MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 88007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49001	NC_010159	GGC	2	6	2501156	2501161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421326
49002	NC_010159	TCT	2	6	2501169	2501174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421326
49003	NC_010159	ATA	2	6	2501309	2501314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49004	NC_010159	TCC	2	6	2501319	2501324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49005	NC_010159	TTAC	2	8	2501419	2501426	25 %	50 %	0 %	25 %	162421456
49006	NC_010159	CA	3	6	2501701	2501706	50 %	0 %	0 %	50 %	162421456
49007	NC_010159	TTG	2	6	2501898	2501903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421456
49008	NC_010159	A	6	6	2502024	2502029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49009	NC_010159	ACA	2	6	2502095	2502100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49010	NC_010159	GTG	2	6	2502120	2502125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49011	NC_010159	CAGC	2	8	2502141	2502148	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49012	NC_010159	CG	3	6	2502232	2502237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49013	NC_010159	TGA	2	6	2502320	2502325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49014	NC_010159	GCCA	2	8	2502414	2502421	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49015	NC_010159	TTGA	2	8	2502423	2502430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49016	NC_010159	GGC	2	6	2502444	2502449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49017	NC_010159	ATT	2	6	2502631	2502636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49018	NC_010159	AAC	3	9	2502680	2502688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49019	NC_010159	A	6	6	2502712	2502717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49020	NC_010159	GGCCT	2	10	2502821	2502830	0 %	20 %	40 %	40 %	162421764
49021	NC_010159	GTT	2	6	2502885	2502890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421764
49022	NC_010159	GAG	2	6	2502897	2502902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162421764
49023	NC_010159	GCTT	2	8	2502977	2502984	0 %	50 %	25 %	25 %	162421764
49024	NC_010159	TGG	2	6	2502985	2502990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421764
49025	NC_010159	CCGG	2	8	2503041	2503048	0 %	0 %	50 %	50 %	162421764
49026	NC_010159	GCG	2	6	2503050	2503055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421764
49027	NC_010159	TGA	2	6	2503250	2503255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421764
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49029	NC_010159	AGT	2	6	2503425	2503430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421764
49030	NC_010159	CATC	2	8	2503442	2503449	25 %	25 %	0 %	50 %	162421764
49031	NC_010159	TGG	2	6	2503504	2503509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421764
49032	NC_010159	GTG	2	6	2503546	2503551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421764
49033	NC_010159	G	6	6	2503721	2503726	0 %	0 %	100 %	0 %	162421764
49034	NC_010159	CG	3	6	2503791	2503796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49035	NC_010159	AGC	2	6	2503841	2503846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49036	NC_010159	GCTG	2	8	2503859	2503866	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49037	NC_010159	GGC	2	6	2503881	2503886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49038	NC_010159	GAAAC	2	10	2504050	2504059	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
49039	NC_010159	AG	3	6	2504095	2504100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49040	NC_010159	TGT	2	6	2504309	2504314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49041	NC_010159	CAA	2	6	2504349	2504354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49042	NC_010159	TCA	2	6	2504366	2504371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49043	NC_010159	AAGTA	2	10	2504426	2504435	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49044	NC_010159	CAG	2	6	2504446	2504451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49045	NC_010159	TTG	2	6	2504464	2504469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49046	NC_010159	ATTCAG	2	12	2504539	2504550	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49047	NC_010159	TAAG	2	8	2504551	2504558	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49048	NC_010159	ATC	2	6	2504576	2504581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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49050	NC_010159	TCG	2	6	2504715	2504720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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49052	NC_010159	ATG	2	6	2504825	2504830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49053	NC_010159	ATG	2	6	2504847	2504852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49054	NC_010159	GTG	2	6	2504883	2504888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49055	NC_010159	CAG	2	6	2504896	2504901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49056	NC_010159	AAC	3	9	2504936	2504944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49057	NC_010159	GTA	2	6	2504991	2504996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419280
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49094	NC_010159	TTGG	2	8	2507254	2507261	0 %	50 %	50 %	0 %	162419703
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49108	NC_010159	ATG	2	6	2507741	2507746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419703
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49111	NC_010159	TGT	2	6	2507881	2507886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49112	NC_010159	ATT	2	6	2507902	2507907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49113	NC_010159	ACG	2	6	2508004	2508009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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49115	NC_010159	TCTG	2	8	2508106	2508113	0 %	50 %	25 %	25 %	162418191
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49121	NC_010159	CTGA	2	8	2508305	2508312	25 %	25 %	25 %	25 %	162418191
