MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 89546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017168	GCA	2	6	31	36	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017168	GAA	2	6	126	131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017168	TTG	2	6	202	207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017168	TAA	2	6	235	240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017168	CCAGC	2	10	279	288	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_017168	CTG	2	6	444	449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017168	GTT	2	6	492	497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017168	CCA	2	6	511	516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017168	TTG	3	9	558	566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017168	ATC	2	6	582	587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017168	CCG	2	6	619	624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017168	AAG	2	6	664	669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017168	TGG	3	9	680	688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017168	GCC	2	6	735	740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017168	T	6	6	878	883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017168	TCA	2	6	952	957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017168	TGA	2	6	1019	1024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017168	GCGCT	2	10	1061	1070	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017168	CTG	2	6	1097	1102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017168	TCG	2	6	1186	1191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017168	CGT	2	6	1283	1288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017168	ACC	2	6	1289	1294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017168	C	6	6	1293	1298	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_017168	GC	3	6	1333	1338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017168	C	6	6	1344	1349	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_017168	GGC	2	6	1356	1361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017168	GCC	2	6	1407	1412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_017168	TCCT	2	8	1434	1441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017168	T	6	6	1446	1451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017168	C	6	6	1471	1476	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_017168	TG	3	6	1523	1528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017168	GATC	2	8	1541	1548	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017168	GGC	2	6	1559	1564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017168	ATC	2	6	1600	1605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017168	GCT	2	6	1656	1661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017168	GCC	2	6	1710	1715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017168	TTG	2	6	1722	1727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017168	GTT	2	6	1756	1761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017168	CGC	2	6	1827	1832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017168	CAG	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017168	GTGTTT	2	12	1875	1886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017168	CCG	2	6	2038	2043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137009
43	NC_017168	GCTGA	2	10	2117	2126	20 %	20 %	40 %	20 %	384137009
44	NC_017168	CGG	2	6	2236	2241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137009
45	NC_017168	CTG	2	6	2288	2293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137009
46	NC_017168	CG	3	6	2383	2388	0 %	0 %	50 %	50 %	384137009
47	NC_017168	GC	3	6	2423	2428	0 %	0 %	50 %	50 %	384137009
48	NC_017168	TGG	2	6	2457	2462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137009
49	NC_017168	AGT	2	6	2484	2489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137009
50	NC_017168	GTT	2	6	2633	2638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137009
51	NC_017168	GCT	2	6	2659	2664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137009
52	NC_017168	GCC	3	9	2720	2728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137009
53	NC_017168	AGC	2	6	2791	2796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137009
54	NC_017168	GC	3	6	2861	2866	0 %	0 %	50 %	50 %	384137009
55	NC_017168	GGT	2	6	2885	2890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137009
56	NC_017168	GCT	2	6	2905	2910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137009
57	NC_017168	GTC	2	6	2912	2917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137009
58	NC_017168	GGC	2	6	2969	2974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137009
59	NC_017168	CTC	2	6	2996	3001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384137009
60	NC_017168	GGT	2	6	3023	3028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137009
61	NC_017168	TGC	2	6	3051	3056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137009
62	NC_017168	CAT	2	6	3149	3154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137009
63	NC_017168	AAT	2	6	3339	3344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137010
64	NC_017168	GCC	2	6	3361	3366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137010
65	NC_017168	TAAA	2	8	3426	3433	75 %	25 %	0 %	0 %	384137010
66	NC_017168	TGC	2	6	3467	3472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137010
67	NC_017168	CAG	2	6	3499	3504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137010
68	NC_017168	G	6	6	3723	3728	0 %	0 %	100 %	0 %	384137010
69	NC_017168	GGT	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137010
70	NC_017168	CAC	2	6	3811	3816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137010
71	NC_017168	CCAG	2	8	3837	3844	25 %	0 %	25 %	50 %	384137010
72	NC_017168	TTG	2	6	3902	3907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137010
73	NC_017168	TC	3	6	3969	3974	0 %	50 %	0 %	50 %	384137010
74	NC_017168	GCA	2	6	4041	4046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137010
75	NC_017168	GCG	2	6	4055	4060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137010
76	NC_017168	TGC	2	6	4118	4123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137010
77	NC_017168	CGG	2	6	4229	4234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137010
78	NC_017168	TTG	2	6	4261	4266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137010
79	NC_017168	T	6	6	4344	4349	0 %	100 %	0 %	0 %	384137010
