MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis KIM 10 chromosome

Total Repeats: 73018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_004088	GTTTCT	2	12	313567	313578	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	22124212
5002	NC_004088	AGG	2	6	313634	313639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22124212
5003	NC_004088	ATCT	2	8	313676	313683	25 %	50 %	0 %	25 %	22124212
5004	NC_004088	ATC	2	6	313694	313699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124212
5005	NC_004088	CTT	2	6	313718	313723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124212
5006	NC_004088	GTT	2	6	313778	313783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124212
5007	NC_004088	TTC	2	6	313817	313822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124212
5008	NC_004088	CTT	2	6	313918	313923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124212
5009	NC_004088	TGA	2	6	313966	313971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124212
5010	NC_004088	CGG	2	6	313998	314003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124212
5011	NC_004088	ATC	2	6	314037	314042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124212
5012	NC_004088	ACG	2	6	314093	314098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124212
5013	NC_004088	GAT	2	6	314150	314155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124212
5014	NC_004088	TTC	2	6	314286	314291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124213
5015	NC_004088	AAC	2	6	314386	314391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124213
5016	NC_004088	TGC	2	6	314397	314402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124213
5017	NC_004088	ATC	2	6	314442	314447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124213
5018	NC_004088	GCA	2	6	314531	314536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124213
5019	NC_004088	CGGT	2	8	314539	314546	0 %	25 %	50 %	25 %	22124213
5020	NC_004088	CAG	2	6	314642	314647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124213
5021	NC_004088	C	7	7	314649	314655	0 %	0 %	0 %	100 %	22124213
5022	NC_004088	TTG	2	6	314674	314679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124213
5023	NC_004088	CGG	2	6	314689	314694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124213
5024	NC_004088	T	6	6	314697	314702	0 %	100 %	0 %	0 %	22124213
5025	NC_004088	TCA	2	6	314714	314719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124213
5026	NC_004088	CCA	2	6	314749	314754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124213
5027	NC_004088	TTG	2	6	314789	314794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124213
5028	NC_004088	AG	3	6	314910	314915	50 %	0 %	50 %	0 %	22124214
5029	NC_004088	CAC	2	6	314997	315002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124214
5030	NC_004088	T	6	6	315125	315130	0 %	100 %	0 %	0 %	22124214
5031	NC_004088	GGC	2	6	315151	315156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124214
5032	NC_004088	GCG	2	6	315178	315183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124214
5033	NC_004088	CGG	2	6	315240	315245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124214
5034	NC_004088	TGG	2	6	315269	315274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124214
5035	NC_004088	GGT	2	6	315277	315282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124214
5036	NC_004088	CTG	2	6	315309	315314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124214
5037	NC_004088	GTT	2	6	315353	315358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124214
5038	NC_004088	CTGC	2	8	315368	315375	0 %	25 %	25 %	50 %	22124214
5039	NC_004088	GTT	2	6	315395	315400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124214
5040	NC_004088	TTC	2	6	315507	315512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124214
5041	NC_004088	GCC	2	6	315603	315608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124214
5042	NC_004088	AACA	2	8	315609	315616	75 %	0 %	0 %	25 %	22124214
5043	NC_004088	T	6	6	315675	315680	0 %	100 %	0 %	0 %	22124214
5044	NC_004088	GCA	2	6	315822	315827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124215
5045	NC_004088	TGA	2	6	315838	315843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124215
5046	NC_004088	G	6	6	315963	315968	0 %	0 %	100 %	0 %	22124215
5047	NC_004088	TCA	2	6	315993	315998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124215
5048	NC_004088	CAT	2	6	316075	316080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124215
5049	NC_004088	G	7	7	316100	316106	0 %	0 %	100 %	0 %	22124215
5050	NC_004088	ACG	2	6	316202	316207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124215
5051	NC_004088	GCG	2	6	316323	316328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124215
5052	NC_004088	GCT	2	6	316408	316413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124215
5053	NC_004088	CTT	2	6	316414	316419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124215
5054	NC_004088	AGC	2	6	316452	316457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124215
5055	NC_004088	TGT	2	6	316515	316520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124215
5056	NC_004088	GGC	2	6	316556	316561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124215
5057	NC_004088	A	6	6	316592	316597	100 %	0 %	0 %	0 %	22124215
5058	NC_004088	GAG	2	6	316672	316677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22124215
5059	NC_004088	TCA	2	6	316744	316749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124215
5060	NC_004088	CG	3	6	316751	316756	0 %	0 %	50 %	50 %	22124215
5061	NC_004088	TTCT	2	8	316820	316827	0 %	75 %	0 %	25 %	22124215
5062	NC_004088	AGGTA	2	10	317241	317250	40 %	20 %	40 %	0 %	22124216
5063	NC_004088	GCA	2	6	317285	317290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124216
5064	NC_004088	TGT	2	6	317305	317310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124216
5065	NC_004088	TTG	2	6	317424	317429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124216
5066	NC_004088	TTG	2	6	317445	317450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124216
5067	NC_004088	ATA	2	6	317476	317481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124216
5068	NC_004088	CTG	2	6	317553	317558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124216
5069	NC_004088	GCA	2	6	317570	317575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124216
