MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 91405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_017154	AAAT	2	8	810229	810236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_017154	GA	3	6	810246	810251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_017154	TCA	2	6	810407	810412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16004	NC_017154	TA	3	6	810456	810461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_017154	TAA	2	6	810504	810509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_017154	TAA	2	6	810512	810517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_017154	ATG	2	6	810531	810536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_017154	ACC	2	6	810544	810549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16009	NC_017154	ATT	2	6	810550	810555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_017154	GCAT	2	8	810580	810587	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16011	NC_017154	TCTT	2	8	810589	810596	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16012	NC_017154	GAA	2	6	810612	810617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_017154	ATT	2	6	810627	810632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_017154	TCT	2	6	810659	810664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121254
16015	NC_017154	GTT	2	6	810673	810678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121254
16016	NC_017154	ATCACG	2	12	810705	810716	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384121254
16017	NC_017154	CTG	2	6	810731	810736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121254
16018	NC_017154	T	7	7	810784	810790	0 %	100 %	0 %	0 %	384121254
16019	NC_017154	T	6	6	810800	810805	0 %	100 %	0 %	0 %	384121254
16020	NC_017154	ATT	2	6	810818	810823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121254
16021	NC_017154	T	6	6	810830	810835	0 %	100 %	0 %	0 %	384121254
16022	NC_017154	AC	3	6	810931	810936	50 %	0 %	0 %	50 %	384121254
16023	NC_017154	ATA	2	6	810950	810955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121254
16024	NC_017154	CTTCGC	2	12	811087	811098	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384121254
16025	NC_017154	AAAT	2	8	811143	811150	75 %	25 %	0 %	0 %	384121254
16026	NC_017154	CAC	2	6	811304	811309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121254
16027	NC_017154	CCA	2	6	811339	811344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121254
16028	NC_017154	CG	3	6	811396	811401	0 %	0 %	50 %	50 %	384121254
16029	NC_017154	CGGT	2	8	811578	811585	0 %	25 %	50 %	25 %	384121254
16030	NC_017154	TGC	2	6	811638	811643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121254
16031	NC_017154	CAT	2	6	811696	811701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121254
16032	NC_017154	CTGCC	2	10	811779	811788	0 %	20 %	20 %	60 %	384121254
16033	NC_017154	TCC	2	6	811794	811799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384121254
16034	NC_017154	AGT	2	6	811831	811836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121254
16035	NC_017154	GTT	2	6	811936	811941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121254
16036	NC_017154	CTG	2	6	811997	812002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121254
16037	NC_017154	CGTAGC	2	12	812026	812037	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384121254
16038	NC_017154	GTC	2	6	812060	812065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121254
16039	NC_017154	GCT	2	6	812092	812097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121254
16040	NC_017154	CTG	2	6	812102	812107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121254
16041	NC_017154	CGG	2	6	812110	812115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121254
16042	NC_017154	TGC	2	6	812154	812159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121254
16043	NC_017154	CCG	2	6	812212	812217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121254
16044	NC_017154	TCA	2	6	812277	812282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121254
16045	NC_017154	TTC	2	6	812292	812297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121254
16046	NC_017154	CGG	2	6	812394	812399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121254
16047	NC_017154	CTT	2	6	812419	812424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121254
16048	NC_017154	TTC	2	6	812498	812503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121254
16049	NC_017154	T	6	6	812690	812695	0 %	100 %	0 %	0 %	384121254
16050	NC_017154	GCC	2	6	812727	812732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121254
16051	NC_017154	T	6	6	812735	812740	0 %	100 %	0 %	0 %	384121254
16052	NC_017154	CAG	2	6	812741	812746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121254
16053	NC_017154	CAT	2	6	812821	812826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121254
16054	NC_017154	GCT	2	6	812842	812847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121254
16055	NC_017154	CCA	2	6	812857	812862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121254
16056	NC_017154	CCA	2	6	812866	812871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121254
16057	NC_017154	TCA	2	6	812883	812888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121254
16058	NC_017154	CCTTG	2	10	812935	812944	0 %	40 %	20 %	40 %	384121254
16059	NC_017154	GCC	2	6	812959	812964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121254
16060	NC_017154	CCG	2	6	812973	812978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121254
16061	NC_017154	ATC	2	6	813005	813010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121254
16062	NC_017154	GCT	2	6	813029	813034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121254
16063	NC_017154	TCT	2	6	813051	813056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121254
16064	NC_017154	CAT	2	6	813136	813141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121254
16065	NC_017154	TCG	2	6	813198	813203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121254
