MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis A1122 plasmid unnamed

Total Repeats: 1819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017169	GCT	2	6	52430	52435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141208
1002	NC_017169	ATT	2	6	52480	52485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384141208
1003	NC_017169	ATTG	2	8	52570	52577	25 %	50 %	25 %	0 %	384141208
1004	NC_017169	TTC	2	6	52583	52588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141208
1005	NC_017169	TGA	2	6	52606	52611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141208
1006	NC_017169	TAT	2	6	52717	52722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384141208
1007	NC_017169	ATT	2	6	52811	52816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384141208
1008	NC_017169	GTT	2	6	52832	52837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384141208
1009	NC_017169	TGA	2	6	52985	52990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141208
1010	NC_017169	AGTA	2	8	53003	53010	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017169	CAT	2	6	53036	53041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_017169	TAA	2	6	53044	53049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017169	ATG	2	6	53052	53057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017169	ATC	2	6	53061	53066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_017169	TCG	2	6	53073	53078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_017169	GGT	2	6	53098	53103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017169	TCT	2	6	53154	53159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_017169	TAA	2	6	53177	53182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017169	ATG	2	6	53277	53282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141209
1020	NC_017169	CTGG	2	8	53443	53450	0 %	25 %	50 %	25 %	384141209
1021	NC_017169	AAC	2	6	53462	53467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384141209
1022	NC_017169	AG	3	6	53469	53474	50 %	0 %	50 %	0 %	384141209
1023	NC_017169	CAG	2	6	53501	53506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141209
1024	NC_017169	GTT	2	6	53524	53529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384141209
1025	NC_017169	CGC	2	6	53586	53591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384141209
1026	NC_017169	CAGC	2	8	53594	53601	25 %	0 %	25 %	50 %	384141209
1027	NC_017169	GCA	2	6	53624	53629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141209
1028	NC_017169	ACT	2	6	53793	53798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_017169	GCCA	2	8	53810	53817	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_017169	CCTG	2	8	53873	53880	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_017169	GAG	2	6	53895	53900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017169	CTTG	2	8	53923	53930	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_017169	GTG	2	6	54075	54080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017169	TTC	2	6	54119	54124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_017169	ATC	2	6	54150	54155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_017169	TTG	2	6	54264	54269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017169	CAGA	2	8	54303	54310	50 %	0 %	25 %	25 %	384141210
1038	NC_017169	TGG	2	6	54455	54460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384141210
1039	NC_017169	GGC	2	6	54482	54487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384141210
1040	NC_017169	CTT	2	6	54497	54502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_017169	TATT	2	8	54592	54599	25 %	75 %	0 %	0 %	384141211
1042	NC_017169	CTG	2	6	54614	54619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141211
1043	NC_017169	GCA	2	6	54660	54665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141211
1044	NC_017169	ATT	2	6	54794	54799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384141211
1045	NC_017169	TCTG	2	8	54846	54853	0 %	50 %	25 %	25 %	384141211
1046	NC_017169	GA	3	6	54875	54880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017169	ATG	2	6	54901	54906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017169	TGA	2	6	54928	54933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017169	CG	3	6	54938	54943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_017169	ATC	2	6	55019	55024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_017169	TAC	2	6	55049	55054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_017169	GCTG	2	8	55066	55073	0 %	25 %	50 %	25 %	384141212
1053	NC_017169	ATC	2	6	55087	55092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141212
1054	NC_017169	ATG	2	6	55104	55109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141212
1055	NC_017169	GGC	2	6	55132	55137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384141212
1056	NC_017169	CAA	2	6	55143	55148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384141212
1057	NC_017169	CAG	2	6	55252	55257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141212
1058	NC_017169	CCG	2	6	55310	55315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384141212
1059	NC_017169	CTG	2	6	55316	55321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141212
1060	NC_017169	GGC	2	6	55348	55353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384141212
1061	NC_017169	ATC	2	6	55540	55545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141212
1062	NC_017169	TTC	2	6	55577	55582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141212
1063	NC_017169	GCG	2	6	55597	55602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384141212
1064	NC_017169	CTG	2	6	55726	55731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141212
1065	NC_017169	GAC	2	6	55767	55772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141212
1066	NC_017169	GCA	2	6	55802	55807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141212
1067	NC_017169	AGT	2	6	55905	55910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141212
1068	NC_017169	GCA	2	6	55976	55981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141212
1069	NC_017169	AGT	2	6	56071	56076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141212
1070	NC_017169	T	6	6	56179	56184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017169	AC	3	6	56217	56222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_017169	ATT	2	6	56299	56304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384141213
1073	NC_017169	ATC	2	6	56305	56310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141213
1074	NC_017169	T	6	6	56334	56339	0 %	100 %	0 %	0 %	384141213
