MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 88007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_010159	ACG	2	6	2448407	2448412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48002	NC_010159	T	8	8	2448419	2448426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48003	NC_010159	AAC	2	6	2448475	2448480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48004	NC_010159	ACC	2	6	2448526	2448531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48005	NC_010159	TA	3	6	2448536	2448541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48006	NC_010159	ATT	2	6	2448585	2448590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48007	NC_010159	GCA	2	6	2448624	2448629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420167
48008	NC_010159	TGC	2	6	2448647	2448652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420167
48009	NC_010159	GCA	2	6	2448680	2448685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420167
48010	NC_010159	A	7	7	2448729	2448735	100 %	0 %	0 %	0 %	162420167
48011	NC_010159	TGA	2	6	2448868	2448873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420167
48012	NC_010159	A	6	6	2449037	2449042	100 %	0 %	0 %	0 %	162420167
48013	NC_010159	TTAA	2	8	2449063	2449070	50 %	50 %	0 %	0 %	162420167
48014	NC_010159	ACA	2	6	2449112	2449117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48015	NC_010159	AAT	2	6	2449121	2449126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48016	NC_010159	ACC	2	6	2449142	2449147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48017	NC_010159	AAAG	2	8	2449170	2449177	75 %	0 %	25 %	0 %	162421493
48018	NC_010159	AAT	2	6	2449264	2449269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421493
48019	NC_010159	TTG	2	6	2449274	2449279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421493
48020	NC_010159	CTT	2	6	2449296	2449301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421493
48021	NC_010159	GCC	2	6	2449406	2449411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421493
48022	NC_010159	CAT	3	9	2449413	2449421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421493
48023	NC_010159	AAG	2	6	2449433	2449438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421493
48024	NC_010159	TTA	2	6	2449456	2449461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421493
48025	NC_010159	TGG	2	6	2449476	2449481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421493
48026	NC_010159	ATG	2	6	2449517	2449522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421493
48027	NC_010159	AGC	2	6	2449592	2449597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421493
48028	NC_010159	TTGA	2	8	2449609	2449616	25 %	50 %	25 %	0 %	162421493
48029	NC_010159	TGT	2	6	2449644	2449649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421493
48030	NC_010159	AT	3	6	2449659	2449664	50 %	50 %	0 %	0 %	162421493
48031	NC_010159	ATT	2	6	2449708	2449713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421493
48032	NC_010159	TCA	2	6	2449719	2449724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421493
48033	NC_010159	ACC	2	6	2449760	2449765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421493
48034	NC_010159	ATT	2	6	2449789	2449794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421493
48035	NC_010159	ATC	2	6	2449840	2449845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421493
48036	NC_010159	CTG	2	6	2449880	2449885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421493
48037	NC_010159	ATG	2	6	2449891	2449896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421493
48038	NC_010159	AGT	2	6	2449930	2449935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421493
48039	NC_010159	T	6	6	2450006	2450011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48040	NC_010159	A	6	6	2450036	2450041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48041	NC_010159	CGAA	2	8	2450046	2450053	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48042	NC_010159	T	7	7	2450057	2450063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48043	NC_010159	ATG	2	6	2450098	2450103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48044	NC_010159	AGC	2	6	2450132	2450137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48045	NC_010159	GTG	2	6	2450145	2450150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48046	NC_010159	CAC	2	6	2450224	2450229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48047	NC_010159	TAA	2	6	2450236	2450241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48048	NC_010159	TC	5	10	2450244	2450253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48049	NC_010159	ACG	2	6	2450339	2450344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48050	NC_010159	GCG	2	6	2450349	2450354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48051	NC_010159	AAT	2	6	2450382	2450387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48052	NC_010159	CAC	2	6	2450396	2450401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48053	NC_010159	TAA	2	6	2450408	2450413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48054	NC_010159	TCTCCC	2	12	2450417	2450428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48055	NC_010159	ACG	2	6	2450512	2450517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48056	NC_010159	GCG	2	6	2450522	2450527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48057	NC_010159	AAT	2	6	2450555	2450560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48058	NC_010159	ATA	2	6	2450633	2450638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418320
48059	NC_010159	T	7	7	2450683	2450689	0 %	100 %	0 %	0 %	162418320
48060	NC_010159	AAC	2	6	2450713	2450718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418320
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48069	NC_010159	GCCA	2	8	2451200	2451207	25 %	0 %	25 %	50 %	162418320
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48073	NC_010159	TG	3	6	2451503	2451508	0 %	50 %	50 %	0 %	162418320
48074	NC_010159	CGT	2	6	2451588	2451593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418320
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48078	NC_010159	TCTCCC	2	12	2451913	2451924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48079	NC_010159	CAC	2	6	2452024	2452029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48080	NC_010159	T	6	6	2452037	2452042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48081	NC_010159	ATGT	2	8	2452070	2452077	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48082	NC_010159	ATTT	2	8	2452136	2452143	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48083	NC_010159	ATC	2	6	2452197	2452202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48084	NC_010159	ATT	2	6	2452204	2452209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48085	NC_010159	ACA	2	6	2452254	2452259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48086	NC_010159	T	7	7	2452302	2452308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48087	NC_010159	TTC	2	6	2452315	2452320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48088	NC_010159	GAA	2	6	2452380	2452385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48089	NC_010159	ATTA	2	8	2452408	2452415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48090	NC_010159	AT	3	6	2452429	2452434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48091	NC_010159	GAT	2	6	2452496	2452501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48092	NC_010159	CAT	2	6	2452518	2452523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48093	NC_010159	TCA	2	6	2452535	2452540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48094	NC_010159	ATA	2	6	2452549	2452554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48095	NC_010159	T	7	7	2452583	2452589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48096	NC_010159	TAA	2	6	2452637	2452642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48097	NC_010159	TAA	2	6	2452647	2452652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48098	