MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 89546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_017168	TGC	2	6	413097	413102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8502	NC_017168	AGATGT	2	12	413174	413185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_017168	GAAA	2	8	413214	413221	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_017168	TTG	2	6	413294	413299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_017168	GAC	2	6	413307	413312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8506	NC_017168	TAAAC	2	10	413374	413383	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8507	NC_017168	CAT	2	6	413500	413505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137382
8508	NC_017168	ATAA	2	8	413563	413570	75 %	25 %	0 %	0 %	384137382
8509	NC_017168	GGGC	2	8	413579	413586	0 %	0 %	75 %	25 %	384137382
8510	NC_017168	ATC	2	6	413710	413715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137382
8511	NC_017168	CTC	2	6	413728	413733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384137382
8512	NC_017168	CAG	2	6	413853	413858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137382
8513	NC_017168	GGC	2	6	413875	413880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137382
8514	NC_017168	GC	3	6	413911	413916	0 %	0 %	50 %	50 %	384137382
8515	NC_017168	CTGG	2	8	413920	413927	0 %	25 %	50 %	25 %	384137382
8516	NC_017168	ACC	2	6	413941	413946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137382
8517	NC_017168	C	6	6	413999	414004	0 %	0 %	0 %	100 %	384137382
8518	NC_017168	C	6	6	414122	414127	0 %	0 %	0 %	100 %	384137382
8519	NC_017168	TCG	2	6	414146	414151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137382
8520	NC_017168	CGT	2	6	414220	414225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137382
8521	NC_017168	CCA	2	6	414336	414341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137382
8522	NC_017168	ATT	2	6	414410	414415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_017168	AT	4	8	414420	414427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_017168	AATTAA	2	12	414443	414454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8525	NC_017168	CTT	2	6	414455	414460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8526	NC_017168	TAC	2	6	414462	414467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8527	NC_017168	AG	3	6	414524	414529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8528	NC_017168	ATG	2	6	414540	414545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137383
8529	NC_017168	CGC	2	6	414863	414868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137383
8530	NC_017168	A	6	6	414935	414940	100 %	0 %	0 %	0 %	384137383
8531	NC_017168	GCC	2	6	415132	415137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137383
8532	NC_017168	GTT	2	6	415163	415168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137383
8533	NC_017168	TAA	2	6	415178	415183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137383
8534	NC_017168	CGTGG	2	10	415302	415311	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8535	NC_017168	G	6	6	415358	415363	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_017168	CAG	2	6	415367	415372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8537	NC_017168	T	7	7	415478	415484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_017168	A	6	6	415498	415503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_017168	TTA	2	6	415511	415516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137384
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8541	NC_017168	AATGA	2	10	415564	415573	60 %	20 %	20 %	0 %	384137384
8542	NC_017168	AAC	2	6	415650	415655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137384
8543	NC_017168	GGA	2	6	415666	415671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384137384
8544	NC_017168	TATT	2	8	415675	415682	25 %	75 %	0 %	0 %	384137384
8545	NC_017168	GCG	2	6	415696	415701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137384
8546	NC_017168	CG	3	6	415804	415809	0 %	0 %	50 %	50 %	384137384
8547	NC_017168	ATG	2	6	415818	415823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137384
8548	NC_017168	CGT	2	6	415953	415958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8549	NC_017168	AAT	2	6	415975	415980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_017168	TAA	2	6	415985	415990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8551	NC_017168	TAT	2	6	416028	416033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137385
8552	NC_017168	CAAG	2	8	416039	416046	50 %	0 %	25 %	25 %	384137385
8553	NC_017168	ACA	2	6	416208	416213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137385
8554	NC_017168	CAG	2	6	416215	416220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137385
8555	NC_017168	CTT	2	6	416245	416250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137385
8556	NC_017168	C	6	6	416294	416299	0 %	0 %	0 %	100 %	384137385
8557	NC_017168	AACT	2	8	416300	416307	50 %	25 %	0 %	25 %	384137385
8558	NC_017168	GATT	2	8	416416	416423	25 %	50 %	25 %	0 %	384137385
8559	NC_017168	ATT	2	6	416449	416454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8560	NC_017168	CCG	2	6	416461	416466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8561	NC_017168	ACAAAT	2	12	416482	416493	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8562	NC_017168	TTAA	3	12	416495	416506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_017168	TC	3	6	416515	416520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8564	NC_017168	AT	3	6	416521	416526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_017168	CTAT	2	8	416537	416544	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8566	NC_017168	AT	3	6	416543	416548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8567	NC_017168	T	6	6	416548	416553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_017168	AAT	2	6	416557	416562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8569	NC_017168	TAT	2	6	416570	416575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_017168	CTT	2	6	416581	416586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8571	NC_017168	CACT	2	8	416609	416616	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8582	NC_017168	TGAC	2	8	417090	417097	25 %	25 %	25 %	25 %	384137386
8583	NC_017168	AT	3	6	417104	417109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8584	NC_017168	A	6	6	417189	417194	100 %	0 %	0 %	0 %	384137387
8585	NC_017168	T	6	6	417211	417216	0 %	100 %	0 %	0 %	384137387
8586	NC_017168	T	6	6	417226	417231	0 %	100 %	0 %	0 %	384137387
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8594	NC_017168	GCGA	2	8	417688	417695	25 %	0 %	50 %	25 %	384137387
8595	NC_017168	TAA	2	6	417723	417728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137387
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8597	NC_017168	TTTAA	2	10	417786	417795	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8598	NC_017168	ATT	2	6	417815	417820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8599	NC_017168	TAT	2	6	417821	417826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8600	NC_017168	ATA	2	6	417828	417833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8601	NC_017168	TAT	2	6	417840	417845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8602	NC_017168	AAT	2	6	417892	417897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137388
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8612	NC_017168	TAC	2	6	418165	418170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137388
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8623	NC_017168	GAT	2	6	418394	418399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137389
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8997	NC_017168	ATC	2	6	436398	436403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137403
8998	NC_017168	GTT	2	6	436429	436434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137403
8999	NC_017168	GCC	2	6	436565	436570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137403
9000	NC_017168	GCA	2	6	436594	436599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137403

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