MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 91405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017154	AGG	2	6	308056	308061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_017154	CTG	2	6	308081	308086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_017154	TC	3	6	308209	308214	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6004	NC_017154	GCC	2	6	308322	308327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6005	NC_017154	GCC	2	6	308420	308425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120863
6006	NC_017154	CAG	2	6	308462	308467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120863
6007	NC_017154	TGC	2	6	308587	308592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120863
6008	NC_017154	TG	3	6	308632	308637	0 %	50 %	50 %	0 %	384120863
6009	NC_017154	GCG	2	6	308639	308644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120863
6010	NC_017154	GGT	2	6	308645	308650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120863
6011	NC_017154	GGC	2	6	308698	308703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120863
6012	NC_017154	GT	3	6	308824	308829	0 %	50 %	50 %	0 %	384120863
6013	NC_017154	CAG	2	6	309086	309091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120863
6014	NC_017154	CA	3	6	309144	309149	50 %	0 %	0 %	50 %	384120863
6015	NC_017154	TGG	2	6	309172	309177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120863
6016	NC_017154	TGG	2	6	309198	309203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120863
6017	NC_017154	GGC	2	6	309320	309325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120863
6018	NC_017154	GA	3	6	309402	309407	50 %	0 %	50 %	0 %	384120863
6019	NC_017154	CCA	2	6	309472	309477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120863
6020	NC_017154	GTG	2	6	309495	309500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120863
6021	NC_017154	CAG	2	6	309515	309520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120863
6022	NC_017154	CCGC	2	8	309591	309598	0 %	0 %	25 %	75 %	384120863
6023	NC_017154	GGT	2	6	309617	309622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120863
6024	NC_017154	CGGT	2	8	309651	309658	0 %	25 %	50 %	25 %	384120863
6025	NC_017154	GCCA	2	8	309693	309700	25 %	0 %	25 %	50 %	384120863
6026	NC_017154	CGGTCA	2	12	309742	309753	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384120863
6027	NC_017154	ATC	2	6	309758	309763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120863
6028	NC_017154	GCC	2	6	309779	309784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120863
6029	NC_017154	CAG	2	6	309800	309805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120863
6030	NC_017154	TGA	2	6	309820	309825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120863
6031	NC_017154	CGAG	2	8	309850	309857	25 %	0 %	50 %	25 %	384120863
6032	NC_017154	GC	3	6	309862	309867	0 %	0 %	50 %	50 %	384120863
6033	NC_017154	GCG	2	6	309921	309926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120863
6034	NC_017154	GCA	2	6	309933	309938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120863
6035	NC_017154	AGTG	2	8	309962	309969	25 %	25 %	50 %	0 %	384120863
6036	NC_017154	C	6	6	310019	310024	0 %	0 %	0 %	100 %	384120863
6037	NC_017154	TGT	2	6	310096	310101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120863
6038	NC_017154	GCG	2	6	310194	310199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120863
6039	NC_017154	CAT	2	6	310249	310254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120863
6040	NC_017154	GCC	2	6	310385	310390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120863
6041	NC_017154	GCC	2	6	310400	310405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120863
6042	NC_017154	CTG	2	6	310457	310462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120863
6043	NC_017154	GC	3	6	310471	310476	0 %	0 %	50 %	50 %	384120863
6044	NC_017154	GATCA	2	10	310484	310493	40 %	20 %	20 %	20 %	384120863
6045	NC_017154	CAT	2	6	310525	310530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120863
6046	NC_017154	TTATAG	3	18	310554	310571	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384120863
6047	NC_017154	ATT	2	6	310601	310606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120863
6048	NC_017154	CGG	2	6	310705	310710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120863
6049	NC_017154	GA	3	6	310739	310744	50 %	0 %	50 %	0 %	384120863
6050	NC_017154	GTG	2	6	310788	310793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120863
6051	NC_017154	AG	3	6	310803	310808	50 %	0 %	50 %	0 %	384120863
6052	NC_017154	CCG	2	6	310843	310848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120863
6053	NC_017154	A	6	6	310890	310895	100 %	0 %	0 %	0 %	384120863
6054	NC_017154	TTG	2	6	310902	310907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120863
6055	NC_017154	CTG	2	6	310923	310928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120863
6056	NC_017154	ATT	2	6	310937	310942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120863
6057	NC_017154	TGA	2	6	310948	310953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120863
6058	NC_017154	TAG	2	6	310957	310962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120863
6059	NC_017154	CAT	2	6	311086	311091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120863
6060	NC_017154	AATAT	2	10	311199	311208	60 %	40 %	0 %	0 %	384120863
6061	NC_017154	GCT	2	6	311228	311233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120863
6062	NC_017154	ATT	2	6	311267	311272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120863
6063	NC_017154	GCT	2	6	311325	311330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120863
6064	NC_017154	TTGAA	2	10	311440	311449	40 %	40 %	20 %	0 %	384120863
6065	NC_017154	CCA	2	6	311466	311471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120863
6066	NC_017154	GCA	2	6	311475	311480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120863
6067	NC_017154	ATT	2	6	311561	311566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120863