16066	NC_017154	GCA	2	6	813208	813213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121254
16067	NC_017154	GGT	2	6	813215	813220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121254
16068	NC_017154	GTA	2	6	813350	813355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121254
16069	NC_017154	CGGT	2	8	813372	813379	0 %	25 %	50 %	25 %	384121254
16070	NC_017154	AT	3	6	813405	813410	50 %	50 %	0 %	0 %	384121254
16071	NC_017154	CCA	2	6	813481	813486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121254
16072	NC_017154	CGC	2	6	813492	813497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121254
16073	NC_017154	GCCA	2	8	813652	813659	25 %	0 %	25 %	50 %	384121254
16074	NC_017154	CCG	3	9	813706	813714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121254
16075	NC_017154	GAA	2	6	813755	813760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121254
16076	NC_017154	CTG	2	6	813824	813829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121254
16077	NC_017154	CCA	2	6	813907	813912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121254
16078	NC_017154	ATA	2	6	814010	814015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121254
16079	NC_017154	CCA	2	6	814045	814050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121254
16080	NC_017154	ACC	2	6	814068	814073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121254
16081	NC_017154	CAT	2	6	814202	814207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121254
16082	NC_017154	GCC	2	6	814235	814240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121254
16083	NC_017154	CAC	3	9	814241	814249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121254
16084	NC_017154	GGC	2	6	814252	814257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121254
16085	NC_017154	TGC	2	6	814414	814419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121254
16086	NC_017154	CGGT	2	8	814547	814554	0 %	25 %	50 %	25 %	384121254
16087	NC_017154	C	6	6	814559	814564	0 %	0 %	0 %	100 %	384121254
16088	NC_017154	GCC	3	9	814565	814573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121254
16089	NC_017154	TAC	2	6	814658	814663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121254
16090	NC_017154	ATT	2	6	814667	814672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121254
16091	NC_017154	CGC	2	6	814673	814678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121254
16092	NC_017154	CGC	2	6	814721	814726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121254
16093	NC_017154	AAT	2	6	814728	814733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121254
16094	NC_017154	TCC	2	6	814743	814748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384121254
16095	NC_017154	CAG	2	6	814756	814761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121254
16096	NC_017154	ACC	2	6	814797	814802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121254
16097	NC_017154	ATGGGG	2	12	814850	814861	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384121254
16098	NC_017154	GAGG	2	8	814881	814888	25 %	0 %	75 %	0 %	384121254
16099	NC_017154	AAT	2	6	814889	814894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121254
16100	NC_017154	GCG	2	6	815003	815008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121255
16101	NC_017154	ATA	2	6	815011	815016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121255
16102	NC_017154	TCA	2	6	815026	815031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121255
16103	NC_017154	AGAA	2	8	815043	815050	75 %	0 %	25 %	0 %	384121255
16104	NC_017154	TCG	2	6	815143	815148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121255
16105	NC_017154	AAT	2	6	815204	815209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121255
16106	NC_017154	CCA	2	6	815217	815222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121255
16107	NC_017154	GCC	3	9	815269	815277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121255
16108	NC_017154	TGC	2	6	815310	815315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121255
16109	NC_017154	AAT	2	6	815359	815364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121255
16110	NC_017154	CAAC	2	8	815372	815379	50 %	0 %	0 %	50 %	384121255
16111	NC_017154	TAT	2	6	815403	815408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121255
16112	NC_017154	CTT	2	6	815420	815425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121255
16113	NC_017154	TGAT	2	8	815433	815440	25 %	50 %	25 %	0 %	384121255
16114	NC_017154	TAA	2	6	815493	815498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121255
16115	NC_017154	GC	3	6	815565	815570	0 %	0 %	50 %	50 %	384121255
16116	NC_017154	AATA	2	8	815613	815620	75 %	25 %	0 %	0 %	384121255
16117	NC_017154	ACG	2	6	815622	815627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121255
16118	NC_017154	ACA	2	6	815863	815868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121255
16119	NC_017154	CAAA	2	8	815887	815894	75 %	0 %	0 %	25 %	384121255
16120	NC_017154	GAT	2	6	815912	815917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121255
16121	NC_017154	TGA	2	6	815953	815958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121255
16122	NC_017154	G	6	6	815980	815985	0 %	0 %	100 %	0 %	384121255
16123	NC_017154	CGC	3	9	816006	816014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121255
16124	NC_017154	TGA	2	6	816031	816036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121255
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16126	NC_017154	TAT	2	6	816057	816062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121255
16127	NC_017154	CAT	2	6	816095	816100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121255
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16130	NC_017154	TCA	2	6	816229	816234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121255
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16133	NC_017154	TCCT	2	8	816296	816303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16134	NC_017154	GTC	2	6	816398	816403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121256
