MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis KIM 10 chromosome

Total Repeats: 73018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_004088	TGGC	2	8	644186	644193	0 %	25 %	50 %	25 %	22124483
10002	NC_004088	TCA	2	6	644252	644257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124483
10003	NC_004088	AGCGTG	2	12	644275	644286	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	22124483
10004	NC_004088	AAT	2	6	644313	644318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124483
10005	NC_004088	GGTT	2	8	644326	644333	0 %	50 %	50 %	0 %	22124483
10006	NC_004088	TCA	2	6	644654	644659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161484886
10007	NC_004088	CTT	2	6	644729	644734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161484886
10008	NC_004088	CT	3	6	644833	644838	0 %	50 %	0 %	50 %	161484886
10009	NC_004088	GAG	2	6	644877	644882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161484886
10010	NC_004088	CTG	2	6	644997	645002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484886
10011	NC_004088	GCT	2	6	645044	645049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484886
10012	NC_004088	TCCG	2	8	645118	645125	0 %	25 %	25 %	50 %	161484886
10013	NC_004088	CGG	2	6	645133	645138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161484886
10014	NC_004088	ATT	2	6	645192	645197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161484886
10015	NC_004088	ATA	2	6	645201	645206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161484886
10016	NC_004088	TCA	2	6	645209	645214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161484886
10017	NC_004088	GAT	3	9	645237	645245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161484886
10018	NC_004088	TATTCA	2	12	645278	645289	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	161484886
10019	NC_004088	GTA	2	6	645331	645336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161484886
10020	NC_004088	GCT	2	6	645395	645400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484886
10021	NC_004088	TGC	3	9	645462	645470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484886
10022	NC_004088	TTG	2	6	645475	645480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161484886
10023	NC_004088	AGGT	2	8	645592	645599	25 %	25 %	50 %	0 %	161484886
10024	NC_004088	TCTTTT	2	12	645688	645699	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	161484886
10025	NC_004088	CCA	2	6	645790	645795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161484886
10026	NC_004088	GGC	2	6	645848	645853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161484886
10027	NC_004088	C	6	6	645867	645872	0 %	0 %	0 %	100 %	161484886
10028	NC_004088	CAA	2	6	645875	645880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161484886
10029	NC_004088	CGG	2	6	645967	645972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161484886
10030	NC_004088	CGG	2	6	645991	645996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161484886
10031	NC_004088	GCG	2	6	646036	646041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161484886
10032	NC_004088	AGC	2	6	646084	646089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161484886
10033	NC_004088	T	7	7	646313	646319	0 %	100 %	0 %	0 %	161484886
10034	NC_004088	T	6	6	646371	646376	0 %	100 %	0 %	0 %	161484886
10035	NC_004088	GA	3	6	646430	646435	50 %	0 %	50 %	0 %	161484886
10036	NC_004088	GGT	2	6	646518	646523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161484886
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10038	NC_004088	TAG	2	6	646741	646746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161484886
10039	NC_004088	CAA	2	6	646968	646973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161484886
10040	NC_004088	AT	3	6	647001	647006	50 %	50 %	0 %	0 %	161484886
10041	NC_004088	AATC	2	8	647158	647165	50 %	25 %	0 %	25 %	22124485
10042	NC_004088	CCG	2	6	647219	647224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124485
10043	NC_004088	AAT	2	6	647230	647235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124485
10044	NC_004088	TGC	2	6	647262	647267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124485
10045	NC_004088	GC	3	6	647314	647319	0 %	0 %	50 %	50 %	22124485
10046	NC_004088	TTA	2	6	647323	647328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124485
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10049	NC_004088	CTG	3	9	647447	647455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124485
10050	NC_004088	GCA	2	6	647505	647510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124485
10051	NC_004088	TCGC	2	8	647513	647520	0 %	25 %	25 %	50 %	22124485
10052	NC_004088	ACTA	2	8	647656	647663	50 %	25 %	0 %	25 %	22124486
10053	NC_004088	GCT	2	6	647771	647776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124486
10054	NC_004088	GAA	3	9	647858	647866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124486
10055	NC_004088	CTG	2	6	647981	647986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124486
