MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pPCP1

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014027	AACG	2	8	4	11	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014027	GCC	2	6	215	220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294509194
3	NC_014027	CGC	2	6	229	234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294509194
4	NC_014027	CTG	2	6	238	243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294509194
5	NC_014027	TCGC	2	8	328	335	0 %	25 %	25 %	50 %	294509194
6	NC_014027	CATT	2	8	382	389	25 %	50 %	0 %	25 %	294509194
7	NC_014027	TC	4	8	393	400	0 %	50 %	0 %	50 %	294509194
8	NC_014027	CAGGAG	2	12	408	419	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	294509194
9	NC_014027	GTTCG	2	10	426	435	0 %	40 %	40 %	20 %	294509194
10	NC_014027	GAC	2	6	448	453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294509194
11	NC_014027	CTT	2	6	605	610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294509194
12	NC_014027	TGG	2	6	611	616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294509194
13	NC_014027	CG	3	6	622	627	0 %	0 %	50 %	50 %	294509194
14	NC_014027	TC	3	6	736	741	0 %	50 %	0 %	50 %	294509194
15	NC_014027	AAGGT	2	10	775	784	40 %	20 %	40 %	0 %	294509194
16	NC_014027	GCTG	2	8	895	902	0 %	25 %	50 %	25 %	294509194
17	NC_014027	AGC	2	6	970	975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294509194
18	NC_014027	A	6	6	1002	1007	100 %	0 %	0 %	0 %	294509194
19	NC_014027	TGA	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294509194
20	NC_014027	CAT	2	6	1062	1067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294509194
21	NC_014027	TGA	2	6	1107	1112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294509194
22	NC_014027	AGCGC	2	10	1175	1184	20 %	0 %	40 %	40 %	294509195
23	NC_014027	GAA	2	6	1253	1258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294509195
24	NC_014027	TCA	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294509195
25	NC_014027	CGG	2	6	1314	1319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294509195
26	NC_014027	CTCA	2	8	1390	1397	25 %	25 %	0 %	50 %	294509195
27	NC_014027	CAG	3	9	1518	1526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294509195
28	NC_014027	ACG	2	6	1574	1579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294509195
29	NC_014027	C	6	6	1599	1604	0 %	0 %	0 %	100 %	294509195
30	NC_014027	TCA	2	6	1611	1616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294509195
31	NC_014027	TGA	2	6	1618	1623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294509195
32	NC_014027	TCAG	2	8	1641	1648	25 %	25 %	25 %	25 %	294509195
33	NC_014027	GAA	2	6	1649	1654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294509195
34	NC_014027	TTC	2	6	1664	1669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294509195
35	NC_014027	GCA	2	6	1760	1765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294509195
36	NC_014027	TCAAA	2	10	1813	1822	60 %	20 %	0 %	20 %	294509195
37	NC_014027	CAGA	2	8	1840	1847	50 %	0 %	25 %	25 %	294509195
38	NC_014027	TGG	2	6	1913	1918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014027	CGT	2	6	1944	1949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014027	TGA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014027	T	6	6	2015	2020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014027	CAG	2	6	2096	2101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014027	ACA	2	6	2116	2121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014027	A	6	6	2132	2137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014027	AC	3	6	2211	2216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014027	GAT	2	6	2241	2246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014027	T	6	6	2373	2378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014027	GTT	2	6	2381	2386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014027	T	6	6	2385	2390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014027	GTC	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014027	GACGG	2	10	2503	2512	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014027	A	6	6	2526	2531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014027	TGT	2	6	2536	2541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014027	TCAG	2	8	2544	2551	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014027	ACAG	2	8	2559	2566	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014027	T	7	7	2652	2658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014027	T	6	6	2705	2710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014027	TAC	2	6	2721	2726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014027	A	7	7	2746	2752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014027	AAT	2	6	2799	2804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014027	AACA	2	8	2928	2935	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014027	ACA	3	9	2933	2941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014027	CGA	2	6	3017	3022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014027	GGC	2	6	3026	3031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014027	TG	3	6	3034	3039	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014027	GAA	2	6	3060	3065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014027	GCG	2	6	3408	3413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014027	CTCA	2	8	3425	3432	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014027	CA	3	6	3453	3458	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014027	A	6	6	3492	3497	100 %	0 %	0 %	0 %	294509196
71	NC_014027	C	6	6	3548	3553	0 %	0 %	0 %	100 %	294509196
72	NC_014027	C	6	6	3629	3634	0 %	0 %	0 %	100 %	294509196
