MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis D106004 plasmid pMT1

Total Repeats: 1778

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017155	GA	3	6	79506	79511	50 %	0 %	50 %	0 %	384124288
1502	NC_017155	ATG	2	6	79565	79570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124288
1503	NC_017155	A	8	8	79634	79641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017155	GGTAA	2	10	79722	79731	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017155	CTT	2	6	79809	79814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_017155	A	6	6	79857	79862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017155	T	6	6	79878	79883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_017155	CATA	2	8	79926	79933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1509	NC_017155	TA	3	6	79990	79995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017155	A	6	6	80070	80075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017155	T	7	7	80092	80098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017155	GTC	2	6	80146	80151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_017155	CCGTT	2	10	80283	80292	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1514	NC_017155	GGA	2	6	80316	80321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017155	CGT	2	6	80335	80340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_017155	GCC	2	6	80443	80448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_017155	ATG	2	6	80495	80500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017155	CTA	2	6	80503	80508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_017155	AAG	2	6	80522	80527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017155	CCG	2	6	80548	80553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1521	NC_017155	TGG	2	6	80558	80563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017155	ACC	2	6	80565	80570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_017155	AGCG	2	8	80603	80610	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_017155	CTT	2	6	80671	80676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124289
1525	NC_017155	GTT	2	6	80749	80754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124289
1526	NC_017155	TGT	2	6	80820	80825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124289
1527	NC_017155	GCCT	2	8	80906	80913	0 %	25 %	25 %	50 %	384124289
1528	NC_017155	TAA	2	6	80915	80920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124289
1529	NC_017155	AG	3	6	80951	80956	50 %	0 %	50 %	0 %	384124289
1530	NC_017155	TGA	2	6	81012	81017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124289
1531	NC_017155	GCA	2	6	81028	81033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124289
1532	NC_017155	GCC	2	6	81042	81047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124289
1533	NC_017155	TGC	2	6	81049	81054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124289
1534	NC_017155	ATA	2	6	81063	81068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124289
1535	NC_017155	GTC	2	6	81140	81145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124289
1536	NC_017155	ACC	2	6	81157	81162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124289
1537	NC_017155	ATC	2	6	81398	81403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124289
1538	NC_017155	CAA	2	6	81406	81411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124289
1539	NC_017155	CAT	2	6	81532	81537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124289
1540	NC_017155	TCT	2	6	81559	81564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124289
1541	NC_017155	TCA	2	6	81565	81570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124289
1542	NC_017155	ATG	2	6	81587	81592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124289
1543	NC_017155	CGCTTT	2	12	81790	81801	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384124290
1544	NC_017155	CAT	2	6	81874	81879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124290
1545	NC_017155	TGC	2	6	81900	81905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124290
1546	NC_017155	TGGT	2	8	81948	81955	0 %	50 %	50 %	0 %	384124290
1547	NC_017155	GCT	2	6	81978	81983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124290
1548	NC_017155	CGT	2	6	82020	82025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124290
1549	NC_017155	AAT	2	6	82060	82065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124290
1550	NC_017155	TTC	2	6	82181	82186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124290
1551	NC_017155	T	6	6	82193	82198	0 %	100 %	0 %	0 %	384124290
1552	NC_017155	T	6	6	82254	82259	0 %	100 %	0 %	0 %	384124290
1553	NC_017155	AGT	2	6	82279	82284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017155	CCTG	2	8	82495	82502	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1555	NC_017155	TTA	2	6	82525	82530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017155	TCC	2	6	82536	82541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_017155	ATG	2	6	82671	82676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017155	ATC	2	6	82730	82735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_017155	AGT	2	6	82793	82798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_017155	AGT	2	6	82859	82864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017155	CGT	2	6	82893	82898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_017155	TTC	2	6	82948	82953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_017155	T	8	8	82973	82980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017155	AAC	2	6	83008	83013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_017155	TTG	2	6	83055	83060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017155	CAA	2	6	83061	83066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_017155	ACC	2	6	83117	83122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1568	NC_017155	ATG	2	6	83181	83186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017155	AAT	2	6	83200	83205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017155	TGT	2	6	83225	83230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_017155	T	6	6	83234	83239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_017155	GT	3	6	83240	83245	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_017155	AT	3	6	83275	83280	50 %	50 %	0 %	0 %	384124291
