MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 89546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_017168	A	6	6	543030	543035	100 %	0 %	0 %	0 %	384137493
11003	NC_017168	CCGT	2	8	543097	543104	0 %	25 %	25 %	50 %	384137493
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11005	NC_017168	CGG	2	6	543258	543263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137493
11006	NC_017168	C	6	6	543287	543292	0 %	0 %	0 %	100 %	384137493
11007	NC_017168	GGCC	2	8	543339	543346	0 %	0 %	50 %	50 %	384137493
11008	NC_017168	TGA	2	6	543382	543387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137493
11009	NC_017168	GAT	2	6	543498	543503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137493
11010	NC_017168	CAC	2	6	543506	543511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137493
11011	NC_017168	T	6	6	543535	543540	0 %	100 %	0 %	0 %	384137493
11012	NC_017168	ATA	2	6	543545	543550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_017168	GTT	2	6	543553	543558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_017168	CCTT	2	8	543580	543587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11015	NC_017168	ATCA	2	8	543615	543622	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11016	NC_017168	GTT	2	6	543644	543649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_017168	CAGA	2	8	543689	543696	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11018	NC_017168	TA	3	6	543755	543760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_017168	CAAG	2	8	543766	543773	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11020	NC_017168	A	6	6	543784	543789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_017168	GCCA	2	8	543795	543802	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11022	NC_017168	CT	3	6	543814	543819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11023	NC_017168	GTT	2	6	543851	543856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_017168	A	7	7	543890	543896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_017168	A	6	6	543937	543942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_017168	CAA	2	6	543977	543982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11027	NC_017168	A	7	7	543981	543987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_017168	TCAC	2	8	544184	544191	25 %	25 %	0 %	50 %	384137494
11029	NC_017168	GAA	2	6	544216	544221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137494
11030	NC_017168	ATCG	2	8	544360	544367	25 %	25 %	25 %	25 %	384137494
11031	NC_017168	GAT	2	6	544566	544571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137494
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11033	NC_017168	CTG	2	6	544585	544590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137494
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11062	NC_017168	AGTT	2	8	546452	546459	25 %	50 %	25 %	0 %	384137494
11063	NC_017168	CCA	2	6	546511	546516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137494
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11080	NC_017168	CTC	2	6	547270	547275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384137496
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11089	NC_017168	GGTT	2	8	547823	547830	0 %	50 %	50 %	0 %	384137497
11090	NC_017168	TAA	2	6	547848	547853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137497
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11093	NC_017168	AACG	2	8	547982	547989	50 %	0 %	25 %	25 %	384137497
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11102	NC_017168	CGG	2	6	548567	548572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137497
11103	NC_017168	TTA	2	6	548585	548590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137497
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11105	NC_017168	TTG	2	6	548633	548638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137497
11106	NC_017168	TTGCC	2	10	548710	548719	0 %	40 %	20 %	40 %	384137497
11107	NC_017168	AGC	2	6	548720	548725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137497
11108	NC_017168	CAT	2	6	548730	548735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137497
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11110	NC_017168	TTGG	2	8	548785	548792	0 %	50 %	50 %	0 %	384137497
11111	NC_017168	ATA	2	6	548806	548811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137497
11112	NC_017168	GC	3	6	548815	548820	0 %	0 %	50 %	50 %	384137497
11113	NC_017168	ATC	2	6	548909	548914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137497
11114	NC_017168	TACTG	2	10	548998	549007	20 %	40 %	20 %	20 %	384137497
11115	NC_017168	CGG	2	6	549045	549050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137497
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11117	NC_017168	CCT	2	6	549312	549317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384137497
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11121	NC_017168	CAG	2	6	549843	549848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137497
11122	NC_017168	ATA	2	6	549880	549885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137497
11123	NC_017168	AAC	2	6	549939	549944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137497
11124	NC_017168	CAG	2	6	550030	550035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137497
11125	NC_017168	TGG	2	6	550040	550045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137497
11126	NC_017168	TTC	2	6	550123	550128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137497
11127	NC_017168	TCG	2	6	550199	550204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137497
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11129	NC_017168	TTG	2	6	550250	550255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137497
11130	NC_017168	CTT	2	6	550461	550466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137497
11131	NC_017168	GCA	2	6	550479	550484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137497
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11133	NC_017168	GCATC	2	10	550761	550770	20 %	20 %	20 %	40 %	384137497
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11135	NC_017168	GAA	2	6	550858	550863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137497
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11137	NC_017168	AAAAT	2	10	550890	550899	80 %	20 %	0 %	0 %	384137497
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11142	NC_017168	TTG	2	6	551045	551050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137498
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11149	NC_017168	TTCA	2	8	551525	551532	25 %	50 %	0 %	25 %	384137498
11150	NC_017168	ATG	2	6	551565	551570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137498
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11153	NC_017168	TG	3	6	551763	551768	0 %	50 %	50 %	0 %	384137498
11154	NC_017168	CAG	2	6	551816	551821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137498
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11157	NC_017168	GGT	2	6	552064	552069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137498
11158	NC_017168	TCT	2	6	552075	552080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137498
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11169	NC_017168	CCCA	2	8	552527	552534	25 %	0 %	0 %	75 %	384137498
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11172	NC_017168	CAT	2	6	552739	552744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137499
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11193	NC_017168	GC	3	6	553884	553889	0 %	0 %	50 %	50 %	384137499