73	NC_014027	TG	3	6	3782	3787	0 %	50 %	50 %	0 %	294509196
74	NC_014027	C	6	6	3794	3799	0 %	0 %	0 %	100 %	294509196
75	NC_014027	GCA	2	6	3878	3883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014027	TTGAAG	2	12	3925	3936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014027	T	6	6	4061	4066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014027	GCA	2	6	4076	4081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014027	A	7	7	4094	4100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014027	AAG	2	6	4108	4113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014027	CAG	2	6	4155	4160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014027	ATG	2	6	4167	4172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014027	TGC	2	6	4188	4193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014027	TGTA	2	8	4218	4225	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014027	T	8	8	4264	4271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014027	ATT	2	6	4309	4314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014027	ATTT	2	8	4322	4329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014027	ATC	2	6	4393	4398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014027	A	7	7	4413	4419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014027	A	6	6	4550	4555	100 %	0 %	0 %	0 %	294509197
91	NC_014027	GAT	2	6	4588	4593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294509197
92	NC_014027	AG	3	6	4617	4622	50 %	0 %	50 %	0 %	294509197
93	NC_014027	CTGT	2	8	4632	4639	0 %	50 %	25 %	25 %	294509197
94	NC_014027	TC	3	6	4650	4655	0 %	50 %	0 %	50 %	294509197
95	NC_014027	TAA	2	6	4656	4661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294509197
96	NC_014027	A	7	7	4699	4705	100 %	0 %	0 %	0 %	294509197
97	NC_014027	TAG	2	6	4725	4730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294509197
98	NC_014027	GAAA	2	8	4732	4739	75 %	0 %	25 %	0 %	294509197
99	NC_014027	TAT	2	6	4769	4774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294509197
100	NC_014027	ATT	2	6	4794	4799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014027	CAA	2	6	4889	4894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294509198
102	NC_014027	TAT	2	6	4895	4900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294509198
103	NC_014027	CCT	2	6	5171	5176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294509198
104	NC_014027	ATA	2	6	5190	5195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294509198
105	NC_014027	CTA	2	6	5314	5319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294509198
106	NC_014027	CAA	2	6	5387	5392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294509198
107	NC_014027	ACG	2	6	5403	5408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294509198
108	NC_014027	TTA	2	6	5482	5487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294509198
109	NC_014027	TCTT	2	8	5506	5513	0 %	75 %	0 %	25 %	294509198
110	NC_014027	ACC	2	6	5853	5858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294509198
111	NC_014027	A	7	7	5910	5916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014027	A	8	8	5926	5933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014027	TAA	2	6	5967	5972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014027	CGC	2	6	5978	5983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_014027	AAT	2	6	5999	6004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014027	GGAAG	2	10	6049	6058	40 %	0 %	60 %	0 %	294509199
117	NC_014027	GCA	2	6	6063	6068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294509199
118	NC_014027	A	7	7	6094	6100	100 %	0 %	0 %	0 %	294509199
119	NC_014027	CAAAA	2	10	6121	6130	80 %	0 %	0 %	20 %	294509199
120	NC_014027	CTG	2	6	6167	6172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294509199
121	NC_014027	GAA	2	6	6197	6202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294509199
122	NC_014027	AC	3	6	6237	6242	50 %	0 %	0 %	50 %	294509199
123	NC_014027	A	7	7	6364	6370	100 %	0 %	0 %	0 %	294509199
124	NC_014027	GAC	2	6	6546	6551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014027	ATT	2	6	6568	6573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014027	ATT	2	6	6589	6594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014027	ATA	2	6	6623	6628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014027	AG	3	6	6644	6649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014027	GAA	2	6	6666	6671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294509200
130	NC_014027	GCA	2	6	6721	6726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294509200
131	NC_014027	AT	3	6	6746	6751	50 %	50 %	0 %	0 %	294509200
132	NC_014027	GAA	2	6	6833	6838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294509200
133	NC_014027	AT	3	6	6890	6895	50 %	50 %	0 %	0 %	294509200
134	NC_014027	ATGA	2	8	6985	6992	50 %	25 %	25 %	0 %	294509200
135	NC_014027	AATC	2	8	6994	7001	50 %	25 %	0 %	25 %	294509200
136	NC_014027	CTCAT	2	10	7017	7026	20 %	40 %	0 %	40 %	294509200
137	NC_014027	CAG	2	6	7115	7120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294509200
138	NC_014027	GGT	2	6	7156	7161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294509200
139	NC_014027	TAA	2	6	7173	7178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294509200
140	NC_014027	AT	3	6	7248	7253	50 %	50 %	0 %	0 %	294509200
141	NC_014027	ATT	2	6	7299	7304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294509200
142	NC_014027	ATG	2	6	7337	7342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294509200
143	NC_014027	GA	3	6	7353	7358	50 %	0 %	50 %	0 %	294509200
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.