MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pseudotuberculosis YPIII chromosome

Total Repeats: 92567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010465	TTAA	2	8	302555	302562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_010465	TTAT	2	8	302612	302619	25 %	75 %	0 %	0 %	170022524
6003	NC_010465	GC	3	6	302623	302628	0 %	0 %	50 %	50 %	170022524
6004	NC_010465	T	6	6	302778	302783	0 %	100 %	0 %	0 %	170022524
6005	NC_010465	TAA	2	6	302787	302792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170022524
6006	NC_010465	GGT	2	6	302848	302853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022524
6007	NC_010465	GGC	2	6	302862	302867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022524
6008	NC_010465	ATA	2	6	302887	302892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170022524
6009	NC_010465	GCG	2	6	302910	302915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022524
6010	NC_010465	GGT	2	6	303024	303029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022524
6011	NC_010465	TTG	2	6	303159	303164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022524
6012	NC_010465	TTG	2	6	303195	303200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022524
6013	NC_010465	CTG	2	6	303309	303314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022524
6014	NC_010465	CTG	2	6	303321	303326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022524
6015	NC_010465	GCCA	2	8	303352	303359	25 %	0 %	25 %	50 %	170022524
6016	NC_010465	ATC	2	6	303360	303365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022524
6017	NC_010465	CTG	2	6	303441	303446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022524
6018	NC_010465	AGT	2	6	303490	303495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022524
6019	NC_010465	AAT	2	6	303531	303536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170022524
6020	NC_010465	CGC	2	6	303683	303688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6021	NC_010465	TA	3	6	303777	303782	50 %	50 %	0 %	0 %	170022525
6022	NC_010465	TTG	2	6	303878	303883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022525
6023	NC_010465	GC	3	6	303911	303916	0 %	0 %	50 %	50 %	170022525
6024	NC_010465	TGT	2	6	304071	304076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022525
6025	NC_010465	CCA	2	6	304138	304143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170022525
6026	NC_010465	CTG	2	6	304148	304153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022525
6027	NC_010465	CGT	2	6	304192	304197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022525
6028	NC_010465	GGT	2	6	304217	304222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022525
6029	NC_010465	CAC	2	6	304253	304258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170022525
6030	NC_010465	ATCA	2	8	304274	304281	50 %	25 %	0 %	25 %	170022525
6031	NC_010465	TCCAAA	2	12	304308	304319	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	170022525
6032	NC_010465	TGGT	2	8	304320	304327	0 %	50 %	50 %	0 %	170022525
6033	NC_010465	CAG	2	6	304337	304342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022525
6034	NC_010465	AAT	2	6	304364	304369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170022525
6035	NC_010465	TC	3	6	304393	304398	0 %	50 %	0 %	50 %	170022525
6036	NC_010465	GCGG	2	8	304409	304416	0 %	0 %	75 %	25 %	170022525
6037	NC_010465	GGTC	2	8	304420	304427	0 %	25 %	50 %	25 %	170022525
6038	NC_010465	ACC	2	6	304451	304456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170022525
6039	NC_010465	TGC	2	6	304473	304478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022525
6040	NC_010465	GGC	2	6	304498	304503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022525
6041	NC_010465	TGC	2	6	304509	304514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022525
6042	NC_010465	TCA	2	6	304524	304529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022525
6043	NC_010465	AAT	2	6	304626	304631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170022525
6044	NC_010465	GCA	2	6	304759	304764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022525
6045	NC_010465	GCTT	2	8	304872	304879	0 %	50 %	25 %	25 %	170022525
6046	NC_010465	TGG	2	6	304885	304890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022525
6047	NC_010465	TGCTGA	2	12	304941	304952	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	170022525
6048	NC_010465	TTG	3	9	304961	304969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022525
6049	NC_010465	TGG	2	6	304978	304983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022525
6050	NC_010465	ATTC	2	8	305020	305027	25 %	50 %	0 %	25 %	170022525
6051	NC_010465	ATA	2	6	305061	305066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170022525
6052	NC_010465	CCAG	2	8	305134	305141	25 %	0 %	25 %	50 %	170022525
6053	NC_010465	ATCCAA	2	12	305150	305161	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	170022525
6054	NC_010465	TGGT	3	12	305163	305174	0 %	50 %	50 %	0 %	170022525
6055	NC_010465	GCCA	2	8	305236	305243	25 %	0 %	25 %	50 %	170022525
6056	NC_010465	ATGG	2	8	305336	305343	25 %	25 %	50 %	0 %	170022525
6057	NC_010465	ATGGC	2	10	305370	305379	20 %	20 %	40 %	20 %	170022525
6058	NC_010465	CAT	2	6	305380	305385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022525
6059	NC_010465	T	7	7	305385	305391	0 %	100 %	0 %	0 %	170022525
6060	NC_010465	CAG	2	6	305567	305572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022525
6061	NC_010465	A	6	6	305686	305691	100 %	0 %	0 %	0 %	170022525
6062	NC_010465	ATC	2	6	305730	305735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_010465	TGAC	2	8	305784	305791	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6064	NC_010465	ACCT	2	8	305824	305831	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6065	NC_010465	GAC	2	6	305927	305932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_010465	ATG	2	6	305946	305951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022526
6067	NC_010465	GCC	2	6	305957	305962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170022526
6068	NC_010465	TGC	2	6	305971	305976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022526
6069	NC_010465	CAG	2	6	306036	306041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022526
6070	NC_010465	TCA	2	6	306101	306106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022526
6071	NC_010465	AGC	2	6	306109	306114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022526
6072	NC_010465	ATC	2	6	306127	306132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022526
6073	NC_010465	TA	3	6	306157	306162	50 %	50 %	0 %	0 %	170022526
6074	NC_010465	GGC	2	6	306234	306239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022526
