MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pseudotuberculosis PB1/+ chromosome

Total Repeats: 93196

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010634	TGGC	2	8	231192	231199	0 %	25 %	50 %	25 %	186893551
4502	NC_010634	TGACC	2	10	231205	231214	20 %	20 %	20 %	40 %	186893551
4503	NC_010634	CCCATA	2	12	231285	231296	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	186893551
4504	NC_010634	CCA	2	6	231351	231356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893551
4505	NC_010634	G	6	6	231509	231514	0 %	0 %	100 %	0 %	186893551
4506	NC_010634	GAA	2	6	231587	231592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893551
4507	NC_010634	GCG	2	6	231613	231618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893551
4508	NC_010634	TTTA	2	8	231734	231741	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_010634	CCG	2	6	231806	231811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893552
4510	NC_010634	TAT	2	6	231818	231823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893552
4511	NC_010634	TGG	2	6	231824	231829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893552
4512	NC_010634	TTAT	2	8	231889	231896	25 %	75 %	0 %	0 %	186893552
4513	NC_010634	TGC	2	6	231994	231999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893552
4514	NC_010634	GGT	2	6	232001	232006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893552
4515	NC_010634	GAA	2	6	232158	232163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893552
4516	NC_010634	ATT	2	6	232287	232292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893552
4517	NC_010634	GGCAGC	2	12	232382	232393	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	186893552
4518	NC_010634	TGTGC	2	10	232418	232427	0 %	40 %	40 %	20 %	186893552
4519	NC_010634	CTGA	2	8	232542	232549	25 %	25 %	25 %	25 %	186893552
4520	NC_010634	CAC	2	6	232550	232555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893552
4521	NC_010634	GTT	2	6	232672	232677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893553
4522	NC_010634	T	9	9	232689	232697	0 %	100 %	0 %	0 %	186893553
4523	NC_010634	GTG	2	6	232794	232799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_010634	TAT	2	6	232833	232838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_010634	CAAT	2	8	232890	232897	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4526	NC_010634	CAA	2	6	232906	232911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_010634	ACT	2	6	232935	232940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893554
4528	NC_010634	TCT	2	6	232963	232968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186893554
4529	NC_010634	GC	3	6	232980	232985	0 %	0 %	50 %	50 %	186893554
4530	NC_010634	AC	3	6	233015	233020	50 %	0 %	0 %	50 %	186893554
4531	NC_010634	T	6	6	233078	233083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_010634	ACA	2	6	233255	233260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186893555
4533	NC_010634	GAT	2	6	233293	233298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893555
4534	NC_010634	CCT	2	6	233303	233308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	186893555
4535	NC_010634	GAA	2	6	233335	233340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893555
4536	NC_010634	T	7	7	233424	233430	0 %	100 %	0 %	0 %	186893555
4537	NC_010634	GAAGAT	2	12	233431	233442	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	186893555
4538	NC_010634	CTT	2	6	233460	233465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186893555
4539	NC_010634	TGA	2	6	233481	233486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893555
4540	NC_010634	GCGTGA	2	12	233544	233555	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	186893555
4541	NC_010634	CGTTT	2	10	233564	233573	0 %	60 %	20 %	20 %	186893555
4542	NC_010634	GC	3	6	233583	233588	0 %	0 %	50 %	50 %	186893555
4543	NC_010634	CTG	2	6	233629	233634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893555
4544	NC_010634	CAG	2	6	233728	233733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893555
4545	NC_010634	GCC	2	6	233749	233754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893555
4546	NC_010634	CAG	2	6	233859	233864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893555
4547	NC_010634	TGC	2	6	233909	233914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893555
4548	NC_010634	CA	3	6	233915	233920	50 %	0 %	0 %	50 %	186893555
4549	NC_010634	CAT	2	6	233994	233999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893555
4550	NC_010634	TCT	2	6	234005	234010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186893555
4551	NC_010634	GGT	2	6	234012	234017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893555
4552	NC_010634	GCC	2	6	234033	234038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893555
4553	NC_010634	TGG	2	6	234044	234049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893555
4554	NC_010634	TGA	2	6	234125	234130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893555
4555	NC_010634	A	6	6	234216	234221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_010634	T	7	7	234267	234273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_010634	GGC	2	6	234335	234340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893556
4558	NC_010634	GAA	2	6	234437	234442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893556
4559	NC_010634	GCC	2	6	234471	234476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893556
4560	NC_010634	GAA	2	6	234482	234487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893556
4561	NC_010634	CAG	2	6	234488	234493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893556
4562	NC_010634	AGC	2	6	234525	234530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893556
