MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 91405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_017154	T	8	8	718139	718146	0 %	100 %	0 %	0 %	384121167
14003	NC_017154	TAC	2	6	718240	718245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121167
14004	NC_017154	TTA	2	6	718329	718334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121167
14005	NC_017154	GAT	2	6	718349	718354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121167
14006	NC_017154	GAG	2	6	718356	718361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384121167
14007	NC_017154	AGA	3	9	718397	718405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121167
14008	NC_017154	AGCC	2	8	718451	718458	25 %	0 %	25 %	50 %	384121167
14009	NC_017154	GGT	2	6	718461	718466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121167
14010	NC_017154	CGA	2	6	718507	718512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121167
14011	NC_017154	GAA	2	6	718539	718544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121167
14012	NC_017154	TGT	2	6	718565	718570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121167
14013	NC_017154	GAA	2	6	718599	718604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121167
14014	NC_017154	TGAT	2	8	718609	718616	25 %	50 %	25 %	0 %	384121167
14015	NC_017154	CGC	2	6	718619	718624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121167
14016	NC_017154	TGGC	2	8	718644	718651	0 %	25 %	50 %	25 %	384121167
14017	NC_017154	ATAA	2	8	718702	718709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_017154	A	6	6	718708	718713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_017154	GAT	2	6	718757	718762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121168
14020	NC_017154	AAG	2	6	718849	718854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121168
14021	NC_017154	GTC	2	6	718899	718904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121168
14022	NC_017154	CTG	2	6	718924	718929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121168
14023	NC_017154	TGG	2	6	718954	718959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121168
14024	NC_017154	ATG	2	6	718972	718977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121168
14025	NC_017154	GT	3	6	718992	718997	0 %	50 %	50 %	0 %	384121168
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14028	NC_017154	AGAC	2	8	719149	719156	50 %	0 %	25 %	25 %	384121168
14029	NC_017154	ATA	2	6	719181	719186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_017154	G	7	7	719204	719210	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_017154	CG	3	6	719358	719363	0 %	0 %	50 %	50 %	384121169
14032	NC_017154	ATT	2	6	719376	719381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121169
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14034	NC_017154	CGC	2	6	719444	719449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121169
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14036	NC_017154	CCAG	2	8	719522	719529	25 %	0 %	25 %	50 %	384121169
14037	NC_017154	TGGA	2	8	719667	719674	25 %	25 %	50 %	0 %	384121169
14038	NC_017154	TTG	2	6	719715	719720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121169
14039	NC_017154	CAT	2	6	719724	719729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121169
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14043	NC_017154	TGGTA	2	10	719865	719874	20 %	40 %	40 %	0 %	384121169
14044	NC_017154	AGCC	2	8	719885	719892	25 %	0 %	25 %	50 %	384121169
14045	NC_017154	TG	3	6	719901	719906	0 %	50 %	50 %	0 %	384121169
14046	NC_017154	G	6	6	719985	719990	0 %	0 %	100 %	0 %	384121169
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14051	NC_017154	TTC	2	6	720259	720264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121170
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14055	NC_017154	TAT	2	6	720530	720535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121170
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14057	NC_017154	CGT	2	6	720805	720810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121171
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14060	NC_017154	GCTG	2	8	720885	720892	0 %	25 %	50 %	25 %	384121171
14061	NC_017154	CGT	2	6	720901	720906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121171
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14063	NC_017154	TGAT	2	8	720944	720951	25 %	50 %	25 %	0 %	384121171
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14070	NC_017154	CAA	2	6	721362	721367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121171
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14103	NC_017154	GCT	2	6	723111	723116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121172
14104	NC_017154	CTAC	2	8	723153	723160	25 %	25 %	0 %	50 %	384121172
14105	NC_017154	CAT	2	6	723180	723185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121172
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14107	NC_017154	CGG	2	6	723264	723269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121172
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14109	NC_017154	CT	3	6	723355	723360	0 %	50 %	0 %	50 %	384121172
14110	NC_017154	TTA	2	6	723453	723458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121172
