MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis D182038 chromosome

Total Repeats: 91081

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017160	TTTA	2	8	7	14	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017160	TTA	2	6	24	29	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017160	TTA	2	6	36	41	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017160	ATT	2	6	68	73	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017160	AGG	2	6	96	101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017160	TGT	2	6	108	113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017160	GTT	2	6	190	195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017160	TTCG	2	8	245	252	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017160	CG	3	6	251	256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017160	CTG	2	6	305	310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124470
11	NC_017160	TTG	2	6	387	392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124470
12	NC_017160	AACC	2	8	443	450	50 %	0 %	0 %	50 %	384124470
13	NC_017160	TGT	2	6	484	489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124470
14	NC_017160	TAA	2	6	501	506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124470
15	NC_017160	CTT	2	6	626	631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124470
16	NC_017160	TCA	2	6	867	872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124471
17	NC_017160	TTG	2	6	885	890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124471
18	NC_017160	CTG	2	6	899	904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124471
19	NC_017160	TAA	2	6	934	939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124471
20	NC_017160	GTG	2	6	957	962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124471
21	NC_017160	CTT	2	6	979	984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124471
22	NC_017160	T	6	6	998	1003	0 %	100 %	0 %	0 %	384124471
23	NC_017160	AGC	2	6	1051	1056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124471
24	NC_017160	CGT	2	6	1060	1065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124471
25	NC_017160	GTT	2	6	1072	1077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124471
26	NC_017160	GTGC	2	8	1194	1201	0 %	25 %	50 %	25 %	384124471
27	NC_017160	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124471
28	NC_017160	T	7	7	1275	1281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017160	ATT	2	6	1315	1320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017160	A	6	6	1437	1442	100 %	0 %	0 %	0 %	384124472
31	NC_017160	ACA	3	9	1457	1465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124472
32	NC_017160	CAA	2	6	1506	1511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124472
33	NC_017160	CATT	2	8	1644	1651	25 %	50 %	0 %	25 %	384124472
34	NC_017160	ATTC	2	8	1758	1765	25 %	50 %	0 %	25 %	384124472
35	NC_017160	GCG	2	6	1878	1883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124472
36	NC_017160	TGG	2	6	2036	2041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124472
37	NC_017160	ATG	2	6	2065	2070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124472
38	NC_017160	ATG	2	6	2086	2091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124472
39	NC_017160	ATT	2	6	2139	2144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124472
40	NC_017160	TCT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124472
41	NC_017160	ATCA	2	8	2269	2276	50 %	25 %	0 %	25 %	384124472
42	NC_017160	TGC	2	6	2344	2349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124472
43	NC_017160	ACA	2	6	2354	2359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124472
44	NC_017160	CTG	2	6	2418	2423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124472
45	NC_017160	GGC	2	6	2505	2510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017160	GCG	2	6	2537	2542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124473
47	NC_017160	TGG	2	6	2649	2654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124473
48	NC_017160	CTG	3	9	2657	2665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124473
49	NC_017160	TTTA	2	8	2762	2769	25 %	75 %	0 %	0 %	384124473
50	NC_017160	GCC	2	6	2787	2792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124473
51	NC_017160	ACC	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124473
52	NC_017160	GTTG	2	8	2815	2822	0 %	50 %	50 %	0 %	384124473
53	NC_017160	ATT	2	6	2874	2879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124473
54	NC_017160	ATG	2	6	2895	2900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124473
55	NC_017160	GCG	2	6	2906	2911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124473
56	NC_017160	TCA	2	6	3030	3035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124473
57	NC_017160	T	6	6	3067	3072	0 %	100 %	0 %	0 %	384124473
58	NC_017160	GCG	2	6	3125	3130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124473
59	NC_017160	ACTC	2	8	3148	3155	25 %	25 %	0 %	50 %	384124473
60	NC_017160	AAT	2	6	3183	3188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124473
61	NC_017160	TGA	2	6	3207	3212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124473
62	NC_017160	CCT	2	6	3223	3228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384124473
63	NC_017160	CTGG	2	8	3241	3248	0 %	25 %	50 %	25 %	384124473
64	NC_017160	GCA	2	6	3376	3381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124473
65	NC_017160	TGG	2	6	3451	3456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124473
66	NC_017160	CAC	2	6	3475	3480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124473
67	NC_017160	AAC	2	6	3534	3539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124473
