MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 91405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_017154	C	7	7	765456	765462	0 %	0 %	0 %	100 %	384121209
15003	NC_017154	CAG	2	6	765471	765476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121209
15004	NC_017154	CAG	2	6	765489	765494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121209
15005	NC_017154	CAG	2	6	765504	765509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121209
15006	NC_017154	TGA	2	6	765518	765523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121209
15007	NC_017154	TAA	2	6	765595	765600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121210
15008	NC_017154	CAC	3	9	765626	765634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121210
15009	NC_017154	ATG	2	6	765651	765656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121210
15010	NC_017154	GCCA	2	8	765683	765690	25 %	0 %	25 %	50 %	384121210
15011	NC_017154	ATT	2	6	765716	765721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121210
15012	NC_017154	TCA	2	6	765819	765824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121210
15013	NC_017154	TTG	2	6	765829	765834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121210
15014	NC_017154	T	6	6	765838	765843	0 %	100 %	0 %	0 %	384121210
15015	NC_017154	TTG	2	6	765942	765947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121210
15016	NC_017154	GTCA	2	8	765962	765969	25 %	25 %	25 %	25 %	384121210
15017	NC_017154	GTTGG	2	10	765981	765990	0 %	40 %	60 %	0 %	384121211
15018	NC_017154	GGC	2	6	766035	766040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121211
15019	NC_017154	CTT	2	6	766052	766057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121211
15020	NC_017154	AATA	2	8	766062	766069	75 %	25 %	0 %	0 %	384121211
15021	NC_017154	ATA	2	6	766099	766104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121211
15022	NC_017154	T	6	6	766182	766187	0 %	100 %	0 %	0 %	384121211
15023	NC_017154	CT	3	6	766207	766212	0 %	50 %	0 %	50 %	384121211
15024	NC_017154	T	7	7	766225	766231	0 %	100 %	0 %	0 %	384121211
15025	NC_017154	CTAT	2	8	766273	766280	25 %	50 %	0 %	25 %	384121211
15026	NC_017154	A	7	7	766332	766338	100 %	0 %	0 %	0 %	384121211
15027	NC_017154	TGT	2	6	766379	766384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121211
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15029	NC_017154	AAGA	2	8	766419	766426	75 %	0 %	25 %	0 %	384121211
15030	NC_017154	GTTT	2	8	766448	766455	0 %	75 %	25 %	0 %	384121211
15031	NC_017154	T	6	6	766453	766458	0 %	100 %	0 %	0 %	384121211
15032	NC_017154	TCT	2	6	766465	766470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121211
15033	NC_017154	CGTGGT	2	12	766497	766508	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384121211
15034	NC_017154	T	9	9	766508	766516	0 %	100 %	0 %	0 %	384121211
15035	NC_017154	TAG	2	6	766552	766557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121211
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15037	NC_017154	CTGG	2	8	766614	766621	0 %	25 %	50 %	25 %	384121211
15038	NC_017154	TTTG	2	8	766651	766658	0 %	75 %	25 %	0 %	384121211
15039	NC_017154	ATC	2	6	766668	766673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121211
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15041	NC_017154	A	6	6	766702	766707	100 %	0 %	0 %	0 %	384121211
15042	NC_017154	AAT	2	6	766728	766733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121211
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15044	NC_017154	GGC	2	6	766775	766780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121211
15045	NC_017154	CTTTG	2	10	766836	766845	0 %	60 %	20 %	20 %	384121211
15046	NC_017154	TAGAGG	2	12	766959	766970	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15047	NC_017154	ACA	2	6	766975	766980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15048	NC_017154	TCT	2	6	766981	766986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15049	NC_017154	TC	3	6	766990	766995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15050	NC_017154	GCT	2	6	767024	767029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15051	NC_017154	TATT	3	12	767113	767124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_017154	ATTT	2	8	767126	767133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15053	NC_017154	T	6	6	767135	767140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_017154	TGG	2	6	767180	767185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15055	NC_017154	ATTTA	2	10	767204	767213	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_017154	T	6	6	767218	767223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15057	NC_017154	ATTT	2	8	767291	767298	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_017154	T	6	6	767296	767301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_017154	ATG	2	6	767304	767309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15061	NC_017154	ATG	2	6	767385	767390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121212
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15083	NC_017154	GGAT	2	8	768428	768435	25 %	25 %	50 %	0 %	384121213
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15085	NC_017154	GGCA	2	8	768507	768514	25 %	0 %	50 %	25 %	384121213
15086	NC_017154	CCAG	2	8	768537	768544	25 %	0 %	25 %	50 %	384121213
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15090	NC_017154	ACA	2	6	768642	768647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121213
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15098	NC_017154	GCA	2	6	769169	769174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121214
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15102	NC_017154	GGT	2	6	769440	769445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121214
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15111	NC_017154	AT	3	6	769821	769826	50 %	50 %	0 %	0 %	384121214
15112	NC_017154	GGT	2	6	769890	769895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121214
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15122	NC_017154	CAA	2	6	770368	770373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121214
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15124	NC_017154	ATG	2	6	770457	770462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121214
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15240	NC_017154	GACG	2	8	775956	775963	25 %	0 %	50 %	25 %	384121220
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15243	NC_017154	ATTA	2	8	776035	776042	50 %	50 %	0 %	0 %	384121220
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15365	NC_017154	TCC	2	6	782368	782373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384121229
15366	NC_017154	GGC	2	6	782398	782403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121229
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15380	NC_017154	ATC	2	6	783174	783179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15382	NC_017154	GCC	2	6	783307	783312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15383	NC_017154	GAT	2	6	783313	783318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15385	NC_017154	ATG	2	6	783346	783351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15442	NC_017154	TTGG	2	8	785754	785761	0 %	50 %	50 %	0 %	384121231
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15461	NC_017154	CTGCAA	2	12	786914	786925	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15462	NC_017154	GCA	2	6	786948	786953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15472	NC_017154	TTTC	2	8	787416	787423	0 %	75 %	0 %	25 %	384121233
15473	NC_017154	AGA	2	6	787428	787433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121233
15474	NC_017154	TGC	2	6	787440	787445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121233
15475	NC_017154	AGT	2	6	787474	787479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121233
15476	NC_017154	CATTT	2	10	787501	787510	20 %	60 %	0 %	20 %	384121233
15477	NC_017154	TC	3	6	787516	787521	0 %	50 %	0 %	50 %	384121234
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15480	NC_017154	GA	4	8	787642	787649	50 %	0 %	50 %	0 %	384121234
15481	NC_017154	TAA	3	9	787652	787660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121234
15482	NC_017154	TTTA	2	8	787693	787700	25 %	75 %	0 %	0 %	384121234
15483	NC_017154	CTG	2	6	787744	787749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121234
15484	NC_017154	CCA	2	6	787767	787772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121234
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15486	NC_017154	TCA	2	6	787965	787970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121234
15487	NC_017154	TTC	2	6	788026	788031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121234
15488	NC_017154	TGC	2	6	788074	788079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121234
15489	NC_017154	TCA	2	6	788126	788131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121234
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15491	NC_017154	CCG	2	6	788157	788162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121234
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