MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pseudotuberculosis YPIII chromosome

Total Repeats: 92567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_010465	GCA	2	6	508135	508140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_010465	GAAT	2	8	508185	508192	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_010465	CTG	2	6	508203	508208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_010465	GTC	2	6	508259	508264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_010465	CTT	2	6	508327	508332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170022717
10006	NC_010465	ATT	2	6	508337	508342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170022717
10007	NC_010465	CGTT	2	8	508383	508390	0 %	50 %	25 %	25 %	170022717
10008	NC_010465	AAC	2	6	508494	508499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170022717
10009	NC_010465	AAC	2	6	508583	508588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170022717
10010	NC_010465	ATT	2	6	508600	508605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170022717
10011	NC_010465	A	6	6	508632	508637	100 %	0 %	0 %	0 %	170022717
10012	NC_010465	TGT	2	6	508684	508689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022717
10013	NC_010465	GCG	2	6	508710	508715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022717
10014	NC_010465	GTC	2	6	508751	508756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022717
10015	NC_010465	GTT	2	6	508763	508768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022717
10016	NC_010465	TAT	2	6	508794	508799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170022717
10017	NC_010465	TGC	2	6	508836	508841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022717
10018	NC_010465	TGC	2	6	508861	508866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022717
10019	NC_010465	GAT	2	6	508883	508888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022717
10020	NC_010465	TTA	2	6	508889	508894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170022717
10021	NC_010465	TGGG	2	8	508956	508963	0 %	25 %	75 %	0 %	170022717
10022	NC_010465	CCGTTG	2	12	508983	508994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022717
10023	NC_010465	GC	3	6	509020	509025	0 %	0 %	50 %	50 %	170022717
10024	NC_010465	ATGCCA	2	12	509114	509125	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	170022717
10025	NC_010465	ATG	2	6	509168	509173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022717
10026	NC_010465	CTG	2	6	509190	509195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022717
10027	NC_010465	GCC	2	6	509206	509211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170022717
10028	NC_010465	AGT	2	6	509287	509292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022718
10029	NC_010465	TCCT	2	8	509317	509324	0 %	50 %	0 %	50 %	170022718
10030	NC_010465	TGC	2	6	509336	509341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022718
10031	NC_010465	ATC	2	6	509521	509526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022718
10032	NC_010465	TGG	2	6	509534	509539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022718
10033	NC_010465	TGC	2	6	509597	509602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022718
10034	NC_010465	GATG	2	8	509613	509620	25 %	25 %	50 %	0 %	170022718
10035	NC_010465	CGC	2	6	509740	509745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170022718
10036	NC_010465	AGC	2	6	509874	509879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022719
10037	NC_010465	CAC	2	6	509955	509960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170022719
10038	NC_010465	CAA	2	6	510044	510049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170022719
10039	NC_010465	TGA	2	6	510084	510089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022719
10040	NC_010465	CCG	2	6	510090	510095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170022719
10041	NC_010465	GGCG	2	8	510214	510221	0 %	0 %	75 %	25 %	170022719
10042	NC_010465	GGT	2	6	510242	510247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022719
10043	NC_010465	GCAG	2	8	510266	510273	25 %	0 %	50 %	25 %	170022719
10044	NC_010465	GTG	2	6	510284	510289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022719
10045	NC_010465	GGC	2	6	510420	510425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022720
10046	NC_010465	GCT	2	6	510522	510527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022720
10047	NC_010465	TTG	2	6	510529	510534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022720
10048	NC_010465	GCC	2	6	510552	510557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170022720
10049	NC_010465	TCC	2	6	510559	510564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170022720
10050	NC_010465	GTG	2	6	510678	510683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022720
10051	NC_010465	CTTC	2	8	510732	510739	0 %	50 %	0 %	50 %	170022720
10052	NC_010465	A	6	6	510821	510826	100 %	0 %	0 %	0 %	170022720
10053	NC_010465	TGA	2	6	510845	510850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022720
10054	NC_010465	TAT	2	6	510863	510868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170022720
10055	NC_010465	GAA	2	6	510894	510899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022720
10056	NC_010465	CCG	2	6	510907	510912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170022720
10057	NC_010465	AAG	2	6	510957	510962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022720
10058	NC_010465	TGGCGC	2	12	510997	511008	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	170022720
10059	NC_010465	GCG	2	6	511035	511040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022720
10060	NC_010465	TGG	2	6	511084	511089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022720
