MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. palearctica Y11

Total Repeats: 91487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017564	TTG	2	6	1	6	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386307443
2	NC_017564	GAT	2	6	61	66	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386307443
3	NC_017564	CG	3	6	167	172	0 %	0 %	50 %	50 %	386307443
4	NC_017564	TGCA	2	8	197	204	25 %	25 %	25 %	25 %	386307443
5	NC_017564	ATA	2	6	323	328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386307443
6	NC_017564	GAT	2	6	517	522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386307443
7	NC_017564	T	6	6	591	596	0 %	100 %	0 %	0 %	386307443
8	NC_017564	TCGA	2	8	608	615	25 %	25 %	25 %	25 %	386307443
9	NC_017564	TTTA	2	8	627	634	25 %	75 %	0 %	0 %	386307443
10	NC_017564	GCGCA	2	10	670	679	20 %	0 %	40 %	40 %	386307443
11	NC_017564	TGG	2	6	792	797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386307444
12	NC_017564	GC	3	6	807	812	0 %	0 %	50 %	50 %	386307444
13	NC_017564	GCA	2	6	872	877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386307444
14	NC_017564	CTC	2	6	927	932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386307444
15	NC_017564	CGC	2	6	993	998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386307444
16	NC_017564	ACC	2	6	1027	1032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386307444
17	NC_017564	TTG	2	6	1047	1052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386307444
18	NC_017564	TTCA	2	8	1160	1167	25 %	50 %	0 %	25 %	386307445
19	NC_017564	CAT	2	6	1192	1197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386307445
20	NC_017564	CG	4	8	1295	1302	0 %	0 %	50 %	50 %	386307445
21	NC_017564	TGC	3	9	1331	1339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386307445
22	NC_017564	CGC	3	9	1412	1420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386307445
23	NC_017564	GC	3	6	1426	1431	0 %	0 %	50 %	50 %	386307445
24	NC_017564	CAG	2	6	1457	1462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386307445
25	NC_017564	ATT	2	6	1475	1480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386307445
26	NC_017564	GGC	2	6	1504	1509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386307445
27	NC_017564	TCA	2	6	1552	1557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386307445
28	NC_017564	CA	3	6	1569	1574	50 %	0 %	0 %	50 %	386307445
29	NC_017564	GTT	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386307445
30	NC_017564	ACA	2	6	1642	1647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386307445
31	NC_017564	GGC	2	6	1667	1672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386307445
32	NC_017564	GTT	2	6	1675	1680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386307445
33	NC_017564	CATA	2	8	1744	1751	50 %	25 %	0 %	25 %	386307445
34	NC_017564	CGA	2	6	1787	1792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386307445
35	NC_017564	GAC	2	6	1843	1848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386307445
36	NC_017564	TGGG	2	8	1859	1866	0 %	25 %	75 %	0 %	386307445
37	NC_017564	CGG	2	6	1880	1885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386307445
38	NC_017564	TCGG	2	8	1982	1989	0 %	25 %	50 %	25 %	386307445
39	NC_017564	TGA	2	6	2017	2022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386307445
40	NC_017564	CTG	2	6	2027	2032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386307445
41	NC_017564	CAG	2	6	2090	2095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386307445
42	NC_017564	GTG	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386307445
43	NC_017564	GCT	2	6	2137	2142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386307445
44	NC_017564	TTC	2	6	2144	2149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386307445
45	NC_017564	TCGC	2	8	2152	2159	0 %	25 %	25 %	50 %	386307445
46	NC_017564	CAC	2	6	2255	2260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386307445
47	NC_017564	GCC	2	6	2264	2269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386307445
48	NC_017564	AATGG	2	10	2314	2323	40 %	20 %	40 %	0 %	386307445
49	NC_017564	AAT	2	6	2385	2390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386307445
50	NC_017564	GC	3	6	2415	2420	0 %	0 %	50 %	50 %	386307445
51	NC_017564	CTG	2	6	2479	2484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386307445
52	NC_017564	GCA	2	6	2500	2505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386307445
53	NC_017564	TG	3	6	2517	2522	0 %	50 %	50 %	0 %	386307445
54	NC_017564	GCT	2	6	2558	2563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386307445
55	NC_017564	CTTA	2	8	2585	2592	25 %	50 %	0 %	25 %	386307445
56	NC_017564	TTTA	2	8	2621	2628	25 %	75 %	0 %	0 %	386307445
57	NC_017564	TTATT	2	10	2635	2644	20 %	80 %	0 %	0 %	386307445
58	NC_017564	TTC	3	9	2715	2723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017564	ACT	2	6	2729	2734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017564	ATC	2	6	2745	2750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017564	TCA	2	6	2803	2808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017564	TA	3	6	2864	2869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017564	GGC	2	6	2877	2882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017564	CAT	2	6	2944	2949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017564	TGT	2	6	3022	3027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386307446
66	NC_017564	CGT	2	6	3042	3047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386307446
67	NC_017564	CTT	2	6	3110	3115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386307446
68	NC_017564	GGC	2	6	3140	3145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386307446
69	NC_017564	GCC	2	6	3216	3221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386307446
70	NC_017564	TGG	2	6	3232	3237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386307446
71	NC_017564	CGG	2	6	3242	3247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386307446
72	NC_017564	CATTG	2	10	3248	3257	20 %	40 %	20 %	20 %	386307446
73	NC_017564	TGT	2	6	3269	3274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386307446
74	NC_017564	CG	3	6	3365	3370	0 %	0 %	50 %	50 %	386307446
75	NC_017564	ATG	2	6	3405	3410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386307446
