MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 89546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_017168	TTG	2	6	517431	517436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_017168	A	6	6	517554	517559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_017168	ATTA	2	8	517604	517611	50 %	50 %	0 %	0 %	384137472
10505	NC_017168	CAC	2	6	517626	517631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137472
10506	NC_017168	CCA	2	6	517896	517901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137472
10507	NC_017168	GCT	2	6	517911	517916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137472
10508	NC_017168	CAC	2	6	518041	518046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137472
10509	NC_017168	CAG	2	6	518074	518079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137472
10510	NC_017168	CGG	2	6	518093	518098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137472
10511	NC_017168	CCA	3	9	518146	518154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137473
10512	NC_017168	GGC	2	6	518357	518362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137473
10513	NC_017168	CA	3	6	518499	518504	50 %	0 %	0 %	50 %	384137473
10514	NC_017168	ACG	2	6	518506	518511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137473
10515	NC_017168	ACG	2	6	518595	518600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137473
10516	NC_017168	TGT	2	6	518735	518740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137473
10517	NC_017168	CCA	2	6	518781	518786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137473
10518	NC_017168	ACA	2	6	518828	518833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137473
10519	NC_017168	CGG	2	6	518885	518890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137473
10520	NC_017168	ATT	2	6	518964	518969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137473
10521	NC_017168	GGT	2	6	518970	518975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137473
10522	NC_017168	ATCAG	2	10	519007	519016	40 %	20 %	20 %	20 %	384137473
10523	NC_017168	AG	3	6	519112	519117	50 %	0 %	50 %	0 %	384137473
10524	NC_017168	TTC	2	6	519159	519164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137473
10525	NC_017168	GCG	2	6	519172	519177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137473
10526	NC_017168	CAC	3	9	519185	519193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137473
10527	NC_017168	ACAT	2	8	519196	519203	50 %	25 %	0 %	25 %	384137473
10528	NC_017168	GCC	2	6	519217	519222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137473
10529	NC_017168	CTG	2	6	519326	519331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137473
10530	NC_017168	ACC	2	6	519361	519366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137473
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10532	NC_017168	TCT	2	6	519424	519429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137473
10533	NC_017168	AAG	2	6	519442	519447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137473
10534	NC_017168	CCA	2	6	519476	519481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137473
10535	NC_017168	CAAT	2	8	519509	519516	50 %	25 %	0 %	25 %	384137473
10536	NC_017168	CAC	2	6	519540	519545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137473
10537	NC_017168	ACA	2	6	519622	519627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137473
10538	NC_017168	CCG	2	6	519751	519756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137473
10539	NC_017168	ACC	2	6	519802	519807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137473
10540	NC_017168	ACA	2	6	519821	519826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137473
10541	NC_017168	CTT	2	6	519934	519939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10542	NC_017168	TAACG	2	10	519957	519966	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10543	NC_017168	TTA	2	6	519970	519975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10544	NC_017168	GGCA	2	8	519995	520002	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10545	NC_017168	AAT	2	6	520068	520073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10546	NC_017168	ATG	2	6	520173	520178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10547	NC_017168	TAGG	2	8	520194	520201	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10548	NC_017168	CAG	2	6	520215	520220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10549	NC_017168	CAG	2	6	520235	520240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10550	NC_017168	GGA	2	6	520275	520280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10551	NC_017168	GAA	2	6	520334	520339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137474
10552	NC_017168	CCG	2	6	520347	520352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137474
10553	NC_017168	T	6	6	520417	520422	0 %	100 %	0 %	0 %	384137474
10554	NC_017168	AAT	2	6	520608	520613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137474
10555	NC_017168	AT	3	6	520672	520677	50 %	50 %	0 %	0 %	384137474
10556	NC_017168	C	7	7	520680	520686	0 %	0 %	0 %	100 %	384137474
10557	NC_017168	TCA	2	6	520694	520699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137474
10558	NC_017168	TAA	2	6	520718	520723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137474
10559	NC_017168	CAA	2	6	520933	520938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137474
10560	NC_017168	ATC	2	6	521019	521024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137474
10561	NC_017168	C	6	6	521061	521066	0 %	0 %	0 %	100 %	384137474
10562	NC_017168	AC	3	6	521069	521074	50 %	0 %	0 %	50 %	384137474
10563	NC_017168	GT	3	6	521108	521113	0 %	50 %	50 %	0 %	384137474
10564	NC_017168	GCC	2	6	521141	521146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137474