5070	NC_004088	GTG	2	6	317589	317594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124216
5071	NC_004088	CTTG	2	8	317615	317622	0 %	50 %	25 %	25 %	22124216
5072	NC_004088	GCCC	2	8	317626	317633	0 %	0 %	25 %	75 %	22124216
5073	NC_004088	GC	3	6	317702	317707	0 %	0 %	50 %	50 %	22124216
5074	NC_004088	CCA	2	6	317726	317731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124216
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5078	NC_004088	GGT	2	6	318014	318019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124216
5079	NC_004088	ACA	2	6	318083	318088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124216
5080	NC_004088	CGG	2	6	318106	318111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124216
5081	NC_004088	CAG	2	6	318165	318170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124216
5082	NC_004088	GA	3	6	318176	318181	50 %	0 %	50 %	0 %	22124216
5083	NC_004088	TGT	2	6	318220	318225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124216
5084	NC_004088	CTG	2	6	318399	318404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124216
5085	NC_004088	TCA	2	6	318427	318432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124216
5086	NC_004088	ATG	2	6	318436	318441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124216
5087	NC_004088	CGC	2	6	318495	318500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124216
5088	NC_004088	CAC	2	6	318503	318508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124216
5089	NC_004088	CGG	2	6	318770	318775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124216
5090	NC_004088	GGT	2	6	318837	318842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124216
5091	NC_004088	ATCA	2	8	318864	318871	50 %	25 %	0 %	25 %	22124216
5092	NC_004088	AAT	2	6	318952	318957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124216
5093	NC_004088	GCA	2	6	318958	318963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124216
5094	NC_004088	TGC	3	9	318970	318978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124216
5095	NC_004088	GC	3	6	318983	318988	0 %	0 %	50 %	50 %	22124216
5096	NC_004088	TGG	2	6	319002	319007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124216
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5098	NC_004088	G	6	6	319165	319170	0 %	0 %	100 %	0 %	22124216
5099	NC_004088	GTT	2	6	319211	319216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124216
5100	NC_004088	ACG	2	6	319249	319254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124216
5101	NC_004088	AAC	2	6	319377	319382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22124216
5102	NC_004088	CTT	2	6	319671	319676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161484910
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5104	NC_004088	AGC	2	6	319770	319775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161484910
5105	NC_004088	TGG	2	6	319789	319794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161484910
5106	NC_004088	GAA	2	6	319837	319842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161484910
5107	NC_004088	T	6	6	320401	320406	0 %	100 %	0 %	0 %	22124218
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5109	NC_004088	TAA	2	6	320600	320605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124218
5110	NC_004088	ACGG	2	8	320638	320645	25 %	0 %	50 %	25 %	22124218
5111	NC_004088	T	6	6	320646	320651	0 %	100 %	0 %	0 %	22124218
5112	NC_004088	CGG	2	6	320661	320666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124218
5113	NC_004088	ATA	2	6	320695	320700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124218
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5115	NC_004088	ACC	2	6	320758	320763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124218
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5119	NC_004088	ATGC	2	8	321297	321304	25 %	25 %	25 %	25 %	22124219
5120	NC_004088	CA	3	6	321315	321320	50 %	0 %	0 %	50 %	22124219
5121	NC_004088	CGG	2	6	321362	321367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124219
5122	NC_004088	T	7	7	321420	321426	0 %	100 %	0 %	0 %	22124219
5123	NC_004088	TGCT	2	8	321431	321438	0 %	50 %	25 %	25 %	22124219
5124	NC_004088	AGC	2	6	323049	323054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124220
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5127	NC_004088	TGG	2	6	323168	323173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124220
5128	NC_004088	CTG	2	6	323177	323182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124220
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5130	NC_004088	TCA	2	6	323247	323252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124220
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5136	NC_004088	TGA	2	6	323535	323540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124220
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5237	NC_004088	AGTTC	2	10	330193	330202	20 %	40 %	20 %	20 %	161484909
5238	NC_004088	GCTT	2	8	330216	330223	0 %	50 %	25 %	25 %	161484909
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5247	NC_004088	CCA	2	6	330871	330876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161484909
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5251	NC_004088	ACG	2	6	330968	330973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161484909
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5370	NC_004088	AAT	2	6	339729	339734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124230
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5491	NC_004088	ATC	2	6	346424	346429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124235
5492	NC_004088	CG	3	6	346456	346461	0 %	0 %	50 %	50 %	22124235
5493	NC_004088	CCG	2	6	346484	346489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124235
5494	NC_004088	GGTA	2	8	346626	346633	25 %	25 %	50 %	0 %	22124236
5495	NC_004088	TCG	2	6	346644	346649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124236
5496	NC_004088	CCA	2	6	346653	346658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124236
5497	NC_004088	TTC	2	6	346751	346756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124236
5498	NC_004088	GCA	2	6	346777	346782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124236
5499	NC_004088	GTTT	2	8	346912	346919	0 %	75 %	25 %	0 %	22124236
5500	NC_004088	T	6	6	346933	346938	0 %	100 %	0 %	0 %	22124236

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