MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 91405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017154	ATCA	2	8	564546	564553	50 %	25 %	0 %	25 %	384121053
11002	NC_017154	GCT	2	6	564621	564626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121053
11003	NC_017154	ATCAC	2	10	564628	564637	40 %	20 %	0 %	40 %	384121053
11004	NC_017154	TGG	2	6	564658	564663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121053
11005	NC_017154	AATG	2	8	564665	564672	50 %	25 %	25 %	0 %	384121053
11006	NC_017154	TGA	2	6	564721	564726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121053
11007	NC_017154	GCG	2	6	564810	564815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121053
11008	NC_017154	TAA	2	6	564831	564836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121053
11009	NC_017154	T	6	6	564930	564935	0 %	100 %	0 %	0 %	384121053
11010	NC_017154	GTT	3	9	564995	565003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121053
11011	NC_017154	AAG	2	6	565024	565029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121053
11012	NC_017154	AGCC	2	8	565075	565082	25 %	0 %	25 %	50 %	384121053
11013	NC_017154	TGC	2	6	565087	565092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121053
11014	NC_017154	CAG	2	6	565101	565106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121053
11015	NC_017154	GGC	2	6	565118	565123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121053
11016	NC_017154	CAGC	2	8	565142	565149	25 %	0 %	25 %	50 %	384121053
11017	NC_017154	TTG	3	9	565206	565214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121053
11018	NC_017154	TCA	2	6	565257	565262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11019	NC_017154	TTTC	2	8	565266	565273	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11020	NC_017154	A	7	7	565379	565385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_017154	CCAG	2	8	565408	565415	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11022	NC_017154	CTG	2	6	565425	565430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_017154	T	6	6	565433	565438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_017154	GTT	2	6	565469	565474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_017154	GC	3	6	565479	565484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11026	NC_017154	TCA	2	6	565549	565554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11027	NC_017154	GCTG	2	8	565616	565623	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11028	NC_017154	GTT	2	6	565679	565684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_017154	GCAC	2	8	565689	565696	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11030	NC_017154	ACTG	2	8	565708	565715	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11031	NC_017154	GTT	2	6	565750	565755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_017154	CTT	2	6	565812	565817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11033	NC_017154	ATTATG	2	12	565850	565861	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_017154	TAA	2	6	565863	565868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_017154	CGT	2	6	565920	565925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121054
11036	NC_017154	CTTT	2	8	565945	565952	0 %	75 %	0 %	25 %	384121054
11037	NC_017154	GTG	2	6	565953	565958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121054
11038	NC_017154	TTTC	2	8	565962	565969	0 %	75 %	0 %	25 %	384121054
11039	NC_017154	AATT	2	8	566137	566144	50 %	50 %	0 %	0 %	384121054
11040	NC_017154	GTG	2	6	566310	566315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121054
11041	NC_017154	TGCG	2	8	566332	566339	0 %	25 %	50 %	25 %	384121054
11042	NC_017154	GCC	2	6	566424	566429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121054
11043	NC_017154	TTA	2	6	566440	566445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121054
11044	NC_017154	TGG	2	6	566452	566457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121054
11045	NC_017154	GTG	2	6	566511	566516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121054
11046	NC_017154	GTTT	2	8	566527	566534	0 %	75 %	25 %	0 %	384121054
11047	NC_017154	CTG	2	6	566553	566558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121054
11048	NC_017154	CAT	2	6	566600	566605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121054
11049	NC_017154	CCG	3	9	566674	566682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121054
11050	NC_017154	TGT	2	6	566701	566706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121054
11051	NC_017154	TGA	2	6	566818	566823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121054
11052	NC_017154	ACG	2	6	566835	566840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121054
11053	NC_017154	CCA	2	6	566866	566871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11054	NC_017154	TCTG	2	8	566937	566944	0 %	50 %	25 %	25 %	384121055
11055	NC_017154	TTTGA	2	10	566962	566971	20 %	60 %	20 %	0 %	384121055
11056	NC_017154	GTG	2	6	566983	566988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121055
11057	NC_017154	TGC	2	6	567019	567024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121055
11058	NC_017154	GAA	2	6	567115	567120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121055
11059	NC_017154	CTT	2	6	567129	567134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121055
11060	NC_017154	CTGA	2	8	567136	567143	25 %	25 %	25 %	25 %	384121055
11061	NC_017154	TCA	2	6	567161	567166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121055
11062	NC_017154	ATG	2	6	567167	567172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121055
11063	NC_017154	G	6	6	567180	567185	0 %	0 %	100 %	0 %	384121055
11064	NC_017154	CGT	2	6	567205	567210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121055
11065	NC_017154	CTG	3	9	567258	567266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121055
11066	NC_017154	TGAG	2	8	567387	567394	25 %	25 %	50 %	0 %	384121055
11067	NC_017154	CCG	2	6	567465	567470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121055
11068	NC_017154	TGA	2	6	567509	567514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121055
11069	NC_017154	TTC	2	6	567526	567531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121055
11070	NC_017154	TGT	2	6	567584	567589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121055
11071	NC_017154	GCGCT	2	10	567600	567609	0 %	20 %	40 %	40 %	384121055
11072	NC_017154	CAT	2	6	567670	567675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121055
11073	NC_017154	CTC	2	6	567683	567688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384121056
11074	NC_017154	GAT	2	6	567716	567721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121056
11075	NC_017154	TCA	2	6	567754	567759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121056
11076	NC_017154	T	6	6	567777	567782	0 %	100 %	0 %	0 %	384121056