10056	NC_004088	GA	3	6	648007	648012	50 %	0 %	50 %	0 %	22124486
10057	NC_004088	TTG	2	6	648035	648040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124486
10058	NC_004088	GTC	2	6	648080	648085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124486
10059	NC_004088	GC	3	6	648086	648091	0 %	0 %	50 %	50 %	22124486
10060	NC_004088	TGA	3	9	648094	648102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124486
10061	NC_004088	A	6	6	648122	648127	100 %	0 %	0 %	0 %	22124486
10062	NC_004088	GTT	2	6	648179	648184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124486
10063	NC_004088	GATCT	2	10	648250	648259	20 %	40 %	20 %	20 %	22124486
10064	NC_004088	CTT	2	6	648454	648459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161484885
10065	NC_004088	ACG	2	6	648464	648469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161484885
10066	NC_004088	ATC	2	6	648490	648495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161484885
10067	NC_004088	CCA	2	6	648549	648554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161484885
10068	NC_004088	TTC	2	6	648682	648687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161484885
10069	NC_004088	GTG	2	6	648691	648696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161484885
10070	NC_004088	A	6	6	648752	648757	100 %	0 %	0 %	0 %	161484885
10071	NC_004088	GTA	2	6	648807	648812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161484885
10072	NC_004088	CAG	2	6	648817	648822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161484885
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10076	NC_004088	TCA	2	6	648957	648962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161484885
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10079	NC_004088	TGT	2	6	649354	649359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124488
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10085	NC_004088	TGA	2	6	649930	649935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124488
10086	NC_004088	GC	3	6	650133	650138	0 %	0 %	50 %	50 %	22124488
10087	NC_004088	TGT	2	6	650192	650197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124488
10088	NC_004088	GGA	2	6	650198	650203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22124488
10089	NC_004088	TAC	2	6	650229	650234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124488
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10092	NC_004088	CTG	2	6	650849	650854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124489
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10102	NC_004088	C	6	6	651541	651546	0 %	0 %	0 %	100 %	22124490
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10105	NC_004088	GGCA	2	8	651840	651847	25 %	0 %	50 %	25 %	22124490
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10110	NC_004088	ACC	2	6	652058	652063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124490
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10245	NC_004088	CGA	3	9	661413	661421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124496
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10247	NC_004088	CGG	2	6	661782	661787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124497
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10353	NC_004088	GAT	2	6	667696	667701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124504
10354	NC_004088	CATTGC	2	12	667790	667801	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	22124504
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10357	NC_004088	TG	3	6	667931	667936	0 %	50 %	50 %	0 %	22124504
10358	NC_004088	TTTA	2	8	667965	667972	25 %	75 %	0 %	0 %	22124504
10359	NC_004088	CA	3	6	668147	668152	50 %	0 %	0 %	50 %	22124505
10360	NC_004088	CAC	2	6	668159	668164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124505
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10488	NC_004088	GTA	2	6	674277	674282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124511
10489	NC_004088	A	6	6	674282	674287	100 %	0 %	0 %	0 %	22124511
10490	NC_004088	TGG	2	6	674326	674331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124511
10491	NC_004088	ATC	2	6	674407	674412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124511
10492	NC_004088	CTG	2	6	675259	675264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124512
10493	NC_004088	CATC	2	8	675288	675295	25 %	25 %	0 %	50 %	22124512
10494	NC_004088	GCA	2	6	675300	675305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124512
10495	NC_004088	CTG	2	6	675337	675342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124512
10496	NC_004088	GCAG	2	8	675388	675395	25 %	0 %	50 %	25 %	22124512
10497	NC_004088	AGC	2	6	675405	675410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124512
10498	NC_004088	GCTC	2	8	675435	675442	0 %	25 %	25 %	50 %	22124512
10499	NC_004088	TGC	2	6	675470	675475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124512
10500	NC_004088	GCC	3	9	675504	675512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124512

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