	NC_004088	AAT	2	6	796916	796921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124624
12521	NC_004088	CAG	2	6	796949	796954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124624
12522	NC_004088	GCC	2	6	797001	797006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124624
12523	NC_004088	GCT	2	6	797065	797070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124624
12524	NC_004088	CGG	2	6	797077	797082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124624
12525	NC_004088	CAG	2	6	797120	797125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124624
12526	NC_004088	GCC	2	6	797190	797195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124624
12527	NC_004088	CTC	2	6	797339	797344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22124624
12528	NC_004088	AGG	2	6	797526	797531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22124624
12529	NC_004088	CA	3	6	797542	797547	50 %	0 %	0 %	50 %	22124624
12530	NC_004088	ACC	2	6	797588	797593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124624
12531	NC_004088	GTA	2	6	797612	797617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124624
12532	NC_004088	TCA	2	6	797629	797634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124624
12533	NC_004088	CCA	2	6	797735	797740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124624
12534	NC_004088	CGT	2	6	797746	797751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124624
12535	NC_004088	CGC	2	6	797758	797763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124624
12536	NC_004088	GAT	2	6	797770	797775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124624
12537	NC_004088	AAT	2	6	797845	797850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124624
12538	NC_004088	GT	3	6	797890	797895	0 %	50 %	50 %	0 %	22124624
12539	NC_004088	ACC	2	6	797907	797912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124624
12540	NC_004088	AAT	2	6	797936	797941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124624
12541	NC_004088	GTT	2	6	797947	797952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124624
12542	NC_004088	TTG	2	6	798103	798108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124625
12543	NC_004088	CAG	2	6	798120	798125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124625
12544	NC_004088	GCG	2	6	798137	798142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124625
12545	NC_004088	T	6	6	798163	798168	0 %	100 %	0 %	0 %	22124625
12546	NC_004088	TCCA	2	8	798178	798185	25 %	25 %	0 %	50 %	22124625
12547	NC_004088	TGA	2	6	798216	798221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124625
12548	NC_004088	T	6	6	798244	798249	0 %	100 %	0 %	0 %	22124625
12549	NC_004088	GCC	2	6	798485	798490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124625
12550	NC_004088	TCT	2	6	798530	798535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124625
12551	NC_004088	TGG	2	6	798552	798557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124625
12552	NC_004088	ATCA	2	8	798649	798656	50 %	25 %	0 %	25 %	22124625
12553	NC_004088	ATA	2	6	798841	798846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124625
12554	NC_004088	TCTT	2	8	798944	798951	0 %	75 %	0 %	25 %	22124625
12555	NC_004088	CCA	2	6	798964	798969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124625
12556	NC_004088	CAC	2	6	799002	799007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124625
12557	NC_004088	GGC	2	6	799009	799014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124625
12558	NC_004088	T	7	7	799048	799054	0 %	100 %	0 %	0 %	22124625
12559	NC_004088	GTT	2	6	799108	799113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124625
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12561	NC_004088	GCA	2	6	799178	799183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124625
12562	NC_004088	TAAA	2	8	799184	799191	75 %	25 %	0 %	0 %	22124625
12563	NC_004088	CAT	2	6	799246	799251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124625
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12567	NC_004088	A	7	7	799980	799986	100 %	0 %	0 %	0 %	22124626
12568	NC_004088	AAC	2	6	800029	800034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124626
12569	NC_004088	A	6	6	800141	800146	100 %	0 %	0 %	0 %	22124626
12570	NC_004088	TAT	2	6	800147	800152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124626
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12572	NC_004088	AT	3	6	800195	800200	50 %	50 %	0 %	0 %	22124626
12573	NC_004088	GAA	2	6	800294	800299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124626
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12589	NC_004088	ATG	2	6	801088	801093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124626
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12591	NC_004088	AAT	2	6	801129	801134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124627
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12593	NC_004088	TGA	2	6	801245	801250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124627
12594	NC_004088	TGA	2	6	801321	801326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124627
12595	NC_004088	GTT	2	6	801354	801359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124627
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12603	NC_004088	ACG	2	6	801701	801706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124627
12604	NC_004088	TGG	2	6	801730	801735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124627
12605	NC_004088	GT	3	6	801818	801823	0 %	50 %	50 %	0 %	22124627
12606	NC_004088	CCA	2	6	801839	801844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124627
12607	NC_004088	TGG	3	9	801846	801854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124627
12608	NC_004088	A	6	6	801994	801999	100 %	0 %	0 %	0 %	22124627
12609	NC_004088	CTG	3	9	802084	802092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124628
12610	NC_004088	TGTT	2	8	802097	802104	0 %	75 %	25 %	0 %	22124628
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12613	NC_004088	TGGA	2	8	802213	802220	25 %	25 %	50 %	0 %	22124628
12614	NC_004088	GTCA	2	8	802287	802294	25 %	25 %	25 %	25 %	22124628
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12620	NC_004088	ACA	2	6	802454	802459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124628
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12862	NC_004088	TGT	2	6	814625	814630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124644
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12986	NC_004088	C	6	6	825205	825210	0 %	0 %	0 %	100 %	22124653
12987	NC_004088	TTA	2	6	825334	825339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124653
12988	NC_004088	GTTGG	2	10	825425	825434	0 %	40 %	60 %	0 %	22124653
12989	NC_004088	CCA	2	6	825494	825499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124653
12990	NC_004088	CATA	2	8	825533	825540	50 %	25 %	0 %	25 %	22124653
12991	NC_004088	TTGA	2	8	825565	825572	25 %	50 %	25 %	0 %	22124653
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12994	NC_004088	CAAG	2	8	825764	825771	50 %	0 %	25 %	25 %	22124653
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