49122	NC_010159	TCA	2	6	2508330	2508335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418191
49123	NC_010159	ATG	2	6	2508336	2508341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418191
49124	NC_010159	G	6	6	2508349	2508354	0 %	0 %	100 %	0 %	162418191
49125	NC_010159	CGT	2	6	2508374	2508379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418191
49126	NC_010159	CTG	3	9	2508427	2508435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418191
49127	NC_010159	TGAG	2	8	2508556	2508563	25 %	25 %	50 %	0 %	162418191
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49133	NC_010159	CAT	2	6	2508839	2508844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418191
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49150	NC_010159	GAAT	2	8	2509563	2509570	50 %	25 %	25 %	0 %	162418987
49151	NC_010159	GCGA	2	8	2509618	2509625	25 %	0 %	50 %	25 %	162418987
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49225	NC_010159	TC	3	6	2514283	2514288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49226	NC_010159	AAAT	2	8	2514289	2514296	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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49231	NC_010159	A	6	6	2514453	2514458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49232	NC_010159	AAT	2	6	2514553	2514558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49233	NC_010159	AT	3	6	2514577	2514582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49234	NC_010159	AGT	2	6	2514726	2514731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420067
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49240	NC_010159	CCCA	2	8	2515050	2515057	25 %	0 %	0 %	75 %	162420067
49241	NC_010159	ATC	2	6	2515065	2515070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420067
49242	NC_010159	TTA	2	6	2515126	2515131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162420067
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49244	NC_010159	ATG	2	6	2515188	2515193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420067
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49270	NC_010159	TATT	2	8	2516515	2516522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49271	NC_010159	TA	4	8	2516550	2516557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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49351	NC_010159	TAATA	2	10	2521015	2521024	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49352	NC_010159	ATA	2	6	2521040	2521045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49353	NC_010159	T	6	6	2521098	2521103	0 %	100 %	0 %	0 %	162420173
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49356	NC_010159	C	6	6	2521400	2521405	0 %	0 %	0 %	100 %	162420173
49357	NC_010159	CGC	2	6	2521434	2521439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420173
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49360	NC_010159	CTG	2	6	2521644	2521649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420173
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49362	NC_010159	ATCG	2	8	2521755	2521762	25 %	25 %	25 %	25 %	162420173
49363	NC_010159	AAAT	2	8	2521797	2521804	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49364	NC_010159	GC	3	6	2521818	2521823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49365	NC_010159	TAG	2	6	2521825	2521830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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49450	NC_010159	A	6	6	2525753	2525758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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49475	NC_010159	TAT	2	6	2526630	2526635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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49477	NC_010159	TAT	2	6	2526701	2526706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49478	NC_010159	GCC	2	6	2526824	2526829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421583
49479	NC_010159	ATA	2	6	2526839	2526844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421583
49480	NC_010159	TCA	2	6	2526875	2526880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421583
49481	NC_010159	TGC	2	6	2526950	2526955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421583
49482	NC_010159	GTTT	2	8	2527083	2527090	0 %	75 %	25 %	0 %	162421583
49483	NC_010159	GTT	2	6	2527098	2527103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421583
49484	NC_010159	TACTTT	2	12	2527396	2527407	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	162421583
49485	NC_010159	TCA	2	6	2527409	2527414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421583
49486	NC_010159	G	6	6	2527441	2527446	0 %	0 %	100 %	0 %	162421583
49487	NC_010159	ATC	2	6	2527457	2527462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421583
49488	NC_010159	AAC	2	6	2527607	2527612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421583
49489	NC_010159	AGCGA	2	10	2527618	2527627	40 %	0 %	40 %	20 %	162421583
49490	NC_010159	TTTC	2	8	2527650	2527657	0 %	75 %	0 %	25 %	162421583
49491	NC_010159	CGG	2	6	2527834	2527839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421583
49492	NC_010159	AGT	2	6	2527848	2527853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421583
49493	NC_010159	GTG	2	6	2527859	2527864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421583
49494	NC_010159	GCA	2	6	2528115	2528120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421583
49495	NC_010159	CT	3	6	2528257	2528262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49496	NC_010159	A	6	6	2528299	2528304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49497	NC_010159	A	6	6	2528309	2528314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49498	NC_010159	CATC	2	8	2528315	2528322	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49499	NC_010159	GTA	2	6	2528481	2528486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49500	NC_010159	GAAAG	2	10	2528609	2528618	60 %	0 %	40 %	0 %	162420061

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