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16142	NC_017154	T	7	7	816653	816659	0 %	100 %	0 %	0 %	384121256
16143	NC_017154	ATCT	2	8	816691	816698	25 %	50 %	0 %	25 %	384121256
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16182	NC_017154	T	6	6	818973	818978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16242	NC_017154	AAT	2	6	822182	822187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121258
16243	NC_017154	ATT	2	6	822267	822272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121258
16244	NC_017154	GCT	2	6	822435	822440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121258
16245	NC_017154	ATC	2	6	822502	822507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121258
16246	NC_017154	ATG	2	6	822634	822639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121258
16247	NC_017154	GAT	2	6	822684	822689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121258
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16249	NC_017154	TTG	2	6	822736	822741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121258
16250	NC_017154	ACG	2	6	822743	822748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121258
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16252	NC_017154	AAAT	2	8	822866	822873	75 %	25 %	0 %	0 %	384121258
16253	NC_017154	AT	3	6	822923	822928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16254	NC_017154	GT	3	6	823042	823047	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16255	NC_017154	GTT	2	6	823055	823060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16256	NC_017154	AATA	2	8	823113	823120	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16257	NC_017154	T	7	7	823166	823172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16258	NC_017154	AAC	2	6	823217	823222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16259	NC_017154	ATTT	2	8	823227	823234	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16260	NC_017154	AAAT	2	8	823256	823263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16261	NC_017154	TTTA	2	8	823271	823278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16262	NC_017154	TTG	2	6	823293	823298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16263	NC_017154	TAAA	2	8	823306	823313	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16264	NC_017154	ATTT	2	8	823316	823323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16265	NC_017154	T	6	6	823321	823326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16266	NC_017154	GTTT	2	8	823335	823342	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16267	NC_017154	T	6	6	823340	823345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16268	NC_017154	TAA	2	6	823357	823362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16303	NC_017154	CTG	2	6	825598	825603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16305	NC_017154	GATCA	2	10	825625	825634	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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16338	NC_017154	TA	3	6	827304	827309	50 %	50 %	0 %	0 %	384121260
16339	NC_017154	ATT	2	6	827414	827419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16343	NC_017154	A	6	6	827535	827540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16344	NC_017154	ATA	2	6	827589	827594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16345	NC_017154	AAT	2	6	827595	827600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16346	NC_017154	ATCA	2	8	827604	827611	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16347	NC_017154	TCA	2	6	827622	827627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16348	NC_017154	A	8	8	827630	827637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16349	NC_017154	TCAGA	2	10	827682	827691	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16350	NC_017154	AT	3	6	827730	827735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16351	NC_017154	CGT	2	6	827788	827793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16353	NC_017154	TCAT	2	8	827874	827881	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16354	NC_017154	ATA	2	6	827911	827916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16355	NC_017154	CGTT	2	8	827987	827994	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16356	NC_017154	ACG	2	6	828023	828028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16357	NC_017154	ATCT	2	8	828061	828068	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16358	NC_017154	A	6	6	828087	828092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16359	NC_017154	GGA	2	6	828094	828099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16360	NC_017154	CAAC	2	8	828197	828204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16361	NC_017154	GAT	2	6	828231	828236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16362	NC_017154	CAG	2	6	828331	828336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121261
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16364	NC_017154	ACCA	2	8	828349	828356	50 %	0 %	0 %	50 %	384121261
16365	NC_017154	GCA	2	6	828545	828550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121261
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16367	NC_017154	AGCCA	2	10	828623	828632	40 %	0 %	20 %	40 %	384121261
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16493	NC_017154	TCATT	2	10	833788	833797	20 %	60 %	0 %	20 %	384121264
16494	NC_017154	CCAA	2	8	833808	833815	50 %	0 %	0 %	50 %	384121264
16495	NC_017154	ATG	2	6	833854	833859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121264
16496	NC_017154	TGAGAT	2	12	833923	833934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121264
16497	NC_017154	AAAC	2	8	833967	833974	75 %	0 %	0 %	25 %	384121264
16498	NC_017154	GCA	2	6	834138	834143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121264
16499	NC_017154	A	7	7	834147	834153	100 %	0 %	0 %	0 %	384121264
16500	NC_017154	TCC	2	6	834175	834180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384121264

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