MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 89546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
70001	NC_017168	A	6	6	3562254	3562259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70002	NC_017168	TGA	2	6	3562407	3562412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384140257
70003	NC_017168	GCA	2	6	3562438	3562443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384140257
70004	NC_017168	CACAC	2	10	3562458	3562467	40 %	0 %	0 %	60 %	384140257
70005	NC_017168	ACT	2	6	3562493	3562498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384140257
70006	NC_017168	CAA	3	9	3562538	3562546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384140257
70007	NC_017168	CT	4	8	3562552	3562559	0 %	50 %	0 %	50 %	384140257
70008	NC_017168	AGA	2	6	3562569	3562574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384140257
70009	NC_017168	TCA	2	6	3562602	3562607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384140257
70010	NC_017168	GCC	2	6	3562657	3562662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384140257
70011	NC_017168	TCG	2	6	3562677	3562682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140257
70012	NC_017168	GCAA	2	8	3562743	3562750	50 %	0 %	25 %	25 %	384140257
70013	NC_017168	A	6	6	3562793	3562798	100 %	0 %	0 %	0 %	384140257
70014	NC_017168	CG	3	6	3562810	3562815	0 %	0 %	50 %	50 %	384140257
70015	NC_017168	TGC	2	6	3562832	3562837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140257
70016	NC_017168	CT	3	6	3562849	3562854	0 %	50 %	0 %	50 %	384140257
70017	NC_017168	CTA	2	6	3562894	3562899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384140257
70018	NC_017168	GCC	2	6	3563030	3563035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384140257
70019	NC_017168	AGA	2	6	3563205	3563210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384140257
70020	NC_017168	CT	3	6	3563284	3563289	0 %	50 %	0 %	50 %	384140257
70021	NC_017168	TCAA	2	8	3563359	3563366	50 %	25 %	0 %	25 %	384140257
70022	NC_017168	GAG	2	6	3563494	3563499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384140257
70023	NC_017168	TC	4	8	3563516	3563523	0 %	50 %	0 %	50 %	384140257
70024	NC_017168	GTCC	2	8	3563609	3563616	0 %	25 %	25 %	50 %	384140257
70025	NC_017168	TGAT	2	8	3563630	3563637	25 %	50 %	25 %	0 %	384140257
70026	NC_017168	GCC	3	9	3563651	3563659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384140257
70027	NC_017168	TGA	2	6	3563663	3563668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384140257
70028	NC_017168	ATT	2	6	3563796	3563801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384140257
70029	NC_017168	ACC	2	6	3563867	3563872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384140257
70030	NC_017168	TAC	2	6	3563887	3563892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384140257
70031	NC_017168	CGGT	2	8	3564005	3564012	0 %	25 %	50 %	25 %	384140257
70032	NC_017168	TGA	2	6	3564111	3564116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384140257
70033	NC_017168	GGC	3	9	3564153	3564161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384140257
70034	NC_017168	GCCA	2	8	3564301	3564308	25 %	0 %	25 %	50 %	384140257
70035	NC_017168	TGC	2	6	3564447	3564452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140257
70036	NC_017168	C	7	7	3564482	3564488	0 %	0 %	0 %	100 %	384140257
70037	NC_017168	GCT	2	6	3564499	3564504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140257
70038	NC_017168	CGC	2	6	3564516	3564521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384140257
70039	NC_017168	CTT	2	6	3564624	3564629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384140257
70040	NC_017168	ATT	2	6	3564632	3564637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384140257
70041	NC_017168	GTT	2	6	3564694	3564699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384140257
70042	NC_017168	GCC	2	6	3564748	3564753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384140257
70043	NC_017168	AGC	2	6	3564759	3564764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384140257
70044	NC_017168	AACA	2	8	3564794	3564801	75 %	0 %	0 %	25 %	384140257
70045	NC_017168	CTG	2	6	3564832	3564837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140257
70046	NC_017168	GC	3	6	3564896	3564901	0 %	0 %	50 %	50 %	384140257
70047	NC_017168	ATG	2	6	3564911	3564916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384140257
70048	NC_017168	GTGC	2	8	3564922	3564929	0 %	25 %	50 %	25 %	384140257
70049	NC_017168	GTA	2	6	3564974	3564979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384140257
70050	NC_017168	GAT	2	6	3565047	3565052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384140257
70051	NC_017168	ACTG	2	8	3565068	3565075	25 %	25 %	25 %	25 %	384140257
70052	NC_017168	TGT	2	6	3565092	3565097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384140257
70053	NC_017168	GTT	2	6	3565127	3565132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384140257
70054	NC_017168	GAT	2	6	3565159	3565164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384140257
70055	NC_017168	GTG	2	6	3565193	3565198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384140257
70056	NC_017168	TTGA	2	8	3565396	3565403	25 %	50 %	25 %	0 %	384140257
70057	NC_017168	TGA	2	6	3565416	3565421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384140257
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70059	NC_017168	TGT	2	6	3565455	3565460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384140257
70060	NC_017168	TGA	2	6	3565548	3565553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384140257
70061	NC_017168	TGG	2	6	3565644	3565649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384140257
70062	NC_017168	GGC	2	6	3565681	3565686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384140257
70063	NC_017168	TTGTAT	2	12	3565690	3565701	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384140257
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70066	NC_017168	GAC	2	6	3565723	3565728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384140257
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70069	NC_017168	CG	3	6	3565810	3565815	0 %	0 %	50 %	50 %	384140257
70070	NC_017168	AAC	3	9	3565835	3565843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384140257
70071	NC_017168	CT	3	6	3565859	3565864	0 %	50 %	0 %	50 %	384140257
70072	NC_017168	CT	3	6	3565878	3565883	0 %	50 %	0 %	50 %	384140257
70073	NC_017168	CTG	2	6	3565945	3565950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140257
70074	NC_017168	TATC	2	8	3566154	3566161	25 %	50 %	0 %	25 %	384140257
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70081	NC_017168	TGA	2	6	3566333	3566338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384140257
70082	NC_017168	ATTT	2	8	3566350	3566357	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70083	NC_017168	ACTGA	2	10	3566382	3566391	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70084	NC_017168	CCAA	2	8	3566441	3566448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70085	NC_017168	CACT	2	8	3566482	3566489	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70086	NC_017168	GTAAA	2	10	3566616	3566625	60 %	20 %	20 %	0 %	384140258
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70089	NC_017168	AAAT	2	8	3566773	3566780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70090	NC_017168	T	6	6	3566799	3566804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70091	NC_017168	TGAA	2	8	3566810	3566817	50 %	25 %	25 %	0 %	384140259
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70099	NC_017168	AG	3	6	3567103	3567108	50 %	0 %	50 %	0 %	384140259
70100	NC_017168	AGTT	2	8	3567155	3567162	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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70108	NC_017168	A	6	6	3567441	3567446	100 %	0 %	0 %	0 %	384140260
70109	NC_017168	AAG	2	6	3567471	3567476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384140260
70110	NC_017168	AT	3	6	3567598	3567603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70111	NC_017168	CCA	2	6	3567631	3567636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384140261
70112	NC_017168	GA	3	6	3567685	3567690	50 %	0 %	50 %	0 %	384140261
70113	NC_017168	CTC	2	6	3567766	3567771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70114	NC_017168	CAG	2	6	3567813	3567818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384140262
70115	NC_017168	TGC	2	6	3567864	3567869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140262
70116	NC_017168	CAA	2	6	3567904	3567909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384140262
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70118	NC_017168	AGGT	2	8	3568057	3568064	25 %	25 %	50 %	0 %	384140262
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