MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 89546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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61502	NC_017168	GCA	2	6	3123565	3123570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384139829
61503	NC_017168	ATG	2	6	3123591	3123596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384139829
61504	NC_017168	GGC	2	6	3123619	3123624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384139829
61505	NC_017168	TGG	2	6	3123693	3123698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384139829
61506	NC_017168	CTG	2	6	3123722	3123727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384139829
61507	NC_017168	ATT	2	6	3123820	3123825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384139829
61508	NC_017168	CTT	2	6	3123874	3123879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384139829
61509	NC_017168	CCG	2	6	3123979	3123984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384139829
61510	NC_017168	GAA	2	6	3123992	3123997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384139829
61511	NC_017168	A	7	7	3124038	3124044	100 %	0 %	0 %	0 %	384139829
61512	NC_017168	TGG	2	6	3124047	3124052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384139829
61513	NC_017168	TAT	2	6	3124088	3124093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384139829
61514	NC_017168	GTT	2	6	3124165	3124170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384139829
61515	NC_017168	TGA	2	6	3124186	3124191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384139829
61516	NC_017168	CTCA	2	8	3124298	3124305	25 %	25 %	0 %	50 %	384139829
61517	NC_017168	ATC	2	6	3124337	3124342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384139829
61518	NC_017168	TGA	2	6	3124375	3124380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384139829
61519	NC_017168	TGA	2	6	3124399	3124404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384139829
61520	NC_017168	TGA	2	6	3124555	3124560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384139829
61521	NC_017168	GAA	3	9	3124565	3124573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384139829
61522	NC_017168	A	6	6	3124604	3124609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61523	NC_017168	TAAA	2	8	3124613	3124620	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61524	NC_017168	TCC	2	6	3124623	3124628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61525	NC_017168	TTAC	2	8	3124723	3124730	25 %	50 %	0 %	25 %	384139830
61526	NC_017168	CA	3	6	3125005	3125010	50 %	0 %	0 %	50 %	384139830
61527	NC_017168	TTG	2	6	3125202	3125207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61528	NC_017168	A	6	6	3125328	3125333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61529	NC_017168	ACA	2	6	3125399	3125404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61530	NC_017168	GTG	2	6	3125424	3125429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61531	NC_017168	CAGC	2	8	3125445	3125452	25 %	0 %	25 %	50 %	384139831
61532	NC_017168	CG	3	6	3125536	3125541	0 %	0 %	50 %	50 %	384139831
61533	NC_017168	TGA	2	6	3125625	3125630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384139831
61534	NC_017168	GCCA	2	8	3125719	3125726	25 %	0 %	25 %	50 %	384139831
61535	NC_017168	TTGA	2	8	3125728	3125735	25 %	50 %	25 %	0 %	384139831
61536	NC_017168	GGC	2	6	3125749	3125754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384139831
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61538	NC_017168	AAC	3	9	3125985	3125993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61539	NC_017168	A	6	6	3126017	3126022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61540	NC_017168	GGCCT	2	10	3126126	3126135	0 %	20 %	40 %	40 %	384139832
61541	NC_017168	GTT	2	6	3126190	3126195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384139832
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61543	NC_017168	GCTT	2	8	3126282	3126289	0 %	50 %	25 %	25 %	384139832
61544	NC_017168	TGG	2	6	3126290	3126295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384139832
61545	NC_017168	CCGG	2	8	3126346	3126353	0 %	0 %	50 %	50 %	384139832
61546	NC_017168	GCG	2	6	3126355	3126360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384139832
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61551	NC_017168	TGG	2	6	3126809	3126814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384139832
61552	NC_017168	GTG	2	6	3126851	3126856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384139832
61553	NC_017168	G	6	6	3127026	3127031	0 %	0 %	100 %	0 %	384139832
61554	NC_017168	CG	3	6	3127096	3127101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61555	NC_017168	AGC	2	6	3127146	3127151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384139833
61556	NC_017168	GCTG	2	8	3127164	3127171	0 %	25 %	50 %	25 %	384139833
61557	NC_017168	GGC	2	6	3127186	3127191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384139833
61558	NC_017168	GAAAC	2	10	3127355	3127364	60 %	0 %	20 %	20 %	384139833
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61565	NC_017168	TTG	2	6	3127767	3127772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384139833
61566	NC_017168	ATTCAG	2	12	3127842	3127853	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384139833
61567	NC_017168	TAAG	2	8	3127854	3127861	50 %	25 %	25 %	0 %	384139833
61568	NC_017168	ATC	2	6	3127879	3127884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384139833
61569	NC_017168	GAA	2	6	3127956	3127961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61570	NC_017168	TCG	2	6	3128018	3128023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61571	NC_017168	TGC	2	6	3128066	3128071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61572	NC_017168	ATG	2	6	3128128	3128133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61573	NC_017168	ATG	2	6	3128150	3128155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61574	NC_017168	GTG	2	6	3128186	3128191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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61600	NC_017168	TTAA	2	8	3129794	3129801	50 %	50 %	0 %	0 %	384139834
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61605	NC_017168	TCA	2	6	3129995	3130000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61606	NC_017168	ATG	2	6	3130093	3130098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61607	NC_017168	TGT	2	6	3130119	3130124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384139835
61608	NC_017168	TTG	2	6	3130242	3130247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384139835
61609	NC_017168	AG	3	6	3130272	3130277	50 %	0 %	50 %	0 %	384139835
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61614	NC_017168	TTGG	2	8	3130557	3130564	0 %	50 %	50 %	0 %	384139835
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