80	NC_017168	ATC	2	6	4387	4392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137010
81	NC_017168	GCG	2	6	4414	4419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137010
82	NC_017168	CGG	2	6	4437	4442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137010
83	NC_017168	CGG	2	6	4592	4597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137010
84	NC_017168	TTG	2	6	4601	4606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137010
85	NC_017168	CAG	2	6	4630	4635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137010
86	NC_017168	CAT	3	9	4647	4655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137010
87	NC_017168	GCA	2	6	4794	4799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137010
88	NC_017168	GCG	2	6	4808	4813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137010
89	NC_017168	CAGCG	2	10	4829	4838	20 %	0 %	40 %	40 %	384137010
90	NC_017168	CTG	2	6	5002	5007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137010
91	NC_017168	GGT	2	6	5023	5028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137010
92	NC_017168	ATC	2	6	5030	5035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137010
93	NC_017168	GAAA	2	8	5048	5055	75 %	0 %	25 %	0 %	384137011
94	NC_017168	GCG	2	6	5128	5133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137011
95	NC_017168	GGT	2	6	5138	5143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137011
96	NC_017168	CG	3	6	5183	5188	0 %	0 %	50 %	50 %	384137011
97	NC_017168	CAGATA	2	12	5205	5216	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384137011
98	NC_017168	TA	3	6	5244	5249	50 %	50 %	0 %	0 %	384137011
99	NC_017168	GC	3	6	5252	5257	0 %	0 %	50 %	50 %	384137011
100	NC_017168	GGC	2	6	5321	5326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137011
101	NC_017168	CCG	2	6	5339	5344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137011
102	NC_017168	ATC	2	6	5376	5381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137011
103	NC_017168	CAG	2	6	5391	5396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137011
104	NC_017168	GCC	2	6	5437	5442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137011
105	NC_017168	CG	3	6	5483	5488	0 %	0 %	50 %	50 %	384137011
106	NC_017168	G	6	6	5513	5518	0 %	0 %	100 %	0 %	384137011
107	NC_017168	GCG	2	6	5577	5582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137011
108	NC_017168	GGGCG	2	10	5599	5608	0 %	0 %	80 %	20 %	384137011
109	NC_017168	GCT	2	6	5727	5732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137011
110	NC_017168	GGCAA	2	10	5785	5794	40 %	0 %	40 %	20 %	384137011
111	NC_017168	TGCGG	2	10	5806	5815	0 %	20 %	60 %	20 %	384137011
112	NC_017168	ACCA	2	8	5842	5849	50 %	0 %	0 %	50 %	384137011
113	NC_017168	AGA	2	6	6072	6077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137012
114	NC_017168	CAG	2	6	6250	6255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137012
115	NC_017168	TAA	2	6	6274	6279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137012
116	NC_017168	GCTTCG	2	12	6305	6316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137012
117	NC_017168	GC	3	6	6339	6344	0 %	0 %	50 %	50 %	384137012
118	NC_017168	ACA	2	6	6378	6383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137012
119	NC_017168	TGC	2	6	6401	6406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137012
120	NC_017168	CCA	2	6	6411	6416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137012
121	NC_017168	AAC	2	6	6437	6442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137012
122	NC_017168	CCAG	2	8	6504	6511	25 %	0 %	25 %	50 %	384137012
123	NC_017168	ACG	2	6	6556	6561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137012
124	NC_017168	CAG	2	6	6574	6579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137012
125	NC_017168	C	7	7	6585	6591	0 %	0 %	0 %	100 %	384137012
126	NC_017168	CT	3	6	6680	6685	0 %	50 %	0 %	50 %	384137012
127	NC_017168	GC	3	6	6757	6762	0 %	0 %	50 %	50 %	384137012
128	NC_017168	TGAG	2	8	6867	6874	25 %	25 %	50 %	0 %	384137012
129	NC_017168	TGG	2	6	6924	6929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137012
130	NC_017168	TGT	2	6	6974	6979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137012
131	NC_017168	AGC	2	6	7040	7045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017168	CGC	2	6	7137	7142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137013
133	NC_017168	GGCC	2	8	7265	7272	0 %	0 %	50 %	50 %	384137013
134	NC_017168	TAT	2	6	7358	7363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137013
135	NC_017168	CAT	2	6	7403	7408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137013
136	NC_017168	TCA	2	6	7486	7491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137013
137	NC_017168	CTG	2	6	7509	7514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137013
138	NC_017168	TGA	2	6	7540	7545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137013
139	NC_017168	GAA	3	9	7591	7599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137013
140	NC_017168	TGG	2	6	7627	7632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137013
141	NC_017168	AGC	2	6	7695	7700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137013
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143	NC_017168	TTA	2	6	7750	7755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017168	TTATCA	2	12	7789	7800	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_017168	A	6	6	7838	7843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017168	TTA	2	6	7852	7857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017168	CGCT	2	8	7899	7906	0 %	25 %	25 %	50 %	384137014
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262	NC_017168	CTT	2	6	13422	13427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137019
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271	NC_017168	AAT	2	6	14004	14009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_017168	GT	3	6	14191	14196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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409	NC_017168	GCC	2	6	19710	19715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137026
410	NC_017168	CAC	2	6	19733	19738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137026
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412	NC_017168	GATC	2	8	19786	19793	25 %	25 %	25 %	25 %	384137026
413	NC_017168	GCT	2	6	19825	19830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137026
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