NC_010159	TTTCTT	2	12	2452689	2452700	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48099	NC_010159	TC	3	6	2452767	2452772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48100	NC_010159	T	6	6	2452783	2452788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48101	NC_010159	TAT	2	6	2452792	2452797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48102	NC_010159	AGG	2	6	2452828	2452833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48103	NC_010159	TGT	2	6	2452834	2452839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48104	NC_010159	TCA	2	6	2452845	2452850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48105	NC_010159	ACT	2	6	2452883	2452888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48106	NC_010159	TCA	2	6	2452951	2452956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48107	NC_010159	A	6	6	2452958	2452963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48108	NC_010159	TAT	2	6	2453023	2453028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48109	NC_010159	ACT	2	6	2453081	2453086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48110	NC_010159	AAC	2	6	2453098	2453103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48111	NC_010159	GTA	2	6	2453157	2453162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48112	NC_010159	TAA	2	6	2453208	2453213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48113	NC_010159	TA	3	6	2453259	2453264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48114	NC_010159	TAA	2	6	2453278	2453283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48115	NC_010159	TAT	2	6	2453375	2453380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162420255
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48117	NC_010159	AAT	2	6	2453463	2453468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48118	NC_010159	TTA	2	6	2453488	2453493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48119	NC_010159	ATA	2	6	2453509	2453514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48120	NC_010159	A	6	6	2453528	2453533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48121	NC_010159	AATTA	2	10	2453543	2453552	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48122	NC_010159	ATT	2	6	2453566	2453571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48123	NC_010159	AATA	2	8	2453596	2453603	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48124	NC_010159	TA	3	6	2453610	2453615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48125	NC_010159	AATA	2	8	2453624	2453631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48126	NC_010159	ATT	2	6	2453645	2453650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48243	NC_010159	CAC	2	6	2460008	2460013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421479
48244	NC_010159	CCG	2	6	2460026	2460031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421479
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48266	NC_010159	ATC	2	6	2461225	2461230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48273	NC_010159	TTG	2	6	2461655	2461660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418137
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48303	NC_010159	GCCT	2	8	2462964	2462971	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48304	NC_010159	T	6	6	2462981	2462986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48305	NC_010159	GCA	2	6	2463010	2463015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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48320	NC_010159	AAC	2	6	2463894	2463899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48321	NC_010159	TAAT	2	8	2464046	2464053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48324	NC_010159	TGG	2	6	2464167	2464172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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48342	NC_010159	TGC	2	6	2464948	2464953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419284
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48345	NC_010159	GATCT	2	10	2465147	2465156	20 %	40 %	20 %	20 %	162419284
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48347	NC_010159	TGA	2	6	2465305	2465310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48348	NC_010159	TGC	2	6	2465414	2465419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48349	NC_010159	TGT	2	6	2465513	2465518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419642
48350	NC_010159	CAGC	2	8	2465540	2465547	25 %	0 %	25 %	50 %	162419642
48351	NC_010159	GTT	2	6	2465574	2465579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419642
48352	NC_010159	GTGC	2	8	2465592	2465599	0 %	25 %	50 %	25 %	162419642
48353	NC_010159	GTG	2	6	2465644	2465649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419642
48354	NC_010159	AAG	2	6	2465689	2465694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419642
48355	NC_010159	TTG	2	6	2465723	2465728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419642
48356	NC_010159	ATG	2	6	2465800	2465805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419642
48357	NC_010159	GCT	2	6	2465952	2465957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419642
48358	NC_010159	CAA	2	6	2466063	2466068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419642
48359	NC_010159	CCATCA	2	12	2466167	2466178	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	162419642
48360	NC_010159	GCA	2	6	2466223	2466228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419642
48361	NC_010159	ATG	2	6	2466244	2466249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419642
48362	NC_010159	CAA	2	6	2466287	2466292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419642
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48373	NC_010159	CGCA	2	8	2466807	2466814	25 %	0 %	25 %	50 %	162421816
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48477	NC_010159	GTA	2	6	2473123	2473128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420889
48478	NC_010159	CT	4	8	2473159	2473166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48479	NC_010159	TAA	2	6	2473170	2473175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48480	NC_010159	TGAT	2	8	2473294	2473301	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48481	NC_010159	ATG	2	6	2473328	2473333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48482	NC_010159	A	6	6	2473353	2473358	100 %	0 %	0 %	0 %	162419844
48483	NC_010159	AAC	2	6	2473447	2473452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419844
48484	NC_010159	CGA	2	6	2473501	2473506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419844
48485	NC_010159	CGG	2	6	2473604	2473609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419844
48486	NC_010159	TGCAGG	2	12	2473643	2473654	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	162419844
48487	NC_010159	GAG	2	6	2473665	2473670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162419844
48488	NC_010159	GGC	2	6	2473698	2473703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419844
48489	NC_010159	TCG	2	6	2473778	2473783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419844
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48491	NC_010159	TAC	2	6	2474026	2474031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419844
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48493	NC_010159	CTG	2	6	2474085	2474090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419844
48494	NC_010159	CGA	2	6	2474108	2474113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419844
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48497	NC_010159	T	6	6	2474282	2474287	0 %	100 %	0 %	0 %	162419169
48498	NC_010159	TGA	2	6	2474290	2474295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419169
48499	NC_010159	TG	3	6	2474379	2474384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48500	NC_010159	GATC	2	8	2474537	2474544	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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