68	NC_017160	TGA	3	9	3540	3548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124473
69	NC_017160	T	6	6	3627	3632	0 %	100 %	0 %	0 %	384124473
70	NC_017160	TCC	2	6	3741	3746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384124473
71	NC_017160	ATTC	2	8	3772	3779	25 %	50 %	0 %	25 %	384124473
72	NC_017160	GTT	2	6	3814	3819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124473
73	NC_017160	A	8	8	3884	3891	100 %	0 %	0 %	0 %	384124473
74	NC_017160	TGC	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124473
75	NC_017160	ACC	2	6	3921	3926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124473
76	NC_017160	CAG	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124473
77	NC_017160	TGT	2	6	4014	4019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124474
78	NC_017160	GTT	2	6	4030	4035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124474
79	NC_017160	TTG	2	6	4046	4051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124474
80	NC_017160	TTG	2	6	4061	4066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124474
81	NC_017160	CCA	2	6	4081	4086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124474
82	NC_017160	GCCA	2	8	4113	4120	25 %	0 %	25 %	50 %	384124474
83	NC_017160	GAT	2	6	4122	4127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124474
84	NC_017160	TAAA	2	8	4132	4139	75 %	25 %	0 %	0 %	384124474
85	NC_017160	GTT	2	6	4168	4173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124474
86	NC_017160	CAG	3	9	4205	4213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124474
87	NC_017160	TGG	2	6	4217	4222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124474
88	NC_017160	TGGC	2	8	4262	4269	0 %	25 %	50 %	25 %	384124474
89	NC_017160	ATC	2	6	4301	4306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124474
90	NC_017160	GAT	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124474
91	NC_017160	CTGT	2	8	4470	4477	0 %	50 %	25 %	25 %	384124474
92	NC_017160	AGTG	2	8	4538	4545	25 %	25 %	50 %	0 %	384124474
93	NC_017160	TGG	2	6	4548	4553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124474
94	NC_017160	TGC	2	6	4560	4565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124474
95	NC_017160	TAA	2	6	4610	4615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124474
96	NC_017160	CAA	2	6	4643	4648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124474
97	NC_017160	TCA	2	6	4737	4742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124474
98	NC_017160	GAA	2	6	4751	4756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124474
99	NC_017160	GTA	2	6	4768	4773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124474
100	NC_017160	CTT	2	6	4784	4789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124474
101	NC_017160	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124474
102	NC_017160	TCAA	2	8	4890	4897	50 %	25 %	0 %	25 %	384124474
103	NC_017160	TGG	2	6	4908	4913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124474
104	NC_017160	TTC	2	6	4916	4921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124474
105	NC_017160	CTG	2	6	4971	4976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124474
106	NC_017160	CAG	2	6	4979	4984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124474
107	NC_017160	GCT	2	6	5060	5065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124474
108	NC_017160	CTT	3	9	5266	5274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124474
109	NC_017160	TCA	2	6	5329	5334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124474
110	NC_017160	GCG	2	6	5375	5380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124474
111	NC_017160	GGA	2	6	5406	5411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384124474
112	NC_017160	TGC	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124474
113	NC_017160	TTCT	2	8	5518	5525	0 %	75 %	0 %	25 %	384124474
114	NC_017160	GAT	2	6	5535	5540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124474
115	NC_017160	TGA	2	6	5569	5574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017160	TTG	2	6	5629	5634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017160	ATC	2	6	5652	5657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017160	ATT	2	6	5659	5664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017160	AAT	2	6	5724	5729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017160	TCT	2	6	5770	5775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017160	GA	3	6	5917	5922	50 %	0 %	50 %	0 %	384124475
122	NC_017160	T	6	6	5974	5979	0 %	100 %	0 %	0 %	384124475
123	NC_017160	GTC	2	6	6008	6013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124475
124	NC_017160	AGG	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384124475
125	NC_017160	TGG	2	6	6126	6131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124475
126	NC_017160	TGG	2	6	6145	6150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124475
127	NC_017160	CTT	2	6	6154	6159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124475
128	NC_017160	CGC	2	6	6223	6228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124475
129	NC_017160	TAT	2	6	6382	6387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124475
130	NC_017160	T	6	6	6437	6442	0 %	100 %	0 %	0 %	384124475
131	NC_017160	T	6	6	6464	6469	0 %	100 %	0 %	0 %	384124475
132	NC_017160	CGT	2	6	6579	6584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124475
133	NC_017160	ATT	2	6	6594	6599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124475
134	NC_017160	TTA	2	6	6614	6619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124475
135	NC_017160	CTT	2	6	6649	6654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124475
136	NC_017160	ACC	2	6	6784	6789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124475
