MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 89546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_017168	AGT	2	6	2794579	2794584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55002	NC_017168	GGT	2	6	2794692	2794697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55003	NC_017168	ATT	2	6	2794745	2794750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384139529
55004	NC_017168	GCT	2	6	2794790	2794795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384139529
55005	NC_017168	GCA	2	6	2794828	2794833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384139529
55006	NC_017168	AGA	2	6	2794920	2794925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384139529
55007	NC_017168	GCA	2	6	2794948	2794953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384139529
55008	NC_017168	TGTT	2	8	2794974	2794981	0 %	75 %	25 %	0 %	384139529
55009	NC_017168	TGT	2	6	2795036	2795041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55010	NC_017168	A	6	6	2795046	2795051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55011	NC_017168	ACA	2	6	2795061	2795066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55012	NC_017168	AGAATC	2	12	2795070	2795081	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55013	NC_017168	CAGT	2	8	2795139	2795146	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55014	NC_017168	TA	3	6	2795158	2795163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55015	NC_017168	ACT	2	6	2795207	2795212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55016	NC_017168	AC	3	6	2795225	2795230	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55017	NC_017168	ATC	2	6	2795331	2795336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55018	NC_017168	ATT	2	6	2795339	2795344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55019	NC_017168	AAT	2	6	2795388	2795393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55020	NC_017168	TTA	3	9	2795402	2795410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55021	NC_017168	TAT	2	6	2795423	2795428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55022	NC_017168	TCA	2	6	2795431	2795436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55023	NC_017168	GAT	2	6	2795441	2795446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55024	NC_017168	T	6	6	2795456	2795461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55025	NC_017168	G	6	6	2795534	2795539	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55026	NC_017168	TC	3	6	2795683	2795688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55027	NC_017168	TCGC	2	8	2795699	2795706	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55028	NC_017168	AAATT	2	10	2795711	2795720	60 %	40 %	0 %	0 %	384139530
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55030	NC_017168	GCA	2	6	2795824	2795829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384139530
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55033	NC_017168	CGAT	2	8	2796039	2796046	25 %	25 %	25 %	25 %	384139530
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55040	NC_017168	GTC	2	6	2796389	2796394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384139530
55041	NC_017168	A	6	6	2796551	2796556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55042	NC_017168	TAT	2	6	2796615	2796620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55043	NC_017168	GC	3	6	2796622	2796627	0 %	0 %	50 %	50 %	384139531
55044	NC_017168	TGC	2	6	2796636	2796641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384139531
55045	NC_017168	GCAAAT	2	12	2796676	2796687	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384139531
55046	NC_017168	TA	3	6	2796700	2796705	50 %	50 %	0 %	0 %	384139531
55047	NC_017168	TG	3	6	2796716	2796721	0 %	50 %	50 %	0 %	384139531
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55054	NC_017168	ACG	2	6	2796956	2796961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384139532
55055	NC_017168	AGC	2	6	2797015	2797020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384139532
55056	NC_017168	AAG	2	6	2797081	2797086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384139532
55057	NC_017168	GTG	2	6	2797117	2797122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55058	NC_017168	TTA	2	6	2797143	2797148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55059	NC_017168	TGCC	2	8	2797220	2797227	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55060	NC_017168	CTG	2	6	2797268	2797273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55061	NC_017168	CCCT	2	8	2797285	2797292	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
55062	NC_017168	ATG	2	6	2797308	2797313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55063	NC_017168	TTG	2	6	2797450	2797455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55064	NC_017168	ATT	2	6	2797469	2797474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55065	NC_017168	GAT	2	6	2797570	2797575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384139533
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55072	NC_017168	GAT	2	6	2797913	2797918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384139533
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55081	NC_017168	ATT	2	6	2798335	2798340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55090	NC_017168	CA	3	6	2798835	2798840	50 %	0 %	0 %	50 %	384139534
55091	NC_017168	ATA	2	6	2798848	2798853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384139534
55092	NC_017168	GCTA	2	8	2798989	2798996	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55093	NC_017168	TTC	2	6	2799031	2799036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55094	NC_017168	CCCG	2	8	2799055	2799062	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55095	NC_017168	GCC	2	6	2799081	2799086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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55099	NC_017168	A	7	7	2799209	2799215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55100	NC_017168	ATT	2	6	2799270	2799275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55114	NC_017168	T	6	6	2800119	2800124	0 %	100 %	0 %	0 %	384139535
