MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pMT1

Total Repeats: 1777

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014022	TCA	2	6	27835	27840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502016
502	NC_014022	TCA	2	6	27907	27912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502016
503	NC_014022	TCA	2	6	27925	27930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502016
504	NC_014022	TCG	2	6	27994	27999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502016
505	NC_014022	CGA	2	6	28035	28040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502016
506	NC_014022	CTT	2	6	28125	28130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502016
507	NC_014022	CCGA	2	8	28158	28165	25 %	0 %	25 %	50 %	294502016
508	NC_014022	TCG	2	6	28180	28185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502016
509	NC_014022	CGCA	2	8	28227	28234	25 %	0 %	25 %	50 %	294502016
510	NC_014022	ACG	2	6	28332	28337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502016
511	NC_014022	TCC	2	6	28351	28356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502016
512	NC_014022	GT	3	6	28367	28372	0 %	50 %	50 %	0 %	294502016
513	NC_014022	CTTCG	2	10	28389	28398	0 %	40 %	20 %	40 %	294502016
514	NC_014022	AAC	2	6	28499	28504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_014022	TA	3	6	28583	28588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_014022	TAA	2	6	28591	28596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_014022	TA	4	8	28610	28617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_014022	GGT	2	6	28712	28717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_014022	GGC	2	6	28736	28741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_014022	CCA	2	6	28754	28759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_014022	GCA	2	6	28820	28825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_014022	AGC	2	6	28831	28836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_014022	TGA	2	6	28886	28891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_014022	TTTG	2	8	28898	28905	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
525	NC_014022	CAG	2	6	28983	28988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502017
526	NC_014022	AGC	2	6	29080	29085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502017
527	NC_014022	CCA	2	6	29105	29110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502017
528	NC_014022	TCG	2	6	29132	29137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502017
529	NC_014022	ACG	3	9	29208	29216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502017
530	NC_014022	ACTC	2	8	29222	29229	25 %	25 %	0 %	50 %	294502017
531	NC_014022	CGGAA	2	10	29273	29282	40 %	0 %	40 %	20 %	294502017
532	NC_014022	CGGA	2	8	29331	29338	25 %	0 %	50 %	25 %	294502017
533	NC_014022	CGA	2	6	29385	29390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502017
534	NC_014022	GAT	2	6	29400	29405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502017
535	NC_014022	GACGCC	2	12	29451	29462	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	294502017
536	NC_014022	AACGG	2	10	29481	29490	40 %	0 %	40 %	20 %	294502017
537	NC_014022	GTT	3	9	29505	29513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502017
538	NC_014022	GGT	2	6	29544	29549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502017
539	NC_014022	TGG	2	6	29552	29557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502017
540	NC_014022	CAG	3	9	29595	29603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502017
541	NC_014022	ACG	2	6	29623	29628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502017
542	NC_014022	CCA	2	6	29630	29635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502017
543	NC_014022	GTC	2	6	29640	29645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502017
544	NC_014022	ATA	2	6	29658	29663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502017
545	NC_014022	TGA	3	9	29801	29809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502017
546	NC_014022	TGTC	2	8	29810	29817	0 %	50 %	25 %	25 %	294502017
547	NC_014022	TGA	2	6	29848	29853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_014022	CGT	2	6	29932	29937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_014022	ATC	2	6	29943	29948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_014022	CTT	2	6	29995	30000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_014022	CAG	2	6	30002	30007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_014022	GTT	3	9	30023	30031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_014022	TTC	2	6	30139	30144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502018
554	NC_014022	GTC	2	6	30157	30162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502018
555	NC_014022	CCA	2	6	30164	30169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502018
556	NC_014022	GCGG	2	8	30189	30196	0 %	0 %	75 %	25 %	294502018
557	NC_014022	TCG	2	6	30256	30261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502018
558	NC_014022	CAG	2	6	30384	30389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502018
559	NC_014022	TGG	2	6	30404	30409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502018
560	NC_014022	TTG	2	6	30442	30447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502018
561	NC_014022	GCA	2	6	30512	30517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502018
562	NC_014022	CAGC	2	8	30712	30719	25 %	0 %	25 %	50 %	294502019
563	NC_014022	AGA	2	6	30725	30730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502019
564	NC_014022	TCC	2	6	30783	30788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502019
565	NC_014022	GCAA	2	8	30795	30802	50 %	0 %	25 %	25 %	294502019
566	NC_014022	CAG	2	6	30826	30831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502019
567	NC_014022	CTT	2	6	30868	30873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502019
568	NC_014022	CTT	2	6	30907	30912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502019
569	NC_014022	TGC	2	6	30976	30981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502019
570	NC_014022	CTG	2	6	31055	31060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502019
571	NC_014022	CGT	2	6	31072	31077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502019
572	NC_014022	CTT	3	9	31123	31131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502019
573	NC_014022	GTC	2	6	31139	31144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502019
574	NC_014022	CCAG	2	8	31173	31180	25 %	0 %	25 %	50 %	294502019
575	NC_014022	GCC	2	6	31185	31190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502019
576	NC_014022	CGA	2	6	31194	31199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502019
577	NC_014022	ATG	2	6	31212	31217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502019
578	NC_014022	CGT	2	6	31219	31224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502019
579	NC_014022	GGC	2	6	31268	31273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502019
