MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pseudotuberculosis YPIII chromosome

Total Repeats: 92567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_010465	ATC	2	6	639412	639417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022828
12502	NC_010465	CAA	2	6	639440	639445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170022828
12503	NC_010465	AAGA	2	8	639446	639453	75 %	0 %	25 %	0 %	170022828
12504	NC_010465	GGA	2	6	639460	639465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170022828
12505	NC_010465	GAA	2	6	639474	639479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022828
12506	NC_010465	CCT	2	6	639480	639485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170022829
12507	NC_010465	TTA	2	6	639496	639501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170022829
12508	NC_010465	TGTA	2	8	639507	639514	25 %	50 %	25 %	0 %	170022829
12509	NC_010465	TCG	2	6	639530	639535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022829
12510	NC_010465	T	6	6	639542	639547	0 %	100 %	0 %	0 %	170022829
12511	NC_010465	G	9	9	639643	639651	0 %	0 %	100 %	0 %	170022829
12512	NC_010465	TTG	2	6	639707	639712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_010465	CAG	2	6	639805	639810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12514	NC_010465	GCG	2	6	639873	639878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_010465	CTG	2	6	639908	639913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12516	NC_010465	CGG	2	6	639964	639969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12517	NC_010465	TGG	3	9	639978	639986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022830
12518	NC_010465	GCG	2	6	639993	639998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022830
12519	NC_010465	GCA	2	6	640035	640040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022830
12520	NC_010465	CAA	2	6	640101	640106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170022830
12521	NC_010465	A	6	6	640105	640110	100 %	0 %	0 %	0 %	170022830
12522	NC_010465	GGT	3	9	640203	640211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022831
12523	NC_010465	AAT	2	6	640266	640271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170022831
12524	NC_010465	A	8	8	640319	640326	100 %	0 %	0 %	0 %	170022832
12525	NC_010465	TGA	2	6	640329	640334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022832
12526	NC_010465	AT	3	6	640407	640412	50 %	50 %	0 %	0 %	170022832
12527	NC_010465	TATT	2	8	640440	640447	25 %	75 %	0 %	0 %	170022832
12528	NC_010465	GCTC	2	8	640521	640528	0 %	25 %	25 %	50 %	170022832
12529	NC_010465	GCA	2	6	640534	640539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022832
12530	NC_010465	A	6	6	640664	640669	100 %	0 %	0 %	0 %	170022832
12531	NC_010465	ACG	2	6	640688	640693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022832
12532	NC_010465	CCTG	2	8	640729	640736	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12533	NC_010465	AAC	2	6	640809	640814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170022833
12534	NC_010465	GCG	2	6	641043	641048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022833
12535	NC_010465	TC	3	6	641052	641057	0 %	50 %	0 %	50 %	170022833
12536	NC_010465	C	6	6	641069	641074	0 %	0 %	0 %	100 %	170022833
12537	NC_010465	CT	3	6	641078	641083	0 %	50 %	0 %	50 %	170022833
12538	NC_010465	TCC	2	6	641108	641113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170022833
12539	NC_010465	AACCG	2	10	641130	641139	40 %	0 %	20 %	40 %	170022833
12540	NC_010465	GCG	2	6	641167	641172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022833
12541	NC_010465	TGG	2	6	641179	641184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022833
12542	NC_010465	GCA	2	6	641240	641245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022833
12543	NC_010465	AGC	2	6	641250	641255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022833
12544	NC_010465	AGC	2	6	641383	641388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022833
12545	NC_010465	GCC	2	6	641394	641399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170022833
12546	NC_010465	CCG	2	6	641562	641567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12547	NC_010465	CTGT	2	8	641642	641649	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12548	NC_010465	CAAG	2	8	641664	641671	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12549	NC_010465	C	6	6	641705	641710	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12550	NC_010465	AAT	2	6	641783	641788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_010465	GA	3	6	641835	641840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_010465	CAAA	2	8	641855	641862	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12553	NC_010465	TGT	2	6	641866	641871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_010465	AAGC	2	8	641892	641899	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12555	NC_010465	GCCCA	2	10	642006	642015	20 %	0 %	20 %	60 %	170022834
12556	NC_010465	AC	3	6	642082	642087	50 %	0 %	0 %	50 %	170022834
12557	NC_010465	ACA	2	6	642208	642213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170022834
12558	NC_010465	TGC	2	6	642216	642221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022834
12559	NC_010465	GCT	2	6	642323	642328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022834
12560	NC_010465	TGC	2	6	642390	642395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022834
12561	NC_010465	GCT	2	6	642485	642490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022834
12562	NC_010465	GTA	2	6	642521	642526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022834
12563	NC_010465	CTG	2	6	642555	642560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022834
12564	NC_010465	AG	3	6	642596	642601	50 %	0 %	50 %	0 %	170022834
12565	NC_010465	CCG	2	6	642696	642701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170022834
12566	NC_010465	GCCA	2	8	642703	642710	25 %	0 %	25 %	50 %	170022834
12567	NC_010465	ACG	2	6	642791	642796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022834
12568	NC_010465	TTAC	2	8	642867	642874	25 %	50 %	0 %	25 %	170022834
12569	NC_010465	GAG	2	6	642894	642899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170022834
