MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pseudotuberculosis PB1/+ plasmid pYPTS01

Total Repeats: 1404

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010635	CCTC	2	8	25227	25234	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
502	NC_010635	A	6	6	25239	25244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_010635	A	8	8	25248	25255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_010635	TAA	2	6	25261	25266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_010635	TA	3	6	25269	25274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_010635	CTGTA	2	10	25282	25291	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
507	NC_010635	GAG	2	6	25353	25358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_010635	A	7	7	25370	25376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_010635	CGC	2	6	25520	25525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186897528
510	NC_010635	AAC	2	6	25533	25538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186897528
511	NC_010635	TG	3	6	25628	25633	0 %	50 %	50 %	0 %	186897528
512	NC_010635	GAT	2	6	25634	25639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186897528
513	NC_010635	TCA	2	6	25695	25700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186897528
514	NC_010635	ACGT	2	8	25770	25777	25 %	25 %	25 %	25 %	186897528
515	NC_010635	ATC	2	6	25837	25842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186897529
516	NC_010635	TCT	2	6	25928	25933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186897529
517	NC_010635	GGC	2	6	26100	26105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186897529
518	NC_010635	TC	3	6	26106	26111	0 %	50 %	0 %	50 %	186897529
519	NC_010635	CGA	2	6	26138	26143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186897529
520	NC_010635	TCA	3	9	26150	26158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186897529
521	NC_010635	AAG	2	6	26167	26172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186897529
522	NC_010635	ATG	2	6	26204	26209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186897529
523	NC_010635	AGCC	2	8	26215	26222	25 %	0 %	25 %	50 %	186897529
524	NC_010635	AGT	2	6	26243	26248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186897529
525	NC_010635	CAT	2	6	26305	26310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186897529
526	NC_010635	TCA	2	6	26363	26368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186897529
527	NC_010635	G	6	6	26433	26438	0 %	0 %	100 %	0 %	186897529
528	NC_010635	TGTC	2	8	26496	26503	0 %	50 %	25 %	25 %	186897529
529	NC_010635	CTG	2	6	26530	26535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186897529
530	NC_010635	CGC	2	6	26733	26738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186897529
531	NC_010635	GCG	2	6	26746	26751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186897529
532	NC_010635	GGT	2	6	27041	27046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186897529
533	NC_010635	CTC	2	6	27091	27096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	186897529
534	NC_010635	CTG	2	6	27110	27115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186897529
535	NC_010635	TGT	2	6	27221	27226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186897529
536	NC_010635	CAA	2	6	27304	27309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186897529
537	NC_010635	CAG	2	6	27388	27393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186897529
538	NC_010635	TAA	2	6	27462	27467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186897529
539	NC_010635	CAT	2	6	27480	27485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186897529
540	NC_010635	AGG	2	6	27488	27493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	186897529
541	NC_010635	T	6	6	27496	27501	0 %	100 %	0 %	0 %	186897529
542	NC_010635	AATG	2	8	27525	27532	50 %	25 %	25 %	0 %	186897529
543	NC_010635	AGC	2	6	27632	27637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186897529
544	NC_010635	CAG	2	6	27700	27705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186897529
545	NC_010635	GTG	2	6	27791	27796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186897529
546	NC_010635	TAA	2	6	27894	27899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186897529
547	NC_010635	CGC	2	6	27962	27967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186897529
548	NC_010635	AAC	2	6	28044	28049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186897529
549	NC_010635	CCTG	2	8	28102	28109	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
550	NC_010635	AAC	2	6	28123	28128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_010635	AC	3	6	28162	28167	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_010635	TG	3	6	28183	28188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_010635	T	6	6	28202	28207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_010635	CG	3	6	28273	28278	0 %	0 %	50 %	50 %	186897530
555	NC_010635	AGGG	2	8	28388	28395	25 %	0 %	75 %	0 %	186897530
556	NC_010635	CTG	2	6	28403	28408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186897530
557	NC_010635	GAA	2	6	28421	28426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186897530
558	NC_010635	GAA	2	6	28444	28449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186897530
559	NC_010635	GT	3	6	28515	28520	0 %	50 %	50 %	0 %	186897530
560	NC_010635	TGA	2	6	28534	28539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186897530
561	NC_010635	CAG	2	6	28590	28595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186897530
562	NC_010635	GA	3	6	28642	28647	50 %	0 %	50 %	0 %	186897530
563	NC_010635	GCTAA	2	10	28652	28661	40 %	20 %	20 %	20 %	186897530
564	NC_010635	ACT	2	6	28705	28710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186897530
565	NC_010635	A	7	7	28751	28757	100 %	0 %	0 %	0 %	186897530