1574	NC_017155	ATCT	2	8	83290	83297	25 %	50 %	0 %	25 %	384124291
1575	NC_017155	AAAGA	2	10	83394	83403	80 %	0 %	20 %	0 %	384124291
1576	NC_017155	ATC	2	6	83421	83426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124291
1577	NC_017155	GAA	2	6	83504	83509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124291
1578	NC_017155	TAA	2	6	83524	83529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124291
1579	NC_017155	AT	4	8	83583	83590	50 %	50 %	0 %	0 %	384124291
1580	NC_017155	GTC	2	6	83648	83653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124291
1581	NC_017155	CAGT	2	8	83679	83686	25 %	25 %	25 %	25 %	384124291
1582	NC_017155	CCG	2	6	83829	83834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124291
1583	NC_017155	TAT	2	6	83896	83901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124291
1584	NC_017155	TGA	2	6	83932	83937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124291
1585	NC_017155	ACCCCT	2	12	84125	84136	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384124291
1586	NC_017155	GAA	3	9	84206	84214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124291
1587	NC_017155	CAT	2	6	84385	84390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124291
1588	NC_017155	AT	3	6	84490	84495	50 %	50 %	0 %	0 %	384124291
1589	NC_017155	CGTT	2	8	84674	84681	0 %	50 %	25 %	25 %	384124292
1590	NC_017155	CG	3	6	84719	84724	0 %	0 %	50 %	50 %	384124292
1591	NC_017155	GCA	2	6	84759	84764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124292
1592	NC_017155	CGT	2	6	84826	84831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124292
1593	NC_017155	CTGC	2	8	84833	84840	0 %	25 %	25 %	50 %	384124292
1594	NC_017155	TAA	2	6	84846	84851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124292
1595	NC_017155	GAT	2	6	84880	84885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124292
1596	NC_017155	AGA	2	6	84999	85004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124292
1597	NC_017155	GAAA	2	8	85014	85021	75 %	0 %	25 %	0 %	384124292
1598	NC_017155	TC	4	8	85023	85030	0 %	50 %	0 %	50 %	384124292
1599	NC_017155	GCA	2	6	85060	85065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124292
1600	NC_017155	GAA	2	6	85147	85152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124292
1601	NC_017155	ACA	2	6	85157	85162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124292
1602	NC_017155	GA	3	6	85323	85328	50 %	0 %	50 %	0 %	384124292
1603	NC_017155	AGAA	2	8	85354	85361	75 %	0 %	25 %	0 %	384124292
1604	NC_017155	AAG	2	6	85372	85377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124292
1605	NC_017155	TTG	2	6	85382	85387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124292
1606	NC_017155	T	6	6	85508	85513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_017155	CAC	2	6	85524	85529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1608	NC_017155	TTTG	2	8	85546	85553	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017155	CAC	2	6	85592	85597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_017155	AGGC	2	8	85660	85667	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1611	NC_017155	ATC	2	6	85843	85848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_017155	TTCA	2	8	86000	86007	25 %	50 %	0 %	25 %	384124293
1613	NC_017155	CCTC	2	8	86054	86061	0 %	25 %	0 %	75 %	384124293
1614	NC_017155	CA	3	6	86065	86070	50 %	0 %	0 %	50 %	384124293
1615	NC_017155	CGCTT	2	10	86073	86082	0 %	40 %	20 %	40 %	384124293
1616	NC_017155	TTA	2	6	86159	86164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124293
1617	NC_017155	ATG	2	6	86173	86178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124293
1618	NC_017155	CGTT	2	8	86277	86284	0 %	50 %	25 %	25 %	384124293
1619	NC_017155	GTTATT	2	12	86353	86364	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384124293
1620	NC_017155	GAG	2	6	86389	86394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384124293
1621	NC_017155	ATC	2	6	86455	86460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124293
1622	NC_017155	TGATT	2	10	86487	86496	20 %	60 %	20 %	0 %	384124293
1623	NC_017155	GTC	2	6	86561	86566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124293
1624	NC_017155	TGA	2	6	86613	86618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124293
1625	NC_017155	CTA	2	6	86658	86663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124293
1626	NC_017155	GCA	2	6	86678	86683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124293
1627	NC_017155	CTG	2	6	86774	86779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124293
1628	NC_017155	CAT	2	6	86889	86894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124293
1629	NC_017155	CCT	2	6	86897	86902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384124293
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1631	NC_017155	GCAG	2	8	87087	87094	25 %	0 %	50 %	25 %	384124293
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