6075	NC_010465	ACC	2	6	306276	306281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170022526
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6078	NC_010465	GAT	2	6	306395	306400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022526
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6080	NC_010465	CGT	2	6	306689	306694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022527
6081	NC_010465	GGCA	2	8	306838	306845	25 %	0 %	50 %	25 %	170022527
6082	NC_010465	GTC	2	6	306875	306880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022527
6083	NC_010465	GGC	2	6	306933	306938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022527
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6085	NC_010465	TTG	2	6	307098	307103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022527
6086	NC_010465	GTT	2	6	307109	307114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022527
6087	NC_010465	TGG	2	6	307168	307173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022527
6088	NC_010465	GTTT	2	8	307315	307322	0 %	75 %	25 %	0 %	170022527
6089	NC_010465	T	6	6	307320	307325	0 %	100 %	0 %	0 %	170022527
6090	NC_010465	GGCAT	2	10	307335	307344	20 %	20 %	40 %	20 %	170022527
6091	NC_010465	CTG	2	6	307383	307388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022527
6092	NC_010465	GCG	2	6	307454	307459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022527
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6094	NC_010465	TC	3	6	307534	307539	0 %	50 %	0 %	50 %	170022527
6095	NC_010465	GT	3	6	307543	307548	0 %	50 %	50 %	0 %	170022527
6096	NC_010465	AAC	2	6	307558	307563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170022527
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6098	NC_010465	GAT	2	6	307595	307600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022527
6099	NC_010465	TCG	2	6	307643	307648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022527
6100	NC_010465	AG	3	6	307664	307669	50 %	0 %	50 %	0 %	170022527
6101	NC_010465	TGA	2	6	307670	307675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022527
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6103	NC_010465	ATT	2	6	307710	307715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170022527
6104	NC_010465	ATG	2	6	307812	307817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022527
6105	NC_010465	AAAGCC	2	12	307890	307901	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	170022527
6106	NC_010465	ATT	2	6	308090	308095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170022527
6107	NC_010465	GCAT	2	8	308104	308111	25 %	25 %	25 %	25 %	170022527
6108	NC_010465	CAA	2	6	308133	308138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170022527
6109	NC_010465	TCG	2	6	308144	308149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022527
6110	NC_010465	CAT	2	6	308187	308192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022527
6111	NC_010465	AAG	2	6	308221	308226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022527
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6113	NC_010465	AAT	2	6	308305	308310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170022527
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6117	NC_010465	TCC	2	6	308534	308539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170022528
6118	NC_010465	T	6	6	308562	308567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_010465	GTAC	2	8	308683	308690	25 %	25 %	25 %	25 %	170022529
6120	NC_010465	AGA	2	6	308691	308696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022529
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6122	NC_010465	GC	3	6	308726	308731	0 %	0 %	50 %	50 %	170022529
6123	NC_010465	GCACGG	2	12	308745	308756	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	170022529
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6134	NC_010465	TG	3	6	309294	309299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6135	NC_010465	TTA	2	6	309381	309386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6136	NC_010465	TAAT	2	8	309391	309398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6137	NC_010465	TTA	2	6	309401	309406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6143	NC_010465	T	6	6	309712	309717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6144	NC_010465	AT	4	8	309797	309804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6148	NC_010465	CA	5	10	309879	309888	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6153	NC_010465	A	6	6	310242	310247	100 %	0 %	0 %	0 %	170022531
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6162	NC_010465	TTA	2	6	310955	310960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6245	NC_010465	AAT	2	6	315172	315177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170022538
6246	NC_010465	ATC	2	6	315181	315186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022538
6247	NC_010465	CTGTTG	2	12	315221	315232	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	170022538
6248	NC_010465	A	6	6	315257	315262	100 %	0 %	0 %	0 %	170022538
6249	NC_010465	AGA	2	6	315291	315296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022538
6250	NC_010465	CAT	2	6	315299	315304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022538
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6257	NC_010465	GTT	2	6	315676	315681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022538
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6260	NC_010465	CGT	2	6	315874	315879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022538
6261	NC_010465	ATC	2	6	315886	315891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022538
6262	NC_010465	CTT	2	6	315998	316003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170022538
6263	NC_010465	CT	3	6	316110	316115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6264	NC_010465	CAG	2	6	316237	316242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022539
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6282	NC_010465	GTA	2	6	316830	316835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022539
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6294	NC_010465	T	6	6	317387	317392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6296	NC_010465	TG	3	6	317710	317715	0 %	50 %	50 %	0 %	170022540
6297	NC_010465	GTAA	2	8	317990	317997	50 %	25 %	25 %	0 %	170022540
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6299	NC_010465	TATT	2	8	318098	318105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6300	NC_010465	AAT	2	6	318115	318120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6303	NC_010465	ATGA	2	8	318362	318369	50 %	25 %	25 %	0 %	170022541
