MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 89546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55501	NC_017168	ACC	2	6	2820731	2820736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384139548
55502	NC_017168	GCCAC	2	10	2820820	2820829	20 %	0 %	20 %	60 %	384139548
55503	NC_017168	GCCAT	2	10	2820846	2820855	20 %	20 %	20 %	40 %	384139548
55504	NC_017168	GAA	2	6	2820875	2820880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384139548
55505	NC_017168	CTT	2	6	2820892	2820897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384139548
55506	NC_017168	CGT	2	6	2820910	2820915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384139548
55507	NC_017168	CGCA	2	8	2820931	2820938	25 %	0 %	25 %	50 %	384139548
55508	NC_017168	ATT	2	6	2820992	2820997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384139548
55509	NC_017168	AAC	2	6	2820999	2821004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384139548
55510	NC_017168	AGG	2	6	2821035	2821040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384139548
55511	NC_017168	GCTG	2	8	2821121	2821128	0 %	25 %	50 %	25 %	384139549
55512	NC_017168	TGA	2	6	2821182	2821187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384139549
55513	NC_017168	ATT	2	6	2821287	2821292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384139549
55514	NC_017168	ATT	2	6	2821303	2821308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384139549
55515	NC_017168	AAG	2	6	2821328	2821333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384139549
55516	NC_017168	GCT	2	6	2821353	2821358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384139549
55517	NC_017168	GTT	2	6	2821378	2821383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384139549
55518	NC_017168	CGA	2	6	2821419	2821424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384139549
55519	NC_017168	AGA	2	6	2821434	2821439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384139549
55520	NC_017168	GCT	2	6	2821588	2821593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55521	NC_017168	ATC	2	6	2821600	2821605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55522	NC_017168	CGA	2	6	2821641	2821646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384139550
55523	NC_017168	GATC	2	8	2821782	2821789	25 %	25 %	25 %	25 %	384139550
55524	NC_017168	AGC	2	6	2821832	2821837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384139550
55525	NC_017168	ATT	2	6	2821918	2821923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384139550
55526	NC_017168	CTG	2	6	2821999	2822004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384139550
55527	NC_017168	ACGG	2	8	2822052	2822059	25 %	0 %	50 %	25 %	384139550
55528	NC_017168	TGA	2	6	2822142	2822147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384139550
55529	NC_017168	TGG	2	6	2822151	2822156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384139550
55530	NC_017168	GAA	2	6	2822230	2822235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384139550
55531	NC_017168	CGA	2	6	2822331	2822336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384139550
55532	NC_017168	GGT	2	6	2822353	2822358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384139550
55533	NC_017168	GTG	2	6	2822393	2822398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384139550
55534	NC_017168	ATTGAA	2	12	2822404	2822415	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384139550
55535	NC_017168	GAT	2	6	2822482	2822487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384139550
55536	NC_017168	GAA	2	6	2822506	2822511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384139550
55537	NC_017168	TCC	2	6	2822538	2822543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384139551
55538	NC_017168	T	6	6	2822576	2822581	0 %	100 %	0 %	0 %	384139551
55539	NC_017168	GCTT	2	8	2822596	2822603	0 %	50 %	25 %	25 %	384139551
55540	NC_017168	GCC	2	6	2822627	2822632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384139551
55541	NC_017168	CAC	2	6	2822674	2822679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384139551
55542	NC_017168	TTG	2	6	2822704	2822709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384139551
55543	NC_017168	CAAT	2	8	2822784	2822791	50 %	25 %	0 %	25 %	384139551
55544	NC_017168	AGC	2	6	2822812	2822817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384139551
55545	NC_017168	TTA	2	6	2822852	2822857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384139551
55546	NC_017168	TGG	2	6	2822882	2822887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384139551
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55548	NC_017168	CGT	2	6	2823089	2823094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384139551
55549	NC_017168	GCA	2	6	2823101	2823106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384139551
55550	NC_017168	CTG	3	9	2823125	2823133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384139551
55551	NC_017168	CAC	2	6	2823250	2823255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384139551
55552	NC_017168	TGA	2	6	2823271	2823276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384139551
