MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 91405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_017154	ATC	2	6	694610	694615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121147
13502	NC_017154	GAT	2	6	694618	694623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121147
13503	NC_017154	CGA	2	6	694644	694649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121147
13504	NC_017154	GTCG	2	8	694789	694796	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13505	NC_017154	CAA	2	6	694807	694812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13506	NC_017154	T	7	7	694827	694833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_017154	CGC	2	6	694836	694841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13508	NC_017154	T	7	7	694913	694919	0 %	100 %	0 %	0 %	384121148
13509	NC_017154	TTC	2	6	694958	694963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121148
13510	NC_017154	GTT	2	6	695113	695118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121148
13511	NC_017154	TAT	2	6	695128	695133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121148
13512	NC_017154	CAAC	2	8	695191	695198	50 %	0 %	0 %	50 %	384121148
13513	NC_017154	AATA	2	8	695201	695208	75 %	25 %	0 %	0 %	384121148
13514	NC_017154	GGTA	2	8	695335	695342	25 %	25 %	50 %	0 %	384121148
13515	NC_017154	GCTG	2	8	695380	695387	0 %	25 %	50 %	25 %	384121148
13516	NC_017154	TCA	2	6	695388	695393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121148
13517	NC_017154	AGCGC	2	10	695434	695443	20 %	0 %	40 %	40 %	384121148
13518	NC_017154	GC	3	6	695493	695498	0 %	0 %	50 %	50 %	384121148
13519	NC_017154	GCT	2	6	695507	695512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121148
13520	NC_017154	AAG	2	6	695544	695549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121148
13521	NC_017154	GCC	2	6	695565	695570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121148
13522	NC_017154	GTT	2	6	695578	695583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121148
13523	NC_017154	CTT	2	6	695599	695604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121148
13524	NC_017154	CGTC	2	8	695661	695668	0 %	25 %	25 %	50 %	384121148
13525	NC_017154	GGC	2	6	695705	695710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121148
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13527	NC_017154	CCA	2	6	695845	695850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121148
13528	NC_017154	GGGTT	2	10	695881	695890	0 %	40 %	60 %	0 %	384121148
13529	NC_017154	GAT	2	6	695893	695898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121148
13530	NC_017154	GGC	2	6	695929	695934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121148
13531	NC_017154	TTTCTG	2	12	695947	695958	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384121148
13532	NC_017154	CGCC	2	8	695997	696004	0 %	0 %	25 %	75 %	384121148
13533	NC_017154	CCCG	2	8	696016	696023	0 %	0 %	25 %	75 %	384121148
13534	NC_017154	GAT	2	6	696200	696205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121149
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13536	NC_017154	CTG	2	6	696273	696278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121149
13537	NC_017154	GTG	2	6	696343	696348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121149
13538	NC_017154	CTGC	2	8	696352	696359	0 %	25 %	25 %	50 %	384121149
13539	NC_017154	TGG	2	6	696386	696391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121149
13540	NC_017154	TTC	2	6	696396	696401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121149
13541	NC_017154	TCA	2	6	696434	696439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121149
13542	NC_017154	A	6	6	696439	696444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_017154	ATG	2	6	696528	696533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13544	NC_017154	CTT	2	6	696567	696572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13545	NC_017154	GAT	2	6	696600	696605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13546	NC_017154	ACT	2	6	696733	696738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13547	NC_017154	TTC	2	6	696750	696755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13548	NC_017154	A	6	6	696762	696767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13549	NC_017154	GAA	2	6	696789	696794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13550	NC_017154	GCG	2	6	696810	696815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13551	NC_017154	TTC	2	6	696835	696840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13552	NC_017154	CAG	2	6	696854	696859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13553	NC_017154	AGT	2	6	696882	696887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13554	NC_017154	ACG	3	9	696906	696914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13555	NC_017154	ACG	2	6	696957	696962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13556	NC_017154	TGC	2	6	697039	697044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13557	NC_017154	TGC	2	6	697095	697100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13558	NC_017154	CAC	2	6	697110	697115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13559	NC_017154	A	7	7	697163	697169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13560	NC_017154	TA	3	6	697200	697205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13561	NC_017154	T	7	7	697238	697244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13562	NC_017154	CA	3	6	697245	697250	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13563	NC_017154	ACA	2	6	697294	697299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13564	NC_017154	ATG	2	6	697401	697406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13572	NC_017154	TTG	2	6	697761	697766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121150
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13589	NC_017154	GTGGCT	2	12	698629	698640	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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13593	NC_017154	T	6	6	698726	698731	0 %	100 %	0 %	0 %	384121151
13594	NC_017154	CTT	2	6	698758	698763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121151
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13604	NC_017154	CTG	3	9	699160	699168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121151
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13607	NC_017154	AAT	2	6	699341	699346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121151
13608	NC_017154	ATA	2	6	699373	699378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121151
13609	NC_017154	GGCA	2	8	699405	699412	25 %	0 %	50 %	25 %	384121151
13610	NC_017154	TATT	2	8	699443	699450	25 %	75 %	0 %	0 %	384121152
13611	NC_017154	ACC	2	6	699469	699474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121152
13612	NC_017154	CAG	2	6	699505	699510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121152
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13619	NC_017154	TGT	2	6	699838	699843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13620	NC_017154	CTT	2	6	699881	699886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13621	NC_017154	CGC	2	6	699897	699902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13873	NC_017154	GCTG	2	8	712533	712540	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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