MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 91405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_017154	TGG	2	6	644615	644620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121117
12503	NC_017154	TGG	2	6	644676	644681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121117
12504	NC_017154	GGT	2	6	644757	644762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121117
12505	NC_017154	GCC	2	6	644785	644790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121117
12506	NC_017154	CT	3	6	644865	644870	0 %	50 %	0 %	50 %	384121117
12507	NC_017154	TTAA	2	8	644949	644956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_017154	CT	3	6	644962	644967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12509	NC_017154	GC	3	6	645014	645019	0 %	0 %	50 %	50 %	384121118
12510	NC_017154	TGG	2	6	645030	645035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121118
12511	NC_017154	CCGG	2	8	645054	645061	0 %	0 %	50 %	50 %	384121118
12512	NC_017154	TCG	2	6	645068	645073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121118
12513	NC_017154	GCC	2	6	645102	645107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121118
12514	NC_017154	CAG	2	6	645215	645220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121118
12515	NC_017154	CAG	2	6	645232	645237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121118
12516	NC_017154	GCG	2	6	645279	645284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121118
12517	NC_017154	TGGC	2	8	645398	645405	0 %	25 %	50 %	25 %	384121118
12518	NC_017154	GGT	2	6	645499	645504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121118
12519	NC_017154	CAC	2	6	645571	645576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121118
12520	NC_017154	CCGTT	2	10	645694	645703	0 %	40 %	20 %	40 %	384121118
12521	NC_017154	CGC	2	6	645793	645798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121118
12522	NC_017154	GCC	2	6	645804	645809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121118
12523	NC_017154	G	7	7	645844	645850	0 %	0 %	100 %	0 %	384121118
12524	NC_017154	CAG	2	6	645982	645987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121118
12525	NC_017154	CAA	2	6	645992	645997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121118
12526	NC_017154	CGG	3	9	646104	646112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121118
12527	NC_017154	CG	3	6	646127	646132	0 %	0 %	50 %	50 %	384121118
12528	NC_017154	CAG	2	6	646144	646149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121118
12529	NC_017154	CAC	2	6	646336	646341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121118
12530	NC_017154	TCG	2	6	646387	646392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121118
12531	NC_017154	TCTG	2	8	646393	646400	0 %	50 %	25 %	25 %	384121118
12532	NC_017154	CTT	2	6	646410	646415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121118
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12534	NC_017154	TGC	2	6	646587	646592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121118
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12538	NC_017154	ATCAA	2	10	646914	646923	60 %	20 %	0 %	20 %	384121118
12539	NC_017154	CT	3	6	646940	646945	0 %	50 %	0 %	50 %	384121118
12540	NC_017154	GTC	2	6	646961	646966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121118
12541	NC_017154	TGC	2	6	647028	647033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121118
12542	NC_017154	ATTG	2	8	647164	647171	25 %	50 %	25 %	0 %	384121118
12543	NC_017154	ACGC	2	8	647243	647250	25 %	0 %	25 %	50 %	384121118
12544	NC_017154	CT	3	6	647322	647327	0 %	50 %	0 %	50 %	384121118
12545	NC_017154	CGG	2	6	647371	647376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121118
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12548	NC_017154	TCAT	2	8	647481	647488	25 %	50 %	0 %	25 %	384121118
12549	NC_017154	CAGG	2	8	647489	647496	25 %	0 %	50 %	25 %	384121118
12550	NC_017154	CG	3	6	647497	647502	0 %	0 %	50 %	50 %	384121118
12551	NC_017154	CGGG	2	8	647572	647579	0 %	0 %	75 %	25 %	384121118
12552	NC_017154	ATA	2	6	647640	647645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121118
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12554	NC_017154	CTAT	2	8	647706	647713	25 %	50 %	0 %	25 %	384121118
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12557	NC_017154	CAC	2	6	648040	648045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121118
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12559	NC_017154	CGC	2	6	648136	648141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121118
12560	NC_017154	ACTT	2	8	648171	648178	25 %	50 %	0 %	25 %	384121118
12561	NC_017154	CAAT	2	8	648184	648191	50 %	25 %	0 %	25 %	384121118
12562	NC_017154	GGC	2	6	648199	648204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121118
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12565	NC_017154	CAT	2	6	648474	648479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121118
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12567	NC_017154	CGG	2	6	648610	648615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121118
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12586	NC_017154	GATC	2	8	649987	649994	25 %	25 %	25 %	25 %	384121118
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12589	NC_017154	ACC	2	6	650054	650059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121118
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12594	NC_017154	C	6	6	650401	650406	0 %	0 %	0 %	100 %	384121118
12595	NC_017154	CT	3	6	650410	650415	0 %	50 %	0 %	50 %	384121118
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12602	NC_017154	AGC	2	6	650715	650720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121118
12603	NC_017154	GCC	2	6	650726	650731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121118
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12608	NC_017154	GCTT	2	8	651039	651046	0 %	50 %	25 %	25 %	384121118
12609	NC_017154	TGACC	2	10	651091	651100	20 %	20 %	20 %	40 %	384121118
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12611	NC_017154	CAG	2	6	651178	651183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121118
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12619	NC_017154	CTGT	2	8	651560	651567	0 %	50 %	25 %	25 %	384121118
12620	NC_017154	ATG	2	6	651615	651620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121118
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12622	NC_017154	GCG	2	6	651731	651736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121118
12623	NC_017154	AGC	2	6	651780	651785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121118
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12625	NC_017154	GCT	2	6	651811	651816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121118
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12869	NC_017154	ATC	2	6	663986	663991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121124
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12871	NC_017154	TAC	3	9	664061	664069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121124
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12873	NC_017154	TGATC	2	10	664111	664120	20 %	40 %	20 %	20 %	384121124
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12988	NC_017154	CGG	2	6	669850	669855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121127
12989	NC_017154	CAT	2	6	669868	669873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121127
12990	NC_017154	GAT	2	6	669907	669912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121127
12991	NC_017154	TC	3	6	669925	669930	0 %	50 %	0 %	50 %	384121127
12992	NC_017154	ATC	2	6	670070	670075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121127
12993	NC_017154	GGC	2	6	670082	670087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121127
12994	NC_017154	GGC	2	6	670117	670122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121127
12995	NC_017154	CTG	2	6	670175	670180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121127
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12999	NC_017154	TGC	2	6	670395	670400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121127
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