MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 89546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017168	CAT	2	6	201804	201809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137187
4002	NC_017168	ACA	2	6	201816	201821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137187
4003	NC_017168	AGA	2	6	201837	201842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137187
4004	NC_017168	CAC	2	6	201900	201905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137187
4005	NC_017168	ATC	2	6	201946	201951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137187
4006	NC_017168	GCCA	2	8	202014	202021	25 %	0 %	25 %	50 %	384137187
4007	NC_017168	CGA	2	6	202089	202094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137187
4008	NC_017168	ATC	2	6	202102	202107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137187
4009	NC_017168	AG	3	6	202135	202140	50 %	0 %	50 %	0 %	384137187
4010	NC_017168	TG	3	6	202145	202150	0 %	50 %	50 %	0 %	384137187
4011	NC_017168	CTGC	3	12	202223	202234	0 %	25 %	25 %	50 %	384137187
4012	NC_017168	ATA	2	6	202262	202267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137187
4013	NC_017168	AAT	2	6	202345	202350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137187
4014	NC_017168	TAT	2	6	202401	202406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137187
4015	NC_017168	AGGTG	2	10	202415	202424	20 %	20 %	60 %	0 %	384137187
4016	NC_017168	TAA	2	6	202441	202446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137187
4017	NC_017168	CATA	2	8	202488	202495	50 %	25 %	0 %	25 %	384137187
4018	NC_017168	TCG	2	6	202497	202502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_017168	GGT	2	6	202517	202522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017168	AGG	2	6	202529	202534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017168	CTG	2	6	202547	202552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_017168	CAC	2	6	202611	202616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137188
4023	NC_017168	GTA	2	6	202621	202626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137188
4024	NC_017168	TCCA	2	8	202636	202643	25 %	25 %	0 %	50 %	384137188
4025	NC_017168	ATT	2	6	202651	202656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137188
4026	NC_017168	T	6	6	202655	202660	0 %	100 %	0 %	0 %	384137188
4027	NC_017168	ATT	2	6	202696	202701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137188
4028	NC_017168	TTTCC	2	10	202736	202745	0 %	60 %	0 %	40 %	384137188
4029	NC_017168	AAT	2	6	202777	202782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137188
4030	NC_017168	CAC	2	6	202999	203004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137188
4031	NC_017168	TGC	2	6	203118	203123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137188
4032	NC_017168	GAA	2	6	203158	203163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137188
4033	NC_017168	ATC	2	6	203170	203175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137188
4034	NC_017168	TCA	2	6	203288	203293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137188
4035	NC_017168	CGG	2	6	203300	203305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137188
4036	NC_017168	GCT	2	6	203362	203367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137188
4037	NC_017168	TGC	2	6	203416	203421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137188
4038	NC_017168	ACT	2	6	203554	203559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137188
4039	NC_017168	CAC	2	6	203592	203597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137188
4040	NC_017168	TGT	2	6	203616	203621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137188
4041	NC_017168	GTC	3	9	203786	203794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137188
4042	NC_017168	TCTG	2	8	203804	203811	0 %	50 %	25 %	25 %	384137188
4043	NC_017168	TAA	2	6	203815	203820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137188
4044	NC_017168	CCA	2	6	203882	203887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137188
4045	NC_017168	ATA	2	6	203903	203908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137188
4046	NC_017168	TCA	2	6	204023	204028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137188
4047	NC_017168	CAC	2	6	204072	204077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137188
4048	NC_017168	AAT	2	6	204103	204108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137188
4049	NC_017168	TGC	2	6	204355	204360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137188
4050	NC_017168	TG	3	6	204364	204369	0 %	50 %	50 %	0 %	384137188
4051	NC_017168	ATA	2	6	204413	204418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137188
4052	NC_017168	TTG	2	6	204446	204451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137188
4053	NC_017168	AAT	2	6	204502	204507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137188
4054	NC_017168	AT	3	6	204575	204580	50 %	50 %	0 %	0 %	384137188
4055	NC_017168	CAT	2	6	204609	204614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137188
4056	NC_017168	ACT	2	6	204634	204639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137188
4057	NC_017168	TGG	2	6	204655	204660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137188
4058	NC_017168	TAC	2	6	204664	204669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137188
4059	NC_017168	AGC	2	6	204703	204708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137188
4060	NC_017168	TAT	2	6	204741	204746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137188
4061	NC_017168	AATG	2	8	204780	204787	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017168	ATT	2	6	204805	204810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017168	CTT	2	6	204933	204938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137189
4064	NC_017168	AATAT	2	10	204955	204964	60 %	40 %	0 %	0 %	384137189
4065	NC_017168	CCAG	2	8	205069	205076	25 %	0 %	25 %	50 %	384137189
4066	NC_017168	TCA	2	6	205178	205183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137189
