MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 89546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017168	T	6	6	47637	47642	0 %	100 %	0 %	0 %	384137046
1002	NC_017168	GAT	2	6	47685	47690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137046
1003	NC_017168	ATT	2	6	47716	47721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137046
1004	NC_017168	TATT	2	8	47738	47745	25 %	75 %	0 %	0 %	384137046
1005	NC_017168	ATT	2	6	47827	47832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137046
1006	NC_017168	TGG	2	6	47870	47875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137046
1007	NC_017168	GCG	2	6	47974	47979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137046
1008	NC_017168	GCG	2	6	48052	48057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137046
1009	NC_017168	G	6	6	48084	48089	0 %	0 %	100 %	0 %	384137046
1010	NC_017168	TAT	2	6	48111	48116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137046
1011	NC_017168	GGT	2	6	48186	48191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137046
1012	NC_017168	ATC	4	12	48202	48213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137046
1013	NC_017168	GCA	2	6	48294	48299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_017168	TGTT	2	8	48332	48339	0 %	75 %	25 %	0 %	384137047
1015	NC_017168	GTT	2	6	48398	48403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137047
1016	NC_017168	GGC	2	6	48539	48544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137047
1017	NC_017168	TCAG	2	8	48699	48706	25 %	25 %	25 %	25 %	384137047
1018	NC_017168	GCCA	2	8	48761	48768	25 %	0 %	25 %	50 %	384137047
1019	NC_017168	CGG	2	6	48802	48807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137047
1020	NC_017168	GTT	2	6	48896	48901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137047
1021	NC_017168	G	6	6	48944	48949	0 %	0 %	100 %	0 %	384137047
1022	NC_017168	ACC	2	6	49041	49046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137047
1023	NC_017168	GC	3	6	49050	49055	0 %	0 %	50 %	50 %	384137047
1024	NC_017168	GGC	2	6	49099	49104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137047
1025	NC_017168	TGAA	2	8	49185	49192	50 %	25 %	25 %	0 %	384137047
1026	NC_017168	GC	3	6	49195	49200	0 %	0 %	50 %	50 %	384137047
1027	NC_017168	CAG	2	6	49231	49236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137047
1028	NC_017168	GTT	2	6	49295	49300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137047
1029	NC_017168	TGC	2	6	49303	49308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137047
1030	NC_017168	CGG	2	6	49335	49340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137047
1031	NC_017168	TGA	2	6	49371	49376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137047
1032	NC_017168	TG	3	6	49548	49553	0 %	50 %	50 %	0 %	384137047
1033	NC_017168	CGC	2	6	49606	49611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137047
1034	NC_017168	TCG	2	6	49629	49634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137047
1035	NC_017168	GGT	2	6	49742	49747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137047
1036	NC_017168	TGA	2	6	49827	49832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137047
1037	NC_017168	GCCACC	2	12	49892	49903	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384137047
1038	NC_017168	ACT	2	6	49910	49915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137047
1039	NC_017168	TTCA	2	8	49988	49995	25 %	50 %	0 %	25 %	384137047
1040	NC_017168	GGA	2	6	50009	50014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384137047
1041	NC_017168	TGG	2	6	50044	50049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137047
1042	NC_017168	CAT	2	6	50212	50217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137047
1043	NC_017168	TGGC	2	8	50275	50282	0 %	25 %	50 %	25 %	384137047
1044	NC_017168	TGG	2	6	50302	50307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137047
1045	NC_017168	TC	3	6	50339	50344	0 %	50 %	0 %	50 %	384137047
1046	NC_017168	TCT	2	6	50358	50363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137047
1047	NC_017168	GCA	2	6	50380	50385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137047
1048	NC_017168	TTTAT	2	10	50469	50478	20 %	80 %	0 %	0 %	384137047
1049	NC_017168	CTG	2	6	50529	50534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137048
1050	NC_017168	CCG	2	6	50609	50614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137049
1051	NC_017168	TGC	2	6	50689	50694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137049
1052	NC_017168	TTTGC	2	10	50697	50706	0 %	60 %	20 %	20 %	384137049
1053	NC_017168	TGGCT	2	10	50777	50786	0 %	40 %	40 %	20 %	384137049
1054	NC_017168	TGT	2	6	50891	50896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137049
1055	NC_017168	ACC	2	6	50898	50903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137049
1056	NC_017168	CAG	2	6	50913	50918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137049
1057	NC_017168	GTG	3	9	50941	50949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137049
1058	NC_017168	GCA	2	6	50981	50986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137049
1059	NC_017168	GCG	2	6	51013	51018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137049
1060	NC_017168	TGG	2	6	51025	51030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137049
1061	NC_017168	GCTT	2	8	51175	51182	0 %	50 %	25 %	25 %	384137049
1062	NC_017168	TTC	2	6	51204	51209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137049
1063	NC_017168	TGC	2	6	51296	51301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137049
1064	NC_017168	TA	3	6	51341	51346	50 %	50 %	0 %	0 %	384137049