12570	NC_010465	ATA	2	6	642900	642905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170022834
12571	NC_010465	GAA	2	6	642924	642929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022834
12572	NC_010465	GA	3	6	642958	642963	50 %	0 %	50 %	0 %	170022834
12573	NC_010465	GCA	2	6	642984	642989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022834
12574	NC_010465	ACT	2	6	643001	643006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022834
12575	NC_010465	GCT	2	6	643007	643012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022834
12576	NC_010465	C	6	6	643068	643073	0 %	0 %	0 %	100 %	170022834
12577	NC_010465	CTG	2	6	643082	643087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022834
12578	NC_010465	GGT	2	6	643094	643099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022834
12579	NC_010465	CCG	2	6	643323	643328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170022834
12580	NC_010465	GTT	2	6	643451	643456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022834
12581	NC_010465	TGAC	2	8	643522	643529	25 %	25 %	25 %	25 %	170022834
12582	NC_010465	TTG	2	6	643539	643544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022834
12583	NC_010465	TCA	2	6	643546	643551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022834
12584	NC_010465	GGATCG	2	12	643578	643589	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	170022834
12585	NC_010465	AG	3	6	643604	643609	50 %	0 %	50 %	0 %	170022834
12586	NC_010465	TTG	2	6	643674	643679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022834
12587	NC_010465	CAT	2	6	643772	643777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022834
12588	NC_010465	CGG	2	6	643798	643803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022834
12589	NC_010465	AGGCC	2	10	643813	643822	20 %	0 %	40 %	40 %	170022834
12590	NC_010465	CTG	2	6	643956	643961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022834
12591	NC_010465	GCG	2	6	644151	644156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022834
12592	NC_010465	AGCAAC	2	12	644240	644251	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	170022834
12593	NC_010465	T	6	6	644313	644318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12594	NC_010465	TCT	2	6	644381	644386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170022835
12595	NC_010465	CATT	2	8	644402	644409	25 %	50 %	0 %	25 %	170022835
12596	NC_010465	TCG	2	6	644460	644465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022835
12597	NC_010465	TA	3	6	644484	644489	50 %	50 %	0 %	0 %	170022835
12598	NC_010465	TTG	2	6	644498	644503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022835
12599	NC_010465	ACC	2	6	644536	644541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170022835
12600	NC_010465	AT	3	6	644900	644905	50 %	50 %	0 %	0 %	170022835
12601	NC_010465	GCA	2	6	644910	644915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022835
12602	NC_010465	ATT	2	6	644968	644973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170022835
12603	NC_010465	CGT	2	6	644982	644987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022835
12604	NC_010465	TCATAC	2	12	645107	645118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022835
12605	NC_010465	TCG	2	6	645170	645175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022835
12606	NC_010465	ATA	2	6	645182	645187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170022835
12607	NC_010465	AGC	2	6	645260	645265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022835
12608	NC_010465	ATC	2	6	645358	645363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12609	NC_010465	G	6	6	645371	645376	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_010465	TCA	2	6	645438	645443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022836
12611	NC_010465	AGA	2	6	645450	645455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022836
12612	NC_010465	GA	3	6	645460	645465	50 %	0 %	50 %	0 %	170022836
12613	NC_010465	ATT	2	6	645483	645488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170022836
12614	NC_010465	CAA	2	6	645590	645595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170022836
12615	NC_010465	T	6	6	645622	645627	0 %	100 %	0 %	0 %	170022836
12616	NC_010465	CGA	2	6	645734	645739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022836
12617	NC_010465	TGCG	2	8	645756	645763	0 %	25 %	50 %	25 %	170022836
12618	NC_010465	CAT	2	6	645779	645784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022836
12619	NC_010465	GGA	2	6	645864	645869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170022836
12620	NC_010465	TGCT	2	8	645889	645896	0 %	50 %	25 %	25 %	170022836
12621	NC_010465	CAT	3	9	645981	645989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022836
12622	NC_010465	CAG	2	6	646014	646019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022836
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12982	NC_010465	GTA	2	6	664024	664029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12983	NC_010465	CGT	2	6	664037	664042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12984	NC_010465	AAT	2	6	664070	664075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12985	NC_010465	AATT	2	8	664124	664131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12986	NC_010465	AG	3	6	664221	664226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12987	NC_010465	ACTG	2	8	664239	664246	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12988	NC_010465	A	7	7	664259	664265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12989	NC_010465	GT	3	6	664328	664333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12990	NC_010465	ATC	2	6	664336	664341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12991	NC_010465	TAA	2	6	664353	664358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12992	NC_010465	A	6	6	664357	664362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12993	NC_010465	ATTA	2	8	664374	664381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12995	NC_010465	T	6	6	664423	664428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12996	NC_010465	TTA	2	6	664431	664436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12997	NC_010465	AGA	2	6	664461	664466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022850
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