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14112	NC_017154	GC	3	6	723478	723483	0 %	0 %	50 %	50 %	384121172
14113	NC_017154	GAGG	2	8	723555	723562	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14114	NC_017154	AG	4	8	723588	723595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_017154	GAA	2	6	723778	723783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121173
14116	NC_017154	GGC	2	6	723918	723923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121173
14117	NC_017154	TCA	2	6	723944	723949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121173
14118	NC_017154	CCA	2	6	723982	723987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121173
14119	NC_017154	GTG	2	6	724067	724072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121173
14120	NC_017154	TGG	2	6	724082	724087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121173
14121	NC_017154	TAA	2	6	724173	724178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121173
14122	NC_017154	TTG	2	6	724238	724243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14123	NC_017154	AAT	2	6	724298	724303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14124	NC_017154	GCAA	2	8	724341	724348	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14125	NC_017154	GATTGA	2	12	724362	724373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14126	NC_017154	TGACT	2	10	724503	724512	20 %	40 %	20 %	20 %	384121174
14127	NC_017154	TCA	2	6	724583	724588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121174
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14129	NC_017154	ATC	2	6	724730	724735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121174
14130	NC_017154	TGCT	2	8	724749	724756	0 %	50 %	25 %	25 %	384121174
14131	NC_017154	GAT	2	6	724837	724842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121174
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14133	NC_017154	GC	3	6	724984	724989	0 %	0 %	50 %	50 %	384121174
14134	NC_017154	CA	3	6	725054	725059	50 %	0 %	0 %	50 %	384121174
14135	NC_017154	GCAG	2	8	725076	725083	25 %	0 %	50 %	25 %	384121174
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14140	NC_017154	A	6	6	725245	725250	100 %	0 %	0 %	0 %	384121174
14141	NC_017154	GC	3	6	725331	725336	0 %	0 %	50 %	50 %	384121174
14142	NC_017154	TGA	2	6	725367	725372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121174
14143	NC_017154	TGA	2	6	725441	725446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121174
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14148	NC_017154	TGGT	2	8	725557	725564	0 %	50 %	50 %	0 %	384121174
14149	NC_017154	CCG	2	6	725568	725573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121174
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14151	NC_017154	TGA	2	6	725667	725672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121174
14152	NC_017154	ATC	2	6	725683	725688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121174
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14154	NC_017154	CTG	2	6	725857	725862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121174
14155	NC_017154	AAGA	2	8	725893	725900	75 %	0 %	25 %	0 %	384121174
14156	NC_017154	TGC	3	9	725913	725921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121174
14157	NC_017154	TGA	2	6	725928	725933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121174
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14172	NC_017154	GCG	2	6	726544	726549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121174
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14175	NC_017154	TGG	2	6	726811	726816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14176	NC_017154	GC	3	6	726875	726880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14177	NC_017154	AAGT	2	8	726928	726935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14178	NC_017154	GT	5	10	727108	727117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14184	NC_017154	CTG	2	6	727351	727356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121175
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14192	NC_017154	CG	3	6	727827	727832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14193	NC_017154	GTC	2	6	727980	727985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121176
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14200	NC_017154	GC	4	8	728131	728138	0 %	0 %	50 %	50 %	384121176
14201	NC_017154	TGA	2	6	728224	728229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121176
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14209	NC_017154	ATT	2	6	728605	728610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121176
14210	NC_017154	TTG	2	6	728634	728639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121176
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14213	NC_017154	TACGTT	2	12	728658	728669	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384121176
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14220	NC_017154	CAGAT	2	10	728997	729006	40 %	20 %	20 %	20 %	384121176
14221	NC_017154	CAG	2	6	729110	729115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121176
14222	NC_017154	ATA	2	6	729134	729139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121176
