MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Yersinia pseudotuberculosis PB1/+ plasmid pYPTS01

Total Repeats: 1404

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010635	AAG	2	6	50215	50220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_010635	TGC	2	6	50235	50240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_010635	AGC	2	6	50243	50248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_010635	AAT	2	6	50266	50271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_010635	A	6	6	50299	50304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_010635	CGA	2	6	50377	50382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_010635	CAA	2	6	50506	50511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_010635	CGA	2	6	50740	50745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186897561
1009	NC_010635	CA	3	6	50827	50832	50 %	0 %	0 %	50 %	186897561
1010	NC_010635	ACC	2	6	50873	50878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186897561
1011	NC_010635	TCG	2	6	50886	50891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186897561
1012	NC_010635	GCT	2	6	51115	51120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186897561
1013	NC_010635	TGGC	2	8	51128	51135	0 %	25 %	50 %	25 %	186897561
1014	NC_010635	CAT	2	6	51286	51291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186897561
1015	NC_010635	AGA	2	6	51382	51387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186897561
1016	NC_010635	GGC	2	6	51388	51393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186897561
1017	NC_010635	GAC	2	6	51428	51433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186897561
1018	NC_010635	TTC	2	6	51488	51493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186897561
1019	NC_010635	GAC	2	6	51599	51604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186897561
1020	NC_010635	GTT	2	6	51617	51622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186897561
1021	NC_010635	A	7	7	51646	51652	100 %	0 %	0 %	0 %	186897561
1022	NC_010635	TAT	2	6	51697	51702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186897561
1023	NC_010635	GTT	2	6	51806	51811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_010635	ATT	2	6	51820	51825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_010635	C	7	7	51826	51832	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1026	NC_010635	ATT	2	6	51859	51864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_010635	T	6	6	51881	51886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_010635	CAA	2	6	51992	51997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_010635	CTA	2	6	52025	52030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_010635	TTTTA	2	10	52044	52053	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_010635	TTA	2	6	52073	52078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_010635	TAA	2	6	52088	52093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_010635	TA	3	6	52148	52153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_010635	TAAAA	2	10	52183	52192	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_010635	TTAA	2	8	52200	52207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_010635	TCA	2	6	52218	52223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_010635	ACA	2	6	52232	52237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186897562
1038	NC_010635	TCAA	2	8	52283	52290	50 %	25 %	0 %	25 %	186897562
1039	NC_010635	GCA	2	6	52358	52363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186897562
1040	NC_010635	CTT	2	6	52377	52382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186897562
1041	NC_010635	TGA	2	6	52412	52417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186897562
1042	NC_010635	AAT	2	6	52511	52516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186897562
1043	NC_010635	CT	3	6	52570	52575	0 %	50 %	0 %	50 %	186897562
1044	NC_010635	TGC	2	6	52607	52612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186897562
1045	NC_010635	GTT	2	6	52629	52634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186897562
1046	NC_010635	AGC	2	6	52726	52731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186897562
1047	NC_010635	ATG	2	6	52733	52738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186897562
1048	NC_010635	ACC	2	6	52745	52750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186897562
1049	NC_010635	ATC	2	6	52760	52765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186897562
1050	NC_010635	TAG	2	6	52815	52820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186897562
1051	NC_010635	TTG	2	6	52840	52845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186897562
1052	NC_010635	CAA	3	9	52885	52893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186897562
1053	NC_010635	TCT	2	6	53039	53044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186897562
1054	NC_010635	T	7	7	53046	53052	0 %	100 %	0 %	0 %	186897562
1055	NC_010635	CTGT	2	8	53123	53130	0 %	50 %	25 %	25 %	186897562
1056	NC_010635	TCC	2	6	53155	53160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_010635	TTAAAC	2	12	53161	53172	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	186897563
1058	NC_010635	GCA	2	6	53199	53204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186897563
1059	NC_010635	ATC	2	6	53222	53227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186897563
1060	NC_010635	TTG	2	6	53248	53253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186897563
1061	NC_010635	TTC	2	6	53278	53283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186897563
1062	NC_010635	AAT	2	6	53296	53301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186897563
1063	NC_010635	TTA	2	6	53348	53353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186897563
1064	NC_010635	TGT	2	6	53354	53359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186897563
1065	NC_010635	GCTT	2	8	53366	53373	0 %	50 %	25 %	25 %	186897563
1066	NC_010635	TAT	2	6	53376	53381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186897563
1067	NC_010635	CCG	2	6	53736	53741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186897563
1068	NC_010635	CAT	2	6	53788	53793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186897563
1069	NC_010635	CCA	2	6	53823	53828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186897563
1070	NC_010635	AGCC	2	8	53864	53871	25 %	0 %	25 %	50 %	186897563
1071	NC_010635	CTTG	2	8	53904	53911	0 %	50 %	25 %	25 %	186897563
1072	NC_010635	TCT	2	6	53918	53923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186897563
1073	NC_010635	TTC	2	6	53957	53962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186897563
1074	NC_010635	CTT	2	6	54015	54020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186897563
1075	NC_010635	AAGC	2	8	54069	54076	50 %	0 %	25 %	25 %	186897563
