MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 91405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_017154	AGC	2	6	617560	617565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121098
12002	NC_017154	ATA	2	6	617567	617572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121098
12003	NC_017154	GTG	2	6	617588	617593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121098
12004	NC_017154	CAT	2	6	617716	617721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121098
12005	NC_017154	TGG	2	6	617769	617774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12006	NC_017154	TGC	2	6	617808	617813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12007	NC_017154	GGT	2	6	617820	617825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12008	NC_017154	GTCA	2	8	617881	617888	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12009	NC_017154	CGA	2	6	617964	617969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12010	NC_017154	CTTT	2	8	617977	617984	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12011	NC_017154	T	8	8	617982	617989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12012	NC_017154	TCTT	2	8	617996	618003	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12013	NC_017154	CTC	2	6	618036	618041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12014	NC_017154	GGC	2	6	618125	618130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12015	NC_017154	GC	3	6	618168	618173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12016	NC_017154	AAAGC	2	10	618179	618188	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12017	NC_017154	CAA	2	6	618211	618216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12018	NC_017154	AAT	2	6	618277	618282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12019	NC_017154	CGT	2	6	618514	618519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121099
12020	NC_017154	GCC	2	6	618573	618578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121099
12021	NC_017154	CCGT	2	8	618792	618799	0 %	25 %	25 %	50 %	384121099
12022	NC_017154	ATT	2	6	618864	618869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121099
12023	NC_017154	GC	3	6	618889	618894	0 %	0 %	50 %	50 %	384121099
12024	NC_017154	GCA	2	6	618903	618908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121099
12025	NC_017154	GAC	2	6	618937	618942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121099
12026	NC_017154	TGA	2	6	618948	618953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121099
12027	NC_017154	CCA	2	6	618960	618965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121099
12028	NC_017154	AGC	2	6	619044	619049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121099
12029	NC_017154	GCC	2	6	619153	619158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121099
12030	NC_017154	TGG	2	6	619193	619198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121099
12031	NC_017154	CTGG	2	8	619249	619256	0 %	25 %	50 %	25 %	384121099
12032	NC_017154	AGA	2	6	619272	619277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121099
12033	NC_017154	ATC	2	6	619325	619330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121099
12034	NC_017154	CAG	2	6	619345	619350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121099
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12036	NC_017154	TGG	2	6	619397	619402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121099
12037	NC_017154	TGG	2	6	619606	619611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121099
12038	NC_017154	TTG	2	6	619682	619687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121099
12039	NC_017154	GAT	2	6	619758	619763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121099
12040	NC_017154	GCA	2	6	619848	619853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121099
12041	NC_017154	TCAA	2	8	619898	619905	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12042	NC_017154	TAA	2	6	619909	619914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12043	NC_017154	TTTA	2	8	619954	619961	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12044	NC_017154	TGA	2	6	620031	620036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12045	NC_017154	CGT	2	6	620089	620094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121100
12046	NC_017154	GC	3	6	620154	620159	0 %	0 %	50 %	50 %	384121100
12047	NC_017154	TGAA	2	8	620186	620193	50 %	25 %	25 %	0 %	384121100
12048	NC_017154	GTG	2	6	620218	620223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121100
12049	NC_017154	TA	3	6	620276	620281	50 %	50 %	0 %	0 %	384121100
12050	NC_017154	TGA	2	6	620379	620384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121100
12051	NC_017154	CTGGCG	2	12	620389	620400	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384121100
12052	NC_017154	GCC	2	6	620484	620489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121100
12053	NC_017154	TAT	2	6	620519	620524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121100
12054	NC_017154	GCA	2	6	620551	620556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121100
12055	NC_017154	ATTG	2	8	620586	620593	25 %	50 %	25 %	0 %	384121100
12056	NC_017154	TGC	2	6	620624	620629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121100
12057	NC_017154	CTGA	2	8	620674	620681	25 %	25 %	25 %	25 %	384121100
12058	NC_017154	ATA	2	6	620684	620689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121100
12059	NC_017154	GGC	2	6	620745	620750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121100
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12061	NC_017154	GATG	2	8	620994	621001	25 %	25 %	50 %	0 %	384121100
12062	NC_017154	A	6	6	621026	621031	100 %	0 %	0 %	0 %	384121100
12063	NC_017154	GTT	2	6	621078	621083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121100
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12065	NC_017154	GCA	2	6	621253	621258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121100
12066	NC_017154	GTG	2	6	621275	621280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121100
12067	NC_017154	CTGG	2	8	621321	621328	0 %	25 %	50 %	25 %	384121100
12068	NC_017154	GCG	2	6	621502	621507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121100
12069	NC_017154	GAT	2	6	621697	621702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121101
12070	NC_017154	ATTC	2	8	621761	621768	25 %	50 %	0 %	25 %	384121101
12071	NC_017154	AGTTC	2	10	621822	621831	20 %	40 %	20 %	20 %	384121101
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12073	NC_017154	GGTT	2	8	621925	621932	0 %	50 %	50 %	0 %	384121101
12074	NC_017154	CCAT	2	8	622021	622028	25 %	25 %	0 %	50 %	384121101
12075	NC_017154	GCT	2	6	622032	622037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121101
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12078	NC_017154	CGG	2	6	622405	622410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121101
12079	NC_017154	TGA	2	6	622461	622466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121101
12080	NC_017154	TGA	2	6	622477	622482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121101
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12082	NC_017154	TAA	2	6	622576	622581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121101
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12084	NC_017154	CAC	2	6	622594	622599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121101