11077	NC_017154	CTG	2	6	567807	567812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121056
11078	NC_017154	CAGC	2	8	567882	567889	25 %	0 %	25 %	50 %	384121056
11079	NC_017154	ACCTT	2	10	568000	568009	20 %	40 %	0 %	40 %	384121056
11080	NC_017154	GA	3	6	568043	568048	50 %	0 %	50 %	0 %	384121056
11081	NC_017154	ACA	2	6	568148	568153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121056
11082	NC_017154	CG	3	6	568157	568162	0 %	0 %	50 %	50 %	384121056
11083	NC_017154	CAC	2	6	568166	568171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121056
11084	NC_017154	AAG	2	6	568174	568179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121056
11085	NC_017154	GTC	2	6	568331	568336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121056
11086	NC_017154	CGAAC	2	10	568349	568358	40 %	0 %	20 %	40 %	384121056
11087	NC_017154	GCTCCT	2	12	568364	568375	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384121056
11088	NC_017154	GA	4	8	568384	568391	50 %	0 %	50 %	0 %	384121056
11089	NC_017154	GAAT	2	8	568394	568401	50 %	25 %	25 %	0 %	384121056
11090	NC_017154	GCGA	2	8	568449	568456	25 %	0 %	50 %	25 %	384121056
11091	NC_017154	CAG	2	6	568541	568546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121056
11092	NC_017154	GGC	2	6	568564	568569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121056
11093	NC_017154	CGTT	2	8	568773	568780	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11094	NC_017154	TCG	2	6	568816	568821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11095	NC_017154	GGGC	2	8	568860	568867	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11096	NC_017154	TGC	2	6	568927	568932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11097	NC_017154	ATC	2	6	569007	569012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11098	NC_017154	GA	3	6	569024	569029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_017154	GCG	2	6	569093	569098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11100	NC_017154	TTG	2	6	569136	569141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_017154	CAA	2	6	569161	569166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_017154	TTAC	2	8	569175	569182	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11103	NC_017154	TAC	2	6	569208	569213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11104	NC_017154	AT	3	6	569225	569230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_017154	CTG	2	6	569257	569262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11106	NC_017154	TGT	2	6	569296	569301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121057
11107	NC_017154	TGC	2	6	569329	569334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121057
11108	NC_017154	GGC	2	6	569375	569380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121057
11109	NC_017154	TGC	2	6	569431	569436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121057
11110	NC_017154	CGCTT	2	10	569502	569511	0 %	40 %	20 %	40 %	384121057
11111	NC_017154	TAA	2	6	569523	569528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121057
11112	NC_017154	TTA	2	6	569533	569538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121057
11113	NC_017154	A	6	6	569552	569557	100 %	0 %	0 %	0 %	384121057
11114	NC_017154	GAG	2	6	569629	569634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384121057
11115	NC_017154	CAT	2	6	569726	569731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121057
11116	NC_017154	A	6	6	569734	569739	100 %	0 %	0 %	0 %	384121057
11117	NC_017154	TGC	2	6	569829	569834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121057
11118	NC_017154	AACCA	2	10	569847	569856	60 %	0 %	0 %	40 %	384121057
11119	NC_017154	TGG	2	6	569879	569884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121057
11120	NC_017154	GTGG	2	8	569897	569904	0 %	25 %	75 %	0 %	384121058
11121	NC_017154	CGG	2	6	569944	569949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121058
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11123	NC_017154	GGCTG	2	10	569963	569972	0 %	20 %	60 %	20 %	384121058
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11125	NC_017154	C	6	6	569987	569992	0 %	0 %	0 %	100 %	384121058
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11151	NC_017154	TTCA	2	8	571596	571603	25 %	50 %	0 %	25 %	384121059
11152	NC_017154	TGG	2	6	571727	571732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121059
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11155	NC_017154	GAT	2	6	571913	571918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121059
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11227	NC_017154	TAT	2	6	575494	575499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11228	NC_017154	TGT	2	6	575541	575546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11229	NC_017154	TA	3	6	575553	575558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11230	NC_017154	T	6	6	575575	575580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11231	NC_017154	T	6	6	575590	575595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11232	NC_017154	ACA	2	6	575610	575615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11233	NC_017154	TTA	2	6	575705	575710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11234	NC_017154	AAT	2	6	575773	575778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11235	NC_017154	GAA	2	6	575830	575835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11236	NC_017154	TTA	2	6	575866	575871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11237	NC_017154	A	6	6	575947	575952	100 %	0 %	0 %	0 %	384121061
11238	NC_017154	AAG	2	6	575973	575978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121061
11239	NC_017154	ATGCAA	2	12	576016	576027	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384121061
11240	NC_017154	CTG	2	6	576068	576073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121061
11241	NC_017154	ATG	2	6	576110	576115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121061
11242	NC_017154	GGC	2	6	576294	576299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121061
11243	NC_017154	TCA	2	6	576347	576352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121061
11244	NC_017154	ATCTT	2	10	576354	576363	20 %	60 %	0 %	20 %	384121061
11245	NC_017154	ACA	2	6	576368	576373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121061
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11247	NC_017154	A	6	6	576568	576573	100 %	0 %	0 %	0 %	384121061
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11496	NC_017154	CG	3	6	590758	590763	0 %	0 %	50 %	50 %	384121072
11497	NC_017154	G	6	6	590771	590776	0 %	0 %	100 %	0 %	384121072
11498	NC_017154	TC	3	6	590792	590797	0 %	50 %	0 %	50 %	384121073
11499	NC_017154	CTTA	2	8	590814	590821	25 %	50 %	0 %	25 %	384121073
11500	NC_017154	AT	3	6	590829	590834	50 %	50 %	0 %	0 %	384121073

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