76	NC_017564	CT	3	6	3432	3437	0 %	50 %	0 %	50 %	386307446
77	NC_017564	GTG	2	6	3453	3458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386307446
78	NC_017564	CTAT	2	8	3499	3506	25 %	50 %	0 %	25 %	386307446
79	NC_017564	TTGG	2	8	3614	3621	0 %	50 %	50 %	0 %	386307446
80	NC_017564	TTC	2	6	3702	3707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386307446
81	NC_017564	TGG	2	6	3808	3813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386307446
82	NC_017564	TGG	2	6	3868	3873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386307446
83	NC_017564	CTG	2	6	3894	3899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386307446
84	NC_017564	GTT	2	6	3908	3913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386307446
85	NC_017564	TGG	2	6	3968	3973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386307446
86	NC_017564	GGA	2	6	4049	4054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386307446
87	NC_017564	CACT	2	8	4116	4123	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017564	GCTG	2	8	4166	4173	0 %	25 %	50 %	25 %	386307447
89	NC_017564	TGC	2	6	4177	4182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386307447
90	NC_017564	AGA	2	6	4288	4293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386307447
91	NC_017564	TC	3	6	4371	4376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017564	T	6	6	4402	4407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017564	GTG	2	6	4477	4482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386307448
94	NC_017564	TGG	2	6	4485	4490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386307448
95	NC_017564	AAG	2	6	4538	4543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386307448
96	NC_017564	TCA	2	6	4628	4633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386307448
97	NC_017564	AAAGT	2	10	4635	4644	60 %	20 %	20 %	0 %	386307448
98	NC_017564	T	6	6	4726	4731	0 %	100 %	0 %	0 %	386307448
99	NC_017564	AAACT	2	10	4868	4877	60 %	20 %	0 %	20 %	386307448
100	NC_017564	GGA	2	6	5068	5073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386307449
101	NC_017564	AAT	2	6	5157	5162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386307449
102	NC_017564	GGCA	2	8	5202	5209	25 %	0 %	50 %	25 %	386307449
103	NC_017564	TCA	2	6	5240	5245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386307449
104	NC_017564	AGC	2	6	5323	5328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386307449
105	NC_017564	ATA	2	6	5329	5334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386307449
106	NC_017564	TCA	2	6	5467	5472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386307449
107	NC_017564	A	8	8	5529	5536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017564	CTG	2	6	5538	5543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017564	ACA	2	6	5554	5559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017564	GTT	2	6	5562	5567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017564	TGCT	2	8	5568	5575	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017564	GAC	2	6	5687	5692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386307450
113	NC_017564	GCG	2	6	5756	5761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386307450
114	NC_017564	ACG	2	6	5777	5782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386307450
115	NC_017564	ATGTTG	2	12	5814	5825	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386307450
116	NC_017564	CCG	2	6	6080	6085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386307450
117	NC_017564	TTG	2	6	6117	6122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386307450
118	NC_017564	AAG	2	6	6129	6134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386307450
119	NC_017564	TGA	3	9	6178	6186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386307450
120	NC_017564	GTG	2	6	6204	6209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386307450
121	NC_017564	TGC	2	6	6277	6282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386307450
122	NC_017564	GC	3	6	6281	6286	0 %	0 %	50 %	50 %	386307450
123	NC_017564	ATTT	2	8	6375	6382	25 %	75 %	0 %	0 %	386307450
124	NC_017564	GAA	2	6	6418	6423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386307450
125	NC_017564	ACTG	2	8	6469	6476	25 %	25 %	25 %	25 %	386307450
126	NC_017564	GGT	2	6	6572	6577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386307451
127	NC_017564	CAC	2	6	6620	6625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386307451
128	NC_017564	GAT	2	6	6710	6715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386307451
129	NC_017564	ATG	2	6	6739	6744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386307451
130	NC_017564	AC	3	6	6757	6762	50 %	0 %	0 %	50 %	386307451
131	NC_017564	TCC	2	6	6794	6799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386307451
132	NC_017564	GCC	2	6	6946	6951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386307451
133	NC_017564	GCCA	2	8	6957	6964	25 %	0 %	25 %	50 %	386307451
134	NC_017564	ACTG	2	8	6975	6982	25 %	25 %	25 %	25 %	386307451
135	NC_017564	TGG	2	6	7069	7074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386307451
136	NC_017564	ACA	2	6	7091	7096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386307451
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258	NC_017564	TGA	2	6	12288	12293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
259	NC_017564	TAA	2	6	12370	12375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386307456
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261	NC_017564	T	7	7	12418	12424	0 %	100 %	0 %	0 %	386307456
262	NC_017564	CTCAT	2	10	12426	12435	20 %	40 %	0 %	40 %	386307456
263	NC_017564	TAG	2	6	12436	12441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386307456
264	NC_017564	TAT	2	6	12449	12454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386307456
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399	NC_017564	CG	3	6	19035	19040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
400	NC_017564	TGA	2	6	19052	19057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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408	NC_017564	A	6	6	19273	19278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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