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12087	NC_017154	ATG	2	6	622719	622724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121101
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12090	NC_017154	A	6	6	623024	623029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12091	NC_017154	T	6	6	623063	623068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12092	NC_017154	TTA	2	6	623124	623129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12093	NC_017154	T	6	6	623220	623225	0 %	100 %	0 %	0 %	384121102
12094	NC_017154	TTC	2	6	623241	623246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121102
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12100	NC_017154	TGG	2	6	623404	623409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121102
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12106	NC_017154	TTGAGA	2	12	623686	623697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121102
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12108	NC_017154	TCC	2	6	623726	623731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12109	NC_017154	TTAC	2	8	623826	623833	25 %	50 %	0 %	25 %	384121103
12110	NC_017154	CA	3	6	624108	624113	50 %	0 %	0 %	50 %	384121103
12111	NC_017154	TTG	2	6	624305	624310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121103
12112	NC_017154	A	7	7	624428	624434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12113	NC_017154	ACTG	2	8	624450	624457	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12114	NC_017154	GACT	2	8	624488	624495	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12115	NC_017154	ACA	2	6	624562	624567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121104
12116	NC_017154	ACCA	2	8	624632	624639	50 %	0 %	0 %	50 %	384121104
12117	NC_017154	TGC	2	6	624673	624678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121104
12118	NC_017154	AG	3	6	624699	624704	50 %	0 %	50 %	0 %	384121104
12119	NC_017154	CAC	2	6	624724	624729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121104
12120	NC_017154	CCG	2	6	624803	624808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121104
12121	NC_017154	GTGATG	2	12	624823	624834	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384121104
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12123	NC_017154	TTCA	2	8	624891	624898	25 %	50 %	0 %	25 %	384121104
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12232	NC_017154	CCG	2	6	631096	631101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12233	NC_017154	AG	3	6	631140	631145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12234	NC_017154	ATG	2	6	631154	631159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12240	NC_017154	T	6	6	631316	631321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12241	NC_017154	TAT	2	6	631336	631341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12242	NC_017154	T	6	6	631363	631368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12243	NC_017154	T	6	6	631383	631388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12244	NC_017154	ATAA	2	8	631392	631399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12245	NC_017154	TGTT	2	8	631406	631413	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12246	NC_017154	TTAT	2	8	631427	631434	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12247	NC_017154	AAT	2	6	631460	631465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12249	NC_017154	TAG	2	6	631518	631523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12373	NC_017154	TCA	2	6	637895	637900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121112
12374	NC_017154	GA	3	6	637910	637915	50 %	0 %	50 %	0 %	384121112
12375	NC_017154	GGC	3	9	638085	638093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121112
12376	NC_017154	TCT	2	6	638161	638166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121112
12377	NC_017154	TTG	2	6	638191	638196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121112
12378	NC_017154	GTG	2	6	638214	638219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121112
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12380	NC_017154	CGC	2	6	638306	638311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121112
12381	NC_017154	CAGA	2	8	638321	638328	50 %	0 %	25 %	25 %	384121112
12382	NC_017154	ATG	2	6	638407	638412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121112
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12386	NC_017154	ATC	2	6	638565	638570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121112
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12389	NC_017154	TGC	2	6	638971	638976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121112
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12394	NC_017154	CTTG	2	8	639308	639315	0 %	50 %	25 %	25 %	384121112
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12417	NC_017154	TG	3	6	640506	640511	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12418	NC_017154	A	7	7	640533	640539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12419	NC_017154	TTACA	2	10	640573	640582	40 %	40 %	0 %	20 %	384121114
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12440	NC_017154	TTAT	2	8	641869	641876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12441	NC_017154	ACA	2	6	641899	641904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121116
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12462	NC_017154	TAATT	2	10	642889	642898	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12463	NC_017154	T	7	7	642897	642903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12465	NC_017154	AT	3	6	642909	642914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12466	NC_017154	TAA	2	6	642988	642993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12467	NC_017154	TAT	3	9	643002	643010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12469	NC_017154	CAT	2	6	643126	643131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12471	NC_017154	TTA	2	6	643142	643147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12472	NC_017154	ATT	2	6	643156	643161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12473	NC_017154	CGTAA	2	10	643190	643199	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12474	NC_017154	TTATGT	2	12	643203	643214	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12475	NC_017154	CTC	2	6	643239	643244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12489	NC_017154	GCA	2	6	643960	643965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121117
12490	NC_017154	G	7	7	643980	643986	0 %	0 %	100 %	0 %	384121117
12491	NC_017154	GTT	2	6	643991	643996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121117
12492	NC_017154	T	6	6	644026	644031	0 %	100 %	0 %	0 %	384121117
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12494	NC_017154	AAT	2	6	644079	644084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121117
12495	NC_017154	GTT	2	6	644231	644236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121117
12496	NC_017154	GCCA	2	8	644247	644254	25 %	0 %	25 %	50 %	384121117
12497	NC_017154	ACC	2	6	644259	644264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121117
12498	NC_017154	TCG	2	6	644289	644294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121117
12499	NC_017154	GCC	2	6	644332	644337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121117
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