MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 89546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017168	GCA	2	6	23836	23841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137029
502	NC_017168	CTGG	2	8	23842	23849	0 %	25 %	50 %	25 %	384137029
503	NC_017168	CCG	2	6	23891	23896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137029
504	NC_017168	CGC	2	6	23899	23904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137029
505	NC_017168	GTC	2	6	23965	23970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137029
506	NC_017168	GGC	2	6	24013	24018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137029
507	NC_017168	TGG	2	6	24021	24026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137029
508	NC_017168	GCA	2	6	24033	24038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137029
509	NC_017168	ATT	2	6	24114	24119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137029
510	NC_017168	GGCGGT	2	12	24133	24144	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384137029
511	NC_017168	GCT	2	6	24163	24168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137029
512	NC_017168	TGA	2	6	24169	24174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137029
513	NC_017168	G	6	6	24222	24227	0 %	0 %	100 %	0 %	384137029
514	NC_017168	CGC	2	6	24240	24245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137029
515	NC_017168	GGC	2	6	24250	24255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137029
516	NC_017168	CCA	2	6	24372	24377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137029
517	NC_017168	GGCT	2	8	24419	24426	0 %	25 %	50 %	25 %	384137029
518	NC_017168	GTG	2	6	24431	24436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137029
519	NC_017168	CCG	2	6	24622	24627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137029
520	NC_017168	GAC	2	6	24767	24772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137030
521	NC_017168	GCA	2	6	24819	24824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137030
522	NC_017168	ACC	2	6	24965	24970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137030
523	NC_017168	CCG	2	6	24987	24992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137030
524	NC_017168	TGA	2	6	25012	25017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137030
525	NC_017168	ACG	2	6	25092	25097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137030
526	NC_017168	ACC	2	6	25125	25130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137030
527	NC_017168	TGG	2	6	25137	25142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137030
528	NC_017168	A	6	6	25155	25160	100 %	0 %	0 %	0 %	384137030
529	NC_017168	CAT	2	6	25186	25191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137030
530	NC_017168	GC	3	6	25213	25218	0 %	0 %	50 %	50 %	384137030
531	NC_017168	TTC	2	6	25239	25244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_017168	CTGC	2	8	25275	25282	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
533	NC_017168	ATT	2	6	25290	25295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017168	CGC	2	6	25322	25327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_017168	T	6	6	25332	25337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017168	TAC	2	6	25523	25528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_017168	ACTG	2	8	25566	25573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
538	NC_017168	CTTA	2	8	25599	25606	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
539	NC_017168	TTA	2	6	25667	25672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137031
540	NC_017168	CGC	2	6	25673	25678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137031
541	NC_017168	TGC	2	6	25711	25716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137031
542	NC_017168	GTT	2	6	25765	25770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137031
543	NC_017168	CTG	2	6	25775	25780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137031
544	NC_017168	CCG	2	6	25908	25913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137031
545	NC_017168	GCA	2	6	25918	25923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137031
546	NC_017168	CTGG	2	8	25939	25946	0 %	25 %	50 %	25 %	384137031
547	NC_017168	CAT	2	6	26016	26021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137031
548	NC_017168	GCC	2	6	26027	26032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137031
549	NC_017168	GCC	2	6	26036	26041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137031
550	NC_017168	TTG	2	6	26081	26086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137031
551	NC_017168	CGA	2	6	26107	26112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137031
552	NC_017168	CAG	2	6	26126	26131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137031
553	NC_017168	GCA	2	6	26135	26140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137031
554	NC_017168	GCG	2	6	26228	26233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137031
555	NC_017168	GAT	2	6	26320	26325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137031
556	NC_017168	CGC	2	6	26339	26344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137031
557	NC_017168	AAC	2	6	26351	26356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137031
558	NC_017168	TGG	2	6	26364	26369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137031
559	NC_017168	CAA	2	6	26552	26557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137031
560	NC_017168	TGC	2	6	26571	26576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137031
561	NC_017168	CGA	2	6	26584	26589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137031
562	NC_017168	GGT	2	6	26624	26629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137031
563	NC_017168	CTG	2	6	26645	26650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137031
564	NC_017168	CGC	2	6	26686	26691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137031