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6306	NC_010465	TTC	2	6	318534	318539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170022542
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6309	NC_010465	TGA	2	6	318832	318837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022542
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6312	NC_010465	CGT	2	6	318964	318969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6314	NC_010465	CTT	2	6	319041	319046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6315	NC_010465	GTCA	2	8	319066	319073	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6316	NC_010465	AATTA	2	10	319089	319098	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6317	NC_010465	GCTT	2	8	319132	319139	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6318	NC_010465	CTG	2	6	319141	319146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6320	NC_010465	TGG	2	6	319181	319186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6321	NC_010465	GAG	2	6	319300	319305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6322	NC_010465	AAT	2	6	319324	319329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6323	NC_010465	ATC	2	6	319385	319390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022543
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6335	NC_010465	GAG	2	6	320323	320328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6336	NC_010465	GGAAT	2	10	320332	320341	40 %	20 %	40 %	0 %	170022545
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6345	NC_010465	GC	3	6	320642	320647	0 %	0 %	50 %	50 %	170022545
6346	NC_010465	CTG	2	6	320900	320905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022545
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6351	NC_010465	TGCAG	2	10	321071	321080	20 %	20 %	40 %	20 %	170022546
6352	NC_010465	GAAGTC	2	12	321090	321101	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	170022546
6353	NC_010465	GTC	2	6	321160	321165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022546
6354	NC_010465	A	6	6	321177	321182	100 %	0 %	0 %	0 %	170022546
6355	NC_010465	AAG	2	6	321199	321204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022546
6356	NC_010465	CGG	2	6	321224	321229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022546
6357	NC_010465	GGA	2	6	321243	321248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6358	NC_010465	GTC	2	6	321290	321295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022547
6359	NC_010465	GTT	2	6	321301	321306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022547
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6363	NC_010465	CTG	2	6	321479	321484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022547
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6365	NC_010465	GGC	2	6	321706	321711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022547
6366	NC_010465	CTG	2	6	321725	321730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022547
6367	NC_010465	TGC	2	6	321857	321862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022547
6368	NC_010465	GGT	3	9	321952	321960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022547
6369	NC_010465	AAG	2	6	322018	322023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022547
6370	NC_010465	CAA	2	6	322032	322037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170022547
6371	NC_010465	GTA	2	6	322067	322072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022547
6372	NC_010465	A	6	6	322072	322077	100 %	0 %	0 %	0 %	170022547
6373	NC_010465	TC	3	6	322104	322109	0 %	50 %	0 %	50 %	170022548
6374	NC_010465	GAA	2	6	322142	322147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022548
6375	NC_010465	AAG	2	6	322176	322181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022548
6376	NC_010465	CGT	2	6	322200	322205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022548
6377	NC_010465	GTC	2	6	322255	322260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022548
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6380	NC_010465	TTC	2	6	322420	322425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170022549
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6383	NC_010465	GCT	2	6	322514	322519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022549
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6413	NC_010465	ACTG	2	8	324026	324033	25 %	25 %	25 %	25 %	170022552
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6421	NC_010465	ATA	2	6	324324	324329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6422	NC_010465	T	6	6	324355	324360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6423	NC_010465	AGT	3	9	324455	324463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6424	NC_010465	CAT	2	6	324595	324600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022554
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6432	NC_010465	GTAAA	2	10	324934	324943	60 %	20 %	20 %	0 %	170022555
6433	NC_010465	TCT	2	6	324954	324959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170022555
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6464	NC_010465	CGT	2	6	326518	326523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022559
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6470	NC_010465	TC	3	6	326820	326825	0 %	50 %	0 %	50 %	170022559
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6483	NC_010465	TGC	2	6	327361	327366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022560
6484	NC_010465	AGT	2	6	327516	327521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022561
6485	NC_010465	GCA	2	6	327648	327653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022561
6486	NC_010465	TAT	2	6	327717	327722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170022561
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6488	NC_010465	GC	3	6	327738	327743	0 %	0 %	50 %	50 %	170022561
6489	NC_010465	CTA	2	6	327794	327799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022561
6490	NC_010465	GAA	2	6	327889	327894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022561
6491	NC_010465	CAAA	2	8	327936	327943	75 %	0 %	0 %	25 %	170022562
6492	NC_010465	CGT	2	6	327999	328004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022562
6493	NC_010465	CTG	2	6	328036	328041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022562
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6496	NC_010465	CGT	2	6	328233	328238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022563
6497	NC_010465	GGT	2	6	328248	328253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022563
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