MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 89546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_017168	GCA	2	6	648244	648249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137577
13003	NC_017168	CAT	3	9	648275	648283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137577
13004	NC_017168	CCGG	2	8	648400	648407	0 %	0 %	50 %	50 %	384137577
13005	NC_017168	TGA	2	6	648418	648423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137577
13006	NC_017168	TCA	2	6	648442	648447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137577
13007	NC_017168	TCG	2	6	648451	648456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137577
13008	NC_017168	GGT	2	6	648465	648470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137577
13009	NC_017168	GC	3	6	648515	648520	0 %	0 %	50 %	50 %	384137577
13010	NC_017168	TC	3	6	648622	648627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13011	NC_017168	GGT	2	6	648628	648633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_017168	TAT	2	6	648725	648730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_017168	AT	3	6	648794	648799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_017168	ATT	2	6	648801	648806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_017168	TCAA	2	8	648861	648868	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13016	NC_017168	CAT	2	6	648921	648926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13017	NC_017168	GAA	2	6	649127	649132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137578
13018	NC_017168	TCG	2	6	649141	649146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137578
13019	NC_017168	TCA	2	6	649150	649155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137578
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13021	NC_017168	GAC	2	6	649210	649215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137578
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13023	NC_017168	CA	3	6	649279	649284	50 %	0 %	0 %	50 %	384137578
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13030	NC_017168	C	7	7	649541	649547	0 %	0 %	0 %	100 %	384137578
13031	NC_017168	GCAAT	2	10	649561	649570	40 %	20 %	20 %	20 %	384137578
13032	NC_017168	CCCG	2	8	649754	649761	0 %	0 %	25 %	75 %	384137578
13033	NC_017168	TGC	2	6	649763	649768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137578
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13036	NC_017168	CA	3	6	649858	649863	50 %	0 %	0 %	50 %	384137578
13037	NC_017168	CTGA	2	8	649879	649886	25 %	25 %	25 %	25 %	384137578
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13039	NC_017168	TCTG	2	8	649926	649933	0 %	50 %	25 %	25 %	384137578
13040	NC_017168	TCCG	2	8	649968	649975	0 %	25 %	25 %	50 %	384137578
13041	NC_017168	CAG	2	6	649985	649990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137578
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13052	NC_017168	ATG	2	6	650429	650434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13056	NC_017168	CTC	2	6	650669	650674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13059	NC_017168	GCA	2	6	650834	650839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13063	NC_017168	GA	3	6	650896	650901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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13081	NC_017168	CAGT	2	8	651823	651830	25 %	25 %	25 %	25 %	384137581
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13094	NC_017168	GCT	2	6	652322	652327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137581
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13103	NC_017168	A	7	7	652739	652745	100 %	0 %	0 %	0 %	384137581
13104	NC_017168	TGG	2	6	652753	652758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137581
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13108	NC_017168	C	6	6	652920	652925	0 %	0 %	0 %	100 %	384137581
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13112	NC_017168	CAC	2	6	653142	653147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137582
13113	NC_017168	TGC	2	6	653160	653165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137582
13114	NC_017168	CCA	2	6	653188	653193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137582
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13117	NC_017168	G	6	6	653349	653354	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_017168	TTAT	2	8	653360	653367	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_017168	AAT	2	6	653411	653416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13123	NC_017168	ACG	2	6	653768	653773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137583
13124	NC_017168	TTC	2	6	653818	653823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137583
13125	NC_017168	TTC	2	6	653882	653887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137583
13126	NC_017168	GGC	2	6	653929	653934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137583
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13131	NC_017168	CAA	2	6	654082	654087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13132	NC_017168	ACC	2	6	654100	654105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13133	NC_017168	AATC	2	8	654172	654179	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13134	NC_017168	AGAT	2	8	654197	654204	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13135	NC_017168	AGA	2	6	654211	654216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13136	NC_017168	TCA	2	6	654249	654254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13137	NC_017168	A	6	6	654276	654281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13138	NC_017168	TGA	2	6	654295	654300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13139	NC_017168	GCA	2	6	654336	654341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13143	NC_017168	GCA	2	6	654617	654622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137584
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13162	NC_017168	GCC	2	6	655971	655976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13200	NC_017168	CATT	2	8	658224	658231	25 %	50 %	0 %	25 %	384137588
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13227	NC_017168	AATA	2	8	659151	659158	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13228	NC_017168	TTA	2	6	659176	659181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13237	NC_017168	TTA	2	6	659596	659601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137590
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13242	NC_017168	GTT	2	6	659922	659927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137590
13243	NC_017168	CTG	2	6	659956	659961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137590
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13491	NC_017168	CGG	2	6	672082	672087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137600
13492	NC_017168	GGC	2	6	672095	672100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137600
13493	NC_017168	TCC	2	6	672105	672110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384137600
13494	NC_017168	TTC	2	6	672155	672160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137600
13495	NC_017168	AAG	2	6	672204	672209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137600
13496	NC_017168	AAT	2	6	672278	672283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137600
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13499	NC_017168	CCG	2	6	672331	672336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137600
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