1076	NC_010635	GCCGC	2	10	54125	54134	0 %	0 %	40 %	60 %	186897563
1077	NC_010635	AAT	2	6	54149	54154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186897563
1078	NC_010635	CTT	2	6	54162	54167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186897563
1079	NC_010635	TGT	2	6	54170	54175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186897563
1080	NC_010635	TGGC	2	8	54188	54195	0 %	25 %	50 %	25 %	186897563
1081	NC_010635	GTG	2	6	54207	54212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186897563
1082	NC_010635	TTG	2	6	54274	54279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186897563
1083	NC_010635	G	6	6	54288	54293	0 %	0 %	100 %	0 %	186897563
1084	NC_010635	GAC	2	6	54616	54621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186897564
1085	NC_010635	CA	3	6	54665	54670	50 %	0 %	0 %	50 %	186897564
1086	NC_010635	AG	3	6	54732	54737	50 %	0 %	50 %	0 %	186897564
1087	NC_010635	CCT	2	6	54792	54797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	186897564
1088	NC_010635	AGGA	2	8	54801	54808	50 %	0 %	50 %	0 %	186897564
1089	NC_010635	GTC	2	6	54840	54845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186897564
1090	NC_010635	TTG	2	6	54848	54853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186897564
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1092	NC_010635	GTT	2	6	54984	54989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186897565
1093	NC_010635	T	6	6	54988	54993	0 %	100 %	0 %	0 %	186897565
1094	NC_010635	GGT	2	6	55034	55039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186897565
1095	NC_010635	ATT	2	6	55058	55063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186897565
1096	NC_010635	TAT	2	6	55069	55074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186897565
1097	NC_010635	T	7	7	55114	55120	0 %	100 %	0 %	0 %	186897565
1098	NC_010635	T	9	9	55153	55161	0 %	100 %	0 %	0 %	186897565
1099	NC_010635	TGG	2	6	55180	55185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186897565
1100	NC_010635	CCA	2	6	55305	55310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186897565
1101	NC_010635	TTA	2	6	55323	55328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186897565
1102	NC_010635	CGG	2	6	55363	55368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186897565
1103	NC_010635	TTC	2	6	55382	55387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186897565
1104	NC_010635	ATG	2	6	55412	55417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186897565
1105	NC_010635	CAA	2	6	55429	55434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186897565
1106	NC_010635	ATC	3	9	55448	55456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186897565
1107	NC_010635	CGG	2	6	55465	55470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186897565
1108	NC_010635	GAT	2	6	55527	55532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186897565
1109	NC_010635	GTTG	2	8	55570	55577	0 %	50 %	50 %	0 %	186897565
1110	NC_010635	ATC	2	6	55649	55654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186897565
1111	NC_010635	TTC	2	6	55748	55753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186897565
1112	NC_010635	GAA	2	6	55761	55766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186897565
1113	NC_010635	GTT	2	6	55780	55785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186897565
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1115	NC_010635	AAT	2	6	55854	55859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186897566
1116	NC_010635	CAT	2	6	55869	55874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186897566
1117	NC_010635	TCA	2	6	55942	55947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186897566
1118	NC_010635	CGG	2	6	55979	55984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186897566
1119	NC_010635	CA	3	6	56036	56041	50 %	0 %	0 %	50 %	186897566
1120	NC_010635	AAT	2	6	56050	56055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186897566
1121	NC_010635	TCA	2	6	56116	56121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186897566
1122	NC_010635	CCT	2	6	56145	56150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_010635	TTATTT	2	12	56162	56173	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_010635	GTT	2	6	56192	56197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186897567
1125	NC_010635	TGA	2	6	56224	56229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186897567
1126	NC_010635	ACC	2	6	56251	56256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186897567
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1128	NC_010635	GA	3	6	56318	56323	50 %	0 %	50 %	0 %	186897567
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1382	NC_010635	CT	3	6	68797	68802	0 %	50 %	0 %	50 %	186897582
1383	NC_010635	GAG	2	6	68813	68818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	186897582
1384	NC_010635	TAT	2	6	68929	68934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1385	NC_010635	TTGGTT	2	12	68936	68947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1386	NC_010635	CGCA	2	8	68970	68977	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1387	NC_010635	TAA	2	6	68978	68983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1388	NC_010635	AT	3	6	69006	69011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1389	NC_010635	ATT	2	6	69061	69066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1390	NC_010635	GTT	2	6	69097	69102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1391	NC_010635	TA	3	6	69122	69127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1392	NC_010635	AGC	2	6	69157	69162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1393	NC_010635	CGT	2	6	69205	69210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1394	NC_010635	T	6	6	69279	69284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1395	NC_010635	T	6	6	69291	69296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1396	NC_010635	TTGC	2	8	69475	69482	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1397	NC_010635	TC	3	6	69507	69512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1398	NC_010635	AGA	2	6	69540	69545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1399	NC_010635	GGA	2	6	69564	69569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1400	NC_010635	CAC	2	6	69668	69673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1401	NC_010635	AGCG	2	8	69685	69692	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1402	NC_010635	CTT	2	6	69718	69723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1403	NC_010635	TTG	2	6	69740	69745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1404	NC_010635	AGTC	2	8	69772	69779	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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