6068	NC_017154	TGCC	2	8	311629	311636	0 %	25 %	25 %	50 %	384120863
6069	NC_017154	GCT	2	6	311672	311677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120863
6070	NC_017154	AG	3	6	311690	311695	50 %	0 %	50 %	0 %	384120863
6071	NC_017154	TTA	2	6	311797	311802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120863
6072	NC_017154	CGC	2	6	312038	312043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120863
6073	NC_017154	CAA	2	6	312079	312084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384120863
6074	NC_017154	TCA	2	6	312106	312111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120863
6075	NC_017154	CT	3	6	312182	312187	0 %	50 %	0 %	50 %	384120863
6076	NC_017154	GGA	2	6	312296	312301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_017154	TC	3	6	312306	312311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6078	NC_017154	GAG	2	6	312345	312350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_017154	GTT	2	6	312368	312373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_017154	ATT	2	6	312390	312395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_017154	AGG	2	6	312421	312426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_017154	ATAA	2	8	312427	312434	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_017154	T	7	7	312479	312485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_017154	G	8	8	312505	312512	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_017154	TTAA	2	8	312578	312585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_017154	TAA	2	6	312612	312617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_017154	ATG	2	6	312629	312634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_017154	ATA	2	6	312704	312709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_017154	TACT	2	8	312719	312726	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6090	NC_017154	TTC	2	6	312734	312739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_017154	GCC	2	6	312863	312868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6092	NC_017154	TAT	2	6	312880	312885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_017154	TGT	2	6	312911	312916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_017154	AGC	2	6	313155	313160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120864
6095	NC_017154	TTA	2	6	313200	313205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120864
6096	NC_017154	GGA	2	6	313324	313329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384120864
6097	NC_017154	TGG	2	6	313356	313361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120864
6098	NC_017154	GTG	2	6	313398	313403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120864
6099	NC_017154	GGC	2	6	313434	313439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120864
6100	NC_017154	T	7	7	313506	313512	0 %	100 %	0 %	0 %	384120864
6101	NC_017154	CGC	2	6	313521	313526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120864
6102	NC_017154	GCA	2	6	313576	313581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_017154	AGCT	2	8	313684	313691	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6104	NC_017154	CGT	2	6	313697	313702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_017154	CTG	4	12	313799	313810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120865
6106	NC_017154	TGCG	2	8	313899	313906	0 %	25 %	50 %	25 %	384120865
6107	NC_017154	GT	3	6	313912	313917	0 %	50 %	50 %	0 %	384120865
6108	NC_017154	AG	3	6	314005	314010	50 %	0 %	50 %	0 %	384120865
6109	NC_017154	CT	3	6	314039	314044	0 %	50 %	0 %	50 %	384120865
6110	NC_017154	TTTGG	2	10	314045	314054	0 %	60 %	40 %	0 %	384120865
6111	NC_017154	GGT	2	6	314152	314157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120865
6112	NC_017154	GCA	2	6	314165	314170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120865
6113	NC_017154	TGGT	2	8	314173	314180	0 %	50 %	50 %	0 %	384120865
6114	NC_017154	GCC	2	6	314198	314203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120865
6115	NC_017154	CTG	2	6	314227	314232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120865
6116	NC_017154	CTG	2	6	314254	314259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120865
6117	NC_017154	TGC	2	6	314373	314378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120865
6118	NC_017154	TTA	3	9	314390	314398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120865
6119	NC_017154	TGG	2	6	314400	314405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120865
6120	NC_017154	TGGC	2	8	314410	314417	0 %	25 %	50 %	25 %	384120865
6121	NC_017154	TCA	2	6	314476	314481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120865
6122	NC_017154	AGCGTG	2	12	314499	314510	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384120865
6123	NC_017154	AAT	2	6	314537	314542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120865
6124	NC_017154	GGTT	2	8	314550	314557	0 %	50 %	50 %	0 %	384120865
6125	NC_017154	A	6	6	314676	314681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6231	NC_017154	GGC	2	6	320942	320947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6232	NC_017154	T	7	7	320961	320967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6235	NC_017154	CTG	2	6	321089	321094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6240	NC_017154	ATA	2	6	321226	321231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6242	NC_017154	TTG	2	6	321256	321261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6243	NC_017154	TCTT	2	8	321272	321279	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6244	NC_017154	T	6	6	321335	321340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6245	NC_017154	AT	3	6	321385	321390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6246	NC_017154	CTG	2	6	321465	321470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6248	NC_017154	ATC	2	6	321560	321565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6251	NC_017154	TGC	2	6	321653	321658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120871
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