10061	NC_010465	AT	3	6	511103	511108	50 %	50 %	0 %	0 %	170022720
10062	NC_010465	ATG	2	6	511168	511173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022720
10063	NC_010465	CT	3	6	511193	511198	0 %	50 %	0 %	50 %	170022720
10064	NC_010465	GGT	2	6	511224	511229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022720
10065	NC_010465	CAGA	2	8	511245	511252	50 %	0 %	25 %	25 %	170022720
10066	NC_010465	ATT	2	6	511392	511397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170022720
10067	NC_010465	ATC	2	6	511423	511428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022720
10068	NC_010465	CGG	2	6	511431	511436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022720
10069	NC_010465	CATT	2	8	511443	511450	25 %	50 %	0 %	25 %	170022720
10070	NC_010465	GCCGTG	2	12	511582	511593	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	170022720
10071	NC_010465	TCA	2	6	511652	511657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022720
10072	NC_010465	TCG	2	6	511756	511761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022720
10073	NC_010465	GTG	2	6	511815	511820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022720
10074	NC_010465	ATG	2	6	511821	511826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022720
10075	NC_010465	GTT	2	6	511842	511847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_010465	AAT	2	6	511940	511945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170022721
10077	NC_010465	TTG	2	6	511969	511974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022721
10078	NC_010465	TGG	2	6	511975	511980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022721
10079	NC_010465	ATG	2	6	512004	512009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022721
10080	NC_010465	TG	3	6	512198	512203	0 %	50 %	50 %	0 %	170022721
10081	NC_010465	CTG	2	6	512211	512216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022721
10082	NC_010465	CAGTTG	2	12	512253	512264	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	170022721
10083	NC_010465	CACAC	2	10	512271	512280	40 %	0 %	0 %	60 %	170022721
10084	NC_010465	ATA	2	6	512329	512334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170022721
10085	NC_010465	GTG	2	6	512508	512513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022721
10086	NC_010465	AAT	2	6	512553	512558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170022721
10087	NC_010465	TA	3	6	512566	512571	50 %	50 %	0 %	0 %	170022721
10088	NC_010465	ATA	2	6	512581	512586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170022721
10089	NC_010465	GTTG	2	8	512611	512618	0 %	50 %	50 %	0 %	170022721
10090	NC_010465	AAT	2	6	512622	512627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170022721
10091	NC_010465	GGC	2	6	512657	512662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022721
10092	NC_010465	GTG	2	6	512680	512685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022721
10093	NC_010465	TGC	2	6	512704	512709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022721
10094	NC_010465	TCAG	2	8	512710	512717	25 %	25 %	25 %	25 %	170022721
10095	NC_010465	GCC	2	6	512785	512790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170022721
10096	NC_010465	AGC	2	6	512914	512919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022721
10097	NC_010465	ACCC	2	8	512978	512985	25 %	0 %	0 %	75 %	170022721
10098	NC_010465	CTG	2	6	513006	513011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022721
10099	NC_010465	ACC	2	6	513087	513092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170022721
10100	NC_010465	TGAGT	2	10	513167	513176	20 %	40 %	40 %	0 %	170022721
10101	NC_010465	GC	3	6	513277	513282	0 %	0 %	50 %	50 %	170022721
10102	NC_010465	TGA	2	6	513296	513301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022721
10103	NC_010465	TAT	2	6	513372	513377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170022721
10104	NC_010465	ATG	2	6	513454	513459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022721
10105	NC_010465	G	7	7	513536	513542	0 %	0 %	100 %	0 %	170022721
10106	NC_010465	TA	3	6	513565	513570	50 %	50 %	0 %	0 %	170022721
10107	NC_010465	TTTCAG	2	12	513648	513659	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	170022721
10108	NC_010465	CA	3	6	513733	513738	50 %	0 %	0 %	50 %	170022721
10109	NC_010465	GCA	2	6	513760	513765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022721
10110	NC_010465	CAT	2	6	513776	513781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022721
10111	NC_010465	GAAA	2	8	513794	513801	75 %	0 %	25 %	0 %	170022721
10112	NC_010465	ACT	2	6	513850	513855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022721
10113	NC_010465	TGAA	2	8	513895	513902	50 %	25 %	25 %	0 %	170022721
10114	NC_010465	GGTG	2	8	513908	513915	0 %	25 %	75 %	0 %	170022721
10115	NC_010465	GAA	2	6	513954	513959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022721
10116	NC_010465	AAC	2	6	513999	514004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170022721
10117	NC_010465	CTG	2	6	514008	514013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022721
10118	NC_010465	ATG	2	6	514066	514071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022721
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10120	NC_010465	AGC	2	6	514144	514149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022721
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10232	NC_010465	TCTT	2	8	520307	520314	0 %	75 %	0 %	25 %	170022724
10233	NC_010465	CGGG	2	8	520318	520325	0 %	0 %	75 %	25 %	170022724
10234	NC_010465	CT	3	6	520394	520399	0 %	50 %	0 %	50 %	170022724
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10238	NC_010465	TGG	2	6	520569	520574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022724
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