MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 chromosome

Total Repeats: 71974

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003143	CTG	2	6	306	311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927222
2	NC_003143	TTG	2	6	388	393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218927222
3	NC_003143	AACC	2	8	444	451	50 %	0 %	0 %	50 %	218927222
4	NC_003143	TGT	2	6	485	490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218927222
5	NC_003143	TAA	2	6	502	507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218927222
6	NC_003143	CTT	2	6	627	632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218927222
7	NC_003143	TCA	2	6	868	873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218927223
8	NC_003143	TTG	2	6	886	891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218927223
9	NC_003143	CTG	2	6	900	905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927223
10	NC_003143	TAA	2	6	935	940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218927223
11	NC_003143	GTG	2	6	958	963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218927223
12	NC_003143	CTT	2	6	980	985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218927223
13	NC_003143	T	6	6	999	1004	0 %	100 %	0 %	0 %	218927223
14	NC_003143	AGC	2	6	1052	1057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218927223
15	NC_003143	CGT	2	6	1061	1066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927223
16	NC_003143	GTT	2	6	1073	1078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218927223
17	NC_003143	GTGC	2	8	1195	1202	0 %	25 %	50 %	25 %	218927223
18	NC_003143	TGC	2	6	1226	1231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927223
19	NC_003143	A	6	6	1438	1443	100 %	0 %	0 %	0 %	218927224
20	NC_003143	ACA	3	9	1458	1466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218927224
21	NC_003143	CAA	2	6	1507	1512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218927224
22	NC_003143	CATT	2	8	1645	1652	25 %	50 %	0 %	25 %	218927224
23	NC_003143	ATTC	2	8	1759	1766	25 %	50 %	0 %	25 %	218927224
24	NC_003143	GCG	2	6	1879	1884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218927224
25	NC_003143	TGG	2	6	2037	2042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218927224
26	NC_003143	ATG	2	6	2066	2071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218927224
27	NC_003143	ATG	2	6	2087	2092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218927224
28	NC_003143	ATT	2	6	2140	2145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218927224
29	NC_003143	TCT	2	6	2182	2187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218927224
30	NC_003143	ATCA	2	8	2270	2277	50 %	25 %	0 %	25 %	218927224
31	NC_003143	TGC	2	6	2345	2350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927224
32	NC_003143	ACA	2	6	2355	2360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218927224
33	NC_003143	CTG	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927224
34	NC_003143	GCG	2	6	2538	2543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218927225
35	NC_003143	TGG	2	6	2650	2655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218927225
36	NC_003143	CTG	3	9	2658	2666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927225
37	NC_003143	TTTA	2	8	2763	2770	25 %	75 %	0 %	0 %	218927225
38	NC_003143	GCC	2	6	2788	2793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218927225
39	NC_003143	ACC	2	6	2802	2807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218927225
40	NC_003143	GTTG	2	8	2816	2823	0 %	50 %	50 %	0 %	218927225
41	NC_003143	ATT	2	6	2875	2880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218927225
42	NC_003143	ATG	2	6	2896	2901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218927225
43	NC_003143	GCG	2	6	2907	2912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218927225
44	NC_003143	TCA	2	6	3031	3036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218927225
45	NC_003143	T	6	6	3068	3073	0 %	100 %	0 %	0 %	218927225
46	NC_003143	GCG	2	6	3126	3131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218927225
47	NC_003143	ACTC	2	8	3149	3156	25 %	25 %	0 %	50 %	218927225
48	NC_003143	AAT	2	6	3184	3189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218927225
49	NC_003143	TGA	2	6	3208	3213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218927225
50	NC_003143	CCT	2	6	3224	3229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218927225
51	NC_003143	CTGG	2	8	3242	3249	0 %	25 %	50 %	25 %	218927225
52	NC_003143	GCA	2	6	3377	3382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218927225
53	NC_003143	TGG	2	6	3452	3457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218927225
54	NC_003143	CAC	2	6	3476	3481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218927225
55	NC_003143	AAC	2	6	3535	3540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218927225
56	NC_003143	TGA	3	9	3541	3549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218927225
57	NC_003143	T	6	6	3628	3633	0 %	100 %	0 %	0 %	218927225
58	NC_003143	TCC	2	6	3742	3747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218927225
59	NC_003143	ATTC	2	8	3773	3780	25 %	50 %	0 %	25 %	218927225
60	NC_003143	GTT	2	6	3815	3820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218927225