566	NC_010635	TCA	2	6	28788	28793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186897530
567	NC_010635	AAT	2	6	28838	28843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186897531
568	NC_010635	AAT	2	6	28901	28906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186897531
569	NC_010635	ATT	3	9	28932	28940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186897531
570	NC_010635	TA	3	6	29046	29051	50 %	50 %	0 %	0 %	186897531
571	NC_010635	CAA	2	6	29055	29060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186897531
572	NC_010635	GAAA	2	8	29117	29124	75 %	0 %	25 %	0 %	186897531
573	NC_010635	CTT	2	6	29216	29221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186897531
574	NC_010635	ATAA	2	8	29296	29303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_010635	AC	3	6	29415	29420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
576	NC_010635	T	6	6	29438	29443	0 %	100 %	0 %	0 %	186897532
577	NC_010635	TAC	2	6	29450	29455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186897532
578	NC_010635	ATTT	2	8	29460	29467	25 %	75 %	0 %	0 %	186897532
579	NC_010635	CAA	2	6	29470	29475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186897532
580	NC_010635	AAC	2	6	29503	29508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186897532
581	NC_010635	TAA	2	6	29568	29573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186897532
582	NC_010635	TGA	2	6	29593	29598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186897532
583	NC_010635	GAG	2	6	29614	29619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	186897532
584	NC_010635	AAT	3	9	29654	29662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186897532
585	NC_010635	TGA	2	6	29683	29688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186897532
586	NC_010635	TAA	2	6	29691	29696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186897532
587	NC_010635	GGA	2	6	29732	29737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	186897532
588	NC_010635	ACAA	2	8	29762	29769	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
589	NC_010635	CTT	2	6	29826	29831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_010635	GAA	2	6	29879	29884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186897533
591	NC_010635	GAA	2	6	29930	29935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186897533
592	NC_010635	GAA	3	9	29980	29988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186897533
593	NC_010635	TGG	2	6	30063	30068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186897533
594	NC_010635	TGC	2	6	30093	30098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186897533
595	NC_010635	A	6	6	30112	30117	100 %	0 %	0 %	0 %	186897533
596	NC_010635	CTG	2	6	30157	30162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_010635	GCG	2	6	30163	30168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_010635	TGA	2	6	30200	30205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186897534
599	NC_010635	CTG	2	6	30322	30327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186897534
600	NC_010635	GA	3	6	30330	30335	50 %	0 %	50 %	0 %	186897534
601	NC_010635	GGCT	2	8	30337	30344	0 %	25 %	50 %	25 %	186897534
602	NC_010635	CGG	2	6	30412	30417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186897534
603	NC_010635	GCAC	2	8	30438	30445	25 %	0 %	25 %	50 %	186897534
604	NC_010635	GGTC	2	8	30573	30580	0 %	25 %	50 %	25 %	186897534
605	NC_010635	GAT	2	6	30595	30600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186897534
606	NC_010635	CAGA	2	8	30658	30665	50 %	0 %	25 %	25 %	186897534
607	NC_010635	GGC	2	6	30860	30865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186897534
608	NC_010635	TTC	2	6	30891	30896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186897534
609	NC_010635	TCA	2	6	30933	30938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186897534
610	NC_010635	GGGA	2	8	30979	30986	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
611	NC_010635	GTT	2	6	31005	31010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_010635	GAT	2	6	31121	31126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186897535
613	NC_010635	GAT	2	6	31134	31139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186897535
614	NC_010635	TCC	2	6	31142	31147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	186897535
615	NC_010635	TCTT	2	8	31148	31155	0 %	75 %	0 %	25 %	186897535
616	NC_010635	AAGA	2	8	31170	31177	75 %	0 %	25 %	0 %	186897535
617	NC_010635	ATC	2	6	31270	31275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186897535
618	NC_010635	TAC	2	6	31417	31422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186897535
619	NC_010635	TTC	2	6	31474	31479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186897535
620	NC_010635	TTC	2	6	31501	31506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186897535
621	NC_010635	T	7	7	31565	31571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_010635	TC	3	6	31575	31580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
623	NC_010635	CTC	2	6	31675	31680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_010635	GGC	2	6	31692	31697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_010635	CCA	2	6	31702	31707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_010635	A	10	10	31747	31756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_010635	CAC	2	6	31823	31828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_010635	CTC	2	6	31861	31866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_010635	GCT	2	6	31939	31944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186897536
630	NC_010635	GGA	2	6	31987	31992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	186897536
631	NC_010635	CAG	2	6	31995	32000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186897536
632	NC_010635	CGAT	2	8	32059	32066	25 %	25 %	25 %	25 %	186897536
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