MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 89546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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69002	NC_017168	TCG	2	6	3511814	3511819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140195
69003	NC_017168	CTG	2	6	3511824	3511829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140195
69004	NC_017168	AGA	2	6	3511834	3511839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384140195
69005	NC_017168	CAAC	2	8	3511887	3511894	50 %	0 %	0 %	50 %	384140195
69006	NC_017168	GTT	2	6	3511896	3511901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384140195
69007	NC_017168	TTA	2	6	3511918	3511923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384140195
69008	NC_017168	CCGC	2	8	3511925	3511932	0 %	0 %	25 %	75 %	384140195
69009	NC_017168	C	6	6	3511993	3511998	0 %	0 %	0 %	100 %	384140195
69010	NC_017168	GAT	2	6	3512059	3512064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384140195
69011	NC_017168	TCA	2	6	3512165	3512170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384140195
69012	NC_017168	CAT	2	6	3512184	3512189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384140195
69013	NC_017168	T	6	6	3512289	3512294	0 %	100 %	0 %	0 %	384140195
69014	NC_017168	GTA	2	6	3512456	3512461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384140196
69015	NC_017168	GTT	2	6	3512512	3512517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384140196
69016	NC_017168	TGC	2	6	3512641	3512646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140196
69017	NC_017168	CTG	2	6	3512696	3512701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140196
69018	NC_017168	GGAG	2	8	3512722	3512729	25 %	0 %	75 %	0 %	384140196
69019	NC_017168	CAGC	2	8	3513050	3513057	25 %	0 %	25 %	50 %	384140196
69020	NC_017168	TCAA	2	8	3513072	3513079	50 %	25 %	0 %	25 %	384140196
69021	NC_017168	GT	3	6	3513143	3513148	0 %	50 %	50 %	0 %	384140196
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69024	NC_017168	GCCA	2	8	3513216	3513223	25 %	0 %	25 %	50 %	384140197
69025	NC_017168	TTCT	2	8	3513342	3513349	0 %	75 %	0 %	25 %	384140197
69026	NC_017168	GCC	2	6	3513379	3513384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384140197
69027	NC_017168	GCT	2	6	3513437	3513442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140197
69028	NC_017168	CGT	2	6	3513524	3513529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140197
69029	NC_017168	CAT	2	6	3513543	3513548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384140197
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69031	NC_017168	GCA	2	6	3513611	3513616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384140197
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69033	NC_017168	GCA	2	6	3513641	3513646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384140197
69034	NC_017168	GTG	2	6	3513709	3513714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384140197
69035	NC_017168	CCG	2	6	3513752	3513757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384140197
69036	NC_017168	CTG	2	6	3513766	3513771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140197
69037	NC_017168	ATG	3	9	3513819	3513827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384140197
69038	NC_017168	TGA	2	6	3513852	3513857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384140197
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69040	NC_017168	CGG	2	6	3513890	3513895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384140197
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69046	NC_017168	TGC	2	6	3514143	3514148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140197
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69050	NC_017168	CGG	2	6	3514299	3514304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384140198
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69069	NC_017168	ATT	2	6	3515298	3515303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69070	NC_017168	TAT	2	6	3515400	3515405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69071	NC_017168	AT	3	6	3515425	3515430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69072	NC_017168	CTTC	2	8	3515435	3515442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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69078	NC_017168	AACT	2	8	3515751	3515758	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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69082	NC_017168	TAAT	2	8	3515815	3515822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69083	NC_017168	GAT	2	6	3515843	3515848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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69085	NC_017168	ACC	2	6	3515902	3515907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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69087	NC_017168	AC	3	6	3515940	3515945	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69088	NC_017168	GTT	2	6	3516046	3516051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69089	NC_017168	CCG	2	6	3516079	3516084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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69091	NC_017168	C	6	6	3516145	3516150	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69092	NC_017168	GATA	2	8	3516160	3516167	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69093	NC_017168	CAA	2	6	3516263	3516268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384140200
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69107	NC_017168	TGC	2	6	3516798	3516803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140200
