MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis D182038 chromosome

Total Repeats: 91081

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017160	TGGC	2	8	153972	153979	0 %	25 %	50 %	25 %	384124595
3002	NC_017160	GCC	2	6	154088	154093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124595
3003	NC_017160	CAGG	2	8	154168	154175	25 %	0 %	50 %	25 %	384124595
3004	NC_017160	ATT	2	6	154336	154341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124595
3005	NC_017160	CAG	2	6	154426	154431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124595
3006	NC_017160	TGG	2	6	154474	154479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124595
3007	NC_017160	TC	3	6	154596	154601	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3008	NC_017160	GCC	2	6	154608	154613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_017160	GGT	2	6	154642	154647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_017160	AGC	2	6	154679	154684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_017160	GCC	2	6	154721	154726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3012	NC_017160	T	6	6	154798	154803	0 %	100 %	0 %	0 %	384124596
3013	NC_017160	GCC	2	6	154809	154814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124596
3014	NC_017160	TTC	2	6	154894	154899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124596
3015	NC_017160	C	6	6	154923	154928	0 %	0 %	0 %	100 %	384124596
3016	NC_017160	TCA	2	6	154967	154972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124596
3017	NC_017160	GCTT	2	8	155022	155029	0 %	50 %	25 %	25 %	384124596
3018	NC_017160	CCA	2	6	155061	155066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124596
3019	NC_017160	ATTG	2	8	155234	155241	25 %	50 %	25 %	0 %	384124597
3020	NC_017160	ATC	2	6	155348	155353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124597
3021	NC_017160	ACAA	2	8	155355	155362	75 %	0 %	0 %	25 %	384124597
3022	NC_017160	TGC	2	6	155388	155393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124597
3023	NC_017160	TCT	2	6	155418	155423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124597
3024	NC_017160	TCA	2	6	155700	155705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124597
3025	NC_017160	CAG	2	6	155804	155809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124597
3026	NC_017160	CCAT	2	8	155814	155821	25 %	25 %	0 %	50 %	384124597
3027	NC_017160	G	6	6	155861	155866	0 %	0 %	100 %	0 %	384124597
3028	NC_017160	TCC	2	6	155881	155886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_017160	TGG	2	6	155907	155912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017160	CTAGC	2	10	155943	155952	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3031	NC_017160	CTG	2	6	155975	155980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_017160	GAT	2	6	155989	155994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_017160	AAG	2	6	156020	156025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124598
3034	NC_017160	G	6	6	156025	156030	0 %	0 %	100 %	0 %	384124598
3035	NC_017160	ATA	2	6	156061	156066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124598
3036	NC_017160	ATCC	2	8	156079	156086	25 %	25 %	0 %	50 %	384124598
3037	NC_017160	CGA	2	6	156089	156094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124598
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3039	NC_017160	GAC	2	6	156130	156135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124598
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3041	NC_017160	TAA	2	6	156258	156263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124598
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3043	NC_017160	A	6	6	156407	156412	100 %	0 %	0 %	0 %	384124598
3044	NC_017160	ATG	2	6	156471	156476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124598
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3047	NC_017160	ATTG	2	8	156775	156782	25 %	50 %	25 %	0 %	384124598
3048	NC_017160	AATA	2	8	156852	156859	75 %	25 %	0 %	0 %	384124598
3049	NC_017160	GT	3	6	156894	156899	0 %	50 %	50 %	0 %	384124598
3050	NC_017160	G	7	7	156910	156916	0 %	0 %	100 %	0 %	384124598
3051	NC_017160	TGC	2	6	156982	156987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124598
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3053	NC_017160	CGA	2	6	157098	157103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124598
3054	NC_017160	AGGTT	2	10	157107	157116	20 %	40 %	40 %	0 %	384124598
3055	NC_017160	TCA	2	6	157151	157156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124598
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3057	NC_017160	T	7	7	157218	157224	0 %	100 %	0 %	0 %	384124598
3058	NC_017160	CCAG	2	8	157443	157450	25 %	0 %	25 %	50 %	384124598
3059	NC_017160	CAA	2	6	157489	157494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124598
3060	NC_017160	CTT	2	6	157518	157523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124598
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3063	NC_017160	TCT	2	6	157601	157606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124598
3064	NC_017160	TGA	2	6	157667	157672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124598
3065	NC_017160	CAT	2	6	157737	157742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124598
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3067	NC_017160	ATA	2	6	157801	157806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124598
3068	NC_017160	ATTT	2	8	157812	157819	25 %	75 %	0 %	0 %	384124598
3069	NC_017160	ACTC	2	8	158002	158009	25 %	25 %	0 %	50 %	384124598
3070	NC_017160	GT	3	6	158032	158037	0 %	50 %	50 %	0 %	384124598
3071	NC_017160	GCT	2	6	158057	158062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124598
3072	NC_017160	GCG	2	6	158077	158082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124598
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3074	NC_017160	CAG	2	6	158098	158103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124598
3075	NC_017160	CATCC	2	10	158158	158167	20 %	20 %	0 %	60 %	384124598
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3080	NC_017160	CGC	2	6	158433	158438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3081	NC_017160	CA	3	6	158651	158656	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3082	NC_017160	ATA	2	6	158667	158672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_017160	ATA	2	6	158680	158685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_017160	GTGA	2	8	158723	158730	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_017160	TGA	2	6	158892	158897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124599
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3087	NC_017160	TGA	2	6	159160	159165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124599
3088	NC_017160	ATG	2	6	159206	159211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124599