4563	NC_010634	CGG	2	6	234598	234603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893556
4564	NC_010634	AGC	2	6	234612	234617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893556
4565	NC_010634	CAA	2	6	234671	234676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186893556
4566	NC_010634	ACG	2	6	234791	234796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893556
4567	NC_010634	CAG	2	6	234905	234910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893556
4568	NC_010634	CGG	2	6	234931	234936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893556
4569	NC_010634	GGC	2	6	234997	235002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893556
4570	NC_010634	AGA	2	6	235027	235032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893556
4571	NC_010634	TCA	2	6	235062	235067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893556
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4573	NC_010634	AAATA	2	10	235114	235123	80 %	20 %	0 %	0 %	186893556
4574	NC_010634	A	8	8	235136	235143	100 %	0 %	0 %	0 %	186893556
4575	NC_010634	TGT	2	6	235158	235163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893556
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4579	NC_010634	TCA	2	6	235583	235588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893557
4580	NC_010634	GCG	2	6	235690	235695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893557
4581	NC_010634	TTCTC	2	10	235738	235747	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4582	NC_010634	TTAA	2	8	235801	235808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_010634	TTTAT	2	10	235812	235821	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_010634	TGT	2	6	235832	235837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_010634	ACA	2	6	235865	235870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_010634	TG	3	6	235889	235894	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_010634	AAT	2	6	235924	235929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_010634	GTG	2	6	235936	235941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_010634	TTA	2	6	235980	235985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893558
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4591	NC_010634	ATG	2	6	236035	236040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893558
4592	NC_010634	TAT	2	6	236060	236065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893558
4593	NC_010634	ATT	2	6	236267	236272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893558
4594	NC_010634	CTT	2	6	236278	236283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186893558
4595	NC_010634	TGG	2	6	236298	236303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893558
4596	NC_010634	GAA	2	6	236319	236324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893558
4597	NC_010634	TGGC	2	8	236392	236399	0 %	25 %	50 %	25 %	186893558
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4599	NC_010634	TAT	2	6	236598	236603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893558
4600	NC_010634	GGGT	2	8	236791	236798	0 %	25 %	75 %	0 %	186893558
4601	NC_010634	GT	3	6	236903	236908	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_010634	GCA	2	6	236914	236919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_010634	GCA	2	6	236991	236996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893559
4604	NC_010634	ATC	2	6	237001	237006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893559
4605	NC_010634	GGC	2	6	237052	237057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893559
4606	NC_010634	TGG	2	6	237110	237115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893559
4607	NC_010634	TC	3	6	237128	237133	0 %	50 %	0 %	50 %	186893559
4608	NC_010634	TGA	2	6	237134	237139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893559
4609	NC_010634	ATGG	2	8	237226	237233	25 %	25 %	50 %	0 %	186893559
4610	NC_010634	AGC	2	6	237410	237415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893559
4611	NC_010634	TGA	2	6	237456	237461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893559
4612	NC_010634	AGT	2	6	237520	237525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893559
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4616	NC_010634	CTA	2	6	237861	237866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893559
4617	NC_010634	GC	3	6	237879	237884	0 %	0 %	50 %	50 %	186893559
4618	NC_010634	GTT	2	6	237915	237920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893559
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4621	NC_010634	CT	3	6	238162	238167	0 %	50 %	0 %	50 %	186893559
4622	NC_010634	TGC	2	6	238217	238222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893559
4623	NC_010634	GCT	2	6	238344	238349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893559
4624	NC_010634	ACTG	2	8	238383	238390	25 %	25 %	25 %	25 %	186893559
4625	NC_010634	GCG	2	6	238393	238398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893559
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4627	NC_010634	GTT	2	6	238512	238517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893559
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4630	NC_010634	GAT	2	6	238767	238772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4632	NC_010634	CTT	2	6	238909	238914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186893560
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4997	NC_010634	ATT	3	9	257714	257722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4998	NC_010634	TAT	2	6	257734	257739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4999	NC_010634	GAG	2	6	257773	257778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5000	NC_010634	A	8	8	257800	257807	100 %	0 %	0 %	0 %	186893578

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