580	NC_014022	CTG	2	6	31289	31294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502019
581	NC_014022	T	6	6	31304	31309	0 %	100 %	0 %	0 %	294502019
582	NC_014022	GTA	2	6	31390	31395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502020
583	NC_014022	TGA	2	6	31464	31469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502020
584	NC_014022	CTCG	2	8	31548	31555	0 %	25 %	25 %	50 %	294502020
585	NC_014022	GCC	2	6	31652	31657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502020
586	NC_014022	TCG	2	6	31661	31666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502020
587	NC_014022	TTC	2	6	31714	31719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502020
588	NC_014022	CGA	2	6	31770	31775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502020
589	NC_014022	CCA	2	6	31791	31796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502020
590	NC_014022	A	6	6	31927	31932	100 %	0 %	0 %	0 %	294502020
591	NC_014022	TA	3	6	32074	32079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_014022	TACT	3	12	32082	32093	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
593	NC_014022	ATA	2	6	32094	32099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_014022	TGA	2	6	32188	32193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502021
595	NC_014022	GAT	3	9	32473	32481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502021
596	NC_014022	GCT	2	6	32531	32536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502021
597	NC_014022	AATC	2	8	32610	32617	50 %	25 %	0 %	25 %	294502021
598	NC_014022	CG	3	6	32624	32629	0 %	0 %	50 %	50 %	294502021
599	NC_014022	GCC	2	6	32749	32754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502021
600	NC_014022	A	6	6	32774	32779	100 %	0 %	0 %	0 %	294502021
601	NC_014022	ACC	2	6	32784	32789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502021
602	NC_014022	CTG	2	6	32834	32839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502021
603	NC_014022	ATC	2	6	32860	32865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502021
604	NC_014022	ATG	2	6	33296	33301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502021
605	NC_014022	CAG	2	6	33370	33375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502021
606	NC_014022	GGC	2	6	33379	33384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502021
607	NC_014022	GGTGGC	2	12	33464	33475	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	294502021
608	NC_014022	TTA	2	6	33549	33554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502021
609	NC_014022	AATA	2	8	33575	33582	75 %	25 %	0 %	0 %	294502021
610	NC_014022	ACG	2	6	33623	33628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502021
611	NC_014022	AG	3	6	33689	33694	50 %	0 %	50 %	0 %	294502021
612	NC_014022	TCA	2	6	33818	33823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_014022	GGC	2	6	33864	33869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_014022	AGA	2	6	33942	33947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_014022	TGG	2	6	34180	34185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502022
616	NC_014022	CATC	2	8	34225	34232	25 %	25 %	0 %	50 %	294502022
617	NC_014022	GA	3	6	34243	34248	50 %	0 %	50 %	0 %	294502022
618	NC_014022	TTG	2	6	34309	34314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502022
619	NC_014022	CG	3	6	34514	34519	0 %	0 %	50 %	50 %	294502023
620	NC_014022	TC	3	6	34561	34566	0 %	50 %	0 %	50 %	294502023
621	NC_014022	GTC	2	6	34629	34634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502023
622	NC_014022	CAA	2	6	34638	34643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502023
623	NC_014022	TGCCC	2	10	34654	34663	0 %	20 %	20 %	60 %	294502023
624	NC_014022	G	7	7	34887	34893	0 %	0 %	100 %	0 %	294502023
625	NC_014022	GTC	2	6	34951	34956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502023
626	NC_014022	TAA	2	6	35004	35009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_014022	TTA	2	6	35024	35029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_014022	AT	3	6	35085	35090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_014022	ATTT	2	8	35114	35121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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631	NC_014022	T	8	8	35182	35189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_014022	A	6	6	35200	35205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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659	NC_014022	TG	3	6	36425	36430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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762	NC_014022	ACA	2	6	43367	43372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
763	NC_014022	AGA	2	6	43379	43384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
764	NC_014022	TAAG	2	8	43418	43425	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
765	NC_014022	CGTCA	2	10	43479	43488	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
766	NC_014022	CAG	2	6	43521	43526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
767	NC_014022	GCTTAT	2	12	43587	43598	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
768	NC_014022	TAT	2	6	43657	43662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
769	NC_014022	T	7	7	43672	43678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
770	NC_014022	CGG	2	6	43778	43783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502031
771	NC_014022	G	7	7	43836	43842	0 %	0 %	100 %	0 %	294502031
772	NC_014022	CCTG	2	8	43848	43855	0 %	25 %	25 %	50 %	294502031
773	NC_014022	A	6	6	43887	43892	100 %	0 %	0 %	0 %	294502031
774	NC_014022	AC	3	6	43916	43921	50 %	0 %	0 %	50 %	294502031
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785	NC_014022	CAAG	2	8	44718	44725	50 %	0 %	25 %	25 %	294502031
786	NC_014022	TAT	2	6	44796	44801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
787	NC_014022	TCT	2	6	44855	44860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
788	NC_014022	ACT	2	6	44865	44870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
789	NC_014022	TC	4	8	44881	44888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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791	NC_014022	GCC	3	9	44995	45003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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799	NC_014022	CGT	2	6	45587	45592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502032
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806	NC_014022	AG	3	6	45973	45978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
807	NC_014022	ATA	2	6	45980	45985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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811	NC_014022	GTTT	2	8	46140	46147	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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898	NC_014022	TTG	2	6	50083	50088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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