MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 91405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017154	G	6	6	509464	509469	0 %	0 %	100 %	0 %	384121012
10002	NC_017154	TGG	2	6	509473	509478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121012
10003	NC_017154	CCAA	2	8	509540	509547	50 %	0 %	0 %	50 %	384121012
10004	NC_017154	GTT	2	6	509551	509556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121012
10005	NC_017154	CAT	2	6	509626	509631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121012
10006	NC_017154	CGATG	2	10	509653	509662	20 %	20 %	40 %	20 %	384121012
10007	NC_017154	A	6	6	509812	509817	100 %	0 %	0 %	0 %	384121012
10008	NC_017154	GCC	2	6	509909	509914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121012
10009	NC_017154	CGGT	2	8	509922	509929	0 %	25 %	50 %	25 %	384121012
10010	NC_017154	AC	3	6	509931	509936	50 %	0 %	0 %	50 %	384121012
10011	NC_017154	TGA	2	6	509946	509951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121012
10012	NC_017154	TGT	2	6	510004	510009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121012
10013	NC_017154	CGCA	2	8	510107	510114	25 %	0 %	25 %	50 %	384121012
10014	NC_017154	GAT	2	6	510188	510193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121012
10015	NC_017154	TCG	2	6	510214	510219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121012
10016	NC_017154	AAG	2	6	510228	510233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121012
10017	NC_017154	GT	3	6	510294	510299	0 %	50 %	50 %	0 %	384121012
10018	NC_017154	AG	3	6	510361	510366	50 %	0 %	50 %	0 %	384121012
10019	NC_017154	CTG	2	6	510396	510401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121012
10020	NC_017154	GCA	2	6	510464	510469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121012
10021	NC_017154	GGC	2	6	510641	510646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121012
10022	NC_017154	TGC	2	6	510683	510688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121012
10023	NC_017154	CAT	2	6	510730	510735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121012
10024	NC_017154	AGTC	2	8	510798	510805	25 %	25 %	25 %	25 %	384121012
10025	NC_017154	GGT	2	6	510869	510874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121012
10026	NC_017154	ATT	2	6	510923	510928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121012
10027	NC_017154	CAG	2	6	510977	510982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121012
10028	NC_017154	CAGC	2	8	511007	511014	25 %	0 %	25 %	50 %	384121012
10029	NC_017154	CTT	2	6	511089	511094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121012
10030	NC_017154	CG	3	6	511109	511114	0 %	0 %	50 %	50 %	384121012
10031	NC_017154	ATG	2	6	511179	511184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121012
10032	NC_017154	TGA	2	6	511210	511215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121012
10033	NC_017154	CGG	2	6	511267	511272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121012
10034	NC_017154	CAA	2	6	511373	511378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121012
10035	NC_017154	TGA	2	6	511416	511421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121012
10036	NC_017154	AAC	2	6	511442	511447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121012
10037	NC_017154	GGC	2	6	511477	511482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121012
10038	NC_017154	GCTG	2	8	511561	511568	0 %	25 %	50 %	25 %	384121012
10039	NC_017154	GAA	2	6	511583	511588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121012
10040	NC_017154	ATT	2	6	511589	511594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121012
10041	NC_017154	TAC	2	6	511601	511606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121012
10042	NC_017154	AAG	2	6	511614	511619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121012
10043	NC_017154	TAA	2	6	511633	511638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121012
10044	NC_017154	TAT	2	6	511779	511784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121012
10045	NC_017154	CCGT	2	8	511785	511792	0 %	25 %	25 %	50 %	384121012
10046	NC_017154	GGT	2	6	511810	511815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121012
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10049	NC_017154	CGG	2	6	511872	511877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121012
10050	NC_017154	TACGA	2	10	512060	512069	40 %	20 %	20 %	20 %	384121012
10051	NC_017154	GGT	2	6	512078	512083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121012
10052	NC_017154	ATGC	2	8	512144	512151	25 %	25 %	25 %	25 %	384121012
10053	NC_017154	GT	3	6	512253	512258	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_017154	G	6	6	512387	512392	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_017154	GC	3	6	512499	512504	0 %	0 %	50 %	50 %	384121013
10056	NC_017154	GGATCA	2	12	512508	512519	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384121013
10057	NC_017154	CCA	2	6	512530	512535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121013
10058	NC_017154	GAT	2	6	512554	512559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121013
10059	NC_017154	GAA	2	6	512626	512631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121013
10060	NC_017154	TGAG	2	8	512688	512695	25 %	25 %	50 %	0 %	384121013
10061	NC_017154	TAT	2	6	512712	512717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121013
10062	NC_017154	ACTT	2	8	512727	512734	25 %	50 %	0 %	25 %	384121013
10063	NC_017154	CAG	2	6	512746	512751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121013
10064	NC_017154	CGT	2	6	512896	512901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121013
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10067	NC_017154	A	7	7	512947	512953	100 %	0 %	0 %	0 %	384121013
10068	NC_017154	CGA	2	6	512994	512999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121013
10069	NC_017154	ATA	2	6	513053	513058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121013
10070	NC_017154	TGT	2	6	513110	513115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_017154	AGCG	2	8	513168	513175	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10072	NC_017154	CGA	2	6	513260	513265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10073	NC_017154	TC	3	6	513303	513308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10074	NC_017154	TAA	2	6	513358	513363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121014