1065	NC_017168	TTC	2	6	51370	51375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137049
1066	NC_017168	CAC	2	6	51393	51398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137049
1067	NC_017168	GCG	2	6	51403	51408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137049
1068	NC_017168	TA	3	6	51437	51442	50 %	50 %	0 %	0 %	384137049
1069	NC_017168	ATACG	2	10	51461	51470	40 %	20 %	20 %	20 %	384137049
1070	NC_017168	AAC	2	6	51562	51567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137049
1071	NC_017168	A	7	7	51590	51596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017168	A	8	8	51646	51653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017168	T	6	6	51765	51770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017168	CTG	2	6	51771	51776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_017168	ATT	2	6	51802	51807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017168	TTA	2	6	51847	51852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017168	TTA	2	6	51865	51870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017168	GCG	2	6	51881	51886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137050
1079	NC_017168	TTC	2	6	51891	51896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137050
1080	NC_017168	CGG	2	6	51924	51929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137050
1081	NC_017168	GATG	2	8	51939	51946	25 %	25 %	50 %	0 %	384137050
1082	NC_017168	GCC	2	6	52049	52054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137050
1083	NC_017168	AGG	2	6	52060	52065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384137050
1084	NC_017168	C	7	7	52103	52109	0 %	0 %	0 %	100 %	384137050
1085	NC_017168	ATT	2	6	52157	52162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137050
1086	NC_017168	TTGG	2	8	52189	52196	0 %	50 %	50 %	0 %	384137050
1087	NC_017168	ACC	2	6	52245	52250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137050
1088	NC_017168	TGC	2	6	52352	52357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137050
1089	NC_017168	AACG	2	8	52427	52434	50 %	0 %	25 %	25 %	384137050
1090	NC_017168	TTTTG	2	10	52468	52477	0 %	80 %	20 %	0 %	384137050
1091	NC_017168	AAT	2	6	52483	52488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137050
1092	NC_017168	TTG	2	6	52533	52538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137050
1093	NC_017168	TCGA	2	8	52605	52612	25 %	25 %	25 %	25 %	384137050
1094	NC_017168	ATC	2	6	52619	52624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137050
1095	NC_017168	TGA	2	6	52642	52647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137050
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1097	NC_017168	CTT	2	6	52786	52791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137050
1098	NC_017168	TTG	2	6	52890	52895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137050
1099	NC_017168	TAA	2	6	52910	52915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137050
1100	NC_017168	TTC	2	6	52944	52949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137050
1101	NC_017168	TGA	2	6	52968	52973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017168	GCC	2	6	53070	53075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_017168	TTAC	2	8	53134	53141	25 %	50 %	0 %	25 %	384137051
1104	NC_017168	TCT	2	6	53222	53227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137051
1105	NC_017168	TCA	2	6	53232	53237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137051
1106	NC_017168	GTTT	2	8	53267	53274	0 %	75 %	25 %	0 %	384137051
1107	NC_017168	CTT	2	6	53295	53300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137051
1108	NC_017168	CTT	2	6	53371	53376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137051
1109	NC_017168	A	6	6	53388	53393	100 %	0 %	0 %	0 %	384137051
1110	NC_017168	TGC	2	6	53549	53554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_017168	GTT	3	9	53625	53633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137052
1112	NC_017168	TAA	2	6	53665	53670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137052
1113	NC_017168	AGC	2	6	53695	53700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137052
1114	NC_017168	CAT	2	6	53748	53753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137052
1115	NC_017168	CTG	2	6	53842	53847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137052
1116	NC_017168	TTC	2	6	53893	53898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137052
1117	NC_017168	GCC	2	6	53929	53934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137052
1118	NC_017168	G	6	6	53948	53953	0 %	0 %	100 %	0 %	384137052
1119	NC_017168	TAA	2	6	53989	53994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137052
1120	NC_017168	T	6	6	54006	54011	0 %	100 %	0 %	0 %	384137052
1121	NC_017168	T	6	6	54031	54036	0 %	100 %	0 %	0 %	384137052
1122	NC_017168	GC	3	6	54046	54051	0 %	0 %	50 %	50 %	384137052
1123	NC_017168	AC	3	6	54124	54129	50 %	0 %	0 %	50 %	384137052
1124	NC_017168	CAT	2	6	54145	54150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137052
1125	NC_017168	GGC	2	6	54210	54215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137052
1126	NC_017168	T	7	7	54226	54232	0 %	100 %	0 %	0 %	384137052
1127	NC_017168	TGT	2	6	54379	54384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137052
1128	NC_017168	GTA	2	6	54451	54456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137052
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1252	NC_017168	A	6	6	59687	59692	100 %	0 %	0 %	0 %	384137058
1253	NC_017168	ATT	2	6	59696	59701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137058
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