61	NC_003143	A	8	8	3885	3892	100 %	0 %	0 %	0 %	218927225
62	NC_003143	TGC	2	6	3906	3911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927225
63	NC_003143	ACC	2	6	3922	3927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218927225
64	NC_003143	CAG	2	6	3960	3965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218927225
65	NC_003143	TGT	2	6	4015	4020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218927226
66	NC_003143	GTT	2	6	4031	4036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218927226
67	NC_003143	TTG	2	6	4047	4052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218927226
68	NC_003143	TTG	2	6	4062	4067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218927226
69	NC_003143	CCA	2	6	4082	4087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218927226
70	NC_003143	GCCA	2	8	4114	4121	25 %	0 %	25 %	50 %	218927226
71	NC_003143	GAT	2	6	4123	4128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218927226
72	NC_003143	TAAA	2	8	4133	4140	75 %	25 %	0 %	0 %	218927226
73	NC_003143	GTT	2	6	4169	4174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218927226
74	NC_003143	CAG	3	9	4206	4214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218927226
75	NC_003143	TGG	2	6	4218	4223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218927226
76	NC_003143	TGGC	2	8	4263	4270	0 %	25 %	50 %	25 %	218927226
77	NC_003143	ATC	2	6	4302	4307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218927226
78	NC_003143	GAT	2	6	4412	4417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218927226
79	NC_003143	CTGT	2	8	4471	4478	0 %	50 %	25 %	25 %	218927226
80	NC_003143	AGTG	2	8	4539	4546	25 %	25 %	50 %	0 %	218927226
81	NC_003143	TGG	2	6	4549	4554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218927226
82	NC_003143	TGC	2	6	4561	4566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927226
83	NC_003143	TAA	2	6	4611	4616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218927226
84	NC_003143	CAA	2	6	4644	4649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218927226
85	NC_003143	TCA	2	6	4738	4743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218927226
86	NC_003143	GAA	2	6	4752	4757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218927226
87	NC_003143	GTA	2	6	4769	4774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218927226
88	NC_003143	CTT	2	6	4785	4790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218927226
89	NC_003143	GCG	2	6	4794	4799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218927226
90	NC_003143	TCAA	2	8	4891	4898	50 %	25 %	0 %	25 %	218927226
91	NC_003143	TGG	2	6	4909	4914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218927226
92	NC_003143	TTC	2	6	4917	4922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218927226
93	NC_003143	CTG	2	6	4972	4977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927226
94	NC_003143	CAG	2	6	4980	4985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218927226
95	NC_003143	GCT	2	6	5061	5066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927226
96	NC_003143	CTT	3	9	5267	5275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218927226
97	NC_003143	TCA	2	6	5330	5335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218927226
98	NC_003143	GCG	2	6	5376	5381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218927226
99	NC_003143	GGA	2	6	5407	5412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218927226
100	NC_003143	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927226
101	NC_003143	TTCT	2	8	5519	5526	0 %	75 %	0 %	25 %	218927226
102	NC_003143	GAT	2	6	5536	5541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218927226
103	NC_003143	GA	3	6	5918	5923	50 %	0 %	50 %	0 %	218927227
104	NC_003143	T	6	6	5975	5980	0 %	100 %	0 %	0 %	218927227
105	NC_003143	GTC	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927227
106	NC_003143	AGG	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218927227
107	NC_003143	TGG	2	6	6127	6132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218927227
108	NC_003143	TGG	2	6	6146	6151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218927227
109	NC_003143	CTT	2	6	6155	6160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218927227
110	NC_003143	CGC	2	6	6224	6229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218927227
111	NC_003143	TAT	2	6	6383	6388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218927227
112	NC_003143	T	6	6	6438	6443	0 %	100 %	0 %	0 %	218927227
113	NC_003143	T	6	6	6465	6470	0 %	100 %	0 %	0 %	218927227
114	NC_003143	CGT	2	6	6580	6585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927227
115	NC_003143	ATT	2	6	6595	6600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218927227
116	NC_003143	TTA	2	6	6615	6620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218927227
117	NC_003143	CTT	2	6	6650	6655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218927227
118	NC_003143	ACC	2	6	6785	6790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218927227
119	NC_003143	ATT	2	6	6798	6803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218927227
120	NC_003143	AT	4	8	6831	6838	50 %	50 %	0 %	0 %	218927227