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69110	NC_017168	ATC	2	6	3516865	3516870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384140200
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69114	NC_017168	AGAA	2	8	3516982	3516989	75 %	0 %	25 %	0 %	384140200
69115	NC_017168	CTA	2	6	3517023	3517028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384140200
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69117	NC_017168	ATAA	2	8	3517157	3517164	75 %	25 %	0 %	0 %	384140200
69118	NC_017168	GTC	2	6	3517294	3517299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140200
69119	NC_017168	TCA	2	6	3517324	3517329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384140200
69120	NC_017168	CT	3	6	3517379	3517384	0 %	50 %	0 %	50 %	384140200
69121	NC_017168	GTT	2	6	3517385	3517390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384140200
69122	NC_017168	CCT	2	6	3517479	3517484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384140200
69123	NC_017168	ATC	2	6	3517569	3517574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384140200
69124	NC_017168	GCAA	2	8	3517579	3517586	50 %	0 %	25 %	25 %	384140200
69125	NC_017168	AGC	3	9	3517619	3517627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384140200
69126	NC_017168	AG	3	6	3517675	3517680	50 %	0 %	50 %	0 %	384140200
69127	NC_017168	AGA	2	6	3517759	3517764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384140200
69128	NC_017168	GCC	2	6	3517836	3517841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69129	NC_017168	TAC	2	6	3517845	3517850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69130	NC_017168	AAACC	2	10	3517852	3517861	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
69131	NC_017168	TGAC	2	8	3517956	3517963	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69132	NC_017168	ACT	2	6	3518000	3518005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69133	NC_017168	CGG	2	6	3518047	3518052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384140201
69134	NC_017168	CCA	2	6	3518090	3518095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384140201
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69143	NC_017168	TCA	2	6	3518475	3518480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384140201
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69150	NC_017168	C	6	6	3518705	3518710	0 %	0 %	0 %	100 %	384140202
69151	NC_017168	CAA	2	6	3518728	3518733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384140202
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69154	NC_017168	CCAA	2	8	3518943	3518950	50 %	0 %	0 %	50 %	384140202
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69158	NC_017168	CTT	2	6	3519228	3519233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384140202
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69169	NC_017168	A	6	6	3519917	3519922	100 %	0 %	0 %	0 %	384140202
69170	NC_017168	AATT	2	8	3520001	3520008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69171	NC_017168	TA	3	6	3520023	3520028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69172	NC_017168	AC	3	6	3520034	3520039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69173	NC_017168	GCA	2	6	3520129	3520134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384140203
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69178	NC_017168	CGC	2	6	3520404	3520409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384140203
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69188	NC_017168	GCA	2	6	3521031	3521036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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69201	NC_017168	TAC	2	6	3521923	3521928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384140204
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69223	NC_017168	A	6	6	3523341	3523346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69224	NC_017168	CAA	2	6	3523413	3523418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384140206
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69228	NC_017168	ACG	2	6	3523606	3523611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69229	NC_017168	CCA	2	6	3523637	3523642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69230	NC_017168	TCTG	2	8	3523708	3523715	0 %	50 %	25 %	25 %	384140207
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69233	NC_017168	TGC	2	6	3523790	3523795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140207
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69237	NC_017168	TCA	2	6	3523932	3523937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384140207
69238	NC_017168	ATG	2	6	3523938	3523943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384140207
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69241	NC_017168	CTG	3	9	3524029	3524037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140207
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69355	NC_017168	GCA	2	6	3529583	3529588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384140216
69356	NC_017168	CTT	2	6	3529594	3529599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384140216
69357	NC_017168	GAT	2	6	3529653	3529658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384140216
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69433	NC_017168	AG	3	6	3534251	3534256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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69461	NC_017168	CA	3	6	3535398	3535403	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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