4067	NC_017168	CTT	2	6	205341	205346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137189
4068	NC_017168	CTA	2	6	205359	205364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137189
4069	NC_017168	CAT	2	6	205422	205427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137189
4070	NC_017168	TGG	2	6	205437	205442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137189
4071	NC_017168	ACTT	2	8	205534	205541	25 %	50 %	0 %	25 %	384137189
4072	NC_017168	GTA	2	6	205597	205602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137189
4073	NC_017168	TGC	2	6	205708	205713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137189
4074	NC_017168	CAGG	2	8	205750	205757	25 %	0 %	50 %	25 %	384137189
4075	NC_017168	AAC	2	6	205778	205783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137189
4076	NC_017168	AAC	2	6	205799	205804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137189
4077	NC_017168	AG	3	6	205868	205873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_017168	T	6	6	205905	205910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_017168	T	6	6	205933	205938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017168	TAA	2	6	205944	205949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_017168	TTA	2	6	206046	206051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_017168	A	8	8	206081	206088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_017168	A	8	8	206092	206099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017168	GTGG	2	8	206113	206120	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017168	CA	3	6	206128	206133	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4086	NC_017168	AAG	2	6	206167	206172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_017168	TCA	2	6	206198	206203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_017168	GTCA	2	8	206211	206218	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4089	NC_017168	ATCA	2	8	206225	206232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4090	NC_017168	GCA	2	6	206303	206308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_017168	TCC	2	6	206340	206345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4092	NC_017168	TTTC	2	8	206438	206445	0 %	75 %	0 %	25 %	384137190
4093	NC_017168	GTCTG	2	10	206464	206473	0 %	40 %	40 %	20 %	384137190
4094	NC_017168	CAA	2	6	206508	206513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137190
4095	NC_017168	CTG	2	6	206532	206537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137190
4096	NC_017168	CCG	2	6	206540	206545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137190
4097	NC_017168	CCA	2	6	206561	206566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137190
4098	NC_017168	ATA	2	6	206664	206669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137190
4099	NC_017168	ATG	2	6	206676	206681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137190
4100	NC_017168	A	7	7	206693	206699	100 %	0 %	0 %	0 %	384137190
4101	NC_017168	AAGGAA	2	12	206755	206766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017168	ATTAA	2	10	206818	206827	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017168	T	7	7	206828	206834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017168	TCA	2	6	206838	206843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_017168	GA	3	6	206917	206922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017168	AAC	2	6	206939	206944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_017168	T	6	6	206966	206971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017168	ATAA	2	8	207020	207027	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017168	TAC	2	6	207032	207037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_017168	TTG	2	6	207119	207124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137191
4111	NC_017168	AGA	2	6	207128	207133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137191
4112	NC_017168	ATC	2	6	207136	207141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137191
4113	NC_017168	TAG	2	6	207146	207151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137191
4114	NC_017168	CTG	2	6	207184	207189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137191
4115	NC_017168	GGA	2	6	207201	207206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384137191
4116	NC_017168	TGC	2	6	207236	207241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137191
4117	NC_017168	AAG	2	6	207253	207258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137191
4118	NC_017168	CAGAT	2	10	207277	207286	40 %	20 %	20 %	20 %	384137191
4119	NC_017168	GCA	2	6	207338	207343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137191
4120	NC_017168	CAG	3	9	207388	207396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137191
4121	NC_017168	ATT	2	6	207435	207440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137191
4122	NC_017168	ATG	2	6	207496	207501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137191
4123	NC_017168	GCG	2	6	207531	207536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137191
4124	NC_017168	A	6	6	207679	207684	100 %	0 %	0 %	0 %	384137191
4125	NC_017168	AAT	2	6	207767	207772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137191
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4252	NC_017168	GT	3	6	212041	212046	0 %	50 %	50 %	0 %	384137195
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4352	NC_017168	AAATA	2	10	216075	216084	80 %	20 %	0 %	0 %	384137201
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4360	NC_017168	TAT	2	6	216366	216371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137202
4361	NC_017168	A	6	6	216377	216382	100 %	0 %	0 %	0 %	384137202
4362	NC_017168	AGAA	2	8	216397	216404	75 %	0 %	25 %	0 %	384137202
4363	NC_017168	GAA	2	6	216426	216431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137202
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4372	NC_017168	GCT	2	6	216924	216929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137202
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