MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis KIM 10 chromosome

Total Repeats: 73018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_004088	CAC	2	6	706848	706853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124539
11002	NC_004088	TTGA	2	8	706871	706878	25 %	50 %	25 %	0 %	22124539
11003	NC_004088	GGC	2	6	706897	706902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124539
11004	NC_004088	TG	3	6	706932	706937	0 %	50 %	50 %	0 %	22124539
11005	NC_004088	TCGGT	2	10	706956	706965	0 %	40 %	40 %	20 %	22124539
11006	NC_004088	TTG	2	6	706992	706997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124539
11007	NC_004088	TTGGG	2	10	707035	707044	0 %	40 %	60 %	0 %	22124539
11008	NC_004088	GAT	2	6	707057	707062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124539
11009	NC_004088	TCAG	2	8	707089	707096	25 %	25 %	25 %	25 %	22124539
11010	NC_004088	CCG	2	6	707115	707120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124539
11011	NC_004088	ATC	2	6	707121	707126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124539
11012	NC_004088	CGC	2	6	707147	707152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124539
11013	NC_004088	CTG	2	6	707183	707188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124539
11014	NC_004088	TGG	2	6	707190	707195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124539
11015	NC_004088	GGT	2	6	707213	707218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124539
11016	NC_004088	GCC	2	6	707240	707245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124539
11017	NC_004088	TACT	2	8	707274	707281	25 %	50 %	0 %	25 %	22124539
11018	NC_004088	GCT	2	6	707309	707314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124539
11019	NC_004088	CCG	2	6	707343	707348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124539
11020	NC_004088	GTC	2	6	707387	707392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124539
11021	NC_004088	ACTTA	2	10	707482	707491	40 %	40 %	0 %	20 %	22124539
11022	NC_004088	CTC	2	6	707532	707537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22124539
11023	NC_004088	GCT	2	6	707549	707554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124539
11024	NC_004088	CGT	2	6	707572	707577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124539
11025	NC_004088	TGG	2	6	707629	707634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124539
11026	NC_004088	TGG	2	6	707637	707642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124539
11027	NC_004088	CGG	2	6	707725	707730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124539
11028	NC_004088	TTCT	2	8	707742	707749	0 %	75 %	0 %	25 %	22124539
11029	NC_004088	TAT	2	6	707752	707757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124539
11030	NC_004088	ATG	2	6	707790	707795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124539
11031	NC_004088	GT	3	6	707809	707814	0 %	50 %	50 %	0 %	22124539
11032	NC_004088	TGC	2	6	707827	707832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124539
11033	NC_004088	GCTG	2	8	707839	707846	0 %	25 %	50 %	25 %	22124539
11034	NC_004088	TGA	2	6	707966	707971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124540
11035	NC_004088	GGT	2	6	708015	708020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124540
11036	NC_004088	TTAT	2	8	708028	708035	25 %	75 %	0 %	0 %	22124540
11037	NC_004088	T	6	6	708080	708085	0 %	100 %	0 %	0 %	22124540
11038	NC_004088	TGG	2	6	708256	708261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124540
11039	NC_004088	GGC	2	6	708326	708331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124540
11040	NC_004088	AGGC	2	8	708364	708371	25 %	0 %	50 %	25 %	22124540
11041	NC_004088	AACGA	2	10	708409	708418	60 %	0 %	20 %	20 %	22124540
11042	NC_004088	ACT	2	6	708499	708504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124541
11043	NC_004088	TCG	2	6	708525	708530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124541
11044	NC_004088	GAT	2	6	708549	708554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124541
11045	NC_004088	TTA	2	6	708562	708567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124541
11046	NC_004088	GGT	2	6	708714	708719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124541
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11049	NC_004088	CGT	3	9	709056	709064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124541
11050	NC_004088	TGG	2	6	709142	709147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124541
11051	NC_004088	TGG	2	6	709164	709169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124541
11052	NC_004088	CCG	2	6	709233	709238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124541
11053	NC_004088	CCG	2	6	709428	709433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124541
11054	NC_004088	CTGG	2	8	709455	709462	0 %	25 %	50 %	25 %	22124541
11055	NC_004088	G	7	7	709492	709498	0 %	0 %	100 %	0 %	22124541
11056	NC_004088	AG	3	6	709577	709582	50 %	0 %	50 %	0 %	22124541
11057	NC_004088	TGC	2	6	709607	709612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124541
11058	NC_004088	GGTG	2	8	709626	709633	0 %	25 %	75 %	0 %	22124541
11059	NC_004088	GGA	2	6	709734	709739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22124541
11060	NC_004088	GCT	2	6	709743	709748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124541
11061	NC_004088	GCG	2	6	709870	709875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124541
11062	NC_004088	CTC	2	6	709881	709886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22124541
11063	NC_004088	AAT	2	6	709927	709932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124541
11064	NC_004088	CTGC	2	8	709972	709979	0 %	25 %	25 %	50 %	22124541
11065	NC_004088	GCCA	2	8	710032	710039	25 %	0 %	25 %	50 %	22124541
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11068	NC_004088	GCG	2	6	710230	710235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124541
11069	NC_004088	TGAG	2	8	710252	710259	25 %	25 %	50 %	0 %	22124541
11070	NC_004088	GCC	2	6	710389	710394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124542