1075	NC_017169	CGT	2	6	56373	56378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141213
1076	NC_017169	T	7	7	56409	56415	0 %	100 %	0 %	0 %	384141213
1077	NC_017169	A	7	7	56434	56440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017169	TTA	2	6	56462	56467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017169	A	6	6	56511	56516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017169	ATA	2	6	56588	56593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384141214
1081	NC_017169	T	7	7	56638	56644	0 %	100 %	0 %	0 %	384141214
1082	NC_017169	AAC	2	6	56668	56673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384141214
1083	NC_017169	GTC	2	6	56686	56691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141214
1084	NC_017169	GTG	2	6	56759	56764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384141214
1085	NC_017169	GAA	2	6	56797	56802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384141214
1086	NC_017169	GTC	2	6	56857	56862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141214
1087	NC_017169	GCC	2	6	56897	56902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384141214
1088	NC_017169	TCT	2	6	56903	56908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141214
1089	NC_017169	GAT	2	6	56998	57003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141214
1090	NC_017169	GCCA	2	8	57155	57162	25 %	0 %	25 %	50 %	384141214
1091	NC_017169	CAG	2	6	57169	57174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141214
1092	NC_017169	CGA	2	6	57399	57404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141214
1093	NC_017169	GGT	2	6	57412	57417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384141214
1094	NC_017169	TG	3	6	57458	57463	0 %	50 %	50 %	0 %	384141214
1095	NC_017169	CGT	2	6	57543	57548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141214
1096	NC_017169	GTT	2	6	57778	57783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017169	GGTT	2	8	57843	57850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017169	CATTC	2	10	57855	57864	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1099	NC_017169	CAT	2	6	57865	57870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_017169	CAGC	2	8	57879	57886	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_017169	GCG	2	6	57946	57951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_017169	GGCT	2	8	57961	57968	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1103	NC_017169	T	6	6	58001	58006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017169	AAT	2	6	58106	58111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384141215
1105	NC_017169	ATT	2	6	58159	58164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384141215
1106	NC_017169	TCA	2	6	58199	58204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141215
1107	NC_017169	CAAT	2	8	58229	58236	50 %	25 %	0 %	25 %	384141215
1108	NC_017169	AT	3	6	58318	58323	50 %	50 %	0 %	0 %	384141215
1109	NC_017169	TGA	2	6	58334	58339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141215
1110	NC_017169	GAA	2	6	58363	58368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384141215
1111	NC_017169	A	6	6	58367	58372	100 %	0 %	0 %	0 %	384141215
1112	NC_017169	AAC	2	6	58435	58440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384141215
1113	NC_017169	AAT	2	6	58450	58455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384141215
1114	NC_017169	TTC	2	6	58511	58516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141215
1115	NC_017169	TC	3	6	58609	58614	0 %	50 %	0 %	50 %	384141215
1116	NC_017169	CAA	2	6	58669	58674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384141215
1117	NC_017169	ATC	2	6	58697	58702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141215
1118	NC_017169	A	6	6	58770	58775	100 %	0 %	0 %	0 %	384141215
1119	NC_017169	TAT	2	6	58792	58797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384141215
1120	NC_017169	GCA	2	6	58823	58828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141215
1121	NC_017169	CTA	2	6	58832	58837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141215
1122	NC_017169	AT	3	6	58853	58858	50 %	50 %	0 %	0 %	384141215
1123	NC_017169	CTG	2	6	58910	58915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141215
1124	NC_017169	TCT	2	6	58970	58975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141215
1125	NC_017169	AT	3	6	58976	58981	50 %	50 %	0 %	0 %	384141215
1126	NC_017169	AAT	2	6	58984	58989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384141215
1127	NC_017169	ATA	2	6	59036	59041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017169	CAA	2	6	59151	59156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1387	NC_017169	TCA	2	6	71169	71174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141224
1388	NC_017169	TGAA	2	8	71250	71257	50 %	25 %	25 %	0 %	384141224
1389	NC_017169	CTGCG	2	10	71316	71325	0 %	20 %	40 %	40 %	384141224
1390	NC_017169	TGC	2	6	71353	71358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141224
1391	NC_017169	GGA	2	6	71392	71397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384141224
1392	NC_017169	GCG	2	6	71480	71485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384141224
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1419	NC_017169	CATT	2	8	73369	73376	25 %	50 %	0 %	25 %	384141225
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1423	NC_017169	GAC	2	6	73435	73440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141225
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1451	NC_017169	TGG	2	6	74900	74905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_017169	CGT	2	6	74931	74936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1453	NC_017169	TGA	2	6	74945	74950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_017169	TA	3	6	74985	74990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1455	NC_017169	CTAC	3	12	74996	75007	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1456	NC_017169	TTTA	2	8	75008	75015	25 %	75 %	0 %	0 %	384141227
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1496	NC_017169	AGCC	2	8	77160	77167	25 %	0 %	25 %	50 %	384141229
1497	NC_017169	CAA	2	6	77185	77190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384141229
1498	NC_017169	TCCA	2	8	77245	77252	25 %	25 %	0 %	50 %	384141229
1499	NC_017169	GCT	2	6	77256	77261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384141229
1500	NC_017169	GCA	2	6	77315	77320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141229

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