121	NC_003143	GGT	2	6	6869	6874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218927227
122	NC_003143	GGC	3	9	6911	6919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218927227
123	NC_003143	TCG	2	6	7009	7014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927227
124	NC_003143	TTG	2	6	7032	7037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218927227
125	NC_003143	ATT	2	6	7076	7081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218927227
126	NC_003143	GTTG	2	8	7090	7097	0 %	50 %	50 %	0 %	218927227
127	NC_003143	TAT	3	9	7124	7132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218927227
128	NC_003143	ACC	2	6	7134	7139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218927227
129	NC_003143	GAT	2	6	7202	7207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218927227
130	NC_003143	CGG	2	6	7249	7254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218927227
131	NC_003143	AATG	2	8	7271	7278	50 %	25 %	25 %	0 %	218927227
132	NC_003143	ATT	2	6	7292	7297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218927227
133	NC_003143	GTGTT	2	10	7333	7342	0 %	60 %	40 %	0 %	218927227
134	NC_003143	GGT	2	6	7427	7432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218927227
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138	NC_003143	CCCA	2	8	7646	7653	25 %	0 %	0 %	75 %	218927227
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241	NC_003143	TCA	2	6	19910	19915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218927234
242	NC_003143	T	6	6	19942	19947	0 %	100 %	0 %	0 %	218927234
243	NC_003143	GCAT	2	8	20042	20049	25 %	25 %	25 %	25 %	218927234
244	NC_003143	TA	3	6	20112	20117	50 %	50 %	0 %	0 %	218927234
245	NC_003143	TCAC	2	8	20150	20157	25 %	25 %	0 %	50 %	218927234
246	NC_003143	ATTG	2	8	20466	20473	25 %	50 %	25 %	0 %	218927235
247	NC_003143	GCA	2	6	20493	20498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218927235
248	NC_003143	GGC	2	6	20538	20543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218927235
249	NC_003143	TATC	2	8	20592	20599	25 %	50 %	0 %	25 %	218927235
250	NC_003143	A	6	6	20647	20652	100 %	0 %	0 %	0 %	218927235
251	NC_003143	GAA	2	6	20659	20664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218927235
252	NC_003143	ATT	2	6	20698	20703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218927235
253	NC_003143	AAC	2	6	20795	20800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218927236
254	NC_003143	CCTGA	2	10	20828	20837	20 %	20 %	20 %	40 %	218927236
255	NC_003143	AG	3	6	20932	20937	50 %	0 %	50 %	0 %	218927236
256	NC_003143	AGT	2	6	20978	20983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218927236
257	NC_003143	TTC	2	6	21095	21100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218927236
258	NC_003143	TGG	2	6	21118	21123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218927236
259	NC_003143	GCCC	2	8	21218	21225	0 %	0 %	25 %	75 %	218927236
260	NC_003143	AGA	2	6	21238	21243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218927236
261	NC_003143	AAC	2	6	21297	21302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218927236
262	NC_003143	GAT	2	6	21446	21451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218927236
263	NC_003143	AT	3	6	21528	21533	50 %	50 %	0 %	0 %	218927236
264	NC_003143	GC	3	6	21598	21603	0 %	0 %	50 %	50 %	218927236
265	NC_003143	TAC	2	6	21617	21622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218927236
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384	NC_003143	AAT	2	6	30662	30667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218927243
385	NC_003143	CTT	2	6	30948	30953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218927243
386	NC_003143	CCCGA	2	10	31024	31033	20 %	0 %	20 %	60 %	218927243
387	NC_003143	A	7	7	31106	31112	100 %	0 %	0 %	0 %	218927243
388	NC_003143	GCC	2	6	31223	31228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218927243
389	NC_003143	TACCGG	2	12	31299	31310	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	218927243
390	NC_003143	GAG	2	6	31337	31342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218927243
391	NC_003143	ATA	2	6	31397	31402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218927243
392	NC_003143	ACTG	2	8	31417	31424	25 %	25 %	25 %	25 %	218927243
393	NC_003143	CGGG	2	8	31433	31440	0 %	0 %	75 %	25 %	218927243
394	NC_003143	TTG	3	9	31441	31449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218927243
395	NC_003143	TCG	2	6	31493	31498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218927243
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399	NC_003143	CCAT	2	8	31637	31644	25 %	25 %	0 %	50 %	218927243
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402	NC_003143	GC	3	6	31757	31762	0 %	0 %	50 %	50 %	218927243
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405	NC_003143	GATA	2	8	31925	31932	50 %	25 %	25 %	0 %	218927244
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497	NC_003143	CT	3	6	38066	38071	0 %	50 %	0 %	50 %	218927249
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499	NC_003143	TGCC	2	8	38172	38179	0 %	25 %	25 %	50 %	218927249
500	NC_003143	CAT	2	6	38188	38193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218927249

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