MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 89546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_017168	CGG	2	6	1080888	1080893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384138000
21503	NC_017168	CAG	2	6	1080915	1080920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384138000
21504	NC_017168	ATA	2	6	1080962	1080967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384138000
21505	NC_017168	GCC	2	6	1080992	1080997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384138000
21506	NC_017168	TGA	2	6	1081121	1081126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384138000
21507	NC_017168	GT	3	6	1081133	1081138	0 %	50 %	50 %	0 %	384138000
21508	NC_017168	CAGC	2	8	1081257	1081264	25 %	0 %	25 %	50 %	384138000
21509	NC_017168	CGC	2	6	1081282	1081287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384138000
21510	NC_017168	TTC	2	6	1081301	1081306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384138000
21511	NC_017168	AT	3	6	1081449	1081454	50 %	50 %	0 %	0 %	384138000
21512	NC_017168	TCAA	2	8	1081460	1081467	50 %	25 %	0 %	25 %	384138000
21513	NC_017168	TTTACC	2	12	1081660	1081671	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384138000
21514	NC_017168	GGGGC	2	10	1081920	1081929	0 %	0 %	80 %	20 %	384138000
21515	NC_017168	CAATC	2	10	1082073	1082082	40 %	20 %	0 %	40 %	384138000
21516	NC_017168	CAG	2	6	1082145	1082150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384138000
21517	NC_017168	CAA	2	6	1082169	1082174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384138000
21518	NC_017168	T	6	6	1082209	1082214	0 %	100 %	0 %	0 %	384138000
21519	NC_017168	CAGC	2	8	1082244	1082251	25 %	0 %	25 %	50 %	384138000
21520	NC_017168	ATC	2	6	1082296	1082301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384138000
21521	NC_017168	GAG	2	6	1082304	1082309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384138000
21522	NC_017168	TCA	2	6	1082321	1082326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384138000
21523	NC_017168	GTCT	2	8	1082347	1082354	0 %	50 %	25 %	25 %	384138000
21524	NC_017168	TAG	2	6	1082358	1082363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384138000
21525	NC_017168	GA	3	6	1082375	1082380	50 %	0 %	50 %	0 %	384138000
21526	NC_017168	CAC	2	6	1082427	1082432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384138000
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21528	NC_017168	T	6	6	1082514	1082519	0 %	100 %	0 %	0 %	384138000
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21531	NC_017168	CAT	2	6	1082763	1082768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384138000
21532	NC_017168	TGA	2	6	1082822	1082827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384138000
21533	NC_017168	ATC	2	6	1082851	1082856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384138000
21534	NC_017168	CGGT	2	8	1082866	1082873	0 %	25 %	50 %	25 %	384138000
21535	NC_017168	TCA	2	6	1082897	1082902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384138000
21536	NC_017168	ACT	2	6	1082930	1082935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384138000
21537	NC_017168	GCA	3	9	1082958	1082966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384138000
21538	NC_017168	GTG	2	6	1083030	1083035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384138000
21539	NC_017168	CAA	2	6	1083075	1083080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384138000
21540	NC_017168	TTC	2	6	1083117	1083122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21541	NC_017168	TG	3	6	1083268	1083273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21542	NC_017168	ATT	2	6	1083275	1083280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21543	NC_017168	ATG	2	6	1083328	1083333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21544	NC_017168	T	6	6	1083351	1083356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21545	NC_017168	ATTT	2	8	1083367	1083374	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21546	NC_017168	ACA	3	9	1083405	1083413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21547	NC_017168	T	6	6	1083456	1083461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21548	NC_017168	ATAA	2	8	1083556	1083563	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21549	NC_017168	A	8	8	1083562	1083569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21550	NC_017168	CAA	2	6	1083574	1083579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21551	NC_017168	ATT	2	6	1083602	1083607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384138001
21552	NC_017168	CAG	2	6	1083615	1083620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384138001
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21554	NC_017168	CAT	2	6	1083680	1083685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384138001
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21556	NC_017168	AACA	2	8	1083708	1083715	75 %	0 %	0 %	25 %	384138001
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21563	NC_017168	T	7	7	1084026	1084032	0 %	100 %	0 %	0 %	384138001
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21568	NC_017168	AT	3	6	1084499	1084504	50 %	50 %	0 %	0 %	384138002
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21582	NC_017168	AAT	2	6	1085270	1085275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21583	NC_017168	ATA	2	6	1085278	1085283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21585	NC_017168	TCT	2	6	1085366	1085371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384138003
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21587	NC_017168	GAT	2	6	1085430	1085435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384138003
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21590	NC_017168	TCAA	2	8	1085558	1085565	50 %	25 %	0 %	25 %	384138003
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21592	NC_017168	AGTG	2	8	1085874	1085881	25 %	25 %	50 %	0 %	384138004
21593	NC_017168	TA	3	6	1085915	1085920	50 %	50 %	0 %	0 %	384138004
21594	NC_017168	ATGC	2	8	1085983	1085990	25 %	25 %	25 %	25 %	384138004
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21596	NC_017168	GAT	2	6	1086115	1086120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384138004
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21601	NC_017168	TTA	2	6	1086393	1086398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384138005
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21604	NC_017168	CAAT	2	8	1086667	1086674	50 %	25 %	0 %	25 %	384138005
21605	NC_017168	GAC	2	6	1086767	1086772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384138005
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21607	NC_017168	T	7	7	1087002	1087008	0 %	100 %	0 %	0 %	384138006
21608	NC_017168	AAC	2	6	1087032	1087037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384138006
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21966	NC_017168	TTAA	2	8	1106036	1106043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21967	NC_017168	CCCCA	2	10	1106091	1106100	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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21980	NC_017168	AAC	2	6	1106842	1106847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384138019
21981	NC_017168	A	6	6	1106887	1106892	100 %	0 %	0 %	0 %	384138019
21982	NC_017168	ATC	2	6	1106943	1106948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384138019
21983	NC_017168	ATCG	2	8	1106975	1106982	25 %	25 %	25 %	25 %	384138019
21984	NC_017168	TAT	2	6	1107146	1107151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384138019
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