14223	NC_017154	TTTC	2	8	729177	729184	0 %	75 %	0 %	25 %	384121176
14224	NC_017154	GCG	2	6	729206	729211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121176
14225	NC_017154	TCA	2	6	729293	729298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121176
14226	NC_017154	CGG	2	6	729354	729359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121176
14227	NC_017154	GCA	2	6	729377	729382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121176
14228	NC_017154	GTG	2	6	729410	729415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14229	NC_017154	TCGGT	2	10	729417	729426	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14230	NC_017154	CAA	2	6	729562	729567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14231	NC_017154	CCAT	2	8	729580	729587	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14232	NC_017154	TCA	2	6	729589	729594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14233	NC_017154	AT	3	6	729599	729604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14234	NC_017154	GCCG	2	8	729638	729645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14235	NC_017154	TGA	2	6	729647	729652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14236	NC_017154	ACC	2	6	729666	729671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14237	NC_017154	GGA	2	6	729800	729805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384121177
14238	NC_017154	TTGGG	2	10	729816	729825	0 %	40 %	60 %	0 %	384121177
14239	NC_017154	TCA	2	6	729844	729849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121177
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14241	NC_017154	TCGGG	2	10	729923	729932	0 %	20 %	60 %	20 %	384121177
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14362	NC_017154	CAG	2	6	736034	736039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121182
14363	NC_017154	CCA	2	6	736138	736143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121182
14364	NC_017154	GGC	2	6	736148	736153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121182
14365	NC_017154	AACA	2	8	736166	736173	75 %	0 %	0 %	25 %	384121182
14366	NC_017154	GC	3	6	736182	736187	0 %	0 %	50 %	50 %	384121182
14367	NC_017154	AAC	2	6	736212	736217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121182
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14372	NC_017154	TGG	2	6	736559	736564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14373	NC_017154	GTG	2	6	736705	736710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14374	NC_017154	AAT	2	6	736800	736805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121183
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14398	NC_017154	TGT	2	6	737932	737937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14399	NC_017154	GCCA	2	8	737967	737974	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14400	NC_017154	CATT	2	8	737976	737983	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14401	NC_017154	ATG	2	6	738008	738013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14402	NC_017154	TTG	2	6	738015	738020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14403	NC_017154	A	7	7	738043	738049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14404	NC_017154	AG	3	6	738054	738059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14405	NC_017154	A	7	7	738089	738095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14406	NC_017154	TAA	2	6	738127	738132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14413	NC_017154	A	7	7	738292	738298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14435	NC_017154	TTAT	2	8	739285	739292	25 %	75 %	0 %	0 %	384121184
14436	NC_017154	CTG	2	6	739359	739364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121184
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14451	NC_017154	TCA	3	9	740002	740010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121186
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14465	NC_017154	T	7	7	740798	740804	0 %	100 %	0 %	0 %	384121186
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14471	NC_017154	TAAG	2	8	741126	741133	50 %	25 %	25 %	0 %	384121186
14472	NC_017154	TAA	2	6	741138	741143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121186
14473	NC_017154	TAT	2	6	741287	741292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121186
14474	NC_017154	ATT	2	6	741315	741320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121186
14475	NC_017154	AG	3	6	741360	741365	50 %	0 %	50 %	0 %	384121186
14476	NC_017154	CT	3	6	741371	741376	0 %	50 %	0 %	50 %	384121186
14477	NC_017154	TAA	2	6	741476	741481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14478	NC_017154	A	6	6	741480	741485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14479	NC_017154	T	7	7	741518	741524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14480	NC_017154	AT	3	6	741529	741534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14481	NC_017154	GAT	2	6	741577	741582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121187
14482	NC_017154	G	8	8	741631	741638	0 %	0 %	100 %	0 %	384121187
14483	NC_017154	TCA	2	6	741766	741771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121187
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