10075	NC_017154	CAT	2	6	513378	513383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121014
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10077	NC_017154	GTG	2	6	513534	513539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121014
10078	NC_017154	GCTG	2	8	513718	513725	0 %	25 %	50 %	25 %	384121014
10079	NC_017154	GTT	2	6	513754	513759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121014
10080	NC_017154	CGG	3	9	513773	513781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121014
10081	NC_017154	ATTA	2	8	513866	513873	50 %	50 %	0 %	0 %	384121014
10082	NC_017154	TTA	2	6	513915	513920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121014
10083	NC_017154	GGC	2	6	513962	513967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121014
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10086	NC_017154	TGA	2	6	514281	514286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121015
10087	NC_017154	GCT	2	6	514360	514365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121015
10088	NC_017154	GGT	2	6	514444	514449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121015
10089	NC_017154	CTT	2	6	514504	514509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121015
10090	NC_017154	TCG	2	6	514524	514529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121015
10091	NC_017154	T	8	8	514598	514605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_017154	CTAGG	2	10	514621	514630	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10093	NC_017154	TAA	2	6	514739	514744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121016
10094	NC_017154	GCA	2	6	514771	514776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121016
10095	NC_017154	TAAA	2	8	514853	514860	75 %	25 %	0 %	0 %	384121016
10096	NC_017154	TCA	2	6	514928	514933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121016
10097	NC_017154	AGCC	2	8	514936	514943	25 %	0 %	25 %	50 %	384121016
10098	NC_017154	TGA	2	6	514950	514955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121016
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10100	NC_017154	GAA	2	6	514981	514986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121016
10101	NC_017154	GAA	2	6	515011	515016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121016
10102	NC_017154	ATG	2	6	515168	515173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121016
10103	NC_017154	CA	3	6	515189	515194	50 %	0 %	0 %	50 %	384121016
10104	NC_017154	CGC	2	6	515218	515223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121016
10105	NC_017154	AT	5	10	515229	515238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_017154	TAA	2	6	515274	515279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_017154	CAA	2	6	515412	515417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121017
10108	NC_017154	TG	3	6	515609	515614	0 %	50 %	50 %	0 %	384121017
10109	NC_017154	GTAA	2	8	515889	515896	50 %	25 %	25 %	0 %	384121017
10110	NC_017154	GGA	2	6	515991	515996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_017154	TATT	2	8	515997	516004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_017154	AAAT	2	8	516011	516018	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_017154	TTA	2	6	516019	516024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_017154	ATT	3	9	516042	516050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_017154	A	8	8	516150	516157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_017154	TAA	2	6	516165	516170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_017154	TCT	2	6	516203	516208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10118	NC_017154	ACG	2	6	516296	516301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10119	NC_017154	AGG	2	6	516304	516309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_017154	TAT	2	6	516350	516355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_017154	CTG	2	6	516407	516412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10122	NC_017154	GA	3	6	516439	516444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_017154	TAA	2	6	516445	516450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_017154	TA	3	6	516473	516478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_017154	TTG	2	6	516483	516488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_017154	A	6	6	516505	516510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_017154	TGA	2	6	516586	516591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10129	NC_017154	AAATA	2	10	516674	516683	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_017154	TGGA	2	8	516699	516706	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_017154	T	6	6	516741	516746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_017154	ATA	2	6	516757	516762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10197	NC_017154	GGCT	2	8	520369	520376	0 %	25 %	50 %	25 %	384121022
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10214	NC_017154	GAGC	2	8	521368	521375	25 %	0 %	50 %	25 %	384121023
10215	NC_017154	ATG	2	6	521478	521483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121023
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10219	NC_017154	TTG	2	6	521540	521545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121023
10220	NC_017154	AACAC	2	10	521592	521601	60 %	0 %	0 %	40 %	384121023
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10223	NC_017154	GTG	2	6	521638	521643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121023
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10225	NC_017154	GT	3	6	521757	521762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10226	NC_017154	ACC	2	6	521835	521840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121024
10227	NC_017154	TGT	2	6	521876	521881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121024
10228	NC_017154	TACT	2	8	521884	521891	25 %	50 %	0 %	25 %	384121024
10229	NC_017154	CCAG	2	8	521910	521917	25 %	0 %	25 %	50 %	384121024
10230	NC_017154	CAA	2	6	521950	521955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121024