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55122	NC_017168	CTT	2	6	2800533	2800538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384139535
55123	NC_017168	TCA	2	6	2800554	2800559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384139535
55124	NC_017168	CAG	2	6	2800590	2800595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384139535
55125	NC_017168	ATCT	2	8	2800615	2800622	25 %	50 %	0 %	25 %	384139535
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55130	NC_017168	CAGG	2	8	2800797	2800804	25 %	0 %	50 %	25 %	384139535
55131	NC_017168	TCA	3	9	2800829	2800837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384139535
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55134	NC_017168	AAGGA	2	10	2801015	2801024	60 %	0 %	40 %	0 %	384139535
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55141	NC_017168	AAAT	2	8	2801691	2801698	75 %	25 %	0 %	0 %	384139536
55142	NC_017168	TTA	2	6	2801754	2801759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384139536
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55187	NC_017168	A	6	6	2804087	2804092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55230	NC_017168	GCCCG	2	10	2806132	2806141	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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55232	NC_017168	CAAA	2	8	2806162	2806169	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55233	NC_017168	AATA	2	8	2806172	2806179	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55234	NC_017168	TCC	2	6	2806180	2806185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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55238	NC_017168	A	7	7	2806882	2806888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55239	NC_017168	CT	3	6	2806902	2806907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55240	NC_017168	CAAA	2	8	2806995	2807002	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55241	NC_017168	AAT	2	6	2807022	2807027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384139540
55242	NC_017168	TCA	2	6	2807082	2807087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384139540
55243	NC_017168	GAC	2	6	2807096	2807101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384139540
55244	NC_017168	GTC	2	6	2807181	2807186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384139540
55245	NC_017168	GTTTCC	2	12	2807268	2807279	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384139540
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55247	NC_017168	TCA	2	6	2807400	2807405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384139540
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55252	NC_017168	ACC	2	6	2807741	2807746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384139540
55253	NC_017168	CGA	2	6	2807763	2807768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384139540
55254	NC_017168	CTG	2	6	2807797	2807802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384139540
55255	NC_017168	CGT	2	6	2807821	2807826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384139540
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55290	NC_017168	TA	3	6	2809124	2809129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55291	NC_017168	TTAT	2	8	2809146	2809153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55292	NC_017168	A	7	7	2809184	2809190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55293	NC_017168	A	7	7	2809250	2809256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55294	NC_017168	ATC	2	6	2809292	2809297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55295	NC_017168	A	8	8	2809299	2809306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55319	NC_017168	CAG	2	6	2810799	2810804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384139542
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55322	NC_017168	ATTT	2	8	2811107	2811114	25 %	75 %	0 %	0 %	384139542
55323	NC_017168	TGA	2	6	2811416	2811421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384139543
55324	NC_017168	CGG	2	6	2811426	2811431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384139543
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55333	NC_017168	AGCAA	2	10	2811893	2811902	60 %	0 %	20 %	20 %	384139543
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55335	NC_017168	TAT	2	6	2812098	2812103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384139543
55336	NC_017168	GCA	2	6	2812127	2812132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384139543
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55343	NC_017168	ACC	2	6	2812553	2812558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384139543
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55345	NC_017168	TGC	2	6	2812613	2812618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384139543
55346	NC_017168	GAAA	2	8	2812648	2812655	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55347	NC_017168	TTA	2	6	2812756	2812761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384139544
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55349	NC_017168	A	6	6	2812969	2812974	100 %	0 %	0 %	0 %	384139544
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55351	NC_017168	AGC	2	6	2813103	2813108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384139544
55352	NC_017168	TTG	2	6	2813114	2813119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384139544
55353	NC_017168	GCCACG	2	12	2813156	2813167	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384139544
55354	NC_017168	A	6	6	2813207	2813212	100 %	0 %	0 %	0 %	384139544
55355	NC_017168	ATC	2	6	2813257	2813262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384139544
55356	NC_017168	GCG	2	6	2813266	2813271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384139544
55357	NC_017168	GCC	2	6	2813488	2813493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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