11194	NC_017168	TGT	2	6	553937	553942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137499
11195	NC_017168	GTT	2	6	553989	553994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137499
11196	NC_017168	GCA	2	6	553998	554003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137499
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11198	NC_017168	TGA	2	6	554117	554122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11202	NC_017168	GAC	2	6	554340	554345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137500
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11209	NC_017168	CAA	2	6	554486	554491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137500
11210	NC_017168	CCG	2	6	554505	554510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137500
11211	NC_017168	TGAGGA	2	12	554529	554540	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384137500
11212	NC_017168	AC	3	6	554594	554599	50 %	0 %	0 %	50 %	384137500
11213	NC_017168	CTGG	2	8	554632	554639	0 %	25 %	50 %	25 %	384137501
11214	NC_017168	ATT	2	6	554668	554673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137501
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11217	NC_017168	CCG	2	6	554792	554797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137501
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11219	NC_017168	GCT	2	6	554963	554968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137501
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11221	NC_017168	TCG	2	6	555100	555105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137502
11222	NC_017168	AG	3	6	555148	555153	50 %	0 %	50 %	0 %	384137502
11223	NC_017168	GGT	2	6	555189	555194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137502
11224	NC_017168	CAC	2	6	555287	555292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137502
11225	NC_017168	TCA	2	6	555296	555301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137502
11226	NC_017168	CTG	3	9	555351	555359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137502
11227	NC_017168	CTGG	2	8	555392	555399	0 %	25 %	50 %	25 %	384137502
11228	NC_017168	AAC	2	6	555404	555409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137502
11229	NC_017168	GTG	2	6	555418	555423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137502
11230	NC_017168	CCGG	2	8	555467	555474	0 %	0 %	50 %	50 %	384137502
11231	NC_017168	GCG	2	6	555497	555502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137502
11232	NC_017168	CGG	2	6	555512	555517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137502
11233	NC_017168	GGCT	2	8	555600	555607	0 %	25 %	50 %	25 %	384137503
11234	NC_017168	T	6	6	555638	555643	0 %	100 %	0 %	0 %	384137503
11235	NC_017168	TGA	2	6	555653	555658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137503
11236	NC_017168	GT	3	6	555711	555716	0 %	50 %	50 %	0 %	384137503
11237	NC_017168	GC	3	6	555732	555737	0 %	0 %	50 %	50 %	384137503
11238	NC_017168	ACG	2	6	555774	555779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137503
11239	NC_017168	CGG	2	6	555882	555887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137503
11240	NC_017168	CAA	2	6	555918	555923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137503
11241	NC_017168	GCC	2	6	555929	555934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137503
11242	NC_017168	ACC	2	6	556106	556111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137503
11243	NC_017168	ACTG	2	8	556196	556203	25 %	25 %	25 %	25 %	384137503
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11255	NC_017168	AG	3	6	557093	557098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11256	NC_017168	C	7	7	557150	557156	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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11259	NC_017168	AAGC	2	8	557205	557212	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11260	NC_017168	ACG	2	6	557242	557247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11263	NC_017168	GGC	2	6	557447	557452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11269	NC_017168	CTG	2	6	557768	557773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11282	NC_017168	TGCC	2	8	558791	558798	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11283	NC_017168	AG	3	6	558833	558838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11284	NC_017168	CAGC	2	8	558843	558850	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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11333	NC_017168	AAAT	2	8	561313	561320	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11334	NC_017168	CAA	2	6	561375	561380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11335	NC_017168	CAA	2	6	561434	561439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137506
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11352	NC_017168	CCTC	2	8	562502	562509	0 %	25 %	0 %	75 %	384137506
11353	NC_017168	GGC	2	6	562532	562537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137506
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11363	NC_017168	TCA	2	6	563086	563091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137506
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11365	NC_017168	ACC	2	6	563275	563280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137506
11366	NC_017168	CCAA	2	8	563305	563312	50 %	0 %	0 %	50 %	384137506
11367	NC_017168	GTT	2	6	563319	563324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137506
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11369	NC_017168	CTT	2	6	563453	563458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137506
11370	NC_017168	TGA	2	6	563460	563465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137506
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11372	NC_017168	TGA	2	6	563727	563732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137506
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11374	NC_017168	CAA	2	6	563930	563935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137506
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11381	NC_017168	GCTG	2	8	564616	564623	0 %	25 %	50 %	25 %	384137507
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11393	NC_017168	GCA	2	6	565418	565423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137508
11394	NC_017168	TGA	2	6	565612	565617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137508
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11431	NC_017168	ACC	3	9	567750	567758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137510
11432	NC_017168	TCC	2	6	567787	567792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384137510
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11434	NC_017168	CTG	2	6	567831	567836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137510
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11436	NC_017168	CCT	2	6	568001	568006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11437	NC_017168	TAA	2	6	568033	568038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11454	NC_017168	ATG	2	6	568960	568965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137511
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11477	NC_017168	CAT	2	6	570321	570326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137513
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11481	NC_017168	CT	3	6	570514	570519	0 %	50 %	0 %	50 %	384137513
11482	NC_017168	GATT	2	8	570523	570530	25 %	50 %	25 %	0 %	384137513
11483	NC_017168	CAA	2	6	570552	570557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137513
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