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55554	NC_017168	AGC	2	6	2823398	2823403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384139551
55555	NC_017168	CAT	2	6	2823469	2823474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384139551
55556	NC_017168	ACCCG	2	10	2823504	2823513	20 %	0 %	20 %	60 %	384139551
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55558	NC_017168	ATTTA	2	10	2823595	2823604	40 %	60 %	0 %	0 %	384139551
55559	NC_017168	CACT	2	8	2823645	2823652	25 %	25 %	0 %	50 %	384139551
55560	NC_017168	CGG	2	6	2823672	2823677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384139551
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55562	NC_017168	GC	3	6	2823817	2823822	0 %	0 %	50 %	50 %	384139551
55563	NC_017168	GCC	2	6	2823834	2823839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384139551
55564	NC_017168	GCA	2	6	2823849	2823854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384139551
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55568	NC_017168	ACC	2	6	2823953	2823958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384139551
55569	NC_017168	ATT	2	6	2824001	2824006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384139551
55570	NC_017168	TGA	2	6	2824088	2824093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55571	NC_017168	ATT	2	6	2824182	2824187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55572	NC_017168	CAA	2	6	2824265	2824270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55573	NC_017168	ATT	2	6	2824402	2824407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55574	NC_017168	GT	3	6	2824471	2824476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55575	NC_017168	GCT	2	6	2824546	2824551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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55577	NC_017168	ATT	2	6	2824596	2824601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55578	NC_017168	CAT	2	6	2824602	2824607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55579	NC_017168	T	6	6	2824626	2824631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55580	NC_017168	AGC	2	6	2824652	2824657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55581	NC_017168	CGG	2	6	2824683	2824688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55582	NC_017168	CAA	2	6	2824707	2824712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55583	NC_017168	TCACA	2	10	2824787	2824796	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
55584	NC_017168	ACA	2	6	2824812	2824817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55585	NC_017168	AGA	2	6	2824899	2824904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384139552
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55587	NC_017168	TCT	2	6	2824987	2824992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384139552
55588	NC_017168	TTA	2	6	2825004	2825009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384139552
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55591	NC_017168	CAG	2	6	2825203	2825208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384139552
55592	NC_017168	GTC	2	6	2825236	2825241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384139552
55593	NC_017168	A	6	6	2825260	2825265	100 %	0 %	0 %	0 %	384139552
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55599	NC_017168	CG	3	6	2825434	2825439	0 %	0 %	50 %	50 %	384139552
55600	NC_017168	ATG	2	6	2825449	2825454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384139552
55601	NC_017168	GAT	2	6	2825455	2825460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384139552
55602	NC_017168	TGA	2	6	2825499	2825504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384139552
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55604	NC_017168	TTA	2	6	2825584	2825589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384139552
55605	NC_017168	CT	3	6	2825695	2825700	0 %	50 %	0 %	50 %	384139552
55606	NC_017168	AAT	3	9	2825753	2825761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55607	NC_017168	TGA	2	6	2825790	2825795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55608	NC_017168	GGT	2	6	2825821	2825826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55609	NC_017168	T	7	7	2825843	2825849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55610	NC_017168	ATC	2	6	2825878	2825883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55611	NC_017168	TCA	2	6	2825886	2825891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55612	NC_017168	ATCC	2	8	2825901	2825908	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55613	NC_017168	T	7	7	2825950	2825956	0 %	100 %	0 %	0 %	384139553
55614	NC_017168	CAGC	2	8	2825958	2825965	25 %	0 %	25 %	50 %	384139553
55615	NC_017168	ACC	2	6	2825979	2825984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384139553
55616	NC_017168	CATTAT	2	12	2826025	2826036	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384139553
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55618	NC_017168	TGG	2	6	2826181	2826186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384139553
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