10565	NC_017168	CTG	2	6	521148	521153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137474
10566	NC_017168	CTGC	2	8	521300	521307	0 %	25 %	25 %	50 %	384137474
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10568	NC_017168	TGT	2	6	521593	521598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137474
10569	NC_017168	GTTGCT	2	12	521609	521620	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384137474
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10572	NC_017168	ACAA	2	8	521755	521762	75 %	0 %	0 %	25 %	384137474
10573	NC_017168	CAT	2	6	521777	521782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137474
10574	NC_017168	GCG	2	6	521803	521808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137474
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10577	NC_017168	AG	3	6	521931	521936	50 %	0 %	50 %	0 %	384137474
10578	NC_017168	TGC	2	6	521974	521979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137474
10579	NC_017168	GCT	2	6	521987	521992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137474
10580	NC_017168	CGCT	2	8	522109	522116	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10581	NC_017168	GT	3	6	522135	522140	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10582	NC_017168	ACA	2	6	522156	522161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10583	NC_017168	T	8	8	522182	522189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10584	NC_017168	ACTC	2	8	522200	522207	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10585	NC_017168	ATA	2	6	522223	522228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10586	NC_017168	TGA	2	6	522251	522256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10587	NC_017168	ATTGA	4	20	522315	522334	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10588	NC_017168	ACTGA	2	10	522335	522344	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10589	NC_017168	GTT	2	6	522368	522373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10590	NC_017168	AAT	2	6	522481	522486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10591	NC_017168	GCGAT	2	10	522518	522527	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10592	NC_017168	T	6	6	522527	522532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10593	NC_017168	CAG	3	9	522595	522603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10594	NC_017168	GC	3	6	522726	522731	0 %	0 %	50 %	50 %	384137475
10595	NC_017168	ACCA	2	8	522792	522799	50 %	0 %	0 %	50 %	384137475
10596	NC_017168	GTT	2	6	522891	522896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137475
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10598	NC_017168	T	6	6	522926	522931	0 %	100 %	0 %	0 %	384137475
10599	NC_017168	TAAA	2	8	523036	523043	75 %	25 %	0 %	0 %	384137475
10600	NC_017168	TGT	2	6	523126	523131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137475
10601	NC_017168	TAAGA	2	10	523135	523144	60 %	20 %	20 %	0 %	384137475
10602	NC_017168	TGA	2	6	523147	523152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137475
10603	NC_017168	GCC	2	6	523200	523205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137475
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10605	NC_017168	TTAC	2	8	523419	523426	25 %	50 %	0 %	25 %	384137475
10606	NC_017168	TTTGCA	2	12	523471	523482	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384137475
10607	NC_017168	CTT	2	6	523521	523526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137475
10608	NC_017168	T	6	6	523547	523552	0 %	100 %	0 %	0 %	384137475
10609	NC_017168	TAA	2	6	523628	523633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10610	NC_017168	TGATAT	2	12	523645	523656	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_017168	TTC	2	6	523664	523669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10612	NC_017168	ATT	2	6	523721	523726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_017168	TAA	2	6	523789	523794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_017168	TGT	2	6	523884	523889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_017168	A	6	6	523904	523909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10616	NC_017168	A	6	6	523919	523924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10617	NC_017168	TA	3	6	523941	523946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10618	NC_017168	CCA	2	6	523948	523953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10619	NC_017168	CAA	2	6	523954	523959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10620	NC_017168	AAT	2	6	523999	524004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10621	NC_017168	GAT	2	6	524016	524021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10622	NC_017168	GAT	2	6	524037	524042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10623	NC_017168	TAA	2	6	524058	524063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10624	NC_017168	ATA	2	6	524064	524069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10625	NC_017168	TCA	2	6	524073	524078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10627	NC_017168	TAATTA	2	12	524147	524158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10628	NC_017168	TAA	2	6	524225	524230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10629	NC_017168	CAT	2	6	524232	524237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10867	NC_017168	A	7	7	536269	536275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10868	NC_017168	TAC	2	6	536282	536287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10993	NC_017168	TGG	2	6	542500	542505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137493
10994	NC_017168	GCA	2	6	542513	542518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137493
10995	NC_017168	AGC	2	6	542621	542626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137493
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