MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 89546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017168	T	6	6	622628	622633	0 %	100 %	0 %	0 %	384137554
12502	NC_017168	TCT	2	6	622701	622706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137554
12503	NC_017168	CCG	2	6	622731	622736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137554
12504	NC_017168	ATC	2	6	622781	622786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137554
12505	NC_017168	TCC	2	6	622854	622859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384137554
12506	NC_017168	AAAG	2	8	622881	622888	75 %	0 %	25 %	0 %	384137554
12507	NC_017168	T	7	7	622912	622918	0 %	100 %	0 %	0 %	384137554
12508	NC_017168	AAC	2	6	622942	622947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12509	NC_017168	T	7	7	622963	622969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_017168	AC	3	6	623027	623032	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12511	NC_017168	CTA	2	6	623075	623080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12512	NC_017168	TGC	2	6	623227	623232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137555
12513	NC_017168	AAG	2	6	623314	623319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137555
12514	NC_017168	GCA	2	6	623398	623403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137555
12515	NC_017168	CG	3	6	623414	623419	0 %	0 %	50 %	50 %	384137555
12516	NC_017168	A	6	6	623423	623428	100 %	0 %	0 %	0 %	384137555
12517	NC_017168	TTACC	2	10	623538	623547	20 %	40 %	0 %	40 %	384137555
12518	NC_017168	AAC	2	6	623550	623555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137555
12519	NC_017168	AC	3	6	623606	623611	50 %	0 %	0 %	50 %	384137555
12520	NC_017168	CAA	2	6	623639	623644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137555
12521	NC_017168	ACG	2	6	623741	623746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137555
12522	NC_017168	ATG	2	6	623832	623837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137555
12523	NC_017168	CCT	2	6	623966	623971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384137555
12524	NC_017168	TCA	2	6	624023	624028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137556
12525	NC_017168	ACGTAA	2	12	624133	624144	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384137556
12526	NC_017168	CGC	2	6	624146	624151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137556
12527	NC_017168	CAA	2	6	624172	624177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137556
12528	NC_017168	CAA	2	6	624184	624189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137556
12529	NC_017168	CTAA	2	8	624212	624219	50 %	25 %	0 %	25 %	384137556
12530	NC_017168	CAG	2	6	624234	624239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137556
12531	NC_017168	TGCA	2	8	624265	624272	25 %	25 %	25 %	25 %	384137556
12532	NC_017168	TCC	2	6	624273	624278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384137556
12533	NC_017168	CTT	2	6	624357	624362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137556
12534	NC_017168	CTG	2	6	624475	624480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137556
12535	NC_017168	TAA	2	6	624501	624506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137556
12536	NC_017168	GCA	2	6	624890	624895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137557
12537	NC_017168	CG	3	6	624933	624938	0 %	0 %	50 %	50 %	384137557
12538	NC_017168	TTGGG	2	10	624963	624972	0 %	40 %	60 %	0 %	384137557
12539	NC_017168	ATA	2	6	624992	624997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137557
12540	NC_017168	ATGG	2	8	625008	625015	25 %	25 %	50 %	0 %	384137557
12541	NC_017168	TGC	2	6	625064	625069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137557
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12545	NC_017168	TTG	2	6	625225	625230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137557
12546	NC_017168	TTG	2	6	625297	625302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137558
12547	NC_017168	TGG	2	6	625338	625343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137558
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12549	NC_017168	AAT	2	6	625446	625451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137558
12550	NC_017168	TCA	2	6	625480	625485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137558
12551	NC_017168	GTCA	2	8	625659	625666	25 %	25 %	25 %	25 %	384137558
12552	NC_017168	ACC	2	6	625687	625692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12553	NC_017168	ACA	2	6	625713	625718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12554	NC_017168	ACAA	2	8	625789	625796	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12555	NC_017168	GCT	2	6	625804	625809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12556	NC_017168	AC	3	6	625865	625870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12557	NC_017168	TTC	2	6	626006	626011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137559
12558	NC_017168	CG	3	6	626019	626024	0 %	0 %	50 %	50 %	384137559
12559	NC_017168	CAC	2	6	626073	626078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137559
12560	NC_017168	CCAA	2	8	626085	626092	50 %	0 %	0 %	50 %	384137559
12561	NC_017168	TAG	2	6	626177	626182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137559
12562	NC_017168	GCT	2	6	626221	626226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137559
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12569	NC_017168	GC	4	8	626570	626577	0 %	0 %	50 %	50 %	384137559
12570	NC_017168	GCC	2	6	626657	626662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137559
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12580	NC_017168	ATG	2	6	627054	627059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137559
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12583	NC_017168	TCGG	2	8	627137	627144	0 %	25 %	50 %	25 %	384137559
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12588	NC_017168	TTG	2	6	627328	627333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137559
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12592	NC_017168	ATTC	2	8	627528	627535	25 %	50 %	0 %	25 %	384137559
12593	NC_017168	GGT	2	6	627563	627568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137559
12594	NC_017168	GTC	2	6	627791	627796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137559
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12596	NC_017168	GTT	2	6	627857	627862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12597	NC_017168	T	6	6	627887	627892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12598	NC_017168	TCT	2	6	627921	627926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12599	NC_017168	CA	3	6	627940	627945	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12600	NC_017168	ACTA	2	8	627982	627989	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12601	NC_017168	CGG	2	6	628101	628106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12602	NC_017168	TTA	2	6	628117	628122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_017168	TAT	2	6	628129	628134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_017168	TATT	2	8	628172	628179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12605	NC_017168	CTA	2	6	628212	628217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12606	NC_017168	TGT	2	6	628240	628245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12607	NC_017168	T	8	8	628266	628273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_017168	TAA	2	6	628280	628285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12609	NC_017168	ATT	2	6	628330	628335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_017168	TAGA	2	8	628372	628379	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12611	NC_017168	TTA	2	6	628381	628386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_017168	TCA	2	6	628416	628421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137560
12613	NC_017168	C	7	7	628438	628444	0 %	0 %	0 %	100 %	384137560
12614	NC_017168	GAA	2	6	628479	628484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137560
12615	NC_017168	GCA	2	6	628490	628495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137560
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12617	NC_017168	AAAAC	2	10	628581	628590	80 %	0 %	0 %	20 %	384137560
12618	NC_017168	ATT	2	6	628692	628697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137560
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12621	NC_017168	CAC	2	6	629036	629041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137560
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12623	NC_017168	ATCA	2	8	629106	629113	50 %	25 %	0 %	25 %	384137560
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