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11072	NC_004088	ATTGAT	2	12	710470	710481	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	22124542
11073	NC_004088	GTG	2	6	710489	710494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124542
11074	NC_004088	GAT	2	6	710542	710547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124542
11075	NC_004088	CGCCA	2	10	710566	710575	20 %	0 %	20 %	60 %	22124542
11076	NC_004088	TCAGT	2	10	710651	710660	20 %	40 %	20 %	20 %	22124542
11077	NC_004088	TCTTA	2	10	710667	710676	20 %	60 %	0 %	20 %	22124542
11078	NC_004088	ATTT	2	8	710792	710799	25 %	75 %	0 %	0 %	22124542
11079	NC_004088	CG	3	6	710811	710816	0 %	0 %	50 %	50 %	22124542
11080	NC_004088	TGA	2	6	710859	710864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124542
11081	NC_004088	GTC	2	6	710866	710871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124542
11082	NC_004088	GC	3	6	710887	710892	0 %	0 %	50 %	50 %	22124542
11083	NC_004088	GCA	2	6	711033	711038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124542
11084	NC_004088	ATG	2	6	711127	711132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124542
11085	NC_004088	TCA	2	6	711279	711284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124542
11086	NC_004088	TTTA	2	8	711304	711311	25 %	75 %	0 %	0 %	22124542
11087	NC_004088	ACA	2	6	711333	711338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124542
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11089	NC_004088	GCA	2	6	711396	711401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124542
11090	NC_004088	AATA	2	8	711427	711434	75 %	25 %	0 %	0 %	22124542
11091	NC_004088	GCG	2	6	711448	711453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124542
11092	NC_004088	GCG	2	6	711463	711468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124542
11093	NC_004088	AGA	2	6	711528	711533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124542
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11095	NC_004088	CCAT	2	8	711646	711653	25 %	25 %	0 %	50 %	22124542
11096	NC_004088	AGA	2	6	711678	711683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124542
11097	NC_004088	TTGA	2	8	711748	711755	25 %	50 %	25 %	0 %	22124542
11098	NC_004088	GTTG	2	8	711800	711807	0 %	50 %	50 %	0 %	22124542
11099	NC_004088	AGCTC	2	10	711813	711822	20 %	20 %	20 %	40 %	22124542
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11101	NC_004088	GGGC	2	8	711961	711968	0 %	0 %	75 %	25 %	22124542
11102	NC_004088	CAA	2	6	712000	712005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124542
11103	NC_004088	GCA	2	6	712047	712052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124542
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11105	NC_004088	ATGA	2	8	712247	712254	50 %	25 %	25 %	0 %	22124542
11106	NC_004088	TAT	2	6	712288	712293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124543
11107	NC_004088	CT	3	6	712322	712327	0 %	50 %	0 %	50 %	22124543
11108	NC_004088	TTGA	2	8	712451	712458	25 %	50 %	25 %	0 %	22124543
11109	NC_004088	GAAA	2	8	712513	712520	75 %	0 %	25 %	0 %	22124543
11110	NC_004088	CTG	2	6	712533	712538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124543
11111	NC_004088	GCT	2	6	712552	712557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124543
11112	NC_004088	G	7	7	712561	712567	0 %	0 %	100 %	0 %	22124543
11113	NC_004088	TGT	2	6	712572	712577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124543
11114	NC_004088	CAG	2	6	712649	712654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124543
11115	NC_004088	GATC	2	8	712699	712706	25 %	25 %	25 %	25 %	22124543
11116	NC_004088	CGG	2	6	712713	712718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124543
11117	NC_004088	T	8	8	712767	712774	0 %	100 %	0 %	0 %	22124543
11118	NC_004088	ACCTT	2	10	712820	712829	20 %	40 %	0 %	40 %	22124543
11119	NC_004088	TCA	2	6	712900	712905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124543
11120	NC_004088	TGCC	2	8	712974	712981	0 %	25 %	25 %	50 %	22124543
11121	NC_004088	TG	3	6	712988	712993	0 %	50 %	50 %	0 %	22124543
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11123	NC_004088	GATT	2	8	713029	713036	25 %	50 %	25 %	0 %	22124543
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11236	NC_004088	AATC	2	8	719775	719782	50 %	25 %	0 %	25 %	161484881
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11241	NC_004088	CGT	2	6	720475	720480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124551
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11243	NC_004088	CGT	2	6	720520	720525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124551
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11245	NC_004088	GAT	2	6	720622	720627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124551
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11356	NC_004088	GCGCT	2	10	727178	727187	0 %	20 %	40 %	40 %	22124556
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11485	NC_004088	ATG	2	6	736020	736025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124567
11486	NC_004088	TAA	2	6	736053	736058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124567
11487	NC_004088	CAA	2	6	736117	736122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124567
11488	NC_004088	CTT	2	6	736160	736165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124567
11489	NC_004088	ATC	2	6	736224	736229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124567
11490	NC_004088	GAT	2	6	736307	736312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124567
11491	NC_004088	ATCA	2	8	736349	736356	50 %	25 %	0 %	25 %	22124567
11492	NC_004088	TTC	2	6	736398	736403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124567
11493	NC_004088	TC	3	6	736492	736497	0 %	50 %	0 %	50 %	22124567
11494	NC_004088	CGT	2	6	736498	736503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124567
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11498	NC_004088	CAT	2	6	736670	736675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124567
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11500	NC_004088	GCA	2	6	736722	736727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124567

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