10231	NC_017154	AACT	2	8	521976	521983	50 %	25 %	0 %	25 %	384121024
10232	NC_017154	GTT	2	6	521993	521998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121024
10233	NC_017154	TAA	2	6	522013	522018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121024
10234	NC_017154	CGA	2	6	522026	522031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121024
10235	NC_017154	TACC	2	8	522068	522075	25 %	25 %	0 %	50 %	384121024
10236	NC_017154	GA	3	6	522077	522082	50 %	0 %	50 %	0 %	384121024
10237	NC_017154	CAG	2	6	522119	522124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121024
10238	NC_017154	AT	3	6	522130	522135	50 %	50 %	0 %	0 %	384121024
10239	NC_017154	CAT	3	9	522410	522418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121024
10240	NC_017154	AT	3	6	522417	522422	50 %	50 %	0 %	0 %	384121024
10241	NC_017154	GTG	2	6	522526	522531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121024
10242	NC_017154	TA	4	8	522535	522542	50 %	50 %	0 %	0 %	384121024
10243	NC_017154	ATC	2	6	522546	522551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121024
10244	NC_017154	ACC	2	6	522640	522645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121024
10245	NC_017154	GTGG	2	8	522747	522754	0 %	25 %	75 %	0 %	384121024
10246	NC_017154	GGCT	2	8	522833	522840	0 %	25 %	50 %	25 %	384121024
10247	NC_017154	GCC	2	6	522874	522879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121024
10248	NC_017154	GTA	2	6	522921	522926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121024
10249	NC_017154	GCA	2	6	522973	522978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121024
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10251	NC_017154	AGT	2	6	523178	523183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121024
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10254	NC_017154	TTC	2	6	523539	523544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121024
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10259	NC_017154	TCG	2	6	523777	523782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121024
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10261	NC_017154	TA	3	6	524060	524065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10262	NC_017154	CAG	2	6	524088	524093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10263	NC_017154	T	7	7	524105	524111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10264	NC_017154	G	6	6	524139	524144	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10265	NC_017154	CAT	2	6	524145	524150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10266	NC_017154	TCA	2	6	524179	524184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10267	NC_017154	GAG	2	6	524290	524295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10268	NC_017154	GTT	2	6	524356	524361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121025
10269	NC_017154	TTG	2	6	524381	524386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121025
10270	NC_017154	CGC	2	6	524419	524424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121025
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10272	NC_017154	T	7	7	524459	524465	0 %	100 %	0 %	0 %	384121025
10273	NC_017154	GCCA	2	8	524539	524546	25 %	0 %	25 %	50 %	384121025
10274	NC_017154	GAAA	2	8	524613	524620	75 %	0 %	25 %	0 %	384121025
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10277	NC_017154	TGG	2	6	524844	524849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121025
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10281	NC_017154	AGC	2	6	525170	525175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10283	NC_017154	TA	3	6	525206	525211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10284	NC_017154	ACT	2	6	525247	525252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10285	NC_017154	TGC	2	6	525385	525390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10289	NC_017154	ATCA	2	8	525754	525761	50 %	25 %	0 %	25 %	384121026
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10295	NC_017154	TA	3	6	526073	526078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10296	NC_017154	TGT	2	6	526138	526143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10303	NC_017154	ATTC	2	8	526379	526386	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10312	NC_017154	TAATG	2	10	526778	526787	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10313	NC_017154	CTT	2	6	526802	526807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10347	NC_017154	A	7	7	528161	528167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10367	NC_017154	A	6	6	529023	529028	100 %	0 %	0 %	0 %	384121028
10368	NC_017154	A	6	6	529091	529096	100 %	0 %	0 %	0 %	384121028
10369	NC_017154	ATG	2	6	529174	529179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121028
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10371	NC_017154	GAT	2	6	529257	529262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121028
10372	NC_017154	TTG	2	6	529283	529288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121028
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10374	NC_017154	CTG	2	6	529533	529538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121029
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10384	NC_017154	GAT	3	9	529889	529897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121029
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10491	NC_017154	CGG	2	6	536693	536698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121035
10492	NC_017154	GC	3	6	536771	536776	0 %	0 %	50 %	50 %	384121035
10493	NC_017154	GCC	2	6	536963	536968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121035
10494	NC_017154	GAGG	2	8	536991	536998	25 %	0 %	75 %	0 %	384121035
10495	NC_017154	GGAG	2	8	537006	537013	25 %	0 %	75 %	0 %	384121035
10496	NC_017154	ATG	2	6	537025	537030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121035
10497	NC_017154	TGA	2	6	537099	537104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121035
10498	NC_017154	CGC	2	6	537114	537119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121035
10499	NC_017154	GCAAC	2	10	537222	537231	40 %	0 %	20 %	40 %	384121035
10500	NC_017154	CGGG	2	8	537268	537275	0 %	0 %	75 %	25 %	384121035

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