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3090	NC_017160	TGA	2	6	159299	159304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_017160	ATTT	2	8	159323	159330	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_017160	T	6	6	159344	159349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_017160	A	7	7	159365	159371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_017160	GAT	2	6	159375	159380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_017160	ATC	2	6	159387	159392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_017160	T	6	6	159396	159401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_017160	GCT	2	6	159421	159426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_017160	GCCCG	2	10	159533	159542	0 %	0 %	40 %	60 %	384124600
3099	NC_017160	ATCA	2	8	159569	159576	50 %	25 %	0 %	25 %	384124600
3100	NC_017160	GGT	3	9	159594	159602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124600
3101	NC_017160	GCTG	2	8	159657	159664	0 %	25 %	50 %	25 %	384124600
3102	NC_017160	TGC	2	6	159724	159729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124600
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3105	NC_017160	CCAG	2	8	159893	159900	25 %	0 %	25 %	50 %	384124600
3106	NC_017160	CGT	2	6	159995	160000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124600
3107	NC_017160	GTC	2	6	160085	160090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124600
3108	NC_017160	CAT	2	6	160189	160194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124600
3109	NC_017160	TGA	2	6	160207	160212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124600
3110	NC_017160	AGG	2	6	160282	160287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384124600
3111	NC_017160	T	6	6	160467	160472	0 %	100 %	0 %	0 %	384124600
3112	NC_017160	GCC	2	6	160474	160479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124600
3113	NC_017160	CGG	2	6	160561	160566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124600
3114	NC_017160	CTA	2	6	160654	160659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124600
3115	NC_017160	AGCC	2	8	160724	160731	25 %	0 %	25 %	50 %	384124600
3116	NC_017160	ATC	2	6	160739	160744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124600
3117	NC_017160	T	6	6	160793	160798	0 %	100 %	0 %	0 %	384124600
3118	NC_017160	GGACC	2	10	160801	160810	20 %	0 %	40 %	40 %	384124600
3119	NC_017160	TGC	2	6	160873	160878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124600
3120	NC_017160	CAGC	2	8	160882	160889	25 %	0 %	25 %	50 %	384124600
3121	NC_017160	ACT	2	6	160923	160928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124600
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3123	NC_017160	ATC	2	6	161166	161171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124600
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3125	NC_017160	AGC	2	6	161304	161309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124600
3126	NC_017160	ATC	2	6	161388	161393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124600
3127	NC_017160	CTT	2	6	161422	161427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124600
3128	NC_017160	GCA	2	6	161448	161453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124600
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3140	NC_017160	GTA	2	6	162033	162038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3153	NC_017160	AATG	2	8	162657	162664	50 %	25 %	25 %	0 %	384124602
3154	NC_017160	GTG	2	6	162705	162710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124602
3155	NC_017160	GCTCA	2	10	162771	162780	20 %	20 %	20 %	40 %	384124602
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3184	NC_017160	GTG	3	9	164381	164389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3186	NC_017160	TGA	3	9	164587	164595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124605
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3221	NC_017160	TTAA	2	8	166259	166266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3222	NC_017160	TCCC	2	8	166296	166303	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3223	NC_017160	ACG	2	6	166304	166309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3226	NC_017160	GTC	2	6	166531	166536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124607
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3229	NC_017160	A	6	6	166821	166826	100 %	0 %	0 %	0 %	384124607
3230	NC_017160	GAA	2	6	166902	166907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124607
3231	NC_017160	AAG	2	6	167027	167032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3232	NC_017160	GCC	2	6	167099	167104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124608
3233	NC_017160	GTT	2	6	167107	167112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124608
3234	NC_017160	TC	3	6	167201	167206	0 %	50 %	0 %	50 %	384124608
3235	NC_017160	T	6	6	167298	167303	0 %	100 %	0 %	0 %	384124608
3236	NC_017160	TAC	2	6	167335	167340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124608
3237	NC_017160	GTTG	2	8	167341	167348	0 %	50 %	50 %	0 %	384124608
3238	NC_017160	GGC	2	6	167357	167362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124608
3239	NC_017160	CTA	2	6	167430	167435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124608
3240	NC_017160	TTC	2	6	167455	167460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124608
3241	NC_017160	TGG	2	6	167464	167469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124608
3242	NC_017160	ACC	2	6	167474	167479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124608
3243	NC_017160	GGT	3	9	167533	167541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124608
3244	NC_017160	C	6	6	167566	167571	0 %	0 %	0 %	100 %	384124608
3245	NC_017160	TGGCT	2	10	167587	167596	0 %	40 %	40 %	20 %	384124608
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3354	NC_017160	CA	3	6	173161	173166	50 %	0 %	0 %	50 %	384124614
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3359	NC_017160	A	6	6	173427	173432	100 %	0 %	0 %	0 %	384124614
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3363	NC_017160	GCG	2	6	173570	173575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124614
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3367	NC_017160	GTG	2	6	173743	173748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124614
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3371	NC_017160	AGTG	2	8	173929	173936	25 %	25 %	50 %	0 %	384124614
3372	NC_017160	GTT	2	6	173949	173954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124614
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3491	NC_017160	GCCT	2	8	180691	180698	0 %	25 %	25 %	50 %	384124619
3492	NC_017160	GCA	2	6	180782	180787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124619
3493	NC_017160	ACA	2	6	180798	180803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124619
3494	NC_017160	CAC	2	6	180826	180831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124619
3495	NC_017160	GCTT	2	8	180834	180841	0 %	50 %	25 %	25 %	384124619
3496	NC_017160	CAG	2	6	180958	180963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124619
3497	NC_017160	ATC	2	6	180986	180991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124619
3498	NC_017160	CAG	2	6	181021	181026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124619
3499	NC_017160	AAG	2	6	181067	181072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124619
3500	NC_017160	ACC	2	6	181100	181105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124619

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