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138	NC_017160	AT	4	8	6830	6837	50 %	50 %	0 %	0 %	384124475
139	NC_017160	GGT	2	6	6868	6873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124475
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150	NC_017160	ATT	2	6	7291	7296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124475
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159	NC_017160	CAT	2	6	7743	7748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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250	NC_017160	TAT	2	6	12000	12005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_017160	GGCA	2	8	12121	12128	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
254	NC_017160	ATA	2	6	12132	12137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_017160	TAC	2	6	12349	12354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_017160	GCG	2	6	12366	12371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_017160	ACT	2	6	12416	12421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_017160	TAG	2	6	12513	12518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
263	NC_017160	CGA	2	6	12541	12546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_017160	GCA	2	6	12615	12620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_017160	GT	3	6	12668	12673	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
266	NC_017160	GAA	2	6	12674	12679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
267	NC_017160	GAG	2	6	12708	12713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
268	NC_017160	AGA	2	6	12757	12762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
269	NC_017160	CAG	2	6	12783	12788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_017160	G	6	6	12930	12935	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
271	NC_017160	GGA	2	6	12974	12979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
272	NC_017160	GGC	2	6	12994	12999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_017160	GAA	2	6	13237	13242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
274	NC_017160	TGC	2	6	13313	13318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_017160	GTC	2	6	13325	13330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_017160	TTG	2	6	13386	13391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
277	NC_017160	TGG	2	6	13403	13408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
278	NC_017160	GGA	2	6	13439	13444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_017160	AC	3	6	13659	13664	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
282	NC_017160	GTAG	2	8	13700	13707	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
283	NC_017160	CCT	2	6	13800	13805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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285	NC_017160	TTG	2	6	13905	13910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_017160	CCG	2	6	14227	14232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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402	NC_017160	GC	3	6	21656	21661	0 %	0 %	50 %	50 %	384124484
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406	NC_017160	A	7	7	22058	22064	100 %	0 %	0 %	0 %	384124485
407	NC_017160	GCAA	2	8	22123	22130	50 %	0 %	25 %	25 %	384124485
408	NC_017160	GAA	2	6	22170	22175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124485
409	NC_017160	A	6	6	22174	22179	100 %	0 %	0 %	0 %	384124485
410	NC_017160	AGA	2	6	22207	22212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124485
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412	NC_017160	ACG	2	6	22282	22287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124485
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414	NC_017160	GTG	2	6	22360	22365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124485
415	NC_017160	TGTT	2	8	22375	22382	0 %	75 %	25 %	0 %	384124485
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422	NC_017160	T	8	8	22521	22528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
423	NC_017160	ATTT	2	8	22529	22536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_017160	TAA	2	6	22625	22630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
425	NC_017160	A	6	6	22629	22634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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427	NC_017160	ATAA	2	8	22714	22721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
428	NC_017160	A	6	6	22734	22739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NC_017160	CAT	2	6	22757	22762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
430	NC_017160	CA	3	6	22817	22822	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
431	NC_017160	GAA	2	6	22968	22973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
432	NC_017160	TTG	2	6	23010	23015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124486
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441	NC_017160	TCCC	2	8	23490	23497	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
442	NC_017160	CTC	2	6	23533	23538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384124487
443	NC_017160	ATA	2	6	23541	23546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124487
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445	NC_017160	TGGG	2	8	23601	23608	0 %	25 %	75 %	0 %	384124487
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481	NC_017160	CTG	2	6	25856	25861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
482	NC_017160	ACA	2	6	25886	25891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
483	NC_017160	A	6	6	25912	25917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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