MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 91405

< Previous12...3031323334353637383940...182183Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_017154	CGC	2	6	858903	858908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121275
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17004	NC_017154	C	6	6	858935	858940	0 %	0 %	0 %	100 %	384121275
17005	NC_017154	ATC	2	6	858949	858954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121275
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17007	NC_017154	CGTA	2	8	859078	859085	25 %	25 %	25 %	25 %	384121275
17008	NC_017154	AAT	2	6	859086	859091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121275
17009	NC_017154	GCT	2	6	859146	859151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121275
17010	NC_017154	C	7	7	859159	859165	0 %	0 %	0 %	100 %	384121275
17011	NC_017154	CAA	2	6	859236	859241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121275
17012	NC_017154	CAG	2	6	859349	859354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121275
17013	NC_017154	CATT	2	8	859500	859507	25 %	50 %	0 %	25 %	384121275
17014	NC_017154	GGA	2	6	859519	859524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384121275
17015	NC_017154	GA	3	6	859523	859528	50 %	0 %	50 %	0 %	384121275
17016	NC_017154	CGTC	2	8	859548	859555	0 %	25 %	25 %	50 %	384121275
17017	NC_017154	TAA	2	6	859650	859655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121275
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17019	NC_017154	TGA	2	6	859758	859763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121275
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17021	NC_017154	ATG	2	6	859801	859806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121275
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17026	NC_017154	CGA	2	6	859940	859945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121275
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17029	NC_017154	T	6	6	860002	860007	0 %	100 %	0 %	0 %	384121275
17030	NC_017154	TCG	2	6	860012	860017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121275
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17033	NC_017154	TAA	2	6	860142	860147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121275
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17035	NC_017154	CAT	2	6	860289	860294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121275
17036	NC_017154	CAT	2	6	860319	860324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121275
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17038	NC_017154	CCTC	2	8	860355	860362	0 %	25 %	0 %	75 %	384121275
17039	NC_017154	ATT	2	6	860377	860382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121275
17040	NC_017154	TAA	2	6	860383	860388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121275
17041	NC_017154	CATAAA	2	12	860448	860459	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17042	NC_017154	TAT	2	6	860530	860535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17043	NC_017154	TTA	2	6	860542	860547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121276
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17045	NC_017154	CAT	2	6	860610	860615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121276
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17053	NC_017154	TA	3	6	861243	861248	50 %	50 %	0 %	0 %	384121276
17054	NC_017154	TAATA	2	10	861264	861273	60 %	40 %	0 %	0 %	384121276
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17088	NC_017154	TAT	2	6	862740	862745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17089	NC_017154	TTTTA	2	10	862746	862755	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17097	NC_017154	GT	3	6	863465	863470	0 %	50 %	50 %	0 %	384121277
17098	NC_017154	GAT	2	6	863572	863577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121277
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17105	NC_017154	TAGA	2	8	863890	863897	50 %	25 %	25 %	0 %	384121277
17106	NC_017154	AAGCGT	2	12	863936	863947	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384121277
17107	NC_017154	TAA	2	6	863997	864002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121277
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17109	NC_017154	TCA	2	6	864062	864067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121277
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17111	NC_017154	TGC	2	6	864128	864133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121277
17112	NC_017154	GGC	2	6	864160	864165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121277
17113	NC_017154	GCT	2	6	864175	864180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121277
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17115	NC_017154	T	6	6	864237	864242	0 %	100 %	0 %	0 %	384121277
17116	NC_017154	TTTA	2	8	864248	864255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17117	NC_017154	GC	3	6	864274	864279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17118	NC_017154	ACA	2	6	864383	864388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121278
17119	NC_017154	GCA	2	6	864425	864430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121278
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