565	NC_017168	CAC	2	6	26692	26697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137031
566	NC_017168	GAT	2	6	26777	26782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137031
567	NC_017168	GCCT	2	8	26789	26796	0 %	25 %	25 %	50 %	384137031
568	NC_017168	TGC	2	6	26799	26804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137031
569	NC_017168	CGC	2	6	26854	26859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137031
570	NC_017168	CGC	2	6	26885	26890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137031
571	NC_017168	GCC	2	6	26901	26906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137031
572	NC_017168	CCG	2	6	26940	26945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137031
573	NC_017168	CCTGCT	2	12	27049	27060	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384137031
574	NC_017168	CGC	2	6	27101	27106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137031
575	NC_017168	GCA	2	6	27124	27129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137031
576	NC_017168	CA	3	6	27128	27133	50 %	0 %	0 %	50 %	384137031
577	NC_017168	AGA	2	6	27151	27156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137031
578	NC_017168	ACC	2	6	27167	27172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137031
579	NC_017168	AGG	2	6	27228	27233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384137031
580	NC_017168	CGC	2	6	27258	27263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137031
581	NC_017168	TTG	2	6	27362	27367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137031
582	NC_017168	GCGG	2	8	27439	27446	0 %	0 %	75 %	25 %	384137031
583	NC_017168	CTG	2	6	27491	27496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137031
584	NC_017168	AAACCG	2	12	27519	27530	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384137031
585	NC_017168	CGG	2	6	27556	27561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137031
586	NC_017168	GTG	2	6	27663	27668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137031
587	NC_017168	GTG	2	6	27704	27709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137031
588	NC_017168	CTG	2	6	27710	27715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137031
589	NC_017168	ATC	2	6	27855	27860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137031
590	NC_017168	AAC	2	6	27879	27884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137031
591	NC_017168	GCT	2	6	27913	27918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137031
592	NC_017168	TCG	2	6	28014	28019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137031
593	NC_017168	AACA	2	8	28052	28059	75 %	0 %	0 %	25 %	384137031
594	NC_017168	CTGCA	2	10	28067	28076	20 %	20 %	20 %	40 %	384137031
595	NC_017168	AC	3	6	28098	28103	50 %	0 %	0 %	50 %	384137031
596	NC_017168	CGC	2	6	28108	28113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137031
597	NC_017168	CTGC	2	8	28114	28121	0 %	25 %	25 %	50 %	384137031
598	NC_017168	TCAA	2	8	28158	28165	50 %	25 %	0 %	25 %	384137031
599	NC_017168	CAG	2	6	28187	28192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137031
600	NC_017168	GAGC	2	8	28207	28214	25 %	0 %	50 %	25 %	384137031
601	NC_017168	CAC	2	6	28222	28227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137031
602	NC_017168	GCTGG	2	10	28237	28246	0 %	20 %	60 %	20 %	384137031
603	NC_017168	AGG	2	6	28279	28284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384137031
604	NC_017168	CCA	2	6	28329	28334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137032
605	NC_017168	TGG	2	6	28340	28345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137032
606	NC_017168	CCG	3	9	28358	28366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137032
607	NC_017168	AGCC	2	8	28402	28409	25 %	0 %	25 %	50 %	384137032
608	NC_017168	ACG	2	6	28475	28480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137032
609	NC_017168	GGC	2	6	28494	28499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137032
610	NC_017168	CAG	2	6	28531	28536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137032
611	NC_017168	GTG	2	6	28558	28563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137032
612	NC_017168	TTG	2	6	28636	28641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137032
613	NC_017168	AT	3	6	28663	28668	50 %	50 %	0 %	0 %	384137032
614	NC_017168	A	6	6	28697	28702	100 %	0 %	0 %	0 %	384137032
615	NC_017168	CGC	2	6	28768	28773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137032
616	NC_017168	TGACC	2	10	28800	28809	20 %	20 %	20 %	40 %	384137032
617	NC_017168	CCG	2	6	28815	28820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137032
618	NC_017168	CTG	2	6	28822	28827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137032
619	NC_017168	CCG	2	6	28856	28861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137032
620	NC_017168	TGG	2	6	28883	28888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137032
621	NC_017168	ACG	2	6	28895	28900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137032
622	NC_017168	GCC	2	6	28941	28946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137032
623	NC_017168	TCA	2	6	28998	29003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137032
624	NC_017168	GGT	2	6	29004	29009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137032
625	NC_017168	ACCGC	2	10	29042	29051	20 %	0 %	20 %	60 %	384137032
626	NC_017168	ACC	3	9	29095	29103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137032
627	NC_017168	GCAG	2	8	29143	29150	25 %	0 %	50 %	25 %	384137032
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740	NC_017168	A	6	6	34916	34921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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754	NC_017168	A	6	6	35